Reference data set: nitrogen
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Predicted average insert size: 361
Predicted average genome size: 12858168
Total number of forward reads: 15234525
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Predicted average insert size: 434
Predicted average genome size: 5668148
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Predicted average insert size: 396
Predicted average genome size: 5379877
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Predicted average insert size: 400
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Predicted average insert size: 478
Predicted average genome size: 6080185
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Predicted average insert size: 494
Predicted average genome size: 5160005
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Predicted average insert size: 413
Predicted average genome size: 4937687
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Predicted average insert size: 408
Predicted average genome size: 5317483
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Predicted average insert size: 413
Predicted average genome size: 29739380
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Predicted average insert size: 376
Predicted average genome size: 29518536
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Total number of reverse reads: 14032284
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Predicted average insert size: 428
Predicted average genome size: 7538771
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Total number of reverse reads: 9198396
Number of mapped reads, forward: 4590
Number of mapped reads, reverse: 4521
Predicted average insert size: 404
Predicted average genome size: 6657780
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NarG_NxrA | 0.03990 | 24 | 95.85 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.01805 | 5 | 99.20 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.01417 | 2 | 100.00 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.02013 | 3 | 89.83 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 2.91129 | 1507 | 79.13 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.42006 | 106 | 78.40 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NirA | 0.82115 | 252 | 77.63 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 3.34106 | 1403 | 80.14 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 1.62419 | 211 | 73.60 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.04157 | 11 | 82.17 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirS | 0.00869 | 3 | 62.67 | nirS; Cytochrome cd1 nitrite reductase (NO-forming) / hydroxylamine reductase [EC:1.7.2.1 1.7.99.1] |
NirU | 0.88342 | 249 | 78.53 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.00702 | 3 | 69.97 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfC | 0.01408 | 2 | 67.45 | nrfC; protein NrfC |
NrfH | 0.01689 | 2 | 91.30 | nrfH; cytochrome c nitrite reductase small subunit |
UreA | 1.86029 | 207 | 84.89 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 2.59434 | 277 | 82.59 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 3.24490 | 964 | 87.97 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNorB_qNor | 0.01021 | 4 | 93.45 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.03098 | 4 | 79.38 |
Denitrification | 0.06748 | 21 | 79.79 |
Nitrate assimilatory reduction | 3.33135 | 1613 | 79.08 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.09225 | 34 | 96.06 |
Nitrite assimilation | 6.66982 | 2115 | 79.00 |
Urease | 7.69954 | 1448 | 86.50 |
NasA | NirS | NrfH | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | UreB | NirA | NarJ | NirD | NrfC | NarI | UreA | NirK | NirU | NarH_NxrB | NosZ | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 2.911294 | 0.008687 | 0.016895 | 3.341060 | 0.420056 | 0.039895 | 0.010208 | 3.244902 | 2.594342 | 0.821152 | 0.020129 | 1.624188 | 0.014081 | 0.014171 | 1.860294 | 0.041565 | 0.883418 | 0.018052 | 0.007022 |
2 | norank | Unknown | 0.007811 | 0.050607 | 0.010823 | 0.003299 | |||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 2.903483 | 0.008687 | 0.016895 | 3.341060 | 0.420056 | 0.039895 | 0.010208 | 3.170700 | 2.561678 | 0.817852 | 0.020129 | 1.624188 | 0.014081 | 0.014171 | 1.860294 | 0.041565 | 0.883418 | 0.018052 | 0.007022 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.016690 | 0.006718 | 0.009650 | 0.018165 | |||||||||||||||
5 | order | Synechococcales | 0.003359 | 0.003687 | |||||||||||||||||
6 | family | Synechococcaceae | 0.003687 | ||||||||||||||||||
7 | family | Unclassified Synechococcales | 0.003359 | ||||||||||||||||||
8 | class | Unclassified Cyanobacteria | 0.016690 | 0.003359 | 0.009650 | 0.014478 | |||||||||||||||
9 | phylum | Proteobacteria | 1.436310 | 0.008687 | 1.953420 | 0.363957 | 0.024861 | 0.005270 | 1.604825 | 1.595319 | 0.585489 | 0.013652 | 1.022569 | 0.014081 | 0.007052 | 1.303384 | 0.736086 | 0.007362 | |||
10 | class | Gammaproteobacteria | 0.282176 | 0.244417 | 0.025268 | 0.018247 | 0.002626 | 0.314265 | 0.323113 | 0.006732 | 0.163802 | 0.014081 | 0.007052 | 0.128424 | 0.007362 | ||||||
11 | order | Xanthomonadales | 0.011112 | 0.021967 | |||||||||||||||||
12 | family | Rhodanobacteraceae | 0.002281 | 0.021967 | |||||||||||||||||
13 | family | Xanthomonadaceae | 0.008830 | ||||||||||||||||||
14 | order | Cardiobacteriales | 0.002626 | ||||||||||||||||||
15 | family | Cardiobacteriaceae | 0.002626 | ||||||||||||||||||
16 | genus | Cardiobacterium | 0.002626 | ||||||||||||||||||
17 | order | Methylococcales | 0.004498 | ||||||||||||||||||
18 | family | Methylococcaceae | 0.004498 | ||||||||||||||||||
19 | order | Oceanospirillales | 0.006816 | ||||||||||||||||||
20 | order | Thiotrichales | 0.011377 | ||||||||||||||||||
21 | order | Pseudomonadales | 0.126525 | 0.163248 | 0.013285 | 0.256507 | 0.277132 | 0.072558 | 0.128424 | ||||||||||||
22 | family | Pseudomonadaceae | 0.112577 | 0.151171 | 0.004376 | 0.249945 | 0.277132 | 0.072558 | 0.128424 | ||||||||||||
23 | genus | Pseudomonas | 0.062988 | 0.122836 | 0.131742 | 0.207804 | 0.041296 | 0.105074 | |||||||||||||
24 | species | Pseudomonas donghuensis | 0.001647 | ||||||||||||||||||
25 | species | Pseudomonas rhizosphaerae | 0.010566 | ||||||||||||||||||
26 | species | Unclassified Pseudomonas | 0.061342 | 0.122836 | 0.131742 | 0.207804 | 0.030729 | 0.105074 | |||||||||||||
27 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 0.049589 | 0.028335 | 0.004376 | 0.118204 | 0.069328 | 0.031263 | 0.023350 | ||||||||||||
28 | family | Unclassified Pseudomonadales | 0.013948 | 0.012077 | 0.008910 | 0.006562 | |||||||||||||||
29 | order | Enterobacterales | 0.022229 | 0.048616 | 0.001541 | 0.014934 | 0.006769 | 0.057564 | 0.003681 | ||||||||||||
30 | family | Erwiniaceae | 0.039644 | 0.001541 | 0.004970 | 0.057564 | |||||||||||||||
31 | genus | Pantoea | 0.001541 | 0.001541 | 0.001541 | ||||||||||||||||
32 | genus | Erwinia | 0.038103 | 0.001657 | 0.056024 | ||||||||||||||||
33 | species | Erwinia billingiae | 0.033340 | 0.001657 | 0.044819 | ||||||||||||||||
34 | species | Unclassified Erwinia | 0.004763 | 0.011205 | |||||||||||||||||
35 | genus | Unclassified Erwiniaceae | 0.003313 | ||||||||||||||||||
36 | family | Pectobacteriaceae | 0.005901 | ||||||||||||||||||
37 | genus | Pectobacterium | 0.001448 | ||||||||||||||||||
38 | genus | Unclassified Pectobacteriaceae | 0.004453 | ||||||||||||||||||
39 | family | Morganellaceae | 0.004743 | ||||||||||||||||||
40 | genus | Proteus | 0.004743 | ||||||||||||||||||
41 | family | Enterobacteriaceae | 0.006487 | ||||||||||||||||||
42 | genus | Kosakonia | 0.001665 | ||||||||||||||||||
43 | genus | Unclassified Enterobacteriaceae | 0.004821 | ||||||||||||||||||
44 | family | Unclassified Enterobacterales | 0.009841 | 0.004229 | 0.009964 | 0.006769 | 0.003681 | ||||||||||||||
45 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 0.117813 | 0.032554 | 0.010442 | 0.003313 | 0.044172 | 0.034604 | 0.006732 | 0.011712 | 0.014081 | 0.007052 | 0.003681 | ||||||||
46 | class | Alphaproteobacteria | 0.418090 | 0.644171 | 0.196036 | 0.420166 | 0.341751 | 0.360308 | 0.006920 | 0.339594 | 0.493317 | 0.693509 | |||||||||
47 | order | Rhodospirillales | 0.020411 | 0.002431 | 0.004536 | 0.033784 | 0.026721 | 0.006920 | 0.022186 | 0.105849 | |||||||||||
48 | family | Rhodospirillaceae | 0.018153 | 0.002431 | 0.022186 | ||||||||||||||||
49 | genus | Nitrospirillum | 0.004516 | ||||||||||||||||||
50 | genus | Tistrella | 0.002431 | ||||||||||||||||||
51 | genus | Unclassified Rhodospirillaceae | 0.013636 | 0.022186 | |||||||||||||||||
52 | family | Acetobacteraceae | 0.023645 | 0.020043 | 0.006920 | 0.074079 | |||||||||||||||
53 | genus | Roseomonas | 0.010021 | 0.014118 | |||||||||||||||||
54 | genus | Acetobacter | 0.006759 | ||||||||||||||||||
55 | genus | Unclassified Acetobacteraceae | 0.016887 | 0.010021 | 0.006920 | 0.059961 | |||||||||||||||
56 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.002258 | 0.004536 | 0.010138 | 0.006678 | 0.031770 | ||||||||||||||
57 | order | Rhodobacterales | 0.002192 | 0.003379 | 0.011614 | 0.011675 | 0.003524 | ||||||||||||||
58 | family | Rhodobacteraceae | 0.002192 | 0.011614 | 0.011675 | 0.003524 | |||||||||||||||
59 | family | Unclassified Rhodobacterales | 0.003379 | ||||||||||||||||||
60 | order | Sphingomonadales | 0.150569 | 0.192326 | 0.016851 | 0.229327 | 0.011675 | ||||||||||||||
61 | family | Sphingomonadaceae | 0.136586 | 0.132334 | 0.010107 | 0.218451 | 0.011675 | ||||||||||||||
62 | genus | Sphingomonas | 0.044276 | 0.040996 | 0.154099 | ||||||||||||||||
63 | species | Sphingomonas taxi | 0.004830 | 0.044152 | |||||||||||||||||
64 | species | Sphingomonas panacis | 0.010930 | ||||||||||||||||||
65 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.044276 | 0.036166 | 0.099017 | ||||||||||||||||
66 | genus | Sphingobium | 0.021967 | ||||||||||||||||||
67 | genus | Novosphingobium | 0.001533 | 0.004700 | |||||||||||||||||
68 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.090777 | 0.086638 | 0.010107 | 0.042385 | 0.011675 | ||||||||||||||
69 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.013983 | 0.059992 | 0.006743 | 0.010876 | |||||||||||||||
70 | order | Caulobacterales | 0.002245 | ||||||||||||||||||
71 | family | Caulobacteraceae | 0.002245 | ||||||||||||||||||
72 | order | Rhizobiales | 0.171368 | 0.201976 | 0.164354 | 0.167455 | 0.213012 | 0.277991 | 0.011261 | 0.208902 | 0.580612 | ||||||||||
73 | family | Methylobacteriaceae | 0.114619 | 0.146271 | 0.117075 | 0.165070 | 0.193374 | 0.165070 | 0.227536 | ||||||||||||
74 | genus | Methylobacterium | 0.074036 | 0.128586 | 0.083621 | 0.120051 | 0.186896 | 0.120051 | 0.191964 | ||||||||||||
75 | species | Methylobacterium sp. GXF4 | 0.011257 | 0.008667 | |||||||||||||||||
76 | species | Unclassified Methylobacterium | 0.062779 | 0.119919 | 0.083621 | 0.120051 | 0.186896 | 0.120051 | 0.191964 | ||||||||||||
77 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 0.040583 | 0.017685 | 0.033454 | 0.045019 | 0.006478 | 0.045019 | 0.035572 | ||||||||||||
78 | family | Methylocystaceae | 0.001481 | 0.025226 | |||||||||||||||||
79 | genus | Methylocystis | 0.001481 | ||||||||||||||||||
80 | genus | Unclassified Methylocystaceae | 0.025226 | ||||||||||||||||||
81 | family | Xanthobacteraceae | 0.002460 | ||||||||||||||||||
82 | genus | Xanthobacter | 0.002460 | ||||||||||||||||||
83 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.006766 | 0.021905 | 0.016246 | 0.021905 | 0.031974 | ||||||||||||||
84 | genus | Bradyrhizobium | 0.002277 | ||||||||||||||||||
85 | genus | Bosea | 0.015006 | 0.003232 | 0.015006 | ||||||||||||||||
86 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.004489 | 0.006899 | 0.013014 | 0.006899 | 0.031974 | ||||||||||||||
87 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.002267 | 0.003374 | |||||||||||||||||
88 | genus | Filomicrobium | 0.002267 | ||||||||||||||||||
89 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 0.003374 | ||||||||||||||||||
90 | family | Beijerinckiaceae | 0.008361 | 0.118231 | 0.007196 | ||||||||||||||||
91 | genus | Methylocella | 0.002787 | 0.034484 | |||||||||||||||||
92 | genus | Unclassified Beijerinckiaceae | 0.005574 | 0.083747 | 0.007196 | ||||||||||||||||
93 | family | Phyllobacteriaceae | 0.002133 | 0.006920 | 0.006920 | ||||||||||||||||
94 | genus | Aminobacter | 0.006920 | 0.006920 | |||||||||||||||||
95 | genus | Mesorhizobium | 0.002133 | ||||||||||||||||||
96 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.035740 | 0.081284 | 0.018083 | 0.047006 | 0.019117 | 0.068370 | 0.011261 | 0.015006 | 0.288681 | ||||||||||
97 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 0.071306 | 0.247439 | 0.027146 | 0.198697 | 0.117124 | 0.055597 | 0.076820 | 0.261066 | 0.003524 | ||||||||||
98 | class | Betaproteobacteria | 0.273441 | 0.424376 | 0.103989 | 0.001666 | 0.002645 | 0.314642 | 0.427727 | 0.342751 | 0.231281 | ||||||||||
99 | order | Neisseriales | 0.003319 | 0.011038 | |||||||||||||||||
100 | family | Neisseriaceae | 0.003319 | 0.011038 | |||||||||||||||||
101 | genus | Vitreoscilla | 0.003319 | 0.011038 | |||||||||||||||||
102 | species | Vitreoscilla filiformis | 0.003319 | ||||||||||||||||||
103 | species | Unclassified Vitreoscilla | 0.011038 | ||||||||||||||||||
104 | order | Nitrosomonadales | 0.003033 | 0.002356 | |||||||||||||||||
105 | family | Methylophilaceae | 0.003033 | 0.002356 | |||||||||||||||||
106 | genus | Methylophilus | 0.002356 | ||||||||||||||||||
107 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 0.003033 | ||||||||||||||||||
108 | order | Burkholderiales | 0.212076 | 0.224542 | 0.101751 | 0.001666 | 0.002645 | 0.217589 | 0.381271 | 0.277853 | 0.172906 | ||||||||||
109 | family | Burkholderiaceae | 0.013412 | 0.002366 | 0.001666 | ||||||||||||||||
110 | genus | Burkholderia | 0.004495 | ||||||||||||||||||
111 | genus | Lautropia | 0.001666 | ||||||||||||||||||
112 | species | Lautropia mirabilis | 0.001666 | ||||||||||||||||||
113 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 0.008918 | 0.002366 | |||||||||||||||||
114 | genus | Rhizobacter | 0.002387 | ||||||||||||||||||
115 | family | Alcaligenaceae | 0.004584 | ||||||||||||||||||
116 | genus | Achromobacter | 0.001557 | ||||||||||||||||||
117 | genus | Unclassified Alcaligenaceae | 0.003027 | ||||||||||||||||||
118 | family | Oxalobacteraceae | 0.011208 | 0.002366 | 0.033157 | 0.013559 | 0.022245 | 0.022200 | 0.023350 | ||||||||||||
119 | genus | Massilia | 0.015644 | 0.010823 | |||||||||||||||||
120 | species | Massilia sp. WG5 | 0.002238 | ||||||||||||||||||
121 | species | Unclassified Massilia | 0.013406 | 0.010823 | |||||||||||||||||
122 | genus | Janthinobacterium | 0.002366 | 0.011377 | |||||||||||||||||
123 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 0.011208 | 0.017513 | 0.013559 | 0.022245 | 0.023350 | ||||||||||||||
124 | family | Comamonadaceae | 0.068549 | 0.072428 | 0.096936 | 0.255507 | 0.129380 | 0.081724 | |||||||||||||
125 | genus | Acidovorax | 0.003359 | ||||||||||||||||||
126 | genus | Variovorax | 0.002179 | 0.019191 | 0.162596 | 0.098367 | 0.011675 | ||||||||||||||
127 | species | Variovorax sp. CF313 | 0.032789 | ||||||||||||||||||
128 | species | Variovorax sp. PAMC 28711 | 0.081298 | ||||||||||||||||||
129 | species | Variovorax paradoxus | 0.011614 | 0.011675 | |||||||||||||||||
130 | species | Unclassified Variovorax | 0.002179 | 0.019191 | 0.069684 | 0.065578 | |||||||||||||||
131 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 0.066370 | 0.053237 | 0.093577 | 0.092912 | 0.031014 | 0.070049 | |||||||||||||
132 | genus | Leptothrix | 0.002442 | ||||||||||||||||||
133 | family | Unclassified Burkholderiales | 0.114322 | 0.142554 | 0.068594 | 0.002645 | 0.107095 | 0.103519 | 0.126272 | 0.067832 | |||||||||||
134 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.058332 | 0.197478 | 0.002238 | 0.093734 | 0.046456 | 0.053861 | 0.058374 | ||||||||||||
135 | class | Deltaproteobacteria | 0.014005 | 0.002426 | 0.006728 | 0.019395 | 0.010876 | 0.019395 | |||||||||||||
136 | order | Myxococcales | 0.011204 | 0.006534 | 0.010876 | 0.006534 | |||||||||||||||
137 | family | Archangiaceae | 0.008403 | ||||||||||||||||||
138 | family | Unclassified Myxococcales | 0.002801 | 0.006534 | 0.010876 | 0.006534 | |||||||||||||||
139 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 0.002801 | 0.002426 | 0.006728 | 0.012861 | 0.012861 | ||||||||||||||
140 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.448598 | 0.008687 | 0.638029 | 0.038664 | 0.004948 | 0.549024 | 0.483333 | 0.225181 | 0.165546 | 0.430967 | 0.042577 | ||||||||
141 | phylum | Firmicutes | 0.001549 | 0.012866 | 0.007119 | ||||||||||||||||
142 | class | Negativicutes | 0.007119 | ||||||||||||||||||
143 | order | Selenomonadales | 0.007119 | ||||||||||||||||||
144 | family | Selenomonadaceae | 0.007119 | ||||||||||||||||||
145 | class | Bacilli | 0.001549 | 0.003334 | |||||||||||||||||
146 | order | Bacillales | 0.001549 | ||||||||||||||||||
147 | family | Paenibacillaceae | 0.001549 | ||||||||||||||||||
148 | order | Unclassified Bacilli | 0.003334 | ||||||||||||||||||
149 | class | Unclassified Firmicutes | 0.009533 | ||||||||||||||||||
150 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.002374 | ||||||||||||||||||
151 | class | Deinococci | 0.002374 | ||||||||||||||||||
152 | order | Deinococcales | 0.002374 | ||||||||||||||||||
153 | family | Deinococcaceae | 0.002374 | ||||||||||||||||||
154 | phylum | Actinobacteria | 0.364332 | 0.215848 | 0.042579 | 0.015034 | 0.004938 | 0.090940 | 0.099049 | 0.006477 | 0.221005 | 0.070049 | 0.002183 | 0.010689 | |||||||
155 | class | Actinobacteria | 0.309998 | 0.122379 | 0.038203 | 0.013331 | 0.004938 | 0.088251 | 0.084925 | 0.006477 | 0.116173 | 0.046700 | 0.002183 | 0.010689 | |||||||
156 | order | Actinomycetales | 0.003313 | 0.002557 | 0.006477 | ||||||||||||||||
157 | family | Actinomycetaceae | 0.003313 | 0.002557 | 0.006477 | ||||||||||||||||
158 | genus | Actinomyces | 0.002557 | 0.006477 | |||||||||||||||||
159 | genus | Unclassified Actinomycetaceae | 0.003313 | ||||||||||||||||||
160 | order | Actinopolysporales | 0.003880 | ||||||||||||||||||
161 | family | Actinopolysporaceae | 0.003880 | ||||||||||||||||||
162 | order | Kineosporiales | 0.010944 | 0.006951 | 0.030836 | 0.011319 | |||||||||||||||
163 | family | Kineosporiaceae | 0.007817 | 0.004634 | 0.030836 | 0.011319 | |||||||||||||||
164 | genus | Kineococcus | 0.006254 | 0.004634 | 0.017131 | 0.011319 | |||||||||||||||
165 | species | Kineococcus radiotolerans | 0.003426 | ||||||||||||||||||
166 | species | Unclassified Kineococcus | 0.006254 | 0.004634 | 0.013705 | 0.011319 | |||||||||||||||
167 | genus | Unclassified Kineosporiaceae | 0.001563 | 0.013705 | |||||||||||||||||
168 | family | Unclassified Kineosporiales | 0.003127 | 0.002317 | |||||||||||||||||
169 | order | Micrococcales | 0.024647 | 0.033276 | 0.001678 | 0.010154 | 0.030572 | 0.031114 | |||||||||||||
170 | family | Micrococcaceae | 0.002716 | 0.011973 | 0.001678 | 0.010668 | |||||||||||||||
171 | genus | Arthrobacter | 0.009713 | ||||||||||||||||||
172 | genus | Unclassified Micrococcaceae | 0.002716 | 0.002261 | 0.001678 | 0.010668 | |||||||||||||||
173 | family | Intrasporangiaceae | 0.010823 | ||||||||||||||||||
174 | family | Microbacteriaceae | 0.009154 | 0.020934 | |||||||||||||||||
175 | genus | Agromyces | 0.002319 | ||||||||||||||||||
176 | genus | Cryobacterium | 0.002196 | ||||||||||||||||||
177 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 0.004639 | 0.020934 | |||||||||||||||||
178 | family | Unclassified Micrococcales | 0.011109 | 0.012148 | 0.010154 | 0.019904 | 0.010180 | ||||||||||||||
179 | order | Corynebacteriales | 0.010677 | 0.004862 | 0.003867 | 0.002381 | 0.006759 | 0.021402 | 0.011736 | 0.011675 | |||||||||||
180 | family | Corynebacteriaceae | 0.002381 | 0.009908 | |||||||||||||||||
181 | genus | Corynebacterium | 0.002381 | ||||||||||||||||||
182 | genus | Unclassified Corynebacteriaceae | 0.009908 | ||||||||||||||||||
183 | family | Mycobacteriaceae | 0.001540 | 0.003379 | |||||||||||||||||
184 | genus | Mycobacterium | 0.003379 | ||||||||||||||||||
185 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 0.001540 | ||||||||||||||||||
186 | family | Nocardiaceae | 0.001513 | 0.003867 | 0.011494 | 0.011736 | 0.011675 | ||||||||||||||
187 | genus | Nocardia | 0.003867 | ||||||||||||||||||
188 | genus | Rhodococcus | 0.011736 | ||||||||||||||||||
189 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 0.001513 | 0.011494 | 0.011675 | ||||||||||||||||
190 | family | Gordoniaceae | 0.004542 | ||||||||||||||||||
191 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.003082 | 0.004862 | 0.003379 | ||||||||||||||||
192 | order | Propionibacteriales | 0.007581 | 0.003333 | 0.002183 | 0.003724 | |||||||||||||||
193 | family | Propionibacteriaceae | 0.004814 | 0.003333 | 0.002183 | 0.003724 | |||||||||||||||
194 | genus | Microlunatus | 0.002407 | ||||||||||||||||||
195 | genus | Unclassified Propionibacteriaceae | 0.002407 | 0.003333 | 0.002183 | 0.003724 | |||||||||||||||
196 | family | Nocardioidaceae | 0.002766 | ||||||||||||||||||
197 | genus | Actinopolymorpha | 0.002766 | ||||||||||||||||||
198 | order | Pseudonocardiales | 0.002896 | ||||||||||||||||||
199 | family | Pseudonocardiaceae | 0.002896 | ||||||||||||||||||
200 | order | Streptomycetales | 0.043050 | 0.013528 | 0.003395 | ||||||||||||||||
201 | family | Streptomycetaceae | 0.034706 | 0.004564 | |||||||||||||||||
202 | genus | Streptomyces | 0.017136 | ||||||||||||||||||
203 | genus | Unclassified Streptomycetaceae | 0.017570 | 0.004564 | |||||||||||||||||
204 | family | Unclassified Streptomycetales | 0.008344 | 0.008963 | 0.003395 | ||||||||||||||||
205 | order | Streptosporangiales | 0.007021 | ||||||||||||||||||
206 | family | Nocardiopsaceae | 0.005532 | ||||||||||||||||||
207 | family | Unclassified Streptosporangiales | 0.001488 | ||||||||||||||||||
208 | order | Frankiales | 0.002614 | 0.002263 | |||||||||||||||||
209 | family | Frankiaceae | 0.002614 | 0.002263 | |||||||||||||||||
210 | order | Unclassified Actinobacteria | 0.200568 | 0.075028 | 0.016928 | 0.005007 | 0.037108 | 0.032951 | 0.062004 | 0.035025 | 0.006965 | ||||||||||
211 | class | Rubrobacteria | 0.001703 | ||||||||||||||||||
212 | order | Rubrobacterales | 0.001703 | ||||||||||||||||||
213 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.054334 | 0.093469 | 0.004376 | 0.002689 | 0.014124 | 0.104832 | 0.023350 | ||||||||||||
214 | phylum | Planctomycetes | 0.121615 | 0.025273 | 0.104928 | 0.003410 | |||||||||||||||
215 | class | Planctomycetia | 0.028836 | 0.012636 | 0.028836 | 0.003410 | |||||||||||||||
216 | order | Planctomycetales | 0.018606 | 0.006418 | 0.018606 | 0.003410 | |||||||||||||||
217 | family | Planctomycetaceae | 0.016539 | 0.016539 | |||||||||||||||||
218 | genus | Gimesia | 0.002067 | 0.002067 | |||||||||||||||||
219 | genus | Unclassified Planctomycetaceae | 0.014472 | 0.014472 | |||||||||||||||||
220 | family | Isosphaeraceae | 0.006418 | ||||||||||||||||||
221 | family | Unclassified Planctomycetales | 0.002067 | 0.002067 | 0.003410 | ||||||||||||||||
222 | order | Unclassified Planctomycetia | 0.010230 | 0.006219 | 0.010230 | ||||||||||||||||
223 | class | Unclassified Planctomycetes | 0.092779 | 0.012636 | 0.076092 | ||||||||||||||||
224 | phylum | Spirochaetes | 0.004783 | ||||||||||||||||||
225 | class | Spirochaetia | 0.002392 | ||||||||||||||||||
226 | class | Unclassified Spirochaetes | 0.002392 | ||||||||||||||||||
227 | phylum | Lentisphaerae | 0.019216 | ||||||||||||||||||
228 | class | Lentisphaeria | 0.002402 | ||||||||||||||||||
229 | class | Unclassified Lentisphaerae | 0.016814 | ||||||||||||||||||
230 | phylum | Acidobacteria | 0.061815 | 0.064545 | 0.010823 | 0.029689 | |||||||||||||||
231 | class | Acidobacteriia | 0.059180 | 0.051626 | 0.023100 | ||||||||||||||||
232 | order | Acidobacteriales | 0.056493 | 0.048412 | 0.023100 | ||||||||||||||||
233 | family | Acidobacteriaceae | 0.043063 | 0.038730 | 0.009883 | ||||||||||||||||
234 | genus | Terriglobus | 0.024175 | 0.019365 | 0.003294 | ||||||||||||||||
235 | species | Terriglobus roseus | 0.002686 | ||||||||||||||||||
236 | species | Unclassified Terriglobus | 0.021489 | 0.019365 | 0.003294 | ||||||||||||||||
237 | genus | Unclassified Acidobacteriaceae | 0.018888 | 0.019365 | 0.006589 | ||||||||||||||||
238 | family | Unclassified Acidobacteriales | 0.013430 | 0.009682 | 0.013217 | ||||||||||||||||
239 | order | Unclassified Acidobacteriia | 0.002686 | 0.003213 | |||||||||||||||||
240 | class | Unclassified Acidobacteria | 0.002635 | 0.012919 | 0.010823 | 0.006589 | |||||||||||||||
241 | phylum | Armatimonadetes | 0.005702 | 0.025636 | |||||||||||||||||
242 | class | Fimbriimonadia | 0.005702 | 0.025636 | |||||||||||||||||
243 | order | Fimbriimonadales | 0.005702 | 0.025636 | |||||||||||||||||
244 | family | Fimbriimonadaceae | 0.002851 | ||||||||||||||||||
245 | genus | Fimbriimonas | 0.002851 | ||||||||||||||||||
246 | family | Unclassified Fimbriimonadales | 0.002851 | 0.025636 | |||||||||||||||||
247 | phylum | Verrucomicrobia | 0.009366 | 0.019258 | 0.003334 | 0.003159 | 0.003480 | ||||||||||||||
248 | class | Verrucomicrobiae | 0.003480 | ||||||||||||||||||
249 | order | Verrucomicrobiales | 0.003480 | ||||||||||||||||||
250 | class | Opitutae | 0.009366 | 0.003159 | |||||||||||||||||
251 | order | Opitutales | 0.009366 | 0.003159 | |||||||||||||||||
252 | family | Opitutaceae | 0.009366 | 0.003159 | |||||||||||||||||
253 | genus | Opitutus | 0.009366 | ||||||||||||||||||
254 | genus | Unclassified Opitutaceae | 0.003159 | ||||||||||||||||||
255 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 0.019258 | 0.003334 | |||||||||||||||||
256 | phylum | Bacteroidetes | 0.101818 | 0.007529 | 0.120155 | 0.094153 | 0.120080 | 0.053047 | 0.120080 | 0.023329 | 0.002981 | ||||||||||
257 | class | Flavobacteriia | 0.007529 | 0.023329 | 0.002981 | ||||||||||||||||
258 | order | Flavobacteriales | 0.007529 | 0.023329 | 0.002981 | ||||||||||||||||
259 | family | Flavobacteriaceae | 0.007529 | 0.023329 | 0.002981 | ||||||||||||||||
260 | genus | Capnocytophaga | 0.007529 | 0.015541 | 0.002981 | ||||||||||||||||
261 | genus | Flavobacterium | 0.007787 | ||||||||||||||||||
262 | class | Sphingobacteriia | 0.003521 | 0.009652 | 0.010823 | ||||||||||||||||
263 | order | Sphingobacteriales | 0.003521 | 0.007235 | 0.010823 | ||||||||||||||||
264 | family | Sphingobacteriaceae | 0.001760 | 0.007235 | 0.010823 | ||||||||||||||||
265 | genus | Mucilaginibacter | 0.004835 | ||||||||||||||||||
266 | genus | Pedobacter | 0.002399 | 0.010823 | |||||||||||||||||
267 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 0.001760 | ||||||||||||||||||
268 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.001761 | ||||||||||||||||||
269 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.002418 | ||||||||||||||||||
270 | class | Chitinophagia | 0.001750 | 0.002394 | |||||||||||||||||
271 | class | Cytophagia | 0.010556 | 0.019245 | 0.073979 | 0.120080 | 0.010719 | 0.120080 | |||||||||||||
272 | order | Cytophagales | 0.008797 | 0.004814 | 0.053805 | 0.100067 | 0.010719 | 0.100067 | |||||||||||||
273 | family | Hymenobacteraceae | 0.002407 | 0.023548 | 0.100067 | 0.100067 | |||||||||||||||
274 | genus | Hymenobacter | 0.006728 | 0.060040 | 0.060040 | ||||||||||||||||
275 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.002407 | 0.016820 | 0.040027 | 0.040027 | |||||||||||||||
276 | family | Flammeovirgaceae | 0.001759 | ||||||||||||||||||
277 | family | Cytophagaceae | 0.010719 | ||||||||||||||||||
278 | genus | Dyadobacter | 0.010719 | ||||||||||||||||||
279 | family | Unclassified Cytophagales | 0.007039 | 0.002407 | 0.030256 | ||||||||||||||||
280 | order | Unclassified Cytophagia | 0.001759 | 0.014430 | 0.020174 | 0.020013 | 0.020013 | ||||||||||||||
281 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.085990 | 0.088863 | 0.020174 | 0.031505 | |||||||||||||||
282 | phylum | Unclassified Bacteria | 0.931956 | 0.867701 | 0.013520 | 1.357863 | 0.737579 | 0.121222 | 0.186179 | 0.366780 | 0.016054 | 0.110753 | 0.004041 | ||||||||
283 | superkingdom | Archaea | 0.003379 | 0.010227 | |||||||||||||||||
284 | phylum | Euryarchaeota | 0.003379 | 0.010227 | |||||||||||||||||
285 | class | Halobacteria | 0.010227 | ||||||||||||||||||
286 | order | Halobacteriales | 0.010227 | ||||||||||||||||||
287 | family | Haloarculaceae | 0.010227 | ||||||||||||||||||
288 | class | Unclassified Euryarchaeota | 0.003379 | ||||||||||||||||||
289 | superkingdom | Unclassified | 0.020215 | 0.011614 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NapA | 0.00787 | 9 | 89.49 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapB | 0.00612 | 2 | 82.95 | Periplasmic nitrate reductase cytochrome c550-type subunit |
NapC | 0.01254 | 5 | 91.16 | Cytochrome c-type protein NapC |
NapD | 0.00318 | 1 | 70.80 | Periplasmic nitrate reductase component NapD |
NapF | 0.01450 | 5 | 59.06 | Ferredoxin-type protein NapF (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.01343 | 22 | 95.52 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.01299 | 10 | 95.91 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.02171 | 9 | 88.29 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.02149 | 9 | 82.72 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 2.65618 | 3566 | 82.23 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.49155 | 330 | 80.27 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.00130 | 1 | 89.80 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NifD_AnfD_VnfD | 0.00135 | 1 | 100.00 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NifH_AnfH_VnfH | 0.00985 | 5 | 95.12 | Nitrogenase reductase and maturation protein NifH/AnfH/VnfH |
NirA | 0.43115 | 367 | 77.18 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 2.69435 | 3102 | 88.13 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 1.72120 | 588 | 82.13 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.06832 | 49 | 71.45 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirS | 0.00411 | 4 | 69.38 | nirS; Cytochrome cd1 nitrite reductase (NO-forming) / hydroxylamine reductase [EC:1.7.2.1 1.7.99.1] |
NirT | 0.00261 | 1 | 80.90 | Cytochrome c-type protein NirT |
NirU | 0.37829 | 296 | 82.62 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.00629 | 7 | 76.29 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfA | 0.00451 | 3 | 82.53 | nrfA; nitrite reductase (cytochrome c-552) [EC:1.7.2.2] |
UreA | 2.15904 | 680 | 88.79 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 2.11610 | 687 | 85.00 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 3.04763 | 2526 | 90.88 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.00483 | 2 | 56.80 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.00522 | 5 | 86.70 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.00451 | 3 | 82.53 |
Denitrification | 0.09137 | 68 | 72.65 |
Nitrate assimilatory reduction | 3.14774 | 3896 | 82.07 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.11383 | 72 | 88.79 |
Nitrite assimilation | 5.22499 | 4353 | 86.02 |
Nitrogen fixation | 0.01250 | 7 | 95.06 |
Urease | 7.32277 | 3893 | 89.48 |
NapD | NapC | NarJ | NasA | NirT | NifH_AnfH_VnfH | NapA | NarH_NxrB | NirS | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NapF | NirD | UreA | NirK | cNor-C | NosZ | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapB | NrfA | NarI | NifB | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.003178 | 0.012537 | 2.149141e-02 | 2.656185e+00 | 0.002611 | 0.009852 | 0.007871 | 0.012994 | 0.004114 | 0.001346 | 2.116101 | 0.014501 | 1.721196 | 2.159044 | 0.068317 | 0.004826 | 0.006288 | 2.694350 | 4.915514e-01 | 0.013428 | 0.005215 | 3.047629 | 0.431154 | 0.006119 | 0.004514 | 2.171451e-02 | 0.001304 | 0.378291 |
2 | norank | Unknown | 1.546015e-03 | 0.006801 | 0.035050 | |||||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.003178 | 0.012537 | 2.149141e-02 | 2.653605e+00 | 0.002611 | 0.009852 | 0.007871 | 0.012994 | 0.004114 | 0.001346 | 2.109301 | 0.014501 | 1.721196 | 2.159044 | 0.068317 | 0.004826 | 0.006288 | 2.694350 | 4.915514e-01 | 0.013428 | 0.005215 | 3.007755 | 0.428618 | 0.006119 | 0.004514 | 2.171451e-02 | 0.001304 | 0.378291 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 1.645875e-02 | 0.001707 | 0.002360 | |||||||||||||||||||||||||
5 | order | Oscillatoriales | 2.918714e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
6 | family | Cyanothecaceae | 9.615410e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
7 | family | Unclassified Oscillatoriales | 1.957173e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
8 | class | Unclassified Cyanobacteria | 1.354003e-02 | 0.001707 | 0.002360 | |||||||||||||||||||||||||
9 | phylum | Proteobacteria | 0.003178 | 0.012537 | 1.684155e-02 | 1.846623e+00 | 0.002611 | 0.009852 | 0.006972 | 0.011781 | 1.254723 | 0.014501 | 1.249828 | 1.135268 | 0.026608 | 0.005553 | 1.967950 | 4.279407e-01 | 0.012816 | 0.004273 | 1.630323 | 0.240379 | 0.006119 | 0.001442 | 1.939609e-02 | 0.001304 | 0.283712 | |||
10 | class | Gammaproteobacteria | 0.002619 | 4.662947e-03 | 1.092205e-01 | 0.000872 | 0.001316 | 0.097523 | 0.040713 | 0.081575 | 0.114298 | 9.772913e-03 | 0.001816 | 0.104846 | 7.302857e-03 | |||||||||||||||
11 | order | Chromatiales | 0.001212 | |||||||||||||||||||||||||||
12 | family | Ectothiorhodospiraceae | 0.001212 | |||||||||||||||||||||||||||
13 | order | Xanthomonadales | 1.629743e-03 | 0.001773 | ||||||||||||||||||||||||||
14 | family | Rhodanobacteraceae | 8.148717e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
15 | family | Unclassified Xanthomonadales | 8.148717e-04 | 0.001773 | ||||||||||||||||||||||||||
16 | order | Methylococcales | 1.097351e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
17 | family | Methylococcaceae | 5.486754e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
18 | genus | Methylomicrobium | 5.486754e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
19 | family | Unclassified Methylococcales | 5.486754e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
20 | order | Oceanospirillales | 1.478225e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
21 | order | Pasteurellales | 0.002619 | |||||||||||||||||||||||||||
22 | order | Cellvibrionales | 2.186386e-03 | 0.001723 | ||||||||||||||||||||||||||
23 | family | Cellvibrionaceae | 2.186386e-03 | 0.001723 | ||||||||||||||||||||||||||
24 | genus | Cellvibrio | 0.001723 | |||||||||||||||||||||||||||
25 | genus | Unclassified Cellvibrionaceae | 2.186386e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
26 | order | Pseudomonadales | 4.992776e-02 | 0.000872 | 0.097523 | 0.023108 | 0.081575 | 0.084480 | 3.133242e-03 | 0.100083 | ||||||||||||||||||||
27 | family | Pseudomonadaceae | 4.284389e-02 | 0.000872 | 0.097523 | 0.017306 | 0.081575 | 0.075884 | 1.588846e-03 | 0.097666 | ||||||||||||||||||||
28 | genus | Pseudomonas | 2.046697e-02 | 0.067041 | 0.008731 | 0.078132 | 0.035071 | 1.588846e-03 | 0.038854 | |||||||||||||||||||||
29 | species | Pseudomonas rhizosphaerae | 0.001711 | |||||||||||||||||||||||||||
30 | species | Unclassified Pseudomonas | 2.046697e-02 | 0.067041 | 0.008731 | 0.078132 | 0.033360 | 1.588846e-03 | 0.038854 | |||||||||||||||||||||
31 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 2.237692e-02 | 0.000872 | 0.030482 | 0.008575 | 0.003443 | 0.040813 | 0.058812 | |||||||||||||||||||||
32 | family | Unclassified Pseudomonadales | 7.083871e-03 | 0.005802 | 0.008597 | 1.544395e-03 | 0.002417 | |||||||||||||||||||||||
33 | order | Enterobacterales | 2.331474e-03 | 1.174289e-02 | 0.001316 | 0.006004 | 0.003841 | 2.226398e-03 | 0.000605 | 4.868571e-03 | ||||||||||||||||||||
34 | family | Erwiniaceae | 2.331474e-03 | 0.003792 | 0.001427 | 5.636139e-04 | 2.434286e-03 | |||||||||||||||||||||||
35 | genus | Pantoea | 0.000564 | 0.000564 | 5.636139e-04 | |||||||||||||||||||||||||
36 | genus | Erwinia | 2.331474e-03 | 0.003228 | 0.000863 | 2.434286e-03 | ||||||||||||||||||||||||
37 | species | Erwinia billingiae | 0.003228 | 0.000863 | ||||||||||||||||||||||||||
38 | species | Unclassified Erwinia | 2.331474e-03 | 2.434286e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
39 | family | Pectobacteriaceae | 2.229155e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
40 | genus | Pectobacterium | 5.439894e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
41 | genus | Unclassified Pectobacteriaceae | 1.685165e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
42 | family | Yersiniaceae | 4.946021e-03 | 0.001103 | 0.001304 | 5.530731e-04 | 0.000605 | |||||||||||||||||||||||
43 | genus | Rahnella | 2.471368e-03 | 0.000605 | ||||||||||||||||||||||||||
44 | genus | Unclassified Yersiniaceae | 2.474653e-03 | 0.001103 | 0.001304 | 5.530731e-04 | ||||||||||||||||||||||||
45 | family | Enterobacteriaceae | 2.083133e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
46 | family | Unclassified Enterobacterales | 2.484586e-03 | 0.001316 | 0.001110 | 0.001110 | 1.109711e-03 | 2.434286e-03 | ||||||||||||||||||||||
47 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 2.331474e-03 | 4.263641e-02 | 0.011601 | 0.022481 | 2.935048e-03 | 0.001211 | 0.003550 | 2.434286e-03 | ||||||||||||||||||||
48 | class | Oligoflexia | 0.001442 | |||||||||||||||||||||||||||
49 | order | Bdellovibrionales | 0.001442 | |||||||||||||||||||||||||||
50 | family | Bdellovibrionaceae | 0.001442 | |||||||||||||||||||||||||||
51 | class | Acidithiobacillia | 7.937804e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
52 | order | Acidithiobacillales | 7.937804e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
53 | class | Alphaproteobacteria | 0.003178 | 0.009918 | 8.151243e-01 | 0.007848 | 0.003479 | 0.519055 | 0.014501 | 0.669749 | 0.558806 | 0.013094 | 0.003347 | 0.840992 | 2.362234e-01 | 0.663772 | 0.193779 | 0.006119 | 0.274779 | |||||||||||
54 | order | Rhodospirillales | 2.423153e-03 | 0.011657 | 0.002640 | 0.009708 | 0.002400 | |||||||||||||||||||||||
55 | family | Rhodospirillaceae | 0.008763 | 0.002640 | ||||||||||||||||||||||||||
56 | family | Acetobacteraceae | 2.423153e-03 | 0.009708 | 0.001200 | |||||||||||||||||||||||||
57 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.002894 | 0.001200 | ||||||||||||||||||||||||||
58 | order | Rhodobacterales | 0.003414 | 0.010328 | 0.005940 | |||||||||||||||||||||||||
59 | family | Rhodobacteraceae | 0.003414 | 0.010328 | 0.005940 | |||||||||||||||||||||||||
60 | genus | Rhodobacter | 0.001210 | |||||||||||||||||||||||||||
61 | genus | Paracoccus | 0.003443 | |||||||||||||||||||||||||||
62 | species | Paracoccus sp. TRP | 0.003443 | |||||||||||||||||||||||||||
63 | genus | Unclassified Rhodobacteraceae | 0.003414 | 0.006885 | 0.004730 | |||||||||||||||||||||||||
64 | order | Sphingomonadales | 4.565758e-01 | 0.046115 | 0.560473 | 0.017214 | 0.009807 | 0.529297 | 0.066567 | |||||||||||||||||||||
65 | family | Erythrobacteraceae | 0.000878 | |||||||||||||||||||||||||||
66 | genus | Erythrobacter | 0.000878 | |||||||||||||||||||||||||||
67 | family | Sphingomonadaceae | 4.056540e-01 | 0.036244 | 0.461075 | 0.017214 | 0.005884 | 0.388262 | 0.056884 | |||||||||||||||||||||
68 | genus | Sphingomonas | 1.205931e-01 | 0.190656 | 0.079125 | |||||||||||||||||||||||||
69 | species | Sphingomonas taxi | 1.696525e-03 | 0.037851 | 0.004376 | |||||||||||||||||||||||||
70 | species | Sphingomonas panacis | 4.258765e-03 | 0.021748 | 0.005201 | |||||||||||||||||||||||||
71 | species | Sphingomonas hengshuiensis | 8.430807e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
72 | species | Unclassified Sphingomonas | 1.137948e-01 | 0.131057 | 0.069548 | |||||||||||||||||||||||||
73 | genus | Sphingorhabdus | 0.002614 | |||||||||||||||||||||||||||
74 | genus | Sphingobium | 1.093522e-02 | 0.036925 | 0.003443 | 0.000872 | ||||||||||||||||||||||||
75 | species | Sphingobium sp. RAC03 | 0.009251 | |||||||||||||||||||||||||||
76 | species | Unclassified Sphingobium | 1.093522e-02 | 0.027673 | 0.003443 | 0.000872 | ||||||||||||||||||||||||
77 | genus | Novosphingobium | 5.868396e-03 | 0.013266 | 0.036222 | 0.010328 | 0.013058 | 0.026627 | ||||||||||||||||||||||
78 | species | Novosphingobium resinovorum | 8.371144e-04 | 0.000866 | ||||||||||||||||||||||||||
79 | species | Novosphingobium sp. Rr 2-17 | 0.003386 | 0.009682 | ||||||||||||||||||||||||||
80 | species | Unclassified Novosphingobium | 5.031281e-03 | 0.009880 | 0.036222 | 0.010328 | 0.012192 | 0.016944 | ||||||||||||||||||||||
81 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 2.682573e-01 | 0.022978 | 0.197273 | 0.003443 | 0.005884 | 0.292592 | 0.030258 | |||||||||||||||||||||
82 | family | Unclassified Sphingomonadales | 5.092170e-02 | 0.009870 | 0.099398 | 0.003923 | 0.140157 | 0.009682 | ||||||||||||||||||||||
83 | order | Caulobacterales | 1.876389e-02 | 0.009228 | 0.013289 | |||||||||||||||||||||||||
84 | family | Caulobacteraceae | 1.876389e-02 | 0.006145 | 0.009749 | |||||||||||||||||||||||||
85 | genus | Caulobacter | 1.385282e-02 | 0.003061 | 0.005324 | |||||||||||||||||||||||||
86 | species | Caulobacter sp. K31 | 2.444615e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
87 | species | Unclassified Caulobacter | 1.140820e-02 | 0.003061 | 0.005324 | |||||||||||||||||||||||||
88 | genus | Unclassified Caulobacteraceae | 4.911075e-03 | 0.003084 | 0.004425 | |||||||||||||||||||||||||
89 | family | Unclassified Caulobacterales | 0.003084 | 0.003540 | ||||||||||||||||||||||||||
90 | order | Rhizobiales | 0.003178 | 0.009918 | 1.753604e-01 | 0.002609 | 0.290578 | 0.009511 | 0.235695 | 0.002319 | 0.011569 | 2.218840e-01 | 0.337313 | 0.183282 | 0.006119 | 0.270971 | ||||||||||||||
91 | family | Methylobacteriaceae | 1.551314e-02 | 0.020626 | 0.020626 | 2.039440e-02 | 0.021614 | 0.026712 | 0.031715 | |||||||||||||||||||||
92 | genus | Methylobacterium | 1.143864e-02 | 0.018048 | 0.018048 | 1.573128e-02 | 0.016814 | 0.026712 | 0.026636 | |||||||||||||||||||||
93 | species | Methylobacterium sp. 77 | 0.001166 | |||||||||||||||||||||||||||
94 | species | Unclassified Methylobacterium | 1.143864e-02 | 0.018048 | 0.018048 | 1.573128e-02 | 0.016814 | 0.025546 | 0.026636 | |||||||||||||||||||||
95 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 4.074499e-03 | 0.002578 | 0.002578 | 4.663115e-03 | 0.004799 | 0.005079 | ||||||||||||||||||||||
96 | family | Chelatococcaceae | 8.229706e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
97 | genus | Chelatococcus | 8.229706e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
98 | family | Aurantimonadaceae | 0.003626 | |||||||||||||||||||||||||||
99 | genus | Aurantimonas | 0.002417 | |||||||||||||||||||||||||||
100 | genus | Unclassified Aurantimonadaceae | 0.001209 | |||||||||||||||||||||||||||
101 | family | Methylocystaceae | 2.168833e-03 | 1.556004e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
102 | genus | Methylocystis | 5.422084e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
103 | genus | Methylopila | 1.556004e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
104 | genus | Unclassified Methylocystaceae | 1.626625e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
105 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.003178 | 0.005002 | 8.152975e-02 | 0.001739 | 0.091769 | 0.083282 | 1.511717e-01 | 0.078501 | 0.093935 | 0.003054 | 0.173098 | |||||||||||||||||
106 | genus | Afipia | 8.116766e-04 | 1.594967e-03 | 0.001184 | 0.001268 | ||||||||||||||||||||||||
107 | genus | Rhodopseudomonas | 0.002531 | 0.016989 | 0.002417 | |||||||||||||||||||||||||
108 | genus | Bradyrhizobium | 8.173437e-03 | 3.971969e-02 | 0.003631 | 0.039112 | 0.029303 | |||||||||||||||||||||||
109 | species | Bradyrhizobium diazoefficiens | 0.001119 | |||||||||||||||||||||||||||
110 | species | Unclassified Bradyrhizobium | 8.173437e-03 | 3.971969e-02 | 0.003631 | 0.037994 | 0.029303 | |||||||||||||||||||||||
111 | genus | Bosea | 0.005157 | 0.005157 | 0.001161 | 0.001289 | ||||||||||||||||||||||||
112 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.003178 | 0.002471 | 7.254463e-02 | 0.001739 | 0.069623 | 0.078125 | 1.098570e-01 | 0.072453 | 0.052477 | 0.003054 | 0.141238 | |||||||||||||||||
113 | family | Hyphomicrobiaceae | 1.657554e-03 | 0.001780 | 1.273597e-03 | 0.001210 | 0.001161 | 0.001252 | ||||||||||||||||||||||
114 | genus | Devosia | 0.001210 | |||||||||||||||||||||||||||
115 | genus | Hyphomicrobium | 0.001161 | 0.001252 | ||||||||||||||||||||||||||
116 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 1.657554e-03 | 0.001780 | 1.273597e-03 | |||||||||||||||||||||||||
117 | family | Beijerinckiaceae | 1.607352e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
118 | family | Phyllobacteriaceae | 8.563590e-03 | 0.013657 | ||||||||||||||||||||||||||
119 | genus | Hoeflea | 0.003414 | |||||||||||||||||||||||||||
120 | genus | Chelativorans | 0.003414 | |||||||||||||||||||||||||||
121 | genus | Mesorhizobium | 7.738159e-03 | 0.003414 | ||||||||||||||||||||||||||
122 | species | Mesorhizobium sp. WSM1497 | 7.752021e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
123 | species | Unclassified Mesorhizobium | 6.962956e-03 | 0.003414 | ||||||||||||||||||||||||||
124 | genus | Unclassified Phyllobacteriaceae | 8.254317e-04 | 0.003414 | ||||||||||||||||||||||||||
125 | family | Rhizobiaceae | 9.869027e-03 | 0.102430 | 0.006357 | 0.000890 | 0.038781 | |||||||||||||||||||||||
126 | genus | Agrobacterium | 0.006829 | |||||||||||||||||||||||||||
127 | genus | Rhizobium | 8.279076e-04 | 0.064873 | 0.001209 | |||||||||||||||||||||||||
128 | species | Rhizobium sp. 2MFCol3.1 | 0.020486 | |||||||||||||||||||||||||||
129 | species | Unclassified Rhizobium | 8.279076e-04 | 0.044386 | 0.001209 | |||||||||||||||||||||||||
130 | genus | Unclassified Rhizobiaceae | 9.041119e-03 | 0.030729 | 0.006357 | 0.000890 | 0.037572 | |||||||||||||||||||||||
131 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.004916 | 5.523553e-02 | 0.000870 | 0.062096 | 0.003154 | 0.131786 | 0.002319 | 0.008898 | 4.588101e-02 | 0.193582 | 0.061474 | 0.003065 | 0.064906 | |||||||||||||||
132 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 1.620011e-01 | 0.007848 | 0.000870 | 0.178947 | 0.002844 | 0.090537 | 0.295570 | 0.000968 | 0.003347 | 0.284196 | 1.433937e-02 | 0.244244 | 0.008097 | 0.003807 | ||||||||||||||
133 | class | Betaproteobacteria | 1.217861e-02 | 5.024742e-01 | 0.002611 | 0.006541 | 0.382395 | 0.401655 | 0.236432 | 0.008215 | 0.602869 | 1.409696e-01 | 0.009193 | 0.461739 | 1.209323e-02 | 0.002587 | ||||||||||||||
134 | order | Neisseriales | 0.001191 | 2.413004e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
135 | family | Chromobacteriaceae | 2.413004e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
136 | family | Unclassified Neisseriales | 0.001191 | |||||||||||||||||||||||||||
137 | order | Rhodocyclales | 8.053610e-04 | 0.002611 | 0.003154 | 0.000893 | ||||||||||||||||||||||||
138 | family | Zoogloeaceae | 0.002611 | |||||||||||||||||||||||||||
139 | family | Rhodocyclaceae | 0.000893 | |||||||||||||||||||||||||||
140 | genus | Azospira | 0.000893 | |||||||||||||||||||||||||||
141 | family | Unclassified Rhodocyclales | 8.053610e-04 | 0.003154 | ||||||||||||||||||||||||||
142 | order | Nitrosomonadales | 5.165883e-03 | 0.009131 | 0.003332 | 0.002358 | 0.006257 | 0.006060 | ||||||||||||||||||||||
143 | family | Sterolibacteriaceae | 0.002358 | 0.002358 | ||||||||||||||||||||||||||
144 | genus | Methyloversatilis | 0.002358 | 0.002358 | ||||||||||||||||||||||||||
145 | family | Nitrosomonadaceae | 0.001212 | |||||||||||||||||||||||||||
146 | family | Methylophilaceae | 5.165883e-03 | 0.006773 | 0.006257 | 0.001214 | ||||||||||||||||||||||||
147 | genus | Methylotenera | 1.621770e-03 | 0.000897 | ||||||||||||||||||||||||||
148 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 3.544114e-03 | 0.006773 | 0.005360 | 0.001214 | ||||||||||||||||||||||||
149 | family | Unclassified Nitrosomonadales | 0.003332 | 0.003634 | ||||||||||||||||||||||||||
150 | order | Burkholderiales | 1.217861e-02 | 3.737248e-01 | 0.006541 | 0.323777 | 0.326129 | 0.140166 | 0.008215 | 0.414312 | 1.348372e-01 | 0.007966 | 0.345956 | 4.840113e-03 | ||||||||||||||||
151 | family | Burkholderiaceae | 9.671367e-03 | 0.001680 | 1.567788e-03 | |||||||||||||||||||||||||
152 | genus | Burkholderia | 5.475869e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
153 | genus | Ralstonia | 1.606036e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
154 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 7.517744e-03 | 0.001680 | 1.567788e-03 | |||||||||||||||||||||||||
155 | genus | Rhizobacter | 2.397429e-03 | 0.002595 | 0.001207 | |||||||||||||||||||||||||
156 | species | Rhizobacter gummiphilus | 0.001207 | |||||||||||||||||||||||||||
157 | species | Unclassified Rhizobacter | 2.397429e-03 | 0.002595 | ||||||||||||||||||||||||||
158 | genus | Rubrivivax | 0.003589 | |||||||||||||||||||||||||||
159 | genus | Methylibium | 7.930202e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
160 | genus | Thiomonas | 0.000886 | 0.001193 | ||||||||||||||||||||||||||
161 | family | Alcaligenaceae | 1.097756e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
162 | genus | Mitsuaria | 0.003414 | |||||||||||||||||||||||||||
163 | family | Oxalobacteraceae | 7.302857e-03 | 3.491395e-02 | 0.003925 | 0.030311 | 0.017937 | 0.006885 | 0.004124 | 0.029288 | 5.236171e-02 | 0.007966 | 0.066849 | 4.840113e-03 | ||||||||||||||||
164 | genus | Massilia | 1.645941e-03 | 0.000863 | 1.496932e-03 | 0.001216 | ||||||||||||||||||||||||
165 | genus | Janthinobacterium | 4.868571e-03 | 9.822365e-03 | 0.014604 | 0.005968 | 0.002723 | 0.005153 | 9.490882e-03 | 0.001227 | 0.001216 | 2.420057e-03 | ||||||||||||||||||
166 | genus | Herminiimonas | 0.000866 | |||||||||||||||||||||||||||
167 | genus | Duganella | 1.609157e-03 | 0.000859 | 1.570762e-03 | 0.001212 | ||||||||||||||||||||||||
168 | species | Duganella zoogloeoides | 8.045785e-04 | 1.570762e-03 | 0.001212 | |||||||||||||||||||||||||
169 | species | Unclassified Duganella | 8.045785e-04 | 0.000859 | ||||||||||||||||||||||||||
170 | genus | Herbaspirillum | 0.000852 | 1.567788e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
171 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 2.434286e-03 | 2.183649e-02 | 0.003925 | 0.015708 | 0.011969 | 0.006885 | 0.001401 | 0.020695 | 3.823534e-02 | 0.006739 | 0.063206 | 2.420057e-03 | ||||||||||||||||
172 | family | Comamonadaceae | 1.592782e-01 | 0.155248 | 0.158986 | 0.070323 | 0.001368 | 0.134268 | 1.573748e-03 | 0.149082 | ||||||||||||||||||||
173 | genus | Acidovorax | 7.810518e-04 | 0.003414 | 0.002973 | 0.002352 | ||||||||||||||||||||||||
174 | genus | Ramlibacter | 0.003253 | |||||||||||||||||||||||||||
175 | genus | Caldimonas | 0.000890 | |||||||||||||||||||||||||||
176 | genus | Rhodoferax | 7.922614e-03 | 0.013446 | 0.012154 | 0.009526 | 0.010845 | |||||||||||||||||||||||
177 | species | Rhodoferax saidenbachensis | 0.003203 | |||||||||||||||||||||||||||
178 | species | Rhodoferax koreense | 7.922614e-04 | 0.010243 | 0.000866 | 0.009640 | ||||||||||||||||||||||||
179 | species | Unclassified Rhodoferax | 7.130353e-03 | 0.012154 | 0.008660 | 0.001205 | ||||||||||||||||||||||||
180 | genus | Curvibacter | 1.573748e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
181 | genus | Comamonas | 5.432756e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
182 | genus | Variovorax | 3.159981e-03 | 0.030729 | 0.060638 | 0.012789 | 0.044599 | 0.003615 | ||||||||||||||||||||||
183 | species | Variovorax sp. PAMC 28711 | 0.006214 | |||||||||||||||||||||||||||
184 | species | Variovorax paradoxus | 0.003414 | 0.009346 | 0.000888 | |||||||||||||||||||||||||
185 | species | Unclassified Variovorax | 3.159981e-03 | 0.027315 | 0.054424 | 0.003443 | 0.043710 | 0.003615 | ||||||||||||||||||||||
186 | genus | Hydrogenophaga | 0.003359 | |||||||||||||||||||||||||||
187 | genus | Polaromonas | 8.537413e-03 | 0.013657 | 0.006490 | 0.001368 | 0.001789 | 0.004820 | ||||||||||||||||||||||
188 | species | Polaromonas sp. CF318 | 0.001368 | |||||||||||||||||||||||||||
189 | species | Polaromonas naphthalenivorans | 0.001205 | |||||||||||||||||||||||||||
190 | species | Polaromonas sp. JS666 | 0.000895 | |||||||||||||||||||||||||||
191 | species | Unclassified Polaromonas | 8.537413e-03 | 0.013657 | 0.006490 | 0.000894 | 0.003615 | |||||||||||||||||||||||
192 | genus | Limnohabitans | 0.001205 | |||||||||||||||||||||||||||
193 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 1.383339e-01 | 0.090642 | 0.076730 | 0.054280 | 0.077464 | 0.126245 | ||||||||||||||||||||||
194 | genus | Leptothrix | 0.001769 | |||||||||||||||||||||||||||
195 | genus | Roseateles | 0.000871 | |||||||||||||||||||||||||||
196 | family | Unclassified Burkholderiales | 4.875749e-03 | 1.655730e-01 | 0.002616 | 0.134804 | 0.149206 | 0.062957 | 0.002723 | 0.242955 | 7.933391e-02 | 0.124036 | ||||||||||||||||||
197 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 1.227782e-01 | 0.049487 | 0.072194 | 0.090753 | 0.181407 | 6.132414e-03 | 0.001227 | 0.108531 | 4.840113e-03 | 0.002587 | ||||||||||||||||||
198 | class | Deltaproteobacteria | 1.001065e-03 | 0.027065 | 0.027065 | 0.001783 | 6.973639e-03 | 0.013282 | ||||||||||||||||||||||
199 | order | Myxococcales | 0.020305 | 0.020305 | 0.001783 | 6.973639e-03 | 0.007242 | |||||||||||||||||||||||
200 | family | Sandaracinaceae | 0.000892 | 2.764011e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
201 | genus | Sandaracinus | 0.000892 | |||||||||||||||||||||||||||
202 | genus | Unclassified Sandaracinaceae | 2.764011e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
203 | family | Anaeromyxobacteraceae | 0.002225 | 0.002225 | ||||||||||||||||||||||||||
204 | genus | Anaeromyxobacter | 0.002225 | 0.002225 | ||||||||||||||||||||||||||
205 | family | Labilitrichaceae | 0.004535 | 0.004535 | ||||||||||||||||||||||||||
206 | family | Archangiaceae | 0.002225 | 0.002225 | ||||||||||||||||||||||||||
207 | family | Polyangiaceae | 4.209628e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
208 | genus | Sorangium | 2.796972e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
209 | genus | Unclassified Polyangiaceae | 1.412656e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
210 | family | Unclassified Myxococcales | 0.011319 | 0.011319 | 0.000891 | 8.673617e-19 | 0.007242 | |||||||||||||||||||||||
211 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 1.001065e-03 | 0.006760 | 0.006760 | 0.006039 | ||||||||||||||||||||||||
212 | class | Unclassified Proteobacteria | 4.180092e-01 | 0.002004 | 0.002621 | 0.003923 | 0.228685 | 0.137711 | 0.231391 | 0.005298 | 0.002206 | 0.408007 | 3.400112e-02 | 0.001807 | 0.004273 | 0.386685 | 0.046600 | 0.001304 | 0.006347 | |||||||||||
213 | phylum | Firmicutes | 2.087954e-03 | 0.005841 | 0.003590 | 1.955476e-03 | 0.007218 | 0.017763 | ||||||||||||||||||||||
214 | class | Bacilli | 0.005841 | 0.000899 | 1.955476e-03 | 0.002403 | 0.001262 | |||||||||||||||||||||||
215 | order | Bacillales | 0.005841 | 0.000899 | ||||||||||||||||||||||||||
216 | family | Paenibacillaceae | 0.005841 | |||||||||||||||||||||||||||
217 | family | Alicyclobacillaceae | 0.000899 | |||||||||||||||||||||||||||
218 | order | Unclassified Bacilli | 1.955476e-03 | 0.002403 | 0.001262 | |||||||||||||||||||||||||
219 | class | Unclassified Firmicutes | 2.087954e-03 | 0.002691 | 0.004815 | 0.016501 | ||||||||||||||||||||||||
220 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.002413 | 0.002413 | 0.001198 | |||||||||||||||||||||||||
221 | class | Deinococci | 0.002413 | 0.002413 | ||||||||||||||||||||||||||
222 | class | Unclassified Deinococcus-Thermus | 0.001198 | |||||||||||||||||||||||||||
223 | phylum | Chloroflexi | 0.004114 | |||||||||||||||||||||||||||
224 | class | Chloroflexia | 0.001028 | |||||||||||||||||||||||||||
225 | order | Chloroflexales | 0.001028 | |||||||||||||||||||||||||||
226 | family | Roseiflexaceae | 0.001028 | |||||||||||||||||||||||||||
227 | class | Unclassified Chloroflexi | 0.003085 | |||||||||||||||||||||||||||
228 | phylum | Actinobacteria | 4.649855e-03 | 2.045299e-01 | 0.001214 | 0.238084 | 0.235193 | 0.284615 | 0.275997 | 4.272951e-02 | 0.000612 | 0.429694 | 2.318418e-03 | |||||||||||||||||
229 | class | Thermoleophilia | 0.005125 | 0.005125 | 0.002410 | |||||||||||||||||||||||||
230 | order | Solirubrobacterales | 0.005125 | 0.005125 | ||||||||||||||||||||||||||
231 | family | Conexibacteraceae | 0.005125 | 0.005125 | ||||||||||||||||||||||||||
232 | order | Unclassified Thermoleophilia | 0.002410 | |||||||||||||||||||||||||||
233 | class | Actinobacteria | 2.324927e-03 | 1.856547e-01 | 0.001214 | 0.184168 | 0.176598 | 0.227643 | 0.207215 | 3.879088e-02 | 0.000612 | 0.341871 | ||||||||||||||||||
234 | order | Geodermatophilales | 8.295665e-04 | 0.003245 | ||||||||||||||||||||||||||
235 | family | Geodermatophilaceae | 8.295665e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
236 | family | Unclassified Geodermatophilales | 0.003245 | |||||||||||||||||||||||||||
237 | order | Nakamurellales | 1.742949e-03 | 0.006885 | 0.001727 | 0.001214 | ||||||||||||||||||||||||
238 | family | Nakamurellaceae | 1.742949e-03 | 0.003443 | 0.001727 | |||||||||||||||||||||||||
239 | genus | Nakamurella | 8.714746e-04 | 0.003443 | 0.001727 | |||||||||||||||||||||||||
240 | species | Nakamurella multipartita | 0.003443 | 0.000863 | ||||||||||||||||||||||||||
241 | species | Unclassified Nakamurella | 8.714746e-04 | 0.000863 | ||||||||||||||||||||||||||
242 | genus | Unclassified Nakamurellaceae | 8.714746e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
243 | family | Unclassified Nakamurellales | 0.003443 | 0.001214 | ||||||||||||||||||||||||||
244 | order | Kineosporiales | 0.000841 | |||||||||||||||||||||||||||
245 | family | Kineosporiaceae | 0.000841 | |||||||||||||||||||||||||||
246 | order | Micrococcales | 5.539444e-03 | 0.006185 | 0.006123 | 0.017185 | 0.004240 | 3.828243e-03 | 0.007281 | |||||||||||||||||||||
247 | family | Micrococcaceae | 0.003253 | |||||||||||||||||||||||||||
248 | genus | Pseudarthrobacter | 0.003253 | |||||||||||||||||||||||||||
249 | family | Cellulomonadaceae | 5.486754e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
250 | family | Promicromonosporaceae | 1.893210e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
251 | family | Microbacteriaceae | 1.030979e-03 | 0.003038 | 0.006885 | 1.297546e-03 | 0.004866 | |||||||||||||||||||||||
252 | genus | Microbacterium | 1.030979e-03 | 0.006885 | 1.297546e-03 | 0.002431 | ||||||||||||||||||||||||
253 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 0.003038 | 0.002435 | ||||||||||||||||||||||||||
254 | family | Unclassified Micrococcales | 2.066579e-03 | 0.003147 | 0.002870 | 0.010300 | 0.004240 | 2.530697e-03 | 0.002415 | |||||||||||||||||||||
255 | order | Corynebacteriales | 3.474046e-02 | 0.025954 | 0.057008 | 0.029050 | 0.072395 | 2.759405e-03 | 0.041008 | |||||||||||||||||||||
256 | family | Mycobacteriaceae | 1.384134e-02 | 0.027206 | 0.018153 | 0.013306 | ||||||||||||||||||||||||
257 | genus | Mycobacterium | 8.621362e-03 | 0.015144 | 0.011194 | 0.006034 | ||||||||||||||||||||||||
258 | genus | Hoyosella | 0.000864 | |||||||||||||||||||||||||||
259 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 5.219975e-03 | 0.012062 | 0.006095 | 0.007272 | ||||||||||||||||||||||||
260 | family | Nocardiaceae | 8.321405e-03 | 0.010186 | 0.017358 | 0.010186 | 0.026358 | 2.759405e-03 | 0.010829 | |||||||||||||||||||||
261 | genus | Nocardia | 0.001752 | 2.759405e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
262 | genus | Rhodococcus | 3.887090e-03 | 0.010186 | 0.017358 | 0.010186 | 0.020230 | 0.006016 | ||||||||||||||||||||||
263 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 4.434315e-03 | 0.004376 | 0.004813 | |||||||||||||||||||||||||
264 | family | Gordoniaceae | 1.117043e-03 | 0.000883 | ||||||||||||||||||||||||||
265 | genus | Gordonia | 0.000883 | |||||||||||||||||||||||||||
266 | genus | Unclassified Gordoniaceae | 1.117043e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
267 | family | Unclassified Corynebacteriales | 1.146068e-02 | 0.015768 | 0.012444 | 0.018864 | 0.027002 | 0.016872 | ||||||||||||||||||||||
268 | order | Micromonosporales | 4.058514e-03 | 0.003016 | 0.006507 | 0.000881 | 0.002419 | |||||||||||||||||||||||
269 | family | Micromonosporaceae | 3.077609e-03 | 0.003016 | 0.006507 | 0.000881 | 0.001205 | |||||||||||||||||||||||
270 | genus | Actinoplanes | 2.051739e-03 | 0.006507 | ||||||||||||||||||||||||||
271 | genus | Unclassified Micromonosporaceae | 1.025870e-03 | 0.003016 | 0.000881 | 0.001205 | ||||||||||||||||||||||||
272 | family | Unclassified Micromonosporales | 9.809049e-04 | 0.001214 | ||||||||||||||||||||||||||
273 | order | Propionibacteriales | 4.572474e-02 | 0.003203 | 0.079433 | 0.003443 | 0.014553 | 1.176940e-02 | 0.003658 | |||||||||||||||||||||
274 | family | Propionibacteriaceae | 1.744785e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
275 | family | Nocardioidaceae | 3.796932e-02 | 0.003203 | 0.046935 | 0.003443 | 0.013709 | 8.419295e-03 | ||||||||||||||||||||||
276 | genus | Kribbella | 0.003107 | |||||||||||||||||||||||||||
277 | genus | Nocardioides | 3.124054e-03 | 0.002812 | 0.004344 | 2.879347e-03 | ||||||||||||||||||||||||
278 | genus | Aeromicrobium | 2.981567e-03 | 0.003407 | 1.388960e-03 | |||||||||||||||||||||||||
279 | genus | Pimelobacter | 2.093233e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
280 | genus | Unclassified Nocardioidaceae | 2.977047e-02 | 0.003203 | 0.041017 | 0.003443 | 0.005958 | 4.150988e-03 | ||||||||||||||||||||||
281 | family | Unclassified Propionibacteriales | 6.010630e-03 | 0.032498 | 0.000844 | 3.350102e-03 | 0.003658 | |||||||||||||||||||||||
282 | order | Pseudonocardiales | 6.052054e-03 | 1.415070e-03 | 0.001226 | |||||||||||||||||||||||||
283 | family | Pseudonocardiaceae | 5.036253e-03 | 0.001226 | ||||||||||||||||||||||||||
284 | genus | Lentzea | 0.001226 | |||||||||||||||||||||||||||
285 | genus | Pseudonocardia | 3.032524e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
286 | genus | Actinomycetospora | 1.015802e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
287 | genus | Actinoalloteichus | 9.879268e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
288 | family | Unclassified Pseudonocardiales | 1.015802e-03 | 1.415070e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
289 | order | Streptomycetales | 4.265092e-03 | 0.006988 | 0.006988 | 2.872974e-03 | 0.001214 | |||||||||||||||||||||||
290 | family | Streptomycetaceae | 2.016753e-03 | 0.002338 | 0.002338 | |||||||||||||||||||||||||
291 | genus | Streptomyces | 5.355454e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
292 | genus | Unclassified Streptomycetaceae | 1.481208e-03 | 0.002338 | 0.002338 | |||||||||||||||||||||||||
293 | family | Unclassified Streptomycetales | 2.248338e-03 | 0.004650 | 0.004650 | 2.872974e-03 | 0.001214 | |||||||||||||||||||||||
294 | order | Streptosporangiales | 1.426387e-03 | 2.782587e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
295 | family | Streptosporangiaceae | 1.426387e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
296 | genus | Streptosporangium | 5.447051e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
297 | genus | Unclassified Streptosporangiaceae | 8.816818e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
298 | family | Nocardiopsaceae | 2.782587e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
299 | order | Frankiales | 0.000836 | 0.001350 | ||||||||||||||||||||||||||
300 | family | Frankiaceae | 0.000836 | |||||||||||||||||||||||||||
301 | family | Unclassified Frankiales | 0.001350 | |||||||||||||||||||||||||||
302 | order | Unclassified Actinobacteria | 2.324927e-03 | 8.127548e-02 | 0.001214 | 0.135576 | 0.027527 | 0.164091 | 0.111743 | 1.336320e-02 | 0.000612 | 0.282500 | ||||||||||||||||||
303 | class | Acidimicrobiia | 0.006718 | |||||||||||||||||||||||||||
304 | class | Unclassified Actinobacteria | 2.324927e-03 | 1.887516e-02 | 0.048791 | 0.058595 | 0.045130 | 0.068783 | 3.938629e-03 | 0.085413 | 2.318418e-03 | |||||||||||||||||||
305 | phylum | Planctomycetes | 8.669199e-03 | 0.003741 | 0.007525 | 0.004497 | 0.013903 | |||||||||||||||||||||||
306 | class | Planctomycetia | 6.730315e-03 | 0.001485 | 0.001485 | 0.003361 | 0.011431 | |||||||||||||||||||||||
307 | order | Planctomycetales | 5.756333e-03 | 0.001485 | 0.001485 | 0.002226 | 0.011431 | |||||||||||||||||||||||
308 | family | Planctomycetaceae | 3.848504e-03 | 0.001485 | 0.001485 | 0.001143 | 0.001302 | |||||||||||||||||||||||
309 | genus | Schlesneria | 9.570953e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
310 | genus | Unclassified Planctomycetaceae | 2.891408e-03 | 0.001485 | 0.001485 | 0.001143 | 0.001302 | |||||||||||||||||||||||
311 | family | Isosphaeraceae | 9.429267e-04 | 0.001082 | ||||||||||||||||||||||||||
312 | family | Gemmataceae | 0.001270 | |||||||||||||||||||||||||||
313 | family | Unclassified Planctomycetales | 9.649024e-04 | 0.008859 | ||||||||||||||||||||||||||
314 | order | Unclassified Planctomycetia | 9.739822e-04 | 0.001136 | ||||||||||||||||||||||||||
315 | class | Unclassified Planctomycetes | 1.938885e-03 | 0.002256 | 0.006040 | 0.001136 | 0.002472 | |||||||||||||||||||||||
316 | phylum | Spirochaetes | 0.002831 | 0.004826 | 0.002601 | |||||||||||||||||||||||||
317 | class | Spirochaetia | 0.000867 | |||||||||||||||||||||||||||
318 | family | Leptospiraceae | 0.000867 | |||||||||||||||||||||||||||
319 | class | Unclassified Spirochaetes | 0.002831 | 0.004826 | 0.001734 | |||||||||||||||||||||||||
320 | phylum | Lentisphaerae | 0.000871 | |||||||||||||||||||||||||||
321 | phylum | Nitrospirae | 0.001364 | |||||||||||||||||||||||||||
322 | phylum | Acidobacteria | 2.939233e-03 | 0.002711 | 0.006973 | 0.003503 | ||||||||||||||||||||||||
323 | class | Acidobacteriia | 0.006973 | 0.003503 | ||||||||||||||||||||||||||
324 | order | Acidobacteriales | 0.006973 | 0.003503 | ||||||||||||||||||||||||||
325 | family | Acidobacteriaceae | 0.005810 | 0.003503 | ||||||||||||||||||||||||||
326 | genus | Granulicella | 0.001163 | |||||||||||||||||||||||||||
327 | species | Granulicella mallensis | 0.001163 | |||||||||||||||||||||||||||
328 | genus | Unclassified Acidobacteriaceae | 0.004648 | 0.003503 | ||||||||||||||||||||||||||
329 | family | Unclassified Acidobacteriales | 0.001163 | |||||||||||||||||||||||||||
330 | class | Solibacteres | 2.939233e-03 | 0.000904 | ||||||||||||||||||||||||||
331 | order | Solibacterales | 1.959489e-03 | 0.000904 | ||||||||||||||||||||||||||
332 | family | Solibacteraceae | 0.000904 | |||||||||||||||||||||||||||
333 | genus | Candidatus Solibacter | 0.000904 | |||||||||||||||||||||||||||
334 | family | Unclassified Solibacterales | 1.959489e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
335 | order | Unclassified Solibacteres | 9.797443e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
336 | class | Unclassified Acidobacteria | 0.001808 | |||||||||||||||||||||||||||
337 | phylum | Armatimonadetes | 0.004010 | 0.001251 | ||||||||||||||||||||||||||
338 | class | Chthonomonadetes | 0.001251 | |||||||||||||||||||||||||||
339 | order | Chthonomonadales | 0.001251 | |||||||||||||||||||||||||||
340 | family | Chthonomonadaceae | 0.001251 | |||||||||||||||||||||||||||
341 | class | Fimbriimonadia | 0.004010 | |||||||||||||||||||||||||||
342 | phylum | Verrucomicrobia | 1.156778e-02 | 0.034602 | 0.031331 | 0.003936 | 0.067737 | 0.064621 | 0.041789 | |||||||||||||||||||||
343 | class | Spartobacteria | 1.810370e-03 | 0.003359 | 0.001312 | 0.003599 | 0.004799 | 0.004690 | ||||||||||||||||||||||
344 | order | Chthoniobacterales | 1.206913e-03 | 0.001312 | 0.003599 | 0.004799 | 0.004690 | |||||||||||||||||||||||
345 | family | Chthoniobacteraceae | 1.206913e-03 | 0.003599 | 0.003599 | 0.003518 | ||||||||||||||||||||||||
346 | genus | Chthoniobacter | 6.034567e-04 | 0.002400 | 0.002400 | 0.001173 | ||||||||||||||||||||||||
347 | genus | Unclassified Chthoniobacteraceae | 6.034567e-04 | 0.001200 | 0.001200 | 0.002345 | ||||||||||||||||||||||||
348 | family | Unclassified Chthoniobacterales | 0.001312 | 0.001200 | 0.001173 | |||||||||||||||||||||||||
349 | order | Unclassified Spartobacteria | 6.034567e-04 | 0.003359 | ||||||||||||||||||||||||||
350 | class | Verrucomicrobiae | 6.873551e-03 | 0.009609 | 0.010328 | 0.007220 | 0.008220 | 0.020779 | ||||||||||||||||||||||
351 | order | Verrucomicrobiales | 3.942300e-03 | 0.009609 | 0.010328 | 0.006016 | 0.007046 | 0.017153 | ||||||||||||||||||||||
352 | family | Verrucomicrobia subdivision 3 | 0.002349 | |||||||||||||||||||||||||||
353 | family | Rubritaleaceae | 0.002494 | |||||||||||||||||||||||||||
354 | family | Verrucomicrobiaceae | 2.956725e-03 | 0.009609 | 0.010328 | 0.006016 | 0.005871 | 0.004950 | ||||||||||||||||||||||
355 | genus | Verrucomicrobium | 0.003443 | 0.002349 | 0.001237 | |||||||||||||||||||||||||
356 | genus | Unclassified Verrucomicrobiaceae | 2.956725e-03 | 0.009609 | 0.006885 | 0.006016 | 0.003523 | 0.003712 | ||||||||||||||||||||||
357 | family | Unclassified Verrucomicrobiales | 9.855750e-04 | 0.001174 | 0.007361 | |||||||||||||||||||||||||
358 | order | Unclassified Verrucomicrobiae | 2.931251e-03 | 0.001203 | 0.001174 | 0.003626 | ||||||||||||||||||||||||
359 | class | Opitutae | 9.472414e-04 | 0.005904 | 0.008260 | 0.010344 | 0.010392 | |||||||||||||||||||||||
360 | order | Opitutales | 9.472414e-04 | 0.005904 | 0.007064 | 0.007959 | 0.007996 | |||||||||||||||||||||||
361 | family | Opitutaceae | 9.472414e-04 | 0.005904 | 0.002354 | 0.005687 | 0.007996 | |||||||||||||||||||||||
362 | genus | Opitutus | 9.472414e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
363 | genus | Lacunisphaera | 0.005904 | |||||||||||||||||||||||||||
364 | species | Opitutaceae bacterium TAV5 | 0.001136 | |||||||||||||||||||||||||||
365 | genus | Unclassified Opitutaceae | 0.002354 | 0.004552 | 0.007996 | |||||||||||||||||||||||||
366 | family | Unclassified Opitutales | 0.004710 | 0.002271 | ||||||||||||||||||||||||||
367 | order | Puniceicoccales | 0.001196 | 0.001193 | 0.002396 | |||||||||||||||||||||||||
368 | family | Puniceicoccaceae | 0.001196 | 0.001193 | 0.001198 | |||||||||||||||||||||||||
369 | genus | Coraliomargarita | 0.001196 | |||||||||||||||||||||||||||
370 | genus | Unclassified Puniceicoccaceae | 0.001193 | 0.001198 | ||||||||||||||||||||||||||
371 | family | Unclassified Puniceicoccales | 0.001198 | |||||||||||||||||||||||||||
372 | order | Unclassified Opitutae | 0.001193 | |||||||||||||||||||||||||||
373 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 1.936617e-03 | 0.015730 | 0.021003 | 0.002624 | 0.048658 | 0.041258 | 0.005928 | |||||||||||||||||||||
374 | phylum | Bacteroidetes | 2.389946e-01 | 0.073130 | 0.170416 | 0.124241 | 0.011210 | 0.240833 | 0.078194 | 0.001682 | 0.006689 | |||||||||||||||||||
375 | order | Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.002586 | |||||||||||||||||||||||||||
376 | family | Rhodothermaceae | 0.002586 | |||||||||||||||||||||||||||
377 | class | Flavobacteriia | 4.151162e-02 | 0.019854 | 0.009812 | 0.030453 | 0.001203 | |||||||||||||||||||||||
378 | order | Flavobacteriales | 4.151162e-02 | 0.019854 | 0.008377 | 0.029583 | 0.001203 | |||||||||||||||||||||||
379 | family | Flavobacteriaceae | 3.958020e-02 | 0.019854 | 0.008377 | 0.027843 | 0.001203 | |||||||||||||||||||||||
380 | genus | Flavobacterium | 3.315111e-02 | 0.019854 | 0.008377 | 0.026104 | ||||||||||||||||||||||||
381 | species | Flavobacterium sp. CF136 | 6.433072e-04 | 0.008492 | ||||||||||||||||||||||||||
382 | species | Flavobacterium gilvum | 0.001377 | |||||||||||||||||||||||||||
383 | species | Unclassified Flavobacterium | 3.250781e-02 | 0.011362 | 0.007000 | 0.026104 | ||||||||||||||||||||||||
384 | genus | Unclassified Flavobacteriaceae | 6.429086e-03 | 0.001739 | 0.001203 | |||||||||||||||||||||||||
385 | family | Unclassified Flavobacteriales | 1.931422e-03 | 0.001739 | ||||||||||||||||||||||||||
386 | order | Unclassified Flavobacteriia | 0.001435 | 0.000871 | ||||||||||||||||||||||||||
387 | class | Sphingobacteriia | 3.213044e-03 | 0.005740 | 0.054833 | 0.010328 | 0.001398 | 0.024443 | 0.009626 | |||||||||||||||||||||
388 | order | Sphingobacteriales | 1.928426e-03 | 0.005740 | 0.054833 | 0.010328 | 0.001398 | 0.018340 | 0.008423 | |||||||||||||||||||||
389 | family | Sphingobacteriaceae | 1.928426e-03 | 0.005740 | 0.048998 | 0.010328 | 0.001398 | 0.013967 | 0.008423 | |||||||||||||||||||||
390 | genus | Sphingobacterium | 0.006122 | |||||||||||||||||||||||||||
391 | genus | Mucilaginibacter | 1.284618e-03 | 0.006885 | 0.002627 | |||||||||||||||||||||||||
392 | genus | Pedobacter | 0.018388 | 0.002622 | ||||||||||||||||||||||||||
393 | species | Pedobacter sp. BAL39 | 0.003061 | |||||||||||||||||||||||||||
394 | species | Unclassified Pedobacter | 0.015327 | 0.002622 | ||||||||||||||||||||||||||
395 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 6.438074e-04 | 0.005740 | 0.024488 | 0.003443 | 0.001398 | 0.008718 | 0.008423 | |||||||||||||||||||||
396 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.005835 | 0.004373 | ||||||||||||||||||||||||||
397 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 1.284618e-03 | 0.006103 | 0.001203 | |||||||||||||||||||||||||
398 | class | Chitinophagia | 2.677043e-02 | 0.008670 | 0.014482 | 0.010328 | 0.019978 | 0.003610 | ||||||||||||||||||||||
399 | order | Chitinophagales | 2.104038e-02 | 0.008670 | 0.014482 | 0.010328 | 0.015629 | 0.003610 | ||||||||||||||||||||||
400 | family | Chitinophagaceae | 1.720783e-02 | 0.008670 | 0.011671 | 0.010328 | 0.010422 | 0.003610 | ||||||||||||||||||||||
401 | genus | Niastella | 6.286550e-04 | 0.003038 | 0.001747 | 0.001203 | ||||||||||||||||||||||||
402 | genus | Niabella | 1.275712e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
403 | genus | Segetibacter | 1.916521e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
404 | genus | Filimonas | 0.002812 | |||||||||||||||||||||||||||
405 | genus | Chitinophaga | 6.354088e-04 | 0.005821 | ||||||||||||||||||||||||||
406 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 1.275153e-02 | 0.008670 | 0.010328 | 0.008676 | 0.002407 | |||||||||||||||||||||||
407 | family | Unclassified Chitinophagales | 3.832551e-03 | 0.002812 | 0.005207 | |||||||||||||||||||||||||
408 | order | Unclassified Chitinophagia | 5.730055e-03 | 0.004348 | ||||||||||||||||||||||||||
409 | class | Bacteroidia | 0.001682 | |||||||||||||||||||||||||||
410 | order | Bacteroidales | 0.001682 | |||||||||||||||||||||||||||
411 | class | Cytophagia | 1.084559e-01 | 0.041615 | 0.069182 | 0.048500 | 0.095389 | 0.027728 | ||||||||||||||||||||||
412 | order | Cytophagales | 9.510848e-02 | 0.041615 | 0.060133 | 0.048500 | 0.086715 | 0.025321 | ||||||||||||||||||||||
413 | family | Hymenobacteraceae | 6.423092e-04 | 0.034679 | 0.034679 | 0.010861 | ||||||||||||||||||||||||
414 | genus | Rufibacter | 6.423092e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
415 | genus | Hymenobacter | 0.018496 | 0.018496 | 0.004827 | |||||||||||||||||||||||||
416 | species | Hymenobacter sp. PAMC 26628 | 0.002312 | 0.002312 | ||||||||||||||||||||||||||
417 | species | Unclassified Hymenobacter | 0.016184 | 0.016184 | 0.004827 | |||||||||||||||||||||||||
418 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.016184 | 0.016184 | 0.006034 | |||||||||||||||||||||||||
419 | family | Cytophagaceae | 8.564481e-02 | 0.054101 | 0.065011 | 0.007220 | ||||||||||||||||||||||||
420 | genus | Spirosoma | 6.164859e-03 | 0.002605 | 0.006016 | |||||||||||||||||||||||||
421 | genus | Dyadobacter | 1.143729e-02 | 0.018098 | 0.021653 | |||||||||||||||||||||||||
422 | species | Dyadobacter fermentans | 6.473306e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
423 | species | Unclassified Dyadobacter | 1.078996e-02 | 0.018098 | 0.021653 | |||||||||||||||||||||||||
424 | genus | Rudanella | 6.229794e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
425 | genus | Fibrisoma | 6.310505e-04 | |||||||||||||||||||||||||||
426 | genus | Unclassified Cytophagaceae | 6.678863e-02 | 0.036003 | 0.040753 | 0.001203 | ||||||||||||||||||||||||
427 | family | Unclassified Cytophagales | 8.821362e-03 | 0.006936 | 0.006033 | 0.013821 | 0.021704 | 0.007241 | ||||||||||||||||||||||
428 | order | Unclassified Cytophagia | 1.334741e-02 | 0.009049 | 0.008674 | 0.002407 | ||||||||||||||||||||||||
429 | class | Unclassified Bacteroidetes | 5.904358e-02 | 0.017105 | 0.012065 | 0.055084 | 0.070570 | 0.036027 | 0.004102 | |||||||||||||||||||||
430 | phylum | Unclassified Bacteria | 3.469447e-18 | 3.217350e-01 | 0.000899 | 0.001346 | 0.500507 | 0.055177 | 0.581175 | 0.025199 | 0.000735 | 0.190566 | 1.892580e-02 | 0.000942 | 0.794589 | 0.089577 | 0.001389 | 3.469447e-18 | 0.028696 | |||||||||||
431 | superkingdom | Archaea | 1.033552e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
432 | phylum | Euryarchaeota | 1.033552e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
433 | superkingdom | Unclassified | 4.440892e-16 | 0.004824 | 0.002536 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NapA | 0.03370 | 34 | 93.94 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapB | 0.02532 | 7 | 91.79 | Periplasmic nitrate reductase cytochrome c550-type subunit |
NapC | 0.03482 | 12 | 92.58 | Cytochrome c-type protein NapC |
NapE | 0.01681 | 3 | 73.77 | Periplasmic nitrate reductase component NapE |
NapF | 0.02065 | 6 | 70.65 | Ferredoxin-type protein NapF (periplasmic nitrate reductase) |
NapG | 0.00525 | 2 | 95.45 | Ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase) |
NapH | 0.00228 | 1 | 95.90 | Polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.06703 | 98 | 97.14 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.06270 | 42 | 96.46 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.06756 | 24 | 96.67 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.02988 | 11 | 91.22 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 2.62523 | 3094 | 84.70 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.48957 | 321 | 83.40 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.00748 | 5 | 91.28 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NifD_AnfD_VnfD | 0.00771 | 5 | 90.96 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NifH_AnfH_VnfH | 0.01156 | 5 | 93.82 | Nitrogenase reductase and maturation protein NifH/AnfH/VnfH |
NifK_AnfK_VnfK | 0.00596 | 4 | 90.73 | Nitrogenase beta chain (EC 1.18.6.1) NifK/AnfK/VnfK |
NirA | 0.22024 | 166 | 78.81 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 2.69942 | 2762 | 90.03 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 1.86035 | 503 | 85.54 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.29043 | 178 | 88.03 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirU | 0.21359 | 149 | 83.75 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.01265 | 11 | 85.99 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfA | 0.00464 | 3 | 77.47 | nrfA; nitrite reductase (cytochrome c-552) [EC:1.7.2.2] |
NrfH | 0.01293 | 4 | 81.80 | nrfH; cytochrome c nitrite reductase small subunit |
UreA | 1.90873 | 446 | 90.58 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 1.98188 | 470 | 86.69 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 2.61804 | 1907 | 92.94 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.00782 | 2 | 56.65 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.05222 | 45 | 85.48 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.01757 | 7 | 79.94 |
Denitrification | 0.36311 | 236 | 87.18 |
Nitrate assimilatory reduction | 3.11480 | 3415 | 84.58 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.36599 | 240 | 94.89 |
Nitrite assimilation | 4.99361 | 3580 | 88.62 |
Nitrogen fixation | 0.03271 | 19 | 91.75 |
Urease | 6.50865 | 2823 | 91.53 |
NapC | NarJ | NasA | NapG | NapH | NifH_AnfH_VnfH | NarH_NxrB | NapA | NifK_AnfK_VnfK | NrfH | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NapF | NirD | UreA | NirK | cNor-C | NosZ | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapE | NapB | NrfA | NarI | NifB | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.034821 | 0.029880 | 2.625227 | 0.005246 | 0.00228 | 0.011560 | 0.062701 | 0.033702 | 0.005963 | 0.012928 | 0.007707 | 1.981882 | 0.020649 | 1.860351 | 1.908732 | 0.290427 | 0.007821 | 0.012646 | 2.699418 | 0.489572 | 6.702907e-02 | 0.052220 | 2.618040 | 0.220244 | 0.016806 | 2.531538e-02 | 0.004640 | 0.067560 | 0.007482 | 0.213593 |
2 | norank | Unknown | 0.001241 | 0.010961 | 0.004568 | 0.008186 | ||||||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.034821 | 0.029880 | 2.623986 | 0.005246 | 0.00228 | 0.011560 | 0.062701 | 0.033702 | 0.005963 | 0.012928 | 0.007707 | 1.958481 | 0.020649 | 1.860351 | 1.904164 | 0.290427 | 0.007821 | 0.012646 | 2.699418 | 0.489572 | 6.702907e-02 | 0.052220 | 2.607105 | 0.216006 | 0.016806 | 2.531538e-02 | 0.004640 | 0.067560 | 0.007482 | 0.213593 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.004326 | 0.004214 | 0.000987 | |||||||||||||||||||||||||||
5 | phylum | Proteobacteria | 0.034821 | 0.029880 | 1.834895 | 0.005246 | 0.00228 | 0.011560 | 0.058458 | 0.032629 | 0.004476 | 0.004655 | 1.499584 | 0.020649 | 1.423502 | 1.284289 | 0.047464 | 0.005417 | 2.069747 | 0.439766 | 6.359504e-02 | 0.019760 | 1.844683 | 0.135285 | 0.016806 | 2.531538e-02 | 0.002994 | 0.067560 | 0.004510 | 0.162318 | ||
6 | class | Gammaproteobacteria | 0.003007 | 0.026995 | 0.160853 | 0.005246 | 0.00228 | 0.050961 | 0.007926 | 0.161210 | 0.007035 | 0.197740 | 0.135245 | 0.001534 | 0.251007 | 0.049497 | 4.227212e-02 | 0.203343 | 1.103155e-02 | 0.056344 | ||||||||||||
7 | order | Methylococcales | 0.000617 | |||||||||||||||||||||||||||||
8 | family | Methylococcaceae | 0.000617 | |||||||||||||||||||||||||||||
9 | order | Oceanospirillales | 0.004332 | 0.007215 | ||||||||||||||||||||||||||||
10 | family | Halomonadaceae | 0.004332 | 0.003607 | ||||||||||||||||||||||||||||
11 | family | Unclassified Oceanospirillales | 0.003607 | |||||||||||||||||||||||||||||
12 | order | Aeromonadales | 0.000961 | |||||||||||||||||||||||||||||
13 | family | Aeromonadaceae | 0.000961 | |||||||||||||||||||||||||||||
14 | genus | Aeromonas | 0.000961 | |||||||||||||||||||||||||||||
15 | order | Cellvibrionales | 0.000612 | 0.004353 | 0.002924 | |||||||||||||||||||||||||||
16 | family | Cellvibrionaceae | 0.000612 | 0.004353 | 0.002924 | |||||||||||||||||||||||||||
17 | genus | Cellvibrio | 0.000612 | 0.004353 | 0.002924 | |||||||||||||||||||||||||||
18 | order | Nevskiales | 0.000913 | 0.001459 | 0.001534 | 0.001930 | 0.001459 | |||||||||||||||||||||||||
19 | family | Sinobacteraceae | 0.000913 | 0.001534 | 0.001930 | |||||||||||||||||||||||||||
20 | genus | Hydrocarboniphaga | 0.001930 | |||||||||||||||||||||||||||||
21 | genus | Unclassified Sinobacteraceae | 0.000913 | 0.001534 | ||||||||||||||||||||||||||||
22 | family | Unclassified Nevskiales | 0.001459 | 0.001459 | ||||||||||||||||||||||||||||
23 | order | Pseudomonadales | 0.074150 | 0.000987 | 0.156878 | 0.066163 | 0.135245 | 0.103028 | 0.005421 | 0.189579 | ||||||||||||||||||||||
24 | family | Pseudomonadaceae | 0.066941 | 0.000987 | 0.156878 | 0.053702 | 0.130677 | 0.095168 | 0.003614 | 0.177144 | ||||||||||||||||||||||
25 | genus | Pseudomonas | 0.033382 | 0.000987 | 0.116079 | 0.028805 | 0.094133 | 0.073788 | 0.003614 | 0.101458 | ||||||||||||||||||||||
26 | species | Pseudomonas sp. GM80 | 0.000918 | 0.004523 | ||||||||||||||||||||||||||||
27 | species | Pseudomonas donghuensis | 0.000678 | |||||||||||||||||||||||||||||
28 | species | Unclassified Pseudomonas | 0.031786 | 0.000987 | 0.111556 | 0.028805 | 0.094133 | 0.073788 | 0.003614 | 0.101458 | ||||||||||||||||||||||
29 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 0.033558 | 0.040799 | 0.024897 | 0.036544 | 0.021380 | 0.075685 | ||||||||||||||||||||||||
30 | family | Unclassified Pseudomonadales | 0.007210 | 0.012462 | 0.004568 | 0.007860 | 0.001807 | 0.012435 | ||||||||||||||||||||||||
31 | order | Enterobacterales | 0.003007 | 0.026995 | 0.037758 | 0.005246 | 0.00228 | 0.043503 | 0.001986 | 0.007035 | 0.104453 | 0.101069 | 0.028065 | 3.613181e-02 | 0.001370 | 1.103155e-02 | 0.050706 | |||||||||||||||
32 | family | Erwiniaceae | 0.008098 | 0.001902 | 0.002999 | 0.000993 | 0.003578 | 0.028149 | 0.020797 | 0.005704 | 6.135642e-03 | 0.005646 | ||||||||||||||||||||
33 | genus | Pantoea | 0.001902 | 0.000993 | 0.003578 | 0.016987 | 0.005730 | 0.003805 | ||||||||||||||||||||||||
34 | genus | Erwinia | 0.005399 | 0.001499 | 0.008788 | 0.012693 | 4.772166e-03 | 0.005646 | ||||||||||||||||||||||||
35 | species | Erwinia billingiae | 0.005399 | 0.001499 | 0.008788 | 0.008788 | 3.408690e-03 | 0.005646 | ||||||||||||||||||||||||
36 | species | Unclassified Erwinia | 0.003906 | 1.363476e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
37 | genus | Unclassified Erwiniaceae | 0.002699 | 0.001499 | 0.002374 | 0.002374 | 0.001900 | 1.363476e-03 | ||||||||||||||||||||||||
38 | family | Pectobacteriaceae | 0.001885 | |||||||||||||||||||||||||||||
39 | genus | Pectobacterium | 0.000611 | |||||||||||||||||||||||||||||
40 | genus | Unclassified Pectobacteriaceae | 0.001274 | |||||||||||||||||||||||||||||
41 | family | Yersiniaceae | 0.003007 | 0.013497 | 0.020489 | 0.005246 | 0.00228 | 0.012053 | 0.000993 | 0.003457 | 0.065139 | 0.054103 | 0.016657 | 1.021853e-02 | 0.033776 | |||||||||||||||||
42 | genus | Rahnella | 0.013497 | 0.011174 | 0.007533 | 0.060579 | 0.047367 | 0.012954 | 7.493588e-03 | 0.033776 | ||||||||||||||||||||||
43 | species | Rahnella aquatilis | 0.001862 | |||||||||||||||||||||||||||||
44 | species | Unclassified Rahnella | 0.013497 | 0.009311 | 0.007533 | 0.060579 | 0.047367 | 0.012954 | 7.493588e-03 | 0.033776 | ||||||||||||||||||||||
45 | genus | Serratia | 0.003007 | 0.002623 | 0.003457 | 0.000971 | ||||||||||||||||||||||||||
46 | species | Serratia fonticola | 0.002623 | 0.003457 | ||||||||||||||||||||||||||||
47 | species | Unclassified Serratia | 0.003007 | 0.000971 | ||||||||||||||||||||||||||||
48 | genus | Unclassified Yersiniaceae | 0.009315 | 0.002623 | 0.00228 | 0.004520 | 0.000993 | 0.004561 | 0.005765 | 0.003703 | 2.724941e-03 | |||||||||||||||||||||
49 | family | Enterobacteriaceae | 0.002844 | |||||||||||||||||||||||||||||
50 | family | Unclassified Enterobacterales | 0.005399 | 0.010638 | 0.028451 | 0.011165 | 0.026169 | 0.005704 | 1.977763e-02 | 0.001370 | 1.103155e-02 | 0.011284 | ||||||||||||||||||||
51 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 0.046803 | 0.007459 | 0.004953 | 0.021312 | 0.041094 | 0.007336 | 6.140318e-03 | 0.012394 | 0.005638 | |||||||||||||||||||||
52 | class | Alphaproteobacteria | 0.020119 | 0.754648 | 0.009234 | 0.003939 | 0.001502 | 0.003041 | 0.593884 | 0.013614 | 0.632339 | 0.575986 | 0.015357 | 0.002116 | 0.849866 | 0.130869 | 6.862955e-04 | 0.002705 | 0.766974 | 0.101072 | 0.010386 | 1.077426e-02 | 0.001478 | 0.157984 | ||||||||
53 | order | Rhodospirillales | 0.000926 | 0.004546 | 0.010294 | 0.001003 | 0.001840 | 0.008329 | 0.002726 | 0.002873 | ||||||||||||||||||||||
54 | family | Rhodospirillaceae | 0.000926 | 0.010294 | 0.001003 | |||||||||||||||||||||||||||
55 | family | Acetobacteraceae | 0.004546 | 0.005554 | 0.002726 | 0.001436 | ||||||||||||||||||||||||||
56 | genus | Roseomonas | 0.001436 | |||||||||||||||||||||||||||||
57 | genus | Unclassified Acetobacteraceae | 0.004546 | 0.005554 | 0.002726 | |||||||||||||||||||||||||||
58 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.001840 | 0.002776 | 0.001436 | |||||||||||||||||||||||||||
59 | order | Rhodobacterales | 0.004568 | 0.002654 | ||||||||||||||||||||||||||||
60 | family | Rhodobacteraceae | 0.004568 | 0.002654 | ||||||||||||||||||||||||||||
61 | order | Sphingomonadales | 0.407890 | 0.120946 | 0.485842 | 0.045680 | 0.009030 | 0.467318 | 0.074324 | |||||||||||||||||||||||
62 | family | Sphingomonadaceae | 0.370372 | 0.112029 | 0.473310 | 0.045680 | 0.006773 | 0.360949 | 0.068819 | |||||||||||||||||||||||
63 | genus | Sphingomonas | 0.066213 | 0.103173 | 0.002258 | 0.042294 | ||||||||||||||||||||||||||
64 | species | Sphingomonas taxi | 0.000959 | 0.002970 | ||||||||||||||||||||||||||||
65 | species | Sphingomonas panacis | 0.002890 | 0.008584 | 0.002942 | |||||||||||||||||||||||||||
66 | species | Sphingomonas hengshuiensis | 0.000953 | |||||||||||||||||||||||||||||
67 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.061411 | 0.094588 | 0.002258 | 0.036382 | ||||||||||||||||||||||||||
68 | genus | Sphingobium | 0.023288 | 0.094057 | 0.011752 | 0.002753 | ||||||||||||||||||||||||||
69 | species | Sphingobium yanoikuyae | 0.000951 | |||||||||||||||||||||||||||||
70 | species | Sphingobium sp. RAC03 | 0.012817 | |||||||||||||||||||||||||||||
71 | species | Unclassified Sphingobium | 0.022337 | 0.081240 | 0.011752 | 0.002753 | ||||||||||||||||||||||||||
72 | genus | Novosphingobium | 0.013250 | 0.067387 | 0.096457 | 0.031976 | 0.035293 | 0.030281 | ||||||||||||||||||||||||
73 | species | Novosphingobium resinovorum | 0.001893 | 0.004332 | ||||||||||||||||||||||||||||
74 | species | Novosphingobium sp. Rr 2-17 | 0.004523 | 0.004568 | 0.004129 | |||||||||||||||||||||||||||
75 | species | Unclassified Novosphingobium | 0.011357 | 0.062864 | 0.092125 | 0.027408 | 0.035293 | 0.026152 | ||||||||||||||||||||||||
76 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.267621 | 0.044642 | 0.179623 | 0.013704 | 0.004515 | 0.271610 | 0.035785 | |||||||||||||||||||||||
77 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.037518 | 0.008918 | 0.012532 | 0.002258 | 0.106369 | 0.005506 | ||||||||||||||||||||||||
78 | order | Caulobacterales | 0.030519 | 0.017111 | 0.027045 | |||||||||||||||||||||||||||
79 | family | Caulobacteraceae | 0.027738 | 0.012858 | 0.020032 | |||||||||||||||||||||||||||
80 | genus | Caulobacter | 0.012910 | 0.012858 | 0.010021 | |||||||||||||||||||||||||||
81 | species | Caulobacter sp. K31 | 0.001004 | |||||||||||||||||||||||||||||
82 | species | Unclassified Caulobacter | 0.012910 | 0.012858 | 0.009017 | |||||||||||||||||||||||||||
83 | genus | Unclassified Caulobacteraceae | 0.014828 | 0.010011 | ||||||||||||||||||||||||||||
84 | family | Unclassified Caulobacterales | 0.002781 | 0.004253 | 0.007013 | |||||||||||||||||||||||||||
85 | order | Rhizobiales | 0.011732 | 0.190057 | 0.002326 | 0.001971 | 0.001534 | 0.341885 | 0.073741 | 0.248604 | 0.004069 | 0.094573 | 0.125379 | 0.001679 | 0.415178 | 0.095731 | 0.010386 | 7.182842e-03 | 0.001478 | 0.155111 | ||||||||||||
86 | family | Methylobacteriaceae | 0.009194 | 0.008992 | 0.008992 | 0.018102 | 0.006821 | 0.007920 | 0.017423 | |||||||||||||||||||||||
87 | genus | Methylobacterium | 0.007340 | 0.008992 | 0.008992 | 0.014459 | 0.005457 | 0.007920 | 0.015971 | |||||||||||||||||||||||
88 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 0.001855 | 0.003643 | 0.001364 | 0.001452 | ||||||||||||||||||||||||||
89 | family | Aurantimonadaceae | 0.000675 | 0.009621 | ||||||||||||||||||||||||||||
90 | genus | Aurantimonas | 0.006872 | |||||||||||||||||||||||||||||
91 | genus | Martelella | 0.000675 | |||||||||||||||||||||||||||||
92 | genus | Unclassified Aurantimonadaceae | 0.002749 | |||||||||||||||||||||||||||||
93 | family | Methylocystaceae | 0.003068 | |||||||||||||||||||||||||||||
94 | genus | Methylocystis | 0.001220 | |||||||||||||||||||||||||||||
95 | genus | Unclassified Methylocystaceae | 0.001847 | |||||||||||||||||||||||||||||
96 | family | Xanthobacteraceae | 0.002997 | 0.002997 | ||||||||||||||||||||||||||||
97 | genus | Azorhizobium | 0.002997 | 0.002997 | ||||||||||||||||||||||||||||
98 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.011732 | 0.060823 | 0.001971 | 0.062767 | 0.064302 | 0.002137 | 0.001003 | 0.072754 | 0.070066 | 0.061314 | 7.182842e-03 | 0.097167 | ||||||||||||||||||
99 | genus | Rhodopseudomonas | 0.000925 | 0.018116 | 0.003607 | 0.001374 | 0.001443 | |||||||||||||||||||||||||
100 | species | Rhodopseudomonas palustris | 0.004546 | |||||||||||||||||||||||||||||
101 | species | Unclassified Rhodopseudomonas | 0.000925 | 0.013571 | 0.003607 | 0.001374 | 0.001443 | |||||||||||||||||||||||||
102 | genus | Bradyrhizobium | 0.009232 | 0.016354 | 0.001378 | 0.026317 | 0.017414 | |||||||||||||||||||||||||
103 | genus | Bosea | 0.002997 | 0.002997 | 0.001811 | 0.003964 | 0.002937 | |||||||||||||||||||||||||
104 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.011732 | 0.050666 | 0.001971 | 0.041654 | 0.061305 | 0.002137 | 0.001003 | 0.050982 | 0.067314 | 0.031033 | 7.182842e-03 | 0.075373 | ||||||||||||||||||
105 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.000944 | 0.003022 | 0.003657 | 0.001443 | ||||||||||||||||||||||||||
106 | genus | Pelagibacterium | 0.001007 | |||||||||||||||||||||||||||||
107 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 0.000944 | 0.002015 | 0.003657 | 0.001443 | ||||||||||||||||||||||||||
108 | family | Beijerinckiaceae | 0.001009 | |||||||||||||||||||||||||||||
109 | genus | Methylocella | 0.001009 | |||||||||||||||||||||||||||||
110 | family | Phyllobacteriaceae | 0.004461 | |||||||||||||||||||||||||||||
111 | genus | Mesorhizobium | 0.001857 | |||||||||||||||||||||||||||||
112 | genus | Unclassified Phyllobacteriaceae | 0.002605 | |||||||||||||||||||||||||||||
113 | family | Bartonellaceae | 0.004568 | |||||||||||||||||||||||||||||
114 | genus | Bartonella | 0.004568 | |||||||||||||||||||||||||||||
115 | family | Rhizobiaceae | 0.063352 | 0.181822 | 0.051976 | 0.042257 | 0.063252 | |||||||||||||||||||||||||
116 | genus | Neorhizobium | 0.000876 | 0.001006 | ||||||||||||||||||||||||||||
117 | genus | Agrobacterium | 0.000936 | 0.009091 | 0.001007 | |||||||||||||||||||||||||||
118 | genus | Rhizobium | 0.001872 | 0.059092 | 0.012799 | 0.002012 | ||||||||||||||||||||||||||
119 | species | Rhizobium sp. 2MFCol3.1 | 0.009091 | |||||||||||||||||||||||||||||
120 | species | Unclassified Rhizobium | 0.001872 | 0.050001 | 0.012799 | 0.002012 | ||||||||||||||||||||||||||
121 | genus | Unclassified Rhizobiaceae | 0.059668 | 0.113639 | 0.039178 | 0.038231 | 0.063252 | |||||||||||||||||||||||||
122 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.047540 | 0.002326 | 0.001534 | 0.085307 | 0.021764 | 0.167745 | 0.001932 | 0.047282 | 0.030866 | 0.001679 | 0.265418 | 0.026496 | 0.010386 | 0.001478 | 0.039078 | |||||||||||||||
123 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 0.008387 | 0.125256 | 0.006908 | 0.001968 | 0.001502 | 0.001507 | 0.126507 | 0.003320 | 0.055646 | 0.277134 | 0.002258 | 0.002116 | 0.259927 | 0.003650 | 6.862955e-04 | 0.001026 | 0.266489 | 0.002615 | 3.591421e-03 | |||||||||||
124 | class | Betaproteobacteria | 0.008792 | 0.002885 | 0.537881 | 0.004483 | 0.009921 | 0.466525 | 0.528547 | 0.277111 | 0.012401 | 0.001230 | 0.598494 | 0.222044 | 1.174609e-02 | 0.005321 | 0.517037 | 0.006420 | 3.509569e-03 | 0.005604 | ||||||||||||
125 | order | Neisseriales | 0.000917 | |||||||||||||||||||||||||||||
126 | family | Neisseriaceae | 0.000917 | |||||||||||||||||||||||||||||
127 | genus | Vitreoscilla | 0.000917 | |||||||||||||||||||||||||||||
128 | order | Rhodocyclales | 0.006420 | |||||||||||||||||||||||||||||
129 | family | Zoogloeaceae | 0.006420 | |||||||||||||||||||||||||||||
130 | genus | Azoarcus | 0.006420 | |||||||||||||||||||||||||||||
131 | order | Nitrosomonadales | 0.016737 | 0.013570 | 0.009003 | 0.013704 | 0.023237 | 0.009664 | ||||||||||||||||||||||||
132 | family | Methylophilaceae | 0.015819 | 0.013570 | 0.009003 | 0.013704 | 0.021208 | 0.009664 | ||||||||||||||||||||||||
133 | genus | Methylotenera | 0.000909 | 0.009136 | 0.001004 | |||||||||||||||||||||||||||
134 | genus | Methylovorus | 0.000918 | 0.004142 | ||||||||||||||||||||||||||||
135 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 0.013991 | 0.013570 | 0.009003 | 0.004568 | 0.020204 | 0.005522 | ||||||||||||||||||||||||
136 | family | Unclassified Nitrosomonadales | 0.000918 | 0.002029 | ||||||||||||||||||||||||||||
137 | order | Burkholderiales | 0.008792 | 0.002885 | 0.413720 | 0.004483 | 0.009921 | 0.372997 | 0.434806 | 0.172763 | 0.012401 | 0.427761 | 0.214873 | 9.675392e-03 | 0.002099 | 0.386491 | 3.509569e-03 | 0.002798 | ||||||||||||||
138 | family | Burkholderiaceae | 0.013431 | 0.009091 | 0.008564 | 0.009655 | ||||||||||||||||||||||||||
139 | genus | Cupriavidus | 0.000952 | |||||||||||||||||||||||||||||
140 | genus | Burkholderia | 0.004546 | |||||||||||||||||||||||||||||
141 | genus | Ralstonia | 0.000910 | 0.002910 | ||||||||||||||||||||||||||||
142 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 0.012521 | 0.004546 | 0.008564 | 0.005793 | ||||||||||||||||||||||||||
143 | genus | Rhizobacter | 0.002745 | |||||||||||||||||||||||||||||
144 | species | Rhizobacter gummiphilus | 0.001372 | |||||||||||||||||||||||||||||
145 | species | Unclassified Rhizobacter | 0.001372 | |||||||||||||||||||||||||||||
146 | family | Oxalobacteraceae | 0.002885 | 0.109539 | 0.004483 | 0.061604 | 0.080509 | 0.022840 | 0.009281 | 0.080250 | 0.095113 | 8.292526e-03 | 0.102229 | 0.002798 | ||||||||||||||||||
147 | genus | Massilia | 0.004636 | 0.008830 | 0.006848 | 0.003420 | 0.001383 | |||||||||||||||||||||||||
148 | genus | Collimonas | 0.000908 | |||||||||||||||||||||||||||||
149 | genus | Janthinobacterium | 0.013794 | 0.008747 | 0.009136 | 0.007823 | 0.010889 | 6.909144e-04 | 0.013826 | 0.002798 | ||||||||||||||||||||||
150 | species | Janthinobacterium sp. HH01 | 0.009136 | 0.002920 | 0.001383 | |||||||||||||||||||||||||||
151 | species | Unclassified Janthinobacterium | 0.013794 | 0.008747 | 0.004903 | 0.010889 | 6.909144e-04 | 0.012443 | 0.002798 | |||||||||||||||||||||||
152 | genus | Herminiimonas | 0.002682 | 0.004493 | 0.003918 | |||||||||||||||||||||||||||
153 | species | Herminiimonas arsenicoxydans | 0.001799 | 0.000980 | ||||||||||||||||||||||||||||
154 | species | Unclassified Herminiimonas | 0.000883 | 0.004493 | 0.002939 | |||||||||||||||||||||||||||
155 | genus | Duganella | 0.005455 | 0.002914 | 0.003593 | 0.002757 | ||||||||||||||||||||||||||
156 | species | Duganella zoogloeoides | 0.003637 | 0.000971 | 0.001797 | 0.001378 | ||||||||||||||||||||||||||
157 | species | Unclassified Duganella | 0.001818 | 0.001943 | 0.001797 | 0.001378 | ||||||||||||||||||||||||||
158 | genus | Herbaspirillum | 0.001824 | |||||||||||||||||||||||||||||
159 | species | Herbaspirillum hiltneri | 0.000910 | |||||||||||||||||||||||||||||
160 | species | Unclassified Herbaspirillum | 0.000914 | |||||||||||||||||||||||||||||
161 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 0.002885 | 0.080241 | 0.004483 | 0.044026 | 0.080509 | 0.013704 | 0.004788 | 0.058747 | 0.077210 | 7.601612e-03 | 0.084264 | |||||||||||||||||||
162 | family | Comamonadaceae | 0.002931 | 0.129572 | 0.006945 | 0.144725 | 0.150913 | 0.050248 | 0.126729 | 0.003586 | 0.150290 | 3.509569e-03 | ||||||||||||||||||||
163 | genus | Acidovorax | 0.002931 | 0.002609 | 0.005953 | 0.004546 | 0.004176 | 0.002954 | 0.003586 | 0.004111 | 3.509569e-03 | |||||||||||||||||||||
164 | species | Acidovorax sp. CF316 | 0.001370 | |||||||||||||||||||||||||||||
165 | species | Acidovorax sp. MR-S7 | 0.002976 | 3.509569e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
166 | species | Unclassified Acidovorax | 0.002931 | 0.002609 | 0.002976 | 0.004546 | 0.004176 | 0.002954 | 0.003586 | 0.002741 | ||||||||||||||||||||||
167 | genus | Rhodoferax | 0.003580 | 0.004546 | 0.033424 | 0.006857 | 0.008222 | |||||||||||||||||||||||||
168 | species | Rhodoferax saidenbachensis | 0.004013 | |||||||||||||||||||||||||||||
169 | species | Rhodoferax koreense | 0.000895 | 0.008466 | 0.002741 | |||||||||||||||||||||||||||
170 | species | Unclassified Rhodoferax | 0.002685 | 0.004546 | 0.020945 | 0.006857 | 0.005481 | |||||||||||||||||||||||||
171 | genus | Curvibacter | 0.000883 | |||||||||||||||||||||||||||||
172 | genus | Variovorax | 0.005358 | 0.040910 | 0.037313 | 0.009136 | 0.028903 | 0.005461 | ||||||||||||||||||||||||
173 | species | Variovorax sp. PAMC 28711 | 0.004546 | 0.001370 | ||||||||||||||||||||||||||||
174 | species | Unclassified Variovorax | 0.005358 | 0.036364 | 0.037313 | 0.009136 | 0.028903 | 0.004091 | ||||||||||||||||||||||||
175 | genus | Polaromonas | 0.013031 | 0.004546 | 0.006071 | 0.008222 | ||||||||||||||||||||||||||
176 | species | Polaromonas naphthalenivorans | 0.002741 | |||||||||||||||||||||||||||||
177 | species | Unclassified Polaromonas | 0.013031 | 0.004546 | 0.006071 | 0.005481 | ||||||||||||||||||||||||||
178 | genus | Limnohabitans | 0.004063 | |||||||||||||||||||||||||||||
179 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 0.104110 | 0.000992 | 0.090178 | 0.076001 | 0.041112 | 0.081944 | 0.120212 | |||||||||||||||||||||||
180 | genus | Leptothrix | 0.001001 | |||||||||||||||||||||||||||||
181 | genus | Roseateles | 0.001370 | |||||||||||||||||||||||||||||
182 | family | Unclassified Burkholderiales | 0.005861 | 0.161178 | 0.002976 | 0.157578 | 0.194819 | 0.099674 | 0.003120 | 0.210126 | 0.116174 | 1.382866e-03 | 0.002099 | 0.129857 | ||||||||||||||||||
183 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.106507 | 0.079958 | 0.084739 | 0.090644 | 0.001230 | 0.147496 | 0.007171 | 2.070702e-03 | 0.003222 | 0.120882 | 0.002806 | |||||||||||||||||||
184 | class | Deltaproteobacteria | 0.015693 | 0.015693 | 0.003155 | 0.004117 | 0.002994 | |||||||||||||||||||||||||
185 | order | Myxococcales | 0.007716 | 0.007716 | 0.001579 | 0.001372 | 0.002994 | |||||||||||||||||||||||||
186 | family | Anaeromyxobacteraceae | 0.002994 | |||||||||||||||||||||||||||||
187 | family | Polyangiaceae | 0.002572 | 0.002572 | 0.001579 | |||||||||||||||||||||||||||
188 | family | Unclassified Myxococcales | 0.005144 | 0.005144 | 0.001372 | |||||||||||||||||||||||||||
189 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 0.007977 | 0.007977 | 0.001576 | 0.002745 | ||||||||||||||||||||||||||
190 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.002903 | 0.381512 | 0.002326 | 0.003013 | 0.010843 | 0.002974 | 0.001615 | 0.262272 | 0.064875 | 0.280255 | 0.018172 | 0.002071 | 0.370380 | 0.034202 | 8.890526e-03 | 0.011733 | 0.353212 | 0.034213 | 3.469447e-18 | 0.005612 | 0.003032 | 0.004334 | ||||||||
191 | phylum | Firmicutes | 0.002236 | 0.002724 | 0.001436 | |||||||||||||||||||||||||||
192 | class | Bacilli | 0.002236 | |||||||||||||||||||||||||||||
193 | class | Unclassified Firmicutes | 0.002724 | 0.001436 | ||||||||||||||||||||||||||||
194 | phylum | Chloroflexi | 0.001366 | |||||||||||||||||||||||||||||
195 | class | Ktedonobacteria | 0.001366 | |||||||||||||||||||||||||||||
196 | order | Ktedonobacterales | 0.001366 | |||||||||||||||||||||||||||||
197 | family | Ktedonobacteraceae | 0.001366 | |||||||||||||||||||||||||||||
198 | phylum | Actinobacteria | 0.066161 | 0.004243 | 0.154028 | 0.118760 | 0.141766 | 0.091341 | 0.036086 | 3.434028e-03 | 0.162826 | |||||||||||||||||||||
199 | class | Actinobacteria | 0.059050 | 0.001419 | 0.120385 | 0.101540 | 0.116178 | 0.067340 | 0.036086 | 3.434028e-03 | 0.137000 | |||||||||||||||||||||
200 | order | Geodermatophilales | 0.002908 | 0.002737 | ||||||||||||||||||||||||||||
201 | family | Geodermatophilaceae | 0.002908 | 0.002737 | ||||||||||||||||||||||||||||
202 | genus | Modestobacter | 0.002908 | |||||||||||||||||||||||||||||
203 | genus | Unclassified Geodermatophilaceae | 0.002737 | |||||||||||||||||||||||||||||
204 | order | Nakamurellales | 0.004568 | |||||||||||||||||||||||||||||
205 | family | Nakamurellaceae | 0.004568 | |||||||||||||||||||||||||||||
206 | order | Kineosporiales | 0.002781 | 0.002781 | 0.002794 | |||||||||||||||||||||||||||
207 | family | Kineosporiaceae | 0.001397 | |||||||||||||||||||||||||||||
208 | family | Unclassified Kineosporiales | 0.002781 | 0.002781 | 0.001397 | |||||||||||||||||||||||||||
209 | order | Micrococcales | 0.002224 | 0.008466 | 0.004013 | 0.002872 | 0.002720 | 6.868057e-04 | 0.002767 | |||||||||||||||||||||||
210 | family | Cellulomonadaceae | 0.000959 | |||||||||||||||||||||||||||||
211 | genus | Cellulomonas | 0.000959 | |||||||||||||||||||||||||||||
212 | family | Intrasporangiaceae | 0.001107 | 6.868057e-04 | ||||||||||||||||||||||||||||
213 | genus | Janibacter | 6.868057e-04 | |||||||||||||||||||||||||||||
214 | genus | Unclassified Intrasporangiaceae | 0.001107 | |||||||||||||||||||||||||||||
215 | family | Microbacteriaceae | 0.004233 | 0.001385 | ||||||||||||||||||||||||||||
216 | genus | Microbacterium | 0.004233 | |||||||||||||||||||||||||||||
217 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 0.001385 | |||||||||||||||||||||||||||||
218 | family | Unclassified Micrococcales | 0.001117 | 0.004233 | 0.004013 | 0.001912 | 0.002720 | 0.001383 | ||||||||||||||||||||||||
219 | order | Corynebacteriales | 0.009432 | 0.016127 | 0.012269 | 0.011670 | 0.010843 | 0.024737 | ||||||||||||||||||||||||
220 | family | Mycobacteriaceae | 0.001984 | 0.002867 | 0.008203 | 0.002867 | 0.002888 | 0.001368 | ||||||||||||||||||||||||
221 | genus | Mycobacterium | 0.008203 | 0.001937 | ||||||||||||||||||||||||||||
222 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 0.001984 | 0.002867 | 0.002867 | 0.000950 | 0.001368 | |||||||||||||||||||||||||
223 | family | Nocardiaceae | 0.005523 | 0.002959 | 0.004066 | 0.002959 | 0.002992 | 0.006890 | ||||||||||||||||||||||||
224 | genus | Nocardia | 0.001145 | |||||||||||||||||||||||||||||
225 | genus | Rhodococcus | 0.002500 | 0.004066 | 0.002992 | 0.001368 | ||||||||||||||||||||||||||
226 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 0.001879 | 0.002959 | 0.002959 | 0.005522 | ||||||||||||||||||||||||||
227 | family | Gordoniaceae | 0.001381 | |||||||||||||||||||||||||||||
228 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.001925 | 0.010302 | 0.005844 | 0.004964 | 0.015098 | |||||||||||||||||||||||||
229 | order | Micromonosporales | 0.001163 | 0.002000 | ||||||||||||||||||||||||||||
230 | family | Micromonosporaceae | 0.001163 | 0.002000 | ||||||||||||||||||||||||||||
231 | genus | Actinoplanes | 0.000996 | |||||||||||||||||||||||||||||
232 | genus | Unclassified Micromonosporaceae | 0.001163 | 0.001004 | ||||||||||||||||||||||||||||
233 | order | Propionibacteriales | 0.009277 | 0.008747 | 0.039321 | 0.018272 | 0.005833 | 0.015129 | 0.004160 | |||||||||||||||||||||||
234 | family | Nocardioidaceae | 0.009277 | 0.008747 | 0.035630 | 0.013704 | 0.004839 | 0.010318 | 0.002773 | |||||||||||||||||||||||
235 | genus | Actinopolymorpha | 0.003163 | |||||||||||||||||||||||||||||
236 | genus | Kribbella | 0.009136 | |||||||||||||||||||||||||||||
237 | genus | Nocardioides | 0.004030 | 0.004930 | ||||||||||||||||||||||||||||
238 | species | Nocardioides sp. JS614 | 0.001643 | |||||||||||||||||||||||||||||
239 | species | Unclassified Nocardioides | 0.004030 | 0.003286 | ||||||||||||||||||||||||||||
240 | genus | Aeromicrobium | 0.001126 | 0.000963 | ||||||||||||||||||||||||||||
241 | genus | Unclassified Nocardioidaceae | 0.008150 | 0.008747 | 0.031599 | 0.004568 | 0.003876 | 0.002226 | 0.002773 | |||||||||||||||||||||||
242 | family | Unclassified Propionibacteriales | 0.003692 | 0.004568 | 0.000994 | 0.004811 | 0.001387 | |||||||||||||||||||||||||
243 | order | Streptomycetales | 0.001247 | 0.008848 | ||||||||||||||||||||||||||||
244 | family | Streptomycetaceae | 0.000640 | 0.003563 | ||||||||||||||||||||||||||||
245 | genus | Streptomyces | 0.000640 | |||||||||||||||||||||||||||||
246 | genus | Unclassified Streptomycetaceae | 0.003563 | |||||||||||||||||||||||||||||
247 | family | Unclassified Streptomycetales | 0.000607 | 0.005285 | ||||||||||||||||||||||||||||
248 | order | Streptosporangiales | 0.001610 | |||||||||||||||||||||||||||||
249 | family | Streptosporangiaceae | 0.000997 | |||||||||||||||||||||||||||||
250 | genus | Nonomuraea | 0.000997 | |||||||||||||||||||||||||||||
251 | family | Unclassified Streptosporangiales | 0.000613 | |||||||||||||||||||||||||||||
252 | order | Unclassified Actinobacteria | 0.031188 | 0.001419 | 0.084263 | 0.045937 | 0.078887 | 0.045792 | 0.009388 | 2.747223e-03 | 0.099805 | |||||||||||||||||||||
253 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.007110 | 0.002824 | 0.033643 | 0.017220 | 0.025588 | 0.024001 | 0.025826 | |||||||||||||||||||||||
254 | phylum | Planctomycetes | 0.008852 | 0.001687 | 0.004408 | 0.001310 | 0.002891 | |||||||||||||||||||||||||
255 | class | Planctomycetia | 0.007779 | 0.000849 | 0.001861 | 0.001445 | ||||||||||||||||||||||||||
256 | order | Planctomycetales | 0.006695 | 0.000849 | 0.001861 | 0.001445 | ||||||||||||||||||||||||||
257 | family | Planctomycetaceae | 0.000849 | 0.000849 | ||||||||||||||||||||||||||||
258 | genus | Gimesia | 0.000849 | 0.000849 | ||||||||||||||||||||||||||||
259 | family | Isosphaeraceae | 0.001068 | |||||||||||||||||||||||||||||
260 | genus | Singulisphaera | 0.001068 | |||||||||||||||||||||||||||||
261 | family | Gemmataceae | 0.004554 | 0.001012 | 0.001445 | |||||||||||||||||||||||||||
262 | genus | Zavarzinella | 0.001137 | 0.001012 | ||||||||||||||||||||||||||||
263 | genus | Unclassified Gemmataceae | 0.003417 | 0.001445 | ||||||||||||||||||||||||||||
264 | family | Unclassified Planctomycetales | 0.001073 | |||||||||||||||||||||||||||||
265 | order | Unclassified Planctomycetia | 0.001084 | |||||||||||||||||||||||||||||
266 | class | Unclassified Planctomycetes | 0.001073 | 0.000838 | 0.002547 | 0.001310 | 0.001445 | |||||||||||||||||||||||||
267 | phylum | Spirochaetes | 0.002798 | |||||||||||||||||||||||||||||
268 | phylum | Lentisphaerae | 0.002954 | |||||||||||||||||||||||||||||
269 | phylum | Nitrospirae | 0.004664 | |||||||||||||||||||||||||||||
270 | class | Nitrospira | 0.003110 | |||||||||||||||||||||||||||||
271 | order | Nitrospirales | 0.001555 | |||||||||||||||||||||||||||||
272 | order | Unclassified Nitrospira | 0.001555 | |||||||||||||||||||||||||||||
273 | class | Unclassified Nitrospirae | 0.001555 | |||||||||||||||||||||||||||||
274 | phylum | Acidobacteria | 0.002179 | |||||||||||||||||||||||||||||
275 | genus | Luteitalea | 0.001079 | |||||||||||||||||||||||||||||
276 | class | Acidobacteriia | 0.001100 | |||||||||||||||||||||||||||||
277 | order | Acidobacteriales | 0.001100 | |||||||||||||||||||||||||||||
278 | family | Acidobacteriaceae | 0.001100 | |||||||||||||||||||||||||||||
279 | genus | Terriglobus | 0.001100 | |||||||||||||||||||||||||||||
280 | phylum | Armatimonadetes | 0.001423 | |||||||||||||||||||||||||||||
281 | phylum | Verrucomicrobia | 0.006664 | 0.003470 | 0.017622 | 0.022840 | 0.002989 | 0.040643 | 0.035936 | 0.030947 | ||||||||||||||||||||||
282 | class | Spartobacteria | 0.002039 | 0.003470 | 0.001364 | 0.004093 | 0.003998 | |||||||||||||||||||||||||
283 | order | Chthoniobacterales | 0.001359 | 0.003470 | 0.001364 | 0.004093 | 0.003998 | |||||||||||||||||||||||||
284 | family | Chthoniobacteraceae | 0.001359 | 0.003470 | 0.001364 | 0.002728 | 0.003998 | |||||||||||||||||||||||||
285 | genus | Chthoniobacter | 0.000680 | 0.003470 | 0.001333 | |||||||||||||||||||||||||||
286 | genus | Unclassified Chthoniobacteraceae | 0.000680 | 0.001364 | 0.002728 | 0.002665 | ||||||||||||||||||||||||||
287 | family | Unclassified Chthoniobacterales | 0.001364 | |||||||||||||||||||||||||||||
288 | order | Unclassified Spartobacteria | 0.000680 | |||||||||||||||||||||||||||||
289 | class | Verrucomicrobiae | 0.001117 | 0.008747 | 0.009136 | 0.006841 | 0.002671 | 0.011144 | ||||||||||||||||||||||||
290 | order | Verrucomicrobiales | 0.009136 | 0.006841 | 0.001335 | 0.008396 | ||||||||||||||||||||||||||
291 | family | Verrucomicrobia subdivision 3 | 0.001335 | |||||||||||||||||||||||||||||
292 | genus | Pedosphaera | 0.001335 | |||||||||||||||||||||||||||||
293 | family | Verrucomicrobiaceae | 0.009136 | 0.001368 | 0.001335 | 0.004224 | ||||||||||||||||||||||||||
294 | genus | Verrucomicrobium | 0.009136 | 0.001368 | 0.001335 | 0.004224 | ||||||||||||||||||||||||||
295 | family | Unclassified Verrucomicrobiales | 0.005473 | 0.002837 | ||||||||||||||||||||||||||||
296 | order | Unclassified Verrucomicrobiae | 0.001117 | 0.008747 | 0.001337 | 0.002749 | ||||||||||||||||||||||||||
297 | class | Opitutae | 0.001075 | 0.001337 | 0.009173 | 0.011771 | ||||||||||||||||||||||||||
298 | order | Opitutales | 0.001337 | 0.003881 | 0.009076 | |||||||||||||||||||||||||||
299 | family | Opitutaceae | 0.001337 | 0.002580 | 0.006410 | |||||||||||||||||||||||||||
300 | genus | Opitutus | 0.002427 | |||||||||||||||||||||||||||||
301 | genus | Unclassified Opitutaceae | 0.001337 | 0.002580 | 0.003983 | |||||||||||||||||||||||||||
302 | family | Unclassified Opitutales | 0.001301 | 0.002665 | ||||||||||||||||||||||||||||
303 | order | Puniceicoccales | 0.002712 | 0.001362 | ||||||||||||||||||||||||||||
304 | family | Puniceicoccaceae | 0.001356 | |||||||||||||||||||||||||||||
305 | genus | Coraliomargarita | 0.001356 | |||||||||||||||||||||||||||||
306 | family | Unclassified Puniceicoccales | 0.001356 | 0.001362 | ||||||||||||||||||||||||||||
307 | order | Unclassified Opitutae | 0.001075 | 0.002580 | 0.001333 | |||||||||||||||||||||||||||
308 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 0.002432 | 0.008875 | 0.013704 | 0.002989 | 0.031101 | 0.019999 | 0.004034 | |||||||||||||||||||||||
309 | phylum | Bacteroidetes | 0.479461 | 0.001073 | 0.006113 | 0.021513 | 0.267178 | 0.072764 | 0.194326 | 0.005024 | 0.007229 | 0.413572 | 0.026401 | 0.071166 | 0.003465 | |||||||||||||||||
310 | order | Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.003465 | |||||||||||||||||||||||||||||
311 | class | Flavobacteriia | 0.350897 | 0.182895 | 0.013704 | 0.149620 | 0.263739 | 0.014212 | 0.006841 | |||||||||||||||||||||||
312 | order | Flavobacteriales | 0.341048 | 0.182895 | 0.013704 | 0.146345 | 0.257833 | 0.010980 | 0.004105 | |||||||||||||||||||||||
313 | family | Flavobacteriaceae | 0.339597 | 0.182895 | 0.144708 | 0.254881 | 0.009919 | 0.002737 | ||||||||||||||||||||||||
314 | genus | Flavobacterium | 0.307615 | 0.174764 | 0.112751 | 0.234213 | 0.006651 | |||||||||||||||||||||||||
315 | species | Flavobacterium sp. CF136 | 0.006526 | 0.002954 | ||||||||||||||||||||||||||||
316 | species | Flavobacterium sp. WG21 | 0.010996 | |||||||||||||||||||||||||||||
317 | species | Flavobacterium johnsoniae | 0.020328 | 0.000984 | ||||||||||||||||||||||||||||
318 | species | Unclassified Flavobacterium | 0.290094 | 0.154436 | 0.112751 | 0.230276 | 0.006651 | |||||||||||||||||||||||||
319 | genus | Unclassified Flavobacteriaceae | 0.031982 | 0.008131 | 0.031957 | 0.020668 | 0.003268 | 0.002737 | ||||||||||||||||||||||||
320 | family | Unclassified Flavobacteriales | 0.001451 | 0.013704 | 0.001637 | 0.002952 | 0.001060 | 0.001368 | ||||||||||||||||||||||||
321 | order | Unclassified Flavobacteriia | 0.009849 | 0.003275 | 0.005905 | 0.003232 | 0.002737 | |||||||||||||||||||||||||
322 | class | Sphingobacteriia | 0.006113 | 0.042547 | 0.004568 | 0.026676 | 0.010946 | |||||||||||||||||||||||||
323 | order | Sphingobacteriales | 0.006113 | 0.042547 | 0.004568 | 0.016800 | 0.010946 | |||||||||||||||||||||||||
324 | family | Sphingobacteriaceae | 0.006113 | 0.038294 | 0.004568 | 0.014819 | 0.008210 | |||||||||||||||||||||||||
325 | genus | Mucilaginibacter | 0.004568 | 0.002737 | ||||||||||||||||||||||||||||
326 | genus | Pedobacter | 0.017011 | 0.001968 | ||||||||||||||||||||||||||||
327 | species | Pedobacter sp. BAL39 | 0.008505 | |||||||||||||||||||||||||||||
328 | species | Unclassified Pedobacter | 0.008505 | 0.001968 | ||||||||||||||||||||||||||||
329 | genus | Solitalea | 0.006113 | |||||||||||||||||||||||||||||
330 | species | Solitalea canadensis | 0.003057 | |||||||||||||||||||||||||||||
331 | species | Unclassified Solitalea | 0.003057 | |||||||||||||||||||||||||||||
332 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 0.021283 | 0.012850 | 0.005473 | |||||||||||||||||||||||||||
333 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.004253 | 0.001981 | 0.002737 | |||||||||||||||||||||||||||
334 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.009876 | |||||||||||||||||||||||||||||
335 | class | Chitinophagia | 0.019408 | 0.012820 | 0.004105 | |||||||||||||||||||||||||||
336 | order | Chitinophagales | 0.016532 | 0.008872 | 0.004105 | |||||||||||||||||||||||||||
337 | family | Chitinophagaceae | 0.013657 | 0.007894 | 0.004105 | |||||||||||||||||||||||||||
338 | genus | Niastella | 0.002964 | 0.002737 | ||||||||||||||||||||||||||||
339 | genus | Niabella | 0.002157 | |||||||||||||||||||||||||||||
340 | species | Niabella soli | 0.000719 | |||||||||||||||||||||||||||||
341 | species | Unclassified Niabella | 0.001438 | |||||||||||||||||||||||||||||
342 | genus | Segetibacter | 0.000978 | |||||||||||||||||||||||||||||
343 | genus | Chitinophaga | 0.001432 | |||||||||||||||||||||||||||||
344 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 0.010069 | 0.003952 | 0.001368 | |||||||||||||||||||||||||||
345 | family | Unclassified Chitinophagales | 0.002875 | 0.000978 | ||||||||||||||||||||||||||||
346 | order | Unclassified Chitinophagia | 0.002876 | 0.003947 | ||||||||||||||||||||||||||||
347 | class | Cytophagia | 0.037723 | 0.017393 | 0.025099 | 0.013380 | 0.026513 | 0.009590 | ||||||||||||||||||||||||
348 | order | Cytophagales | 0.034847 | 0.017393 | 0.025099 | 0.013380 | 0.023577 | 0.005481 | ||||||||||||||||||||||||
349 | family | Hymenobacteraceae | 0.001448 | 0.012041 | 0.008028 | 0.000987 | ||||||||||||||||||||||||||
350 | genus | Rufibacter | 0.000724 | |||||||||||||||||||||||||||||
351 | genus | Hymenobacter | 0.009365 | 0.005352 | ||||||||||||||||||||||||||||
352 | species | Hymenobacter sp. PAMC 26628 | 0.002676 | 0.002676 | ||||||||||||||||||||||||||||
353 | species | Unclassified Hymenobacter | 0.006689 | 0.002676 | ||||||||||||||||||||||||||||
354 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.000724 | 0.002676 | 0.002676 | 0.000987 | ||||||||||||||||||||||||||
355 | family | Cytophagaceae | 0.030545 | 0.016855 | 0.020632 | 0.002737 | ||||||||||||||||||||||||||
356 | genus | Spirosoma | 0.000695 | 0.002737 | ||||||||||||||||||||||||||||
357 | genus | Dyadobacter | 0.000730 | 0.008428 | 0.002940 | |||||||||||||||||||||||||||
358 | genus | Unclassified Cytophagaceae | 0.029121 | 0.008428 | 0.017693 | |||||||||||||||||||||||||||
359 | family | Unclassified Cytophagales | 0.002854 | 0.005352 | 0.008244 | 0.005352 | 0.001958 | 0.002745 | ||||||||||||||||||||||||
360 | order | Unclassified Cytophagia | 0.002875 | 0.002935 | 0.004109 | |||||||||||||||||||||||||||
361 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.071433 | 0.001073 | 0.004120 | 0.016638 | 0.041112 | 0.044706 | 0.005024 | 0.007229 | 0.083826 | 0.012189 | 0.039684 | |||||||||||||||||||
362 | phylum | Unclassified Bacteria | 0.221450 | 0.001487 | 0.003344 | 0.003052 | 0.265735 | 0.045009 | 0.382504 | 0.040983 | 0.116410 | 0.011484 | 1.387779e-17 | 0.006059 | 0.483697 | 0.040617 | 0.001646 | 0.002972 | 0.013972 | |||||||||||||
363 | superkingdom | Archaea | 0.003878 | 0.001342 | ||||||||||||||||||||||||||||
364 | phylum | Euryarchaeota | 0.003878 | |||||||||||||||||||||||||||||
365 | class | Halobacteria | 0.003878 | |||||||||||||||||||||||||||||
366 | order | Natrialbales | 0.003878 | |||||||||||||||||||||||||||||
367 | phylum | Unclassified Archaea | 0.001342 | |||||||||||||||||||||||||||||
368 | superkingdom | Unclassified | 0.008563 | 0.002749 | 0.002895 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NapA | 0.04900 | 45 | 91.74 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapB | 0.01924 | 5 | 94.12 | Periplasmic nitrate reductase cytochrome c550-type subunit |
NapC | 0.02905 | 9 | 92.33 | Cytochrome c-type protein NapC |
NapD | 0.05516 | 12 | 78.19 | Periplasmic nitrate reductase component NapD |
NapE | 0.03355 | 5 | 81.18 | Periplasmic nitrate reductase component NapE |
NapF | 0.01125 | 3 | 63.30 | Ferredoxin-type protein NapF (periplasmic nitrate reductase) |
NapG | 0.01731 | 6 | 60.52 | Ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.05401 | 72 | 96.26 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.06322 | 39 | 92.95 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.03980 | 13 | 92.19 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.04513 | 15 | 88.29 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 2.85402 | 3084 | 81.67 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.44027 | 250 | 77.63 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.00649 | 4 | 96.20 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NifD_AnfD_VnfD | 0.00993 | 6 | 97.63 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NifH_AnfH_VnfH | 0.00498 | 2 | 100.00 | Nitrogenase reductase and maturation protein NifH/AnfH/VnfH |
NifK_AnfK_VnfK | 0.00652 | 4 | 94.48 | Nitrogenase beta chain (EC 1.18.6.1) NifK/AnfK/VnfK |
NirA | 0.62072 | 423 | 75.06 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 2.80814 | 2607 | 87.82 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 2.12408 | 497 | 83.34 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.10040 | 57 | 72.31 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirM | 0.00489 | 1 | 88.00 | Cytochrome c551 NirM |
NirS | 0.00154 | 1 | 96.00 | nirS; Cytochrome cd1 nitrite reductase (NO-forming) / hydroxylamine reductase [EC:1.7.2.1 1.7.99.1] |
NirU | 0.46349 | 298 | 79.16 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.01497 | 11 | 92.93 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfA | 0.00501 | 3 | 69.40 | nrfA; nitrite reductase (cytochrome c-552) [EC:1.7.2.2] |
UreA | 2.63995 | 592 | 87.80 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 2.75898 | 632 | 83.95 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 3.68110 | 2452 | 90.31 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.01931 | 6 | 63.85 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.01931 | 16 | 83.97 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.00501 | 3 | 69.40 |
Denitrification | 0.16042 | 92 | 76.68 |
Nitrate assimilatory reduction | 3.29429 | 3334 | 81.37 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.41673 | 224 | 91.10 |
Nitrite assimilation | 6.01642 | 3825 | 85.15 |
Nitrogen fixation | 0.02791 | 16 | 96.78 |
Urease | 9.08004 | 3676 | 88.81 |
NapD | NapC | NirM | NarJ | NasA | NapG | NifH_AnfH_VnfH | NapA | NarH_NxrB | NifK_AnfK_VnfK | NirS | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NapF | NirD | UreA | NirK | cNor-C | NosZ | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapE | NapB | NrfA | NarI | NifB | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.055160 | 0.029054 | 0.004886 | 4.512984e-02 | 2.854016 | 0.017312 | 0.004979 | 0.049005 | 0.063215 | 0.006519 | 0.001535 | 0.009926 | 2.758984 | 0.011246 | 2.124078 | 2.639955 | 0.100398 | 0.019313 | 0.014975 | 2.808143 | 0.440271 | 0.054013 | 1.931209e-02 | 3.681099 | 0.620716 | 0.033552 | 0.019241 | 0.005006 | 0.039801 | 0.006488 | 0.463488 |
2 | norank | Unknown | 0.000958 | 0.026045 | 0.003005 | 0.021026 | 0.001545 | ||||||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.055160 | 0.029054 | 0.004886 | 4.512984e-02 | 2.851822 | 0.017312 | 0.004979 | 0.049005 | 0.063215 | 0.006519 | 0.001535 | 0.009926 | 2.732939 | 0.011246 | 2.124078 | 2.636950 | 0.100398 | 0.019313 | 0.014975 | 2.808143 | 0.440271 | 0.054013 | 1.931209e-02 | 3.658571 | 0.613156 | 0.033552 | 0.019241 | 0.005006 | 0.039801 | 0.006488 | 0.463488 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.022862 | 0.001073 | 0.004631 | ||||||||||||||||||||||||||||
5 | order | Oscillatoriales | 0.001202 | 0.001385 | |||||||||||||||||||||||||||||
6 | family | Cyanothecaceae | 0.001202 | ||||||||||||||||||||||||||||||
7 | family | Oscillatoriaceae | 0.001385 | ||||||||||||||||||||||||||||||
8 | order | Synechococcales | 0.001190 | ||||||||||||||||||||||||||||||
9 | class | Unclassified Cyanobacteria | 0.020470 | 0.001073 | 0.003246 | ||||||||||||||||||||||||||||
10 | phylum | Proteobacteria | 0.055160 | 0.029054 | 0.004886 | 4.201455e-02 | 1.667013 | 0.005167 | 0.043507 | 0.052430 | 0.004888 | 0.001535 | 0.008342 | 1.278966 | 0.011246 | 1.307767 | 1.124651 | 0.044146 | 0.007077 | 0.012236 | 1.689602 | 0.363440 | 0.052507 | 1.456261e-02 | 1.537194 | 0.190663 | 0.033552 | 0.019241 | 0.039801 | 0.006488 | 0.204744 | ||
11 | class | Gammaproteobacteria | 0.014264 | 0.004886 | 2.964310e-02 | 0.133227 | 0.006498 | 0.039315 | 0.001535 | 0.161968 | 0.106279 | 0.098152 | 0.002231 | 0.004064 | 0.167060 | 0.022249 | 0.032910 | 4.113767e-03 | 0.128160 | 0.018484 | |||||||||||||
12 | order | Chromatiales | 0.004361 | ||||||||||||||||||||||||||||||
13 | family | Chromatiaceae | 0.004361 | ||||||||||||||||||||||||||||||
14 | order | Xanthomonadales | 0.001974 | ||||||||||||||||||||||||||||||
15 | family | Xanthomonadaceae | 0.001974 | ||||||||||||||||||||||||||||||
16 | order | Methylococcales | 0.002709 | 1.169110e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
17 | family | Methylococcaceae | 0.002032 | ||||||||||||||||||||||||||||||
18 | genus | Methylomicrobium | 0.000677 | ||||||||||||||||||||||||||||||
19 | species | Methylomicrobium album | 0.000677 | ||||||||||||||||||||||||||||||
20 | genus | Unclassified Methylococcaceae | 0.001355 | ||||||||||||||||||||||||||||||
21 | family | Unclassified Methylococcales | 0.000677 | 1.169110e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
22 | order | Oceanospirillales | 0.000999 | ||||||||||||||||||||||||||||||
23 | order | Cellvibrionales | 0.001347 | 0.001068 | |||||||||||||||||||||||||||||
24 | family | Cellvibrionaceae | 0.001347 | 0.001068 | |||||||||||||||||||||||||||||
25 | genus | Cellvibrio | 0.001347 | 0.001068 | |||||||||||||||||||||||||||||
26 | order | Nevskiales | 0.004003 | 0.002116 | |||||||||||||||||||||||||||||
27 | family | Sinobacteraceae | 0.004003 | 0.002116 | |||||||||||||||||||||||||||||
28 | genus | Hydrocarboniphaga | 0.002001 | 0.001058 | |||||||||||||||||||||||||||||
29 | species | Hydrocarboniphaga effusa | 0.002001 | ||||||||||||||||||||||||||||||
30 | species | Unclassified Hydrocarboniphaga | 0.001058 | ||||||||||||||||||||||||||||||
31 | genus | Unclassified Sinobacteraceae | 0.002001 | 0.001058 | |||||||||||||||||||||||||||||
32 | order | Pseudomonadales | 0.014264 | 0.004886 | 0.063245 | 0.004327 | 0.001535 | 0.139708 | 0.049979 | 0.085777 | 0.002231 | 0.004064 | 0.092483 | 2.944658e-03 | 0.113233 | ||||||||||||||||||
33 | family | Pseudomonadaceae | 0.014264 | 0.004886 | 0.055393 | 0.002164 | 0.001535 | 0.139708 | 0.040906 | 0.085777 | 0.002231 | 0.004064 | 0.084009 | 1.759150e-03 | 0.108689 | ||||||||||||||||||
34 | genus | Pseudomonas | 0.009509 | 0.004886 | 0.026761 | 0.001535 | 0.105028 | 0.023078 | 0.065849 | 0.002231 | 0.004064 | 0.060586 | 1.759150e-03 | 0.071123 | |||||||||||||||||||
35 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 0.004755 | 0.028633 | 0.002164 | 0.034680 | 0.017829 | 0.019929 | 0.023423 | 0.037566 | |||||||||||||||||||||||
36 | family | Unclassified Pseudomonadales | 0.007852 | 0.002164 | 0.009073 | 0.008474 | 1.185507e-03 | 0.004544 | |||||||||||||||||||||||||
37 | order | Enterobacterales | 2.076959e-02 | 0.020918 | 0.001089 | 0.024574 | 0.039382 | 0.035214 | 0.012945 | 0.027672 | 0.001394 | 0.015406 | |||||||||||||||||||||
38 | family | Erwiniaceae | 5.904187e-03 | 0.001045 | 0.001089 | 0.016448 | 0.008487 | 0.002066 | 0.003738 | 0.003087 | |||||||||||||||||||||||
39 | genus | Pantoea | 0.001089 | 0.006186 | 0.002460 | 0.001392 | 0.000748 | ||||||||||||||||||||||||||
40 | genus | Erwinia | 5.904187e-03 | 0.009588 | 0.005352 | 0.002243 | 0.003087 | ||||||||||||||||||||||||||
41 | species | Erwinia billingiae | 2.952093e-03 | 0.004794 | 0.003211 | 0.000748 | 0.003087 | ||||||||||||||||||||||||||
42 | species | Unclassified Erwinia | 2.952093e-03 | 0.004794 | 0.002141 | 0.001495 | |||||||||||||||||||||||||||
43 | genus | Unclassified Erwiniaceae | 0.001045 | 0.000675 | 0.000675 | 0.000675 | 0.000748 | ||||||||||||||||||||||||||
44 | family | Pectobacteriaceae | 0.005448 | 0.000748 | |||||||||||||||||||||||||||||
45 | genus | Pectobacterium | 0.001354 | ||||||||||||||||||||||||||||||
46 | genus | Brenneria | 0.000727 | ||||||||||||||||||||||||||||||
47 | genus | Unclassified Pectobacteriaceae | 0.003367 | 0.000748 | |||||||||||||||||||||||||||||
48 | family | Yersiniaceae | 8.856280e-03 | 0.003073 | 0.001650 | 0.016799 | 0.009941 | 0.004743 | 0.004483 | 0.009232 | |||||||||||||||||||||||
49 | genus | Rahnella | 8.856280e-03 | 0.001650 | 0.009238 | 0.002128 | 0.004483 | 0.009232 | |||||||||||||||||||||||||
50 | genus | Unclassified Yersiniaceae | 0.003073 | 0.007561 | 0.007812 | 0.004743 | |||||||||||||||||||||||||||
51 | family | Enterobacteriaceae | 6.009122e-03 | 0.002856 | 0.000695 | 0.000695 | 0.000695 | 0.001394 | |||||||||||||||||||||||||
52 | genus | Gibbsiella | 0.000674 | ||||||||||||||||||||||||||||||
53 | genus | Unclassified Enterobacteriaceae | 6.009122e-03 | 0.002182 | 0.000695 | 0.000695 | 0.000695 | 0.001394 | |||||||||||||||||||||||||
54 | family | Unclassified Enterobacterales | 0.008497 | 0.022923 | 0.005440 | 0.016091 | 0.005440 | 0.018703 | 0.003087 | ||||||||||||||||||||||||
55 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 8.873514e-03 | 0.038032 | 0.001082 | 0.014741 | 0.022259 | 0.016918 | 0.008014 | 0.036179 | 0.009304 | 0.005238 | 0.013532 | 0.003077 | |||||||||||||||||||
56 | class | Alphaproteobacteria | 0.014247 | 0.009524 | 0.637868 | 0.006491 | 0.003258 | 0.005041 | 0.486173 | 0.011246 | 0.614462 | 0.466368 | 0.007294 | 0.009507 | 0.645987 | 0.220334 | 1.151850e-03 | 0.596228 | 0.145740 | 0.012420 | 0.003907 | 0.002927 | 0.196836 | ||||||||||
57 | order | Rhodospirillales | 0.004073 | 0.011208 | 0.011246 | 0.002014 | 0.011899 | 0.006299 | |||||||||||||||||||||||||
58 | family | Rhodospirillaceae | 0.001032 | 0.011246 | |||||||||||||||||||||||||||||
59 | family | Acetobacteraceae | 0.009916 | 0.009073 | 0.006299 | ||||||||||||||||||||||||||||
60 | species | Acetobacteraceae bacterium AT-5844 | 0.003016 | ||||||||||||||||||||||||||||||
61 | genus | Roseomonas | 0.004958 | ||||||||||||||||||||||||||||||
62 | genus | Unclassified Acetobacteraceae | 0.004958 | 0.006057 | 0.006299 | ||||||||||||||||||||||||||||
63 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.003041 | 0.001293 | 0.002014 | 0.002826 | |||||||||||||||||||||||||||
64 | order | Rhodobacterales | 0.004958 | 0.004727 | 0.014946 | 0.002204 | 0.009750 | 0.010528 | |||||||||||||||||||||||||
65 | family | Rhodobacteraceae | 0.004958 | 0.004727 | 0.014946 | 0.005890 | 0.004496 | ||||||||||||||||||||||||||
66 | genus | Paracoccus | 0.004727 | ||||||||||||||||||||||||||||||
67 | genus | Unclassified Rhodobacteraceae | 0.004958 | 0.014946 | 0.005890 | 0.004496 | |||||||||||||||||||||||||||
68 | family | Unclassified Rhodobacterales | 0.002204 | 0.003860 | 0.006032 | ||||||||||||||||||||||||||||
69 | order | Sphingomonadales | 0.295167 | 0.088213 | 0.484450 | 0.019929 | 0.364994 | 0.069364 | |||||||||||||||||||||||||
70 | family | Sphingomonadaceae | 0.270677 | 0.088213 | 0.442366 | 0.019929 | 0.289328 | 0.063334 | |||||||||||||||||||||||||
71 | genus | Sphingomonas | 0.028406 | 0.126553 | 0.039869 | ||||||||||||||||||||||||||||
72 | species | Sphingomonas taxi | 0.009453 | 0.001085 | |||||||||||||||||||||||||||||
73 | species | Sphingomonas panacis | 0.028099 | 0.007525 | |||||||||||||||||||||||||||||
74 | species | Sphingomonas sp. ATCC 31555 | 0.001081 | ||||||||||||||||||||||||||||||
75 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.027326 | 0.089001 | 0.031259 | ||||||||||||||||||||||||||||
76 | genus | Blastomonas | 0.003135 | ||||||||||||||||||||||||||||||
77 | genus | Rhizorhabdus | 0.001039 | ||||||||||||||||||||||||||||||
78 | genus | Sphingobium | 0.028094 | 0.121546 | 0.010745 | ||||||||||||||||||||||||||||
79 | species | Sphingobium sp. RAC03 | 0.009323 | ||||||||||||||||||||||||||||||
80 | species | Sphingobium sp. SYK-6 | 0.004705 | ||||||||||||||||||||||||||||||
81 | species | Unclassified Sphingobium | 0.028094 | 0.107518 | 0.010745 | ||||||||||||||||||||||||||||
82 | genus | Novosphingobium | 0.005880 | 0.034536 | 0.050496 | 0.014946 | 0.018266 | 0.027145 | |||||||||||||||||||||||||
83 | species | Novosphingobium resinovorum | 0.001038 | ||||||||||||||||||||||||||||||
84 | species | Novosphingobium sp. Rr 2-17 | 0.004524 | ||||||||||||||||||||||||||||||
85 | species | Unclassified Novosphingobium | 0.004843 | 0.034536 | 0.050496 | 0.014946 | 0.018266 | 0.022621 | |||||||||||||||||||||||||
86 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.204122 | 0.053677 | 0.143771 | 0.004982 | 0.220448 | 0.036189 | |||||||||||||||||||||||||
87 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.024490 | 0.042084 | 0.075666 | 0.006030 | |||||||||||||||||||||||||||
88 | order | Caulobacterales | 0.032717 | 0.045512 | 0.045042 | ||||||||||||||||||||||||||||
89 | family | Caulobacteraceae | 0.023559 | 0.036252 | 0.037365 | ||||||||||||||||||||||||||||
90 | genus | Phenylobacterium | 0.004216 | 0.001098 | |||||||||||||||||||||||||||||
91 | genus | Caulobacter | 0.006076 | 0.009280 | 0.019803 | ||||||||||||||||||||||||||||
92 | species | Caulobacter sp. K31 | 0.002201 | ||||||||||||||||||||||||||||||
93 | species | Unclassified Caulobacter | 0.006076 | 0.009280 | 0.017601 | ||||||||||||||||||||||||||||
94 | genus | Unclassified Caulobacteraceae | 0.017483 | 0.022756 | 0.016464 | ||||||||||||||||||||||||||||
95 | family | Unclassified Caulobacterales | 0.009158 | 0.009259 | 0.007677 | ||||||||||||||||||||||||||||
96 | order | Rhizobiales | 0.009498 | 0.009524 | 0.167730 | 0.002157 | 0.003258 | 0.246514 | 0.042414 | 0.216642 | 0.007294 | 0.008141 | 0.028676 | 0.182516 | 0.245258 | 0.141380 | 0.006210 | 0.003907 | 0.002927 | 0.188964 | |||||||||||||
97 | family | Methylobacteriaceae | 0.012153 | 0.019526 | 0.019526 | 0.013664 | 0.016475 | 0.020300 | 0.012700 | ||||||||||||||||||||||||
98 | genus | Methylobacterium | 0.005041 | 0.016382 | 0.016382 | 0.011678 | 0.010496 | 0.014515 | 0.011109 | ||||||||||||||||||||||||
99 | species | Methylobacterium sp. 77 | 0.001452 | ||||||||||||||||||||||||||||||
100 | species | Methylobacterium sp. 88A | 0.003001 | ||||||||||||||||||||||||||||||
101 | species | Unclassified Methylobacterium | 0.005041 | 0.016382 | 0.016382 | 0.011678 | 0.007496 | 0.013063 | 0.011109 | ||||||||||||||||||||||||
102 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 0.007112 | 0.003144 | 0.003144 | 0.001987 | 0.005979 | 0.005785 | 0.001591 | ||||||||||||||||||||||||
103 | family | Aurantimonadaceae | 0.000742 | 0.004982 | 0.003012 | ||||||||||||||||||||||||||||
104 | family | Methylocystaceae | 0.001689 | 0.001948 | 0.001566 | ||||||||||||||||||||||||||||
105 | genus | Methylocystis | 0.000669 | ||||||||||||||||||||||||||||||
106 | genus | Methylopila | 0.001020 | 0.001566 | |||||||||||||||||||||||||||||
107 | genus | Unclassified Methylocystaceae | 0.001948 | ||||||||||||||||||||||||||||||
108 | family | Xanthobacteraceae | 0.001008 | 0.003222 | |||||||||||||||||||||||||||||
109 | genus | Starkeya | 0.001008 | 0.001611 | |||||||||||||||||||||||||||||
110 | genus | Unclassified Xanthobacteraceae | 0.001611 | ||||||||||||||||||||||||||||||
111 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.009498 | 0.006310 | 0.064743 | 0.002157 | 0.001629 | 0.035974 | 0.051138 | 0.001410 | 0.109670 | 0.042086 | 0.090412 | 0.006210 | 0.002927 | 0.115973 | |||||||||||||||||
112 | genus | Rhodopseudomonas | 0.004886 | 0.003950 | |||||||||||||||||||||||||||||
113 | genus | Bradyrhizobium | 0.009498 | 0.006069 | 0.001629 | 0.003022 | 0.003022 | 0.040010 | 0.035993 | 0.006210 | 0.022235 | ||||||||||||||||||||||
114 | species | Bradyrhizobium sp. S23321 | 0.001588 | ||||||||||||||||||||||||||||||
115 | species | Unclassified Bradyrhizobium | 0.009498 | 0.006069 | 0.001629 | 0.003022 | 0.003022 | 0.040010 | 0.035993 | 0.006210 | 0.020646 | ||||||||||||||||||||||
116 | genus | Bosea | 0.008071 | 0.003276 | 0.003276 | 0.007873 | 0.004464 | 0.008678 | 0.002927 | 0.004826 | |||||||||||||||||||||||
117 | species | Bosea sp. PAMC 26642 | 0.001488 | 0.001446 | |||||||||||||||||||||||||||||
118 | species | Bosea sp. RAC05 | 0.002976 | 0.002927 | |||||||||||||||||||||||||||||
119 | species | Unclassified Bosea | 0.008071 | 0.003276 | 0.003276 | 0.007873 | 0.007233 | 0.004826 | |||||||||||||||||||||||||
120 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.006310 | 0.050603 | 0.002157 | 0.024789 | 0.044839 | 0.001410 | 0.057837 | 0.037621 | 0.045741 | 0.088913 | |||||||||||||||||||||
121 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.001020 | 0.009916 | 0.001104 | 0.002002 | 0.001446 | ||||||||||||||||||||||||||
122 | genus | Pelagibacterium | 0.001104 | ||||||||||||||||||||||||||||||
123 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 0.001020 | 0.009916 | 0.002002 | 0.001446 | |||||||||||||||||||||||||||
124 | family | Beijerinckiaceae | 0.002500 | 0.001469 | |||||||||||||||||||||||||||||
125 | family | Phyllobacteriaceae | 0.004800 | 0.014873 | 0.009542 | 0.004982 | 0.002946 | ||||||||||||||||||||||||||
126 | genus | Hoeflea | 0.004958 | ||||||||||||||||||||||||||||||
127 | species | Hoeflea phototrophica | 0.004958 | ||||||||||||||||||||||||||||||
128 | genus | Mesorhizobium | 0.004800 | 0.009916 | 0.009542 | 0.004982 | 0.001473 | ||||||||||||||||||||||||||
129 | species | Mesorhizobium sp. WSM1497 | 0.000960 | ||||||||||||||||||||||||||||||
130 | species | Unclassified Mesorhizobium | 0.003840 | 0.009916 | 0.009542 | 0.004982 | 0.001473 | ||||||||||||||||||||||||||
131 | genus | Unclassified Phyllobacteriaceae | 0.001473 | ||||||||||||||||||||||||||||||
132 | family | Rhizobiaceae | 0.037642 | 0.089240 | 0.032871 | 0.004982 | 0.016547 | 0.031647 | |||||||||||||||||||||||||
133 | genus | Ensifer | 0.001515 | ||||||||||||||||||||||||||||||
134 | genus | Neorhizobium | 0.003893 | ||||||||||||||||||||||||||||||
135 | species | Neorhizobium galegae | 0.001011 | ||||||||||||||||||||||||||||||
136 | species | Unclassified Neorhizobium | 0.002883 | ||||||||||||||||||||||||||||||
137 | genus | Kaistia | 0.003007 | ||||||||||||||||||||||||||||||
138 | species | Kaistia granuli | 0.001513 | ||||||||||||||||||||||||||||||
139 | species | Unclassified Kaistia | 0.001495 | ||||||||||||||||||||||||||||||
140 | genus | Agrobacterium | 0.004727 | 0.001104 | |||||||||||||||||||||||||||||
141 | genus | Rhizobium | 0.007180 | 0.044620 | 0.004982 | 0.006032 | |||||||||||||||||||||||||||
142 | species | Rhizobium sp. 2MFCol3.1 | 0.001508 | ||||||||||||||||||||||||||||||
143 | species | Unclassified Rhizobium | 0.007180 | 0.044620 | 0.004982 | 0.004524 | |||||||||||||||||||||||||||
144 | genus | Unclassified Rhizobiaceae | 0.026568 | 0.044620 | 0.028144 | 0.015443 | 0.021093 | ||||||||||||||||||||||||||
145 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.003214 | 0.041434 | 0.001629 | 0.076986 | 0.131032 | 0.007294 | 0.006732 | 0.011024 | 0.055231 | 0.149092 | 0.027753 | 0.003907 | 0.055503 | ||||||||||||||||||
146 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 0.004749 | 0.138181 | 0.004334 | 0.005041 | 0.135279 | 0.037360 | 0.214851 | 0.001366 | 0.205072 | 0.026054 | 1.151850e-03 | 0.259179 | 0.004360 | 0.006210 | 0.001574 | ||||||||||||||||
147 | class | Betaproteobacteria | 0.026650 | 0.009612 | 1.237144e-02 | 0.513031 | 0.002584 | 0.017406 | 0.006525 | 0.310345 | 0.460770 | 0.201822 | 0.010776 | 0.554397 | 0.080636 | 0.013581 | 1.150544e-03 | 0.440972 | 0.021132 | 0.015334 | 0.015313 | ||||||||||||
148 | order | Neisseriales | 0.002011 | 0.004727 | |||||||||||||||||||||||||||||
149 | family | Neisseriaceae | 0.002011 | 0.004727 | |||||||||||||||||||||||||||||
150 | genus | Vitreoscilla | 0.001006 | 0.004727 | |||||||||||||||||||||||||||||
151 | genus | Unclassified Neisseriaceae | 0.001006 | ||||||||||||||||||||||||||||||
152 | order | Rhodocyclales | 0.004910 | 0.002158 | |||||||||||||||||||||||||||||
153 | family | Zoogloeaceae | 0.001072 | ||||||||||||||||||||||||||||||
154 | family | Rhodocyclaceae | 0.001086 | ||||||||||||||||||||||||||||||
155 | family | Unclassified Rhodocyclales | 0.004910 | ||||||||||||||||||||||||||||||
156 | order | Nitrosomonadales | 0.022110 | 0.019735 | 0.029226 | 0.004982 | 0.032102 | 0.013613 | |||||||||||||||||||||||||
157 | family | Methylophilaceae | 0.018087 | 0.019735 | 0.029226 | 0.004982 | 0.028779 | 0.010588 | |||||||||||||||||||||||||
158 | genus | Methylotenera | 0.004982 | 0.002201 | 0.001513 | ||||||||||||||||||||||||||||
159 | genus | Methylovorus | 0.004886 | 0.004538 | |||||||||||||||||||||||||||||
160 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 0.018087 | 0.019735 | 0.024339 | 0.026577 | 0.004538 | ||||||||||||||||||||||||||
161 | family | Unclassified Nitrosomonadales | 0.004023 | 0.003324 | 0.003025 | ||||||||||||||||||||||||||||
162 | order | Burkholderiales | 0.017881 | 0.009612 | 6.091417e-03 | 0.367333 | 0.017406 | 0.003266 | 0.241270 | 0.368282 | 0.112475 | 0.010776 | 0.370171 | 0.072717 | 0.006789 | 1.150544e-03 | 0.335993 | 0.007077 | 0.015334 | 0.009177 | |||||||||||||
163 | family | Burkholderiaceae | 0.004727 | 0.015666 | 0.002180 | 0.001634 | 0.004457 | 0.001971 | 0.001504 | 0.007527 | 0.003068 | ||||||||||||||||||||||
164 | genus | Paraburkholderia | 0.001090 | ||||||||||||||||||||||||||||||
165 | genus | Burkholderia | 0.000671 | ||||||||||||||||||||||||||||||
166 | genus | Ralstonia | 0.000995 | ||||||||||||||||||||||||||||||
167 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 0.004727 | 0.014001 | 0.001090 | 0.001634 | 0.004457 | 0.001971 | 0.001504 | 0.007527 | 0.003068 | ||||||||||||||||||||||
168 | genus | Rhizobacter | 0.000990 | 0.004511 | |||||||||||||||||||||||||||||
169 | genus | Rubrivivax | 0.001490 | ||||||||||||||||||||||||||||||
170 | genus | Methylibium | 0.004399 | 0.001495 | |||||||||||||||||||||||||||||
171 | species | Methylibium petroleiphilum | 0.004399 | ||||||||||||||||||||||||||||||
172 | species | Unclassified Methylibium | 0.001495 | ||||||||||||||||||||||||||||||
173 | genus | Paucibacter | 0.007077 | ||||||||||||||||||||||||||||||
174 | family | Alcaligenaceae | 0.000672 | ||||||||||||||||||||||||||||||
175 | family | Oxalobacteraceae | 3.086856e-03 | 0.052217 | 0.001632 | 0.023901 | 0.050916 | 0.004982 | 0.009075 | 0.028918 | 0.039263 | 0.002269 | 0.043918 | ||||||||||||||||||||
176 | genus | Massilia | 0.001873 | ||||||||||||||||||||||||||||||
177 | species | Massilia sp. B2 | 0.001873 | ||||||||||||||||||||||||||||||
178 | genus | Collimonas | 0.000996 | ||||||||||||||||||||||||||||||
179 | genus | Janthinobacterium | 3.086856e-03 | 0.014098 | 0.004982 | 0.001067 | 0.003965 | ||||||||||||||||||||||||||
180 | species | Janthinobacterium sp. HH01 | 0.001004 | 0.001067 | |||||||||||||||||||||||||||||
181 | species | Unclassified Janthinobacterium | 3.086856e-03 | 0.013094 | 0.004982 | 0.003965 | |||||||||||||||||||||||||||
182 | genus | Herminiimonas | 0.004015 | 0.007375 | 0.001074 | ||||||||||||||||||||||||||||
183 | species | Herminiimonas arsenicoxydans | 0.003011 | 0.002458 | |||||||||||||||||||||||||||||
184 | species | Unclassified Herminiimonas | 0.001004 | 0.004917 | 0.001074 | ||||||||||||||||||||||||||||
185 | genus | Duganella | 0.003935 | ||||||||||||||||||||||||||||||
186 | genus | Herbaspirillum | 0.001999 | 0.004817 | 0.003168 | 0.001908 | 0.001515 | ||||||||||||||||||||||||||
187 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 0.031109 | 0.001632 | 0.019085 | 0.050916 | 0.001700 | 0.023610 | 0.027582 | 0.002269 | 0.042404 | ||||||||||||||||||||||
188 | family | Comamonadaceae | 0.004385 | 0.009612 | 0.164983 | 0.008701 | 0.113656 | 0.140384 | 0.049656 | 0.134437 | 1.150544e-03 | 0.139262 | 0.007667 | ||||||||||||||||||||
189 | genus | Acidovorax | 0.004385 | 0.009612 | 0.004823 | 0.005438 | 0.004958 | 0.004399 | 0.001069 | 0.001484 | 0.007667 | ||||||||||||||||||||||
190 | species | Acidovorax sp. CF316 | 0.004958 | ||||||||||||||||||||||||||||||
191 | species | Acidovorax sp. MR-S7 | 0.001088 | ||||||||||||||||||||||||||||||
192 | species | Unclassified Acidovorax | 0.004385 | 0.009612 | 0.004823 | 0.004350 | 0.004399 | 0.001069 | 0.001484 | 0.007667 | |||||||||||||||||||||||
193 | genus | Ramlibacter | 0.008798 | 0.004817 | |||||||||||||||||||||||||||||
194 | genus | Caldimonas | 0.000997 | ||||||||||||||||||||||||||||||
195 | genus | Rhodoferax | 0.001963 | 0.004958 | 0.004380 | 0.002148 | 0.006005 | ||||||||||||||||||||||||||
196 | species | Rhodoferax koreense | 0.006005 | ||||||||||||||||||||||||||||||
197 | species | Unclassified Rhodoferax | 0.001963 | 0.004958 | 0.004380 | 0.002148 | |||||||||||||||||||||||||||
198 | genus | Comamonas | 0.001506 | ||||||||||||||||||||||||||||||
199 | genus | Variovorax | 0.004891 | 0.034704 | 0.049583 | 0.042417 | 0.006005 | ||||||||||||||||||||||||||
200 | species | Variovorax sp. PAMC 28711 | 0.004683 | 0.002148 | |||||||||||||||||||||||||||||
201 | species | Variovorax paradoxus | 0.009916 | 0.001073 | |||||||||||||||||||||||||||||
202 | species | Unclassified Variovorax | 0.004891 | 0.024789 | 0.044900 | 0.039197 | 0.006005 | ||||||||||||||||||||||||||
203 | genus | Hydrogenophaga | 0.000965 | ||||||||||||||||||||||||||||||
204 | genus | Polaromonas | 0.004673 | 0.008328 | 0.001501 | ||||||||||||||||||||||||||||
205 | species | Polaromonas sp. CF318 | 0.000962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
206 | species | Unclassified Polaromonas | 0.003712 | 0.008328 | 0.001501 | ||||||||||||||||||||||||||||
207 | genus | Limnohabitans | 0.000950 | ||||||||||||||||||||||||||||||
208 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 0.145722 | 0.003263 | 0.069036 | 0.064897 | 0.044839 | 0.088802 | 1.150544e-03 | 0.122760 | |||||||||||||||||||||||
209 | family | Unclassified Burkholderiales | 0.008769 | 3.004561e-03 | 0.132805 | 0.006525 | 0.103713 | 0.168126 | 0.057837 | 0.001700 | 0.206816 | 0.031483 | 0.003016 | 0.137790 | 0.007667 | 0.006109 | |||||||||||||||||
210 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.008769 | 6.280026e-03 | 0.121578 | 0.002584 | 0.003258 | 0.049340 | 0.053626 | 0.084365 | 0.149965 | 0.007919 | 0.006792 | 0.091366 | 0.014056 | 0.006136 | |||||||||||||||||
211 | class | Deltaproteobacteria | 0.003743 | 0.039747 | 0.039747 | 0.007022 | 0.018052 | ||||||||||||||||||||||||||
212 | order | Myxococcales | 0.003743 | 0.025523 | 0.025523 | 0.005257 | 0.010532 | ||||||||||||||||||||||||||
213 | family | Sandaracinaceae | 0.002487 | 0.001726 | |||||||||||||||||||||||||||||
214 | genus | Sandaracinus | 0.001244 | 0.001726 | |||||||||||||||||||||||||||||
215 | genus | Unclassified Sandaracinaceae | 0.001244 | ||||||||||||||||||||||||||||||
216 | family | Labilitrichaceae | 0.002869 | 0.002869 | 0.001506 | ||||||||||||||||||||||||||||
217 | family | Kofleriaceae | 0.001508 | ||||||||||||||||||||||||||||||
218 | genus | Haliangium | 0.001508 | ||||||||||||||||||||||||||||||
219 | family | Polyangiaceae | 0.001765 | ||||||||||||||||||||||||||||||
220 | family | Unclassified Myxococcales | 0.001256 | 0.022655 | 0.022655 | 0.001765 | 0.007518 | ||||||||||||||||||||||||||
221 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 0.014224 | 0.014224 | 0.001765 | 0.007520 | |||||||||||||||||||||||||||
222 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.009918 | 6.938894e-18 | 0.379143 | 0.002584 | 0.013112 | 0.006591 | 0.001629 | 0.003301 | 0.280733 | 0.126256 | 0.318561 | 0.023845 | 0.003013 | 0.002729 | 0.322158 | 0.033198 | 0.006015 | 8.146450e-03 | 0.353781 | 0.044923 | 0.003077 | 0.006488 | 0.007907 | ||||||||
223 | phylum | Firmicutes | 0.001301 | 0.006717 | 0.004496 | 0.009731 | 0.015600 | 0.006229 | 0.005997 | 0.022147 | |||||||||||||||||||||||
224 | class | Clostridia | 0.003408 | 0.004982 | 0.001499 | ||||||||||||||||||||||||||||
225 | order | Clostridiales | 0.004982 | 0.001499 | |||||||||||||||||||||||||||||
226 | family | Ruminococcaceae | 0.004982 | ||||||||||||||||||||||||||||||
227 | genus | Ruminiclostridium | 0.004982 | ||||||||||||||||||||||||||||||
228 | family | Unclassified Clostridiales | 0.001499 | ||||||||||||||||||||||||||||||
229 | order | Unclassified Clostridia | 0.003408 | ||||||||||||||||||||||||||||||
230 | class | Bacilli | 0.004496 | 0.004749 | 0.001109 | 0.003644 | 0.004497 | ||||||||||||||||||||||||||
231 | order | Bacillales | 0.004496 | 0.001109 | 0.003005 | ||||||||||||||||||||||||||||
232 | family | Paenibacillaceae | 0.004496 | 0.001109 | 0.001504 | ||||||||||||||||||||||||||||
233 | genus | Thermobacillus | 0.004496 | ||||||||||||||||||||||||||||||
234 | genus | Unclassified Paenibacillaceae | 0.001109 | 0.001504 | |||||||||||||||||||||||||||||
235 | family | Unclassified Bacillales | 0.001501 | ||||||||||||||||||||||||||||||
236 | order | Unclassified Bacilli | 0.004749 | 0.003644 | 0.001493 | ||||||||||||||||||||||||||||
237 | class | Unclassified Firmicutes | 0.001301 | 0.003308 | 0.014491 | 0.002586 | 0.022147 | ||||||||||||||||||||||||||
238 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.001048 | 0.002963 | |||||||||||||||||||||||||||||
239 | class | Deinococci | 0.001482 | ||||||||||||||||||||||||||||||
240 | order | Thermales | 0.001482 | ||||||||||||||||||||||||||||||
241 | family | Thermaceae | 0.001482 | ||||||||||||||||||||||||||||||
242 | class | Unclassified Deinococcus-Thermus | 0.001048 | 0.001482 | |||||||||||||||||||||||||||||
243 | phylum | Chloroflexi | 0.001238 | 0.006179 | |||||||||||||||||||||||||||||
244 | class | Chloroflexia | 0.001238 | ||||||||||||||||||||||||||||||
245 | order | Herpetosiphonales | 0.001238 | ||||||||||||||||||||||||||||||
246 | family | Herpetosiphonaceae | 0.001238 | ||||||||||||||||||||||||||||||
247 | genus | Herpetosiphon | 0.001238 | ||||||||||||||||||||||||||||||
248 | class | Unclassified Chloroflexi | 0.006179 | ||||||||||||||||||||||||||||||
249 | phylum | Actinobacteria | 3.115298e-03 | 0.312429 | 0.010785 | 0.507793 | 0.460418 | 0.437098 | 0.001050 | 0.495919 | 0.055948 | 0.001506 | 0.774992 | ||||||||||||||||||||
250 | class | Actinobacteria | 3.115298e-03 | 0.278528 | 0.010785 | 0.437021 | 0.402329 | 0.336659 | 0.001050 | 0.422858 | 0.053823 | 0.001506 | 0.629301 | ||||||||||||||||||||
251 | order | Geodermatophilales | 0.002123 | ||||||||||||||||||||||||||||||
252 | family | Geodermatophilaceae | 0.002123 | ||||||||||||||||||||||||||||||
253 | genus | Modestobacter | 0.002123 | ||||||||||||||||||||||||||||||
254 | order | Nakamurellales | 3.115298e-03 | 0.001081 | 0.003025 | ||||||||||||||||||||||||||||
255 | family | Nakamurellaceae | 0.001081 | 0.003025 | |||||||||||||||||||||||||||||
256 | genus | Nakamurella | 0.001513 | ||||||||||||||||||||||||||||||
257 | genus | Unclassified Nakamurellaceae | 0.001081 | 0.001513 | |||||||||||||||||||||||||||||
258 | family | Unclassified Nakamurellales | 3.115298e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
259 | order | Kineosporiales | 0.003041 | 0.003041 | 0.004592 | ||||||||||||||||||||||||||||
260 | family | Kineosporiaceae | 0.003041 | 0.003041 | 0.004592 | ||||||||||||||||||||||||||||
261 | genus | Kineococcus | 0.001531 | ||||||||||||||||||||||||||||||
262 | species | Kineococcus radiotolerans | 0.001531 | ||||||||||||||||||||||||||||||
263 | genus | Unclassified Kineosporiaceae | 0.003041 | 0.003041 | 0.003062 | ||||||||||||||||||||||||||||
264 | order | Micrococcales | 0.009831 | 0.013857 | 0.013359 | 0.059737 | 0.003050 | 0.007509 | 0.000753 | 0.010606 | |||||||||||||||||||||||
265 | family | Micrococcaceae | 0.004982 | ||||||||||||||||||||||||||||||
266 | family | Dermacoccaceae | 0.001251 | 0.004982 | |||||||||||||||||||||||||||||
267 | family | Cellulomonadaceae | 0.004982 | ||||||||||||||||||||||||||||||
268 | family | Promicromonosporaceae | 0.002402 | 0.004982 | 0.001495 | ||||||||||||||||||||||||||||
269 | family | Microbacteriaceae | 0.013857 | 0.004496 | 0.019880 | 0.002007 | 0.003048 | 0.003034 | |||||||||||||||||||||||||
270 | genus | Agromyces | 0.001043 | 0.001581 | |||||||||||||||||||||||||||||
271 | genus | Microbacterium | 0.004619 | 0.014898 | |||||||||||||||||||||||||||||
272 | genus | Frondihabitans | 0.004982 | ||||||||||||||||||||||||||||||
273 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 0.009238 | 0.004496 | 0.000965 | 0.001467 | 0.003034 | ||||||||||||||||||||||||||
274 | family | Unclassified Micrococcales | 0.006178 | 0.008863 | 0.019929 | 0.001043 | 0.002966 | 0.000753 | 0.007572 | ||||||||||||||||||||||||
275 | order | Corynebacteriales | 0.103701 | 0.080427 | 0.215793 | 0.050285 | 0.227102 | 0.001694 | 0.136636 | ||||||||||||||||||||||||
276 | family | Mycobacteriaceae | 0.043003 | 0.003154 | 0.116496 | 0.003154 | 0.096553 | 0.030132 | |||||||||||||||||||||||||
277 | genus | Mycobacterium | 0.021701 | 0.065317 | 0.049586 | 0.007500 | |||||||||||||||||||||||||||
278 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 0.021302 | 0.003154 | 0.051180 | 0.003154 | 0.046967 | 0.022632 | |||||||||||||||||||||||||
279 | family | Nocardiaceae | 0.034430 | 0.017709 | 0.062567 | 0.017920 | 0.053334 | 0.001694 | 0.027025 | ||||||||||||||||||||||||
280 | genus | Nocardia | 0.004950 | 0.001083 | 0.001499 | ||||||||||||||||||||||||||||
281 | species | Nocardia sp. 348MFTsu5.1 | 0.002475 | 0.001083 | |||||||||||||||||||||||||||||
282 | species | Unclassified Nocardia | 0.002475 | 0.001499 | |||||||||||||||||||||||||||||
283 | genus | Rhodococcus | 0.022624 | 0.012938 | 0.062567 | 0.012938 | 0.034846 | 0.010494 | |||||||||||||||||||||||||
284 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 0.006855 | 0.004771 | 0.004982 | 0.017405 | 0.001694 | 0.015032 | |||||||||||||||||||||||||
285 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.026268 | 0.059564 | 0.036730 | 0.029210 | 0.077215 | 0.079479 | |||||||||||||||||||||||||
286 | order | Micromonosporales | 0.001275 | 0.004598 | 0.019312 | 0.002127 | |||||||||||||||||||||||||||
287 | family | Micromonosporaceae | 0.001275 | 0.004598 | 0.019312 | 0.001034 | |||||||||||||||||||||||||||
288 | genus | Actinoplanes | 0.014496 | ||||||||||||||||||||||||||||||
289 | genus | Unclassified Micromonosporaceae | 0.001275 | 0.004598 | 0.004817 | 0.001034 | |||||||||||||||||||||||||||
290 | family | Unclassified Micromonosporales | 0.001092 | ||||||||||||||||||||||||||||||
291 | order | Propionibacteriales | 0.051754 | 0.001661 | 0.009542 | 0.087194 | 0.004982 | 0.001050 | 0.020206 | 0.017440 | 0.006077 | ||||||||||||||||||||||
292 | family | Propionibacteriaceae | 0.002164 | 0.001661 | |||||||||||||||||||||||||||||
293 | family | Nocardioidaceae | 0.042056 | 0.009542 | 0.065409 | 0.004982 | 0.012790 | 0.007134 | 0.003039 | ||||||||||||||||||||||||
294 | genus | Actinopolymorpha | 0.002481 | ||||||||||||||||||||||||||||||
295 | genus | Nocardioides | 0.002589 | 0.013273 | 0.004309 | 0.005399 | |||||||||||||||||||||||||||
296 | genus | Aeromicrobium | 0.007407 | 0.001056 | |||||||||||||||||||||||||||||
297 | genus | Pimelobacter | 0.001301 | ||||||||||||||||||||||||||||||
298 | genus | Unclassified Nocardioidaceae | 0.028278 | 0.009542 | 0.052136 | 0.004982 | 0.007425 | 0.001735 | 0.003039 | ||||||||||||||||||||||||
299 | family | Unclassified Propionibacteriales | 0.007534 | 0.021785 | 0.001050 | 0.007417 | 0.010306 | 0.003039 | |||||||||||||||||||||||||
300 | order | Pseudonocardiales | 0.002643 | 0.004910 | |||||||||||||||||||||||||||||
301 | family | Pseudonocardiaceae | 0.002643 | ||||||||||||||||||||||||||||||
302 | family | Unclassified Pseudonocardiales | 0.004910 | ||||||||||||||||||||||||||||||
303 | order | Streptomycetales | 0.003328 | 0.017744 | 0.000985 | 0.017744 | 0.000985 | 0.003950 | 0.013549 | ||||||||||||||||||||||||
304 | family | Streptomycetaceae | 0.002626 | 0.017744 | 0.000985 | 0.017744 | 0.000985 | 0.003950 | 0.007557 | ||||||||||||||||||||||||
305 | genus | Streptomyces | 0.001261 | 0.006136 | 0.006136 | ||||||||||||||||||||||||||||
306 | genus | Unclassified Streptomycetaceae | 0.001366 | 0.011608 | 0.000985 | 0.011608 | 0.000985 | 0.003950 | 0.007557 | ||||||||||||||||||||||||
307 | family | Unclassified Streptomycetales | 0.000702 | 0.005993 | |||||||||||||||||||||||||||||
308 | order | Streptosporangiales | 0.002893 | 0.002893 | |||||||||||||||||||||||||||||
309 | family | Streptosporangiaceae | 0.002893 | 0.002893 | |||||||||||||||||||||||||||||
310 | genus | Streptosporangium | 0.002893 | 0.002893 | |||||||||||||||||||||||||||||
311 | species | Streptosporangium roseum | 0.002893 | 0.002893 | |||||||||||||||||||||||||||||
312 | order | Frankiales | 0.002016 | 0.009073 | 0.005214 | ||||||||||||||||||||||||||||
313 | family | Frankiaceae | 0.002016 | 0.004178 | |||||||||||||||||||||||||||||
314 | family | Unclassified Frankiales | 0.009073 | 0.001036 | |||||||||||||||||||||||||||||
315 | order | Unclassified Actinobacteria | 0.100777 | 0.009123 | 0.300008 | 0.056613 | 0.197977 | 0.164172 | 0.023230 | 0.000753 | 0.454815 | ||||||||||||||||||||||
316 | class | Acidimicrobiia | 0.001501 | ||||||||||||||||||||||||||||||
317 | order | Acidimicrobiales | 0.001501 | ||||||||||||||||||||||||||||||
318 | family | Acidimicrobiaceae | 0.001501 | ||||||||||||||||||||||||||||||
319 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.033901 | 0.070773 | 0.058089 | 0.100439 | 0.073062 | 0.002126 | 0.144190 | ||||||||||||||||||||||||
320 | phylum | Planctomycetes | 0.030132 | 0.000907 | 0.005936 | 0.001762 | 0.004497 | 0.016876 | 0.015647 | ||||||||||||||||||||||||
321 | class | Planctomycetia | 0.022838 | 0.000907 | 0.004999 | 0.001762 | 0.004497 | 0.005563 | 0.012723 | ||||||||||||||||||||||||
322 | order | Planctomycetales | 0.016911 | 0.000907 | 0.003125 | 0.001762 | 0.004127 | 0.012723 | |||||||||||||||||||||||||
323 | family | Planctomycetaceae | 0.005941 | 0.001591 | |||||||||||||||||||||||||||||
324 | family | Gemmataceae | 0.001251 | 0.002218 | 0.001762 | 0.004750 | |||||||||||||||||||||||||||
325 | genus | Gemmata | 0.001762 | ||||||||||||||||||||||||||||||
326 | genus | Zavarzinella | 0.001109 | ||||||||||||||||||||||||||||||
327 | genus | Unclassified Gemmataceae | 0.001251 | 0.001109 | 0.004750 | ||||||||||||||||||||||||||||
328 | family | Unclassified Planctomycetales | 0.009718 | 0.000907 | 0.000907 | 0.004127 | 0.006382 | ||||||||||||||||||||||||||
329 | order | Unclassified Planctomycetia | 0.005927 | 0.001874 | 0.004497 | 0.001435 | |||||||||||||||||||||||||||
330 | class | Phycisphaerae | 0.002490 | 0.001462 | |||||||||||||||||||||||||||||
331 | order | Phycisphaerales | 0.002490 | 0.001462 | |||||||||||||||||||||||||||||
332 | family | Phycisphaeraceae | 0.001245 | ||||||||||||||||||||||||||||||
333 | family | Unclassified Phycisphaerales | 0.001245 | 0.001462 | |||||||||||||||||||||||||||||
334 | class | Unclassified Planctomycetes | 0.004804 | 0.000937 | 0.011313 | 0.001462 | |||||||||||||||||||||||||||
335 | phylum | Spirochaetes | 0.012236 | ||||||||||||||||||||||||||||||
336 | phylum | Lentisphaerae | 0.003239 | ||||||||||||||||||||||||||||||
337 | phylum | Acidobacteria | 0.007147 | 0.007849 | 0.011570 | 0.011651 | |||||||||||||||||||||||||||
338 | class | Acidobacteriia | 0.007147 | 0.005783 | 0.008743 | ||||||||||||||||||||||||||||
339 | order | Acidobacteriales | 0.007147 | 0.005783 | 0.008743 | ||||||||||||||||||||||||||||
340 | family | Acidobacteriaceae | 0.007147 | 0.005783 | 0.007289 | ||||||||||||||||||||||||||||
341 | genus | Terriglobus | 0.001205 | 0.002887 | 0.001473 | ||||||||||||||||||||||||||||
342 | species | Terriglobus roseus | 0.001205 | 0.002887 | |||||||||||||||||||||||||||||
343 | species | Unclassified Terriglobus | 0.001473 | ||||||||||||||||||||||||||||||
344 | genus | Granulicella | 0.004736 | 0.001448 | 0.004362 | ||||||||||||||||||||||||||||
345 | genus | Unclassified Acidobacteriaceae | 0.001205 | 0.001448 | 0.001454 | ||||||||||||||||||||||||||||
346 | family | Unclassified Acidobacteriales | 0.001454 | ||||||||||||||||||||||||||||||
347 | class | Solibacteres | 0.002243 | ||||||||||||||||||||||||||||||
348 | order | Solibacterales | 0.002243 | ||||||||||||||||||||||||||||||
349 | family | Solibacteraceae | 0.002243 | ||||||||||||||||||||||||||||||
350 | class | Unclassified Acidobacteria | 0.005606 | 0.005787 | 0.002908 | ||||||||||||||||||||||||||||
351 | phylum | Armatimonadetes | 0.002462 | 0.001559 | |||||||||||||||||||||||||||||
352 | class | Chthonomonadetes | 0.001559 | ||||||||||||||||||||||||||||||
353 | order | Chthonomonadales | 0.001559 | ||||||||||||||||||||||||||||||
354 | family | Chthonomonadaceae | 0.001559 | ||||||||||||||||||||||||||||||
355 | class | Fimbriimonadia | 0.002462 | ||||||||||||||||||||||||||||||
356 | order | Fimbriimonadales | 0.002462 | ||||||||||||||||||||||||||||||
357 | family | Fimbriimonadaceae | 0.002462 | ||||||||||||||||||||||||||||||
358 | genus | Fimbriimonas | 0.001184 | ||||||||||||||||||||||||||||||
359 | genus | Unclassified Fimbriimonadaceae | 0.001278 | ||||||||||||||||||||||||||||||
360 | phylum | Verrucomicrobia | 0.056651 | 0.109215 | 0.044839 | 0.006594 | 0.201607 | 0.205783 | 0.001547 | 0.155008 | |||||||||||||||||||||||
361 | class | Spartobacteria | 0.016401 | 0.014729 | 0.001637 | 0.014947 | 0.025410 | 0.030666 | |||||||||||||||||||||||||
362 | order | Chthoniobacterales | 0.009691 | 0.009820 | 0.013453 | 0.025410 | 0.030666 | ||||||||||||||||||||||||||
363 | family | Chthoniobacteraceae | 0.009691 | 0.009820 | 0.011958 | 0.023916 | 0.023365 | ||||||||||||||||||||||||||
364 | genus | Chthoniobacter | 0.008200 | 0.004484 | 0.014947 | 0.004381 | |||||||||||||||||||||||||||
365 | species | Chthoniobacter flavus | 0.002989 | ||||||||||||||||||||||||||||||
366 | species | Unclassified Chthoniobacter | 0.008200 | 0.001495 | 0.014947 | 0.004381 | |||||||||||||||||||||||||||
367 | genus | Unclassified Chthoniobacteraceae | 0.001491 | 0.009820 | 0.007474 | 0.008968 | 0.018984 | ||||||||||||||||||||||||||
368 | family | Unclassified Chthoniobacterales | 0.001495 | 0.001495 | 0.007301 | ||||||||||||||||||||||||||||
369 | order | Unclassified Spartobacteria | 0.006709 | 0.004910 | 0.001637 | 0.001495 | |||||||||||||||||||||||||||
370 | species | Verrucomicrobia bacterium IMCC26134 | 0.001467 | ||||||||||||||||||||||||||||||
371 | class | Verrucomicrobiae | 0.017040 | 0.038170 | 0.004982 | 0.043475 | 0.041000 | 0.001547 | 0.038493 | ||||||||||||||||||||||||
372 | order | Verrucomicrobiales | 0.014607 | 0.033398 | 0.004982 | 0.035980 | 0.038074 | 0.038493 | |||||||||||||||||||||||||
373 | family | Verrucomicrobia subdivision 3 | 0.003590 | 0.004394 | 0.001462 | ||||||||||||||||||||||||||||
374 | genus | Pedosphaera | 0.003590 | ||||||||||||||||||||||||||||||
375 | genus | Unclassified Verrucomicrobia subdivision 3 | 0.004394 | 0.001462 | |||||||||||||||||||||||||||||
376 | family | Rubritaleaceae | 0.004432 | ||||||||||||||||||||||||||||||
377 | genus | Rubritalea | 0.001477 | ||||||||||||||||||||||||||||||
378 | genus | Unclassified Rubritaleaceae | 0.002955 | ||||||||||||||||||||||||||||||
379 | family | Verrucomicrobiaceae | 0.008569 | 0.028627 | 0.029983 | 0.026323 | 0.018510 | ||||||||||||||||||||||||||
380 | genus | Verrucomicrobium | 0.004897 | 0.019085 | 0.010494 | 0.017549 | 0.004627 | ||||||||||||||||||||||||||
381 | species | Verrucomicrobium spinosum | 0.001224 | ||||||||||||||||||||||||||||||
382 | species | Unclassified Verrucomicrobium | 0.003672 | 0.019085 | 0.010494 | 0.017549 | 0.004627 | ||||||||||||||||||||||||||
383 | genus | Unclassified Verrucomicrobiaceae | 0.003672 | 0.009542 | 0.019489 | 0.008774 | 0.013882 | ||||||||||||||||||||||||||
384 | family | Unclassified Verrucomicrobiales | 0.002448 | 0.004771 | 0.004982 | 0.005997 | 0.002925 | 0.018521 | |||||||||||||||||||||||||
385 | order | Unclassified Verrucomicrobiae | 0.002432 | 0.004771 | 0.007496 | 0.002927 | 0.001547 | ||||||||||||||||||||||||||
386 | class | Opitutae | 0.008305 | 0.001683 | 0.017589 | 0.031273 | 0.047446 | ||||||||||||||||||||||||||
387 | order | Opitutales | 0.002357 | 0.017589 | 0.029787 | 0.043032 | |||||||||||||||||||||||||||
388 | family | Opitutaceae | 0.002357 | 0.014658 | 0.029787 | 0.028870 | |||||||||||||||||||||||||||
389 | genus | Opitutus | 0.001467 | 0.004276 | 0.001330 | ||||||||||||||||||||||||||||
390 | genus | Lacunisphaera | 0.001465 | 0.001417 | 0.002921 | ||||||||||||||||||||||||||||
391 | genus | Unclassified Opitutaceae | 0.002357 | 0.011727 | 0.024093 | 0.024620 | |||||||||||||||||||||||||||
392 | family | Unclassified Opitutales | 0.002931 | 0.014162 | |||||||||||||||||||||||||||||
393 | order | Puniceicoccales | 0.003590 | 0.001486 | 0.001493 | ||||||||||||||||||||||||||||
394 | family | Puniceicoccaceae | 0.003590 | 0.001486 | |||||||||||||||||||||||||||||
395 | family | Unclassified Puniceicoccales | 0.001493 | ||||||||||||||||||||||||||||||
396 | order | Unclassified Opitutae | 0.002357 | 0.001683 | 0.002921 | ||||||||||||||||||||||||||||
397 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 0.014907 | 0.056316 | 0.039857 | 0.003274 | 0.124129 | 0.108100 | 0.038403 | ||||||||||||||||||||||||
398 | phylum | Bacteroidetes | 0.322077 | 0.001154 | 0.001583 | 0.081656 | 0.286789 | 0.127968 | 0.015613 | 0.345324 | 4.749479e-03 | 0.116991 | 0.001435 | 0.015045 | |||||||||||||||||||
399 | order | Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.015045 | ||||||||||||||||||||||||||||||
400 | family | Rhodothermaceae | 0.009861 | ||||||||||||||||||||||||||||||
401 | family | Unclassified Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.005184 | ||||||||||||||||||||||||||||||
402 | class | Flavobacteriia | 0.078569 | 0.001154 | 0.017985 | 0.057665 | 0.009964 | 0.013898 | 0.080915 | 1.196697e-03 | 0.002998 | ||||||||||||||||||||||
403 | order | Flavobacteriales | 0.074977 | 0.001154 | 0.017985 | 0.057665 | 0.009964 | 0.013898 | 0.078756 | 1.196697e-03 | 0.002998 | ||||||||||||||||||||||
404 | family | Flavobacteriaceae | 0.074181 | 0.004496 | 0.057665 | 0.009964 | 0.012163 | 0.076597 | 1.196697e-03 | 0.001499 | |||||||||||||||||||||||
405 | genus | Flavobacterium | 0.067384 | 0.057665 | 0.004982 | 0.006999 | 0.069045 | 1.196697e-03 | |||||||||||||||||||||||||
406 | species | Flavobacterium sp. CF136 | 0.000795 | ||||||||||||||||||||||||||||||
407 | species | Flavobacterium sp. WG21 | 0.002410 | ||||||||||||||||||||||||||||||
408 | species | Flavobacterium johnsoniae | 0.008875 | ||||||||||||||||||||||||||||||
409 | species | Unclassified Flavobacterium | 0.064178 | 0.048790 | 0.004982 | 0.006999 | 0.069045 | 1.196697e-03 | |||||||||||||||||||||||||
410 | genus | Unclassified Flavobacteriaceae | 0.006798 | 0.004496 | 0.004982 | 0.005165 | 0.007552 | 0.001499 | |||||||||||||||||||||||||
411 | family | Unclassified Flavobacteriales | 0.000795 | 0.001154 | 0.013489 | 0.001735 | 0.002159 | 0.001499 | |||||||||||||||||||||||||
412 | order | Unclassified Flavobacteriia | 0.003593 | 0.002159 | |||||||||||||||||||||||||||||
413 | class | Sphingobacteriia | 0.011122 | 0.001583 | 0.004457 | 0.069194 | 0.004982 | 0.018448 | 0.013492 | ||||||||||||||||||||||||
414 | order | Sphingobacteriales | 0.010328 | 0.001583 | 0.069194 | 0.004982 | 0.016263 | 0.011993 | |||||||||||||||||||||||||
415 | family | Sphingobacteriaceae | 0.010328 | 0.001583 | 0.064554 | 0.004982 | 0.011940 | 0.010494 | |||||||||||||||||||||||||
416 | genus | Arcticibacter | 0.001583 | ||||||||||||||||||||||||||||||
417 | species | Arcticibacter svalbardensis | 0.001583 | ||||||||||||||||||||||||||||||
418 | genus | Mucilaginibacter | 0.002383 | 0.008722 | 0.006518 | ||||||||||||||||||||||||||||
419 | genus | Pedobacter | 0.041848 | 0.003250 | |||||||||||||||||||||||||||||
420 | species | Pedobacter sp. BAL39 | 0.004640 | ||||||||||||||||||||||||||||||
421 | species | Unclassified Pedobacter | 0.037207 | 0.003250 | |||||||||||||||||||||||||||||
422 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 0.007945 | 0.013985 | 0.004982 | 0.002172 | 0.010494 | ||||||||||||||||||||||||||
423 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.004640 | 0.004324 | 0.001499 | ||||||||||||||||||||||||||||
424 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.000794 | 0.004457 | 0.002185 | 0.001499 | |||||||||||||||||||||||||||
425 | class | Chitinophagia | 0.026824 | 0.004476 | 0.018036 | 0.027029 | 0.007496 | ||||||||||||||||||||||||||
426 | order | Chitinophagales | 0.022879 | 0.018036 | 0.020565 | 0.005997 | |||||||||||||||||||||||||||
427 | family | Chitinophagaceae | 0.018143 | 0.018036 | 0.014057 | 0.002998 | |||||||||||||||||||||||||||
428 | genus | Niastella | 0.004619 | 0.003249 | |||||||||||||||||||||||||||||
429 | genus | Niabella | 0.003946 | ||||||||||||||||||||||||||||||
430 | species | Niabella ginsenosidivorans | 0.000790 | ||||||||||||||||||||||||||||||
431 | species | Unclassified Niabella | 0.003155 | ||||||||||||||||||||||||||||||
432 | genus | Segetibacter | 0.000790 | 0.001073 | |||||||||||||||||||||||||||||
433 | genus | Filimonas | 0.008798 | ||||||||||||||||||||||||||||||
434 | genus | Chitinophaga | 0.001076 | ||||||||||||||||||||||||||||||
435 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 0.013408 | 0.004619 | 0.008659 | 0.002998 | |||||||||||||||||||||||||||
436 | family | Unclassified Chitinophagales | 0.004736 | 0.006508 | 0.002998 | ||||||||||||||||||||||||||||
437 | order | Unclassified Chitinophagia | 0.003944 | 0.004476 | 0.006463 | 0.001499 | |||||||||||||||||||||||||||
438 | class | Cytophagia | 0.129292 | 0.020416 | 0.123800 | 0.020416 | 0.117260 | 0.031540 | |||||||||||||||||||||||||
439 | order | Cytophagales | 0.119970 | 0.017572 | 0.119202 | 0.017572 | 0.108645 | 0.030036 | |||||||||||||||||||||||||
440 | family | Hymenobacteraceae | 0.011802 | 0.011802 | 0.001504 | ||||||||||||||||||||||||||||
441 | genus | Hymenobacter | 0.005853 | 0.005853 | |||||||||||||||||||||||||||||
442 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.005949 | 0.005949 | 0.001504 | ||||||||||||||||||||||||||||
443 | family | Cytophagaceae | 0.113772 | 0.002885 | 0.119202 | 0.002885 | 0.091429 | 0.019529 | |||||||||||||||||||||||||
444 | genus | Spirosoma | 0.011512 | 0.009196 | 0.007542 | 0.007496 | |||||||||||||||||||||||||||
445 | species | Spirosoma linguale | 0.000762 | 0.001078 | |||||||||||||||||||||||||||||
446 | species | Spirosoma spitsbergense | 0.002998 | ||||||||||||||||||||||||||||||
447 | species | Unclassified Spirosoma | 0.010750 | 0.009196 | 0.006463 | 0.004497 | |||||||||||||||||||||||||||
448 | genus | Dyadobacter | 0.005464 | 0.036785 | 0.029021 | ||||||||||||||||||||||||||||
449 | species | Dyadobacter beijingensis | 0.002145 | ||||||||||||||||||||||||||||||
450 | species | Unclassified Dyadobacter | 0.005464 | 0.036785 | 0.026876 | ||||||||||||||||||||||||||||
451 | genus | Fibrisoma | 0.000780 | ||||||||||||||||||||||||||||||
452 | genus | Fibrella | 0.004536 | 0.001076 | |||||||||||||||||||||||||||||
453 | genus | Cytophaga | 0.004756 | 0.018227 | 0.004313 | 0.009035 | |||||||||||||||||||||||||||
454 | species | Cytophaga aurantiaca | 0.000793 | ||||||||||||||||||||||||||||||
455 | species | Unclassified Cytophaga | 0.003963 | 0.018227 | 0.004313 | 0.009035 | |||||||||||||||||||||||||||
456 | genus | Unclassified Cytophagaceae | 0.091260 | 0.002885 | 0.050457 | 0.002885 | 0.049476 | 0.002998 | |||||||||||||||||||||||||
457 | family | Unclassified Cytophagales | 0.006198 | 0.002885 | 0.002885 | 0.017216 | 0.009004 | ||||||||||||||||||||||||||
458 | order | Unclassified Cytophagia | 0.009323 | 0.002844 | 0.004598 | 0.002844 | 0.008615 | 0.001504 | |||||||||||||||||||||||||
459 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.076270 | 0.034321 | 0.018094 | 0.092605 | 0.001715 | 0.101672 | 3.552783e-03 | 0.061465 | 0.001435 | ||||||||||||||||||||||
460 | phylum | Unclassified Bacteria | 0.428510 | 0.005428 | 0.004979 | 0.004344 | 0.001632 | 0.750813 | 0.068197 | 0.892664 | 0.032994 | 0.002739 | 0.242554 | 0.012891 | 3.469447e-18 | 1.017293 | 0.149349 | 0.003459 | 0.061392 | ||||||||||||||
461 | superkingdom | Archaea | 0.001236 | 0.001458 | |||||||||||||||||||||||||||||
462 | phylum | Euryarchaeota | 0.001236 | ||||||||||||||||||||||||||||||
463 | class | Halobacteria | 0.001236 | ||||||||||||||||||||||||||||||
464 | phylum | Unclassified Archaea | 0.001458 | ||||||||||||||||||||||||||||||
465 | superkingdom | Unclassified | 0.001501 | 0.004556 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NapA | 0.02965 | 32 | 90.81 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapB | 0.01258 | 5 | 86.08 | Periplasmic nitrate reductase cytochrome c550-type subunit |
NapC | 0.01549 | 6 | 90.05 | Cytochrome c-type protein NapC |
NapD | 0.01577 | 4 | 67.23 | Periplasmic nitrate reductase component NapD |
NapE | 0.01090 | 2 | 81.85 | Periplasmic nitrate reductase component NapE |
NapG | 0.00245 | 1 | 53.30 | Ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.04011 | 62 | 93.89 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.02700 | 20 | 95.28 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.02655 | 11 | 87.48 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.02238 | 9 | 79.92 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 2.56451 | 3296 | 82.87 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.73361 | 465 | 78.76 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.01071 | 8 | 86.79 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NifD_AnfD_VnfD | 0.00991 | 7 | 93.79 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NifH_AnfH_VnfH | 0.01664 | 8 | 93.76 | Nitrogenase reductase and maturation protein NifH/AnfH/VnfH |
NifK_AnfK_VnfK | 0.01505 | 11 | 94.56 | Nitrogenase beta chain (EC 1.18.6.1) NifK/AnfK/VnfK |
NirA | 0.50158 | 406 | 76.66 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 2.81126 | 3065 | 87.84 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 2.15342 | 691 | 80.74 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.09603 | 59 | 75.84 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirS | 0.00108 | 1 | 82.60 | nirS; Cytochrome cd1 nitrite reductase (NO-forming) / hydroxylamine reductase [EC:1.7.2.1 1.7.99.1] |
NirT | 0.00267 | 1 | 83.30 | Cytochrome c-type protein NirT |
NirU | 0.34198 | 259 | 80.85 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.01643 | 15 | 90.09 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfA | 0.00583 | 4 | 90.35 | nrfA; nitrite reductase (cytochrome c-552) [EC:1.7.2.2] |
UreA | 2.65198 | 786 | 88.14 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 2.65018 | 810 | 84.24 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 3.56293 | 2818 | 91.31 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.01513 | 6 | 70.45 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.02953 | 29 | 86.08 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.00583 | 4 | 90.35 |
Denitrification | 0.16088 | 111 | 80.28 |
Nitrate assimilatory reduction | 3.29812 | 3761 | 82.36 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.20287 | 152 | 90.60 |
Nitrite assimilation | 5.80823 | 4421 | 85.30 |
Nitrogen fixation | 0.05231 | 34 | 92.39 |
Urease | 8.86509 | 4414 | 89.45 |
NapD | NapC | NarJ | NasA | NapG | NirT | NifH_AnfH_VnfH | NarH_NxrB | NapA | NifK_AnfK_VnfK | NirS | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NirD | UreA | NirK | cNor-C | NosZ | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapE | NapB | NrfA | NarI | NifB | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.015768 | 0.015489 | 0.022376 | 2.564511 | 0.00245 | 0.002672 | 0.016641 | 0.027002 | 0.029645 | 0.015046 | 0.001081 | 0.009912 | 2.650176 | 2.153415 | 2.651981 | 0.096027 | 0.015130 | 0.016434 | 2.811255 | 0.733608 | 0.040110 | 0.029532 | 3.562934 | 0.501579 | 0.010904 | 0.012584 | 0.005835 | 2.654637e-02 | 0.010706 | 0.341980 |
2 | norank | Unknown | 0.004218 | 0.015596 | 0.009363 | 0.018895 | 0.003895 | |||||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.015768 | 0.015489 | 0.022376 | 2.560293 | 0.00245 | 0.002672 | 0.016641 | 0.027002 | 0.029645 | 0.015046 | 0.001081 | 0.009912 | 2.618830 | 2.153415 | 2.640141 | 0.096027 | 0.015130 | 0.016434 | 2.811255 | 0.733608 | 0.040110 | 0.029532 | 3.537672 | 0.495244 | 0.010904 | 0.012584 | 0.005835 | 2.654637e-02 | 0.010706 | 0.341980 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.021483 | 0.007132 | 0.001267 | 0.003848 | ||||||||||||||||||||||||||
5 | order | Synechococcales | 0.003128 | 0.003537 | ||||||||||||||||||||||||||||
6 | family | Synechococcaceae | 0.002079 | 0.003537 | ||||||||||||||||||||||||||||
7 | family | Unclassified Synechococcales | 0.001049 | |||||||||||||||||||||||||||||
8 | class | Unclassified Cyanobacteria | 0.018354 | 0.003595 | 0.001267 | 0.003848 | ||||||||||||||||||||||||||
9 | phylum | Proteobacteria | 0.015768 | 0.015489 | 0.017389 | 1.526998 | 0.002672 | 0.012468 | 0.020590 | 0.029645 | 0.010948 | 0.005630 | 1.384105 | 1.154126 | 1.218249 | 0.057658 | 0.005205 | 0.015309 | 1.532134 | 0.577727 | 0.027820 | 0.022529 | 1.653417 | 0.221845 | 0.010904 | 0.012584 | 1.241625e-02 | 0.008148 | 0.223972 | |||
10 | class | Gammaproteobacteria | 0.002397 | 0.128105 | 0.004131 | 0.141543 | 0.087194 | 0.117900 | 0.003371 | 0.125824 | 0.020432 | 0.007052 | 0.001005 | 0.154966 | ||||||||||||||||||
11 | order | Chromatiales | 0.001857 | |||||||||||||||||||||||||||||
12 | order | Xanthomonadales | 0.003371 | |||||||||||||||||||||||||||||
13 | family | Rhodanobacteraceae | 0.003371 | |||||||||||||||||||||||||||||
14 | order | Methylococcales | 0.001163 | |||||||||||||||||||||||||||||
15 | order | Oceanospirillales | 0.001709 | 0.003276 | 0.003071 | 0.001553 | ||||||||||||||||||||||||||
16 | family | Halomonadaceae | 0.001709 | 0.003276 | 0.003071 | |||||||||||||||||||||||||||
17 | family | Unclassified Oceanospirillales | 0.001553 | |||||||||||||||||||||||||||||
18 | order | Cellvibrionales | 0.003402 | |||||||||||||||||||||||||||||
19 | family | Cellvibrionaceae | 0.003402 | |||||||||||||||||||||||||||||
20 | order | Nevskiales | 0.001341 | 0.001341 | ||||||||||||||||||||||||||||
21 | family | Sinobacteraceae | 0.001341 | 0.001341 | ||||||||||||||||||||||||||||
22 | genus | Solimonas | 0.001341 | 0.001341 | ||||||||||||||||||||||||||||
23 | order | Pseudomonadales | 0.092530 | 0.132273 | 0.067237 | 0.115443 | 0.090424 | 0.011526 | 0.000639 | 0.001005 | 0.148684 | |||||||||||||||||||||
24 | family | Pseudomonadaceae | 0.085745 | 0.132273 | 0.064055 | 0.111759 | 0.079605 | 0.011526 | 0.000639 | 0.001005 | 0.142391 | |||||||||||||||||||||
25 | genus | Pseudomonas | 0.041254 | 0.114063 | 0.041774 | 0.097021 | 0.057810 | 0.006590 | 0.000639 | 0.001005 | 0.087785 | |||||||||||||||||||||
26 | species | Pseudomonas sp. GM16 | 0.000857 | |||||||||||||||||||||||||||||
27 | species | Pseudomonas rhizosphaerae | 0.003684 | |||||||||||||||||||||||||||||
28 | species | Pseudomonas fluorescens | 0.001466 | |||||||||||||||||||||||||||||
29 | species | Pseudomonas syringae | 0.000856 | 0.005977 | 0.001645 | |||||||||||||||||||||||||||
30 | species | Pseudomonas mandelii | 0.001005 | |||||||||||||||||||||||||||||
31 | species | Unclassified Pseudomonas | 0.038075 | 0.114063 | 0.035796 | 0.093337 | 0.057810 | 0.004945 | 0.000639 | 0.087785 | ||||||||||||||||||||||
32 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 0.044491 | 0.018210 | 0.022282 | 0.014737 | 0.021795 | 0.004936 | 0.054606 | |||||||||||||||||||||||
33 | family | Unclassified Pseudomonadales | 0.006785 | 0.003182 | 0.003684 | 0.010819 | 0.006293 | |||||||||||||||||||||||||
34 | order | Enterobacterales | 0.002397 | 0.002716 | 0.004131 | 0.003638 | 0.003205 | |||||||||||||||||||||||||
35 | family | Erwiniaceae | 0.002397 | 0.002731 | 0.000641 | |||||||||||||||||||||||||||
36 | genus | Pantoea | 0.001821 | |||||||||||||||||||||||||||||
37 | genus | Erwinia | 0.002397 | 0.000910 | 0.000641 | |||||||||||||||||||||||||||
38 | species | Erwinia billingiae | 0.002397 | 0.000910 | ||||||||||||||||||||||||||||
39 | species | Unclassified Erwinia | 0.000641 | |||||||||||||||||||||||||||||
40 | family | Pectobacteriaceae | 0.000623 | |||||||||||||||||||||||||||||
41 | family | Yersiniaceae | 0.000869 | |||||||||||||||||||||||||||||
42 | family | Enterobacteriaceae | 0.000579 | |||||||||||||||||||||||||||||
43 | genus | Gibbsiella | 0.000579 | |||||||||||||||||||||||||||||
44 | family | Unclassified Enterobacterales | 0.000644 | 0.004131 | 0.000907 | 0.002564 | ||||||||||||||||||||||||||
45 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 0.029987 | 0.005994 | 0.012142 | 0.002457 | 0.029905 | 0.006011 | 0.003208 | 0.006282 | ||||||||||||||||||||||
46 | class | Acidithiobacillia | 0.000838 | |||||||||||||||||||||||||||||
47 | class | Alphaproteobacteria | 0.003376 | 0.015489 | 0.489156 | 0.008294 | 0.001394 | 0.011013 | 0.006849 | 0.004223 | 0.471337 | 0.339664 | 0.512399 | 0.031981 | 0.005205 | 0.013393 | 0.387782 | 0.254817 | 0.003545 | 0.582527 | 0.188833 | 0.010904 | 0.012584 | 0.002716 | 0.213332 | |||||||
48 | order | Rhodospirillales | 0.001836 | 0.001865 | 0.002537 | 0.003972 | ||||||||||||||||||||||||||
49 | family | Rhodospirillaceae | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||||||
50 | family | Acetobacteraceae | 0.001269 | 0.001325 | ||||||||||||||||||||||||||||
51 | genus | Granulibacter | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||||||
52 | genus | Unclassified Acetobacteraceae | 0.001325 | |||||||||||||||||||||||||||||
53 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.001836 | 0.001865 | 0.002647 | |||||||||||||||||||||||||||
54 | order | Rhodobacterales | 0.000877 | 0.003654 | 0.003402 | 0.025611 | 0.000777 | 0.001867 | 0.008166 | 0.003806 | ||||||||||||||||||||||
55 | family | Rhodobacteraceae | 0.000877 | 0.003402 | 0.022016 | 0.000936 | 0.004899 | |||||||||||||||||||||||||
56 | genus | Labrenzia | 0.000936 | |||||||||||||||||||||||||||||
57 | genus | Unclassified Rhodobacteraceae | 0.000877 | 0.003402 | 0.022016 | 0.004899 | ||||||||||||||||||||||||||
58 | family | Unclassified Rhodobacterales | 0.003654 | 0.003595 | 0.000777 | 0.000930 | 0.003266 | 0.003806 | ||||||||||||||||||||||||
59 | order | Sphingomonadales | 0.167715 | 0.007161 | 0.193407 | 0.007369 | 0.014207 | 0.166907 | 0.001008 | 0.015219 | 0.001358 | |||||||||||||||||||||
60 | family | Erythrobacteraceae | 0.000896 | 0.003182 | ||||||||||||||||||||||||||||
61 | genus | Croceicoccus | 0.003182 | |||||||||||||||||||||||||||||
62 | genus | Unclassified Erythrobacteraceae | 0.000896 | |||||||||||||||||||||||||||||
63 | family | Sphingomonadaceae | 0.148024 | 0.007161 | 0.166773 | 0.007369 | 0.014207 | 0.133047 | 0.001008 | 0.012684 | 0.001358 | |||||||||||||||||||||
64 | genus | Sphingomonas | 0.031301 | 0.060128 | 0.002030 | 0.029380 | 0.001358 | |||||||||||||||||||||||||
65 | species | Sphingomonas taxi | 0.003376 | 0.000923 | ||||||||||||||||||||||||||||
66 | species | Sphingomonas panacis | 0.001797 | 0.006650 | 0.001828 | |||||||||||||||||||||||||||
67 | species | Sphingomonas hengshuiensis | 0.001358 | |||||||||||||||||||||||||||||
68 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.029505 | 0.050102 | 0.002030 | 0.026629 | ||||||||||||||||||||||||||
69 | genus | Blastomonas | 0.000889 | |||||||||||||||||||||||||||||
70 | genus | Sphingobium | 0.005309 | 0.016790 | 0.000915 | |||||||||||||||||||||||||||
71 | genus | Novosphingobium | 0.000883 | 0.003624 | 0.009927 | 0.007335 | 0.002537 | |||||||||||||||||||||||||
72 | genus | Sphingopyxis | 0.000874 | 0.000928 | ||||||||||||||||||||||||||||
73 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.108767 | 0.003537 | 0.079928 | 0.007369 | 0.012177 | 0.094489 | 0.001008 | 0.010146 | ||||||||||||||||||||||
74 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.018794 | 0.023452 | 0.033860 | 0.002535 | ||||||||||||||||||||||||||
75 | order | Caulobacterales | 0.019983 | 0.025748 | 0.028937 | |||||||||||||||||||||||||||
76 | family | Caulobacteraceae | 0.019983 | 0.022931 | 0.020543 | |||||||||||||||||||||||||||
77 | genus | Phenylobacterium | 0.000878 | |||||||||||||||||||||||||||||
78 | genus | Caulobacter | 0.005182 | 0.019655 | 0.010277 | |||||||||||||||||||||||||||
79 | genus | Unclassified Caulobacteraceae | 0.013922 | 0.003276 | 0.010266 | |||||||||||||||||||||||||||
80 | family | Unclassified Caulobacterales | 0.002818 | 0.008394 | ||||||||||||||||||||||||||||
81 | order | Rhizobiales | 0.003376 | 0.012895 | 0.189416 | 0.001394 | 0.008258 | 0.002733 | 0.303175 | 0.047202 | 0.225544 | 0.015745 | 0.005205 | 0.012616 | 0.030005 | 0.218489 | 0.340750 | 0.175369 | 0.010904 | 0.010070 | 0.001358 | 0.208031 | ||||||||||
82 | family | Methylobacteriaceae | 0.004297 | 0.007737 | 0.007737 | 0.004954 | 0.002524 | 0.003652 | 0.002627 | |||||||||||||||||||||||
83 | genus | Methylobacterium | 0.002577 | 0.007737 | 0.007737 | 0.004954 | 0.001267 | 0.003652 | ||||||||||||||||||||||||
84 | species | Methylobacterium sp. GXF4 | 0.002640 | 0.002640 | ||||||||||||||||||||||||||||
85 | species | Unclassified Methylobacterium | 0.002577 | 0.005097 | 0.005097 | 0.004954 | 0.001267 | 0.003652 | ||||||||||||||||||||||||
86 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 0.001719 | 0.001258 | 0.002627 | |||||||||||||||||||||||||||
87 | family | Aurantimonadaceae | 0.000634 | 0.003654 | 0.006334 | |||||||||||||||||||||||||||
88 | genus | Aurantimonas | 0.002533 | |||||||||||||||||||||||||||||
89 | genus | Unclassified Aurantimonadaceae | 0.000634 | 0.003654 | 0.003800 | |||||||||||||||||||||||||||
90 | family | Methylocystaceae | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||||||||
91 | genus | Methylopila | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||||||||
92 | family | Xanthobacteraceae | 0.001352 | |||||||||||||||||||||||||||||
93 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.007693 | 0.099880 | 0.007338 | 0.075047 | 0.056487 | 0.015745 | 0.002603 | 0.003415 | 0.164106 | 0.084729 | 0.116810 | 0.005452 | 0.010070 | 0.152043 | ||||||||||||||||
94 | genus | Afipia | 0.002603 | 0.001138 | 0.001664 | |||||||||||||||||||||||||||
95 | genus | Rhodopseudomonas | 0.001727 | 0.010785 | 0.001140 | 0.003800 | 0.001327 | |||||||||||||||||||||||||
96 | species | Rhodopseudomonas palustris | 0.003654 | 0.001140 | ||||||||||||||||||||||||||||
97 | species | Unclassified Rhodopseudomonas | 0.001727 | 0.007131 | 0.003800 | 0.001327 | ||||||||||||||||||||||||||
98 | genus | Bradyrhizobium | 0.008629 | 0.008044 | 0.004907 | 0.029822 | 0.002535 | 0.045952 | 0.005452 | 0.002528 | 0.024016 | |||||||||||||||||||||
99 | genus | Bosea | 0.002577 | 0.002505 | 0.008528 | 0.002699 | ||||||||||||||||||||||||||
100 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.007693 | 0.086947 | 0.007338 | 0.056217 | 0.051580 | 0.015745 | 0.001137 | 0.132620 | 0.075888 | 0.062331 | 0.007542 | 0.124001 | ||||||||||||||||||
101 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.000862 | 0.004697 | 0.002450 | 0.005074 | 0.001327 | |||||||||||||||||||||||||
102 | genus | Devosia | 0.003806 | |||||||||||||||||||||||||||||
103 | species | Devosia sp. H5989 | 0.002537 | |||||||||||||||||||||||||||||
104 | species | Unclassified Devosia | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||||||
105 | genus | Hyphomicrobium | 0.002450 | 0.002450 | 0.001327 | |||||||||||||||||||||||||||
106 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 0.000862 | 0.002246 | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||||
107 | family | Beijerinckiaceae | 0.002821 | |||||||||||||||||||||||||||||
108 | genus | Methylocella | 0.002821 | |||||||||||||||||||||||||||||
109 | family | Phyllobacteriaceae | 0.003283 | 0.010962 | 0.002507 | |||||||||||||||||||||||||||
110 | genus | Hoeflea | 0.001267 | |||||||||||||||||||||||||||||
111 | genus | Phyllobacterium | 0.010962 | |||||||||||||||||||||||||||||
112 | genus | Mesorhizobium | 0.001637 | |||||||||||||||||||||||||||||
113 | species | Mesorhizobium sp. WSM1497 | 0.000819 | |||||||||||||||||||||||||||||
114 | species | Unclassified Mesorhizobium | 0.000819 | |||||||||||||||||||||||||||||
115 | genus | Unclassified Phyllobacteriaceae | 0.001646 | 0.001240 | ||||||||||||||||||||||||||||
116 | family | Rhizobiaceae | 0.016602 | 0.138849 | 0.013606 | 0.010309 | 0.045620 | |||||||||||||||||||||||||
117 | genus | Agrobacterium | 0.002623 | |||||||||||||||||||||||||||||
118 | genus | Rhizobium | 0.002621 | 0.084040 | 0.003376 | 0.000935 | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||
119 | species | Rhizobium sp. 2MFCol3.1 | 0.021923 | |||||||||||||||||||||||||||||
120 | species | Unclassified Rhizobium | 0.002621 | 0.062117 | 0.003376 | 0.000935 | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||
121 | genus | Unclassified Rhizobiaceae | 0.011358 | 0.054809 | 0.010231 | 0.009373 | 0.044352 | |||||||||||||||||||||||||
122 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.003376 | 0.005202 | 0.062122 | 0.001394 | 0.000920 | 0.002733 | 0.062230 | 0.033596 | 0.158869 | 0.002603 | 0.009202 | 0.016876 | 0.049429 | 0.193962 | 0.054906 | 0.005452 | 0.001358 | 0.050681 | ||||||||||||
123 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 0.002594 | 0.111165 | 0.008294 | 0.000920 | 0.004116 | 0.004223 | 0.157347 | 0.069906 | 0.253876 | 0.002030 | 0.158201 | 0.028162 | 0.002538 | 0.220215 | 0.013464 | 0.002514 | 0.001329 | |||||||||||||
124 | class | Betaproteobacteria | 0.012392 | 0.014992 | 0.556693 | 0.002672 | 0.012320 | 0.000925 | 0.511063 | 0.593513 | 0.356447 | 0.011541 | 0.001138 | 0.660478 | 0.217912 | 0.016246 | 0.002992 | 0.563821 | 1.241625e-02 | |||||||||||||
125 | order | Neisseriales | 0.001308 | |||||||||||||||||||||||||||||
126 | family | Neisseriaceae | 0.001308 | |||||||||||||||||||||||||||||
127 | genus | Neisseria | 0.001308 | |||||||||||||||||||||||||||||
128 | order | Rhodocyclales | 0.001668 | 0.002672 | ||||||||||||||||||||||||||||
129 | family | Zoogloeaceae | 0.000834 | 0.002672 | ||||||||||||||||||||||||||||
130 | genus | Azoarcus | 0.002672 | |||||||||||||||||||||||||||||
131 | genus | Unclassified Zoogloeaceae | 0.000834 | |||||||||||||||||||||||||||||
132 | family | Unclassified Rhodocyclales | 0.000834 | |||||||||||||||||||||||||||||
133 | order | Nitrosomonadales | 0.009444 | 0.003624 | 0.017858 | 0.011053 | 0.013187 | 0.010161 | ||||||||||||||||||||||||
134 | family | Sterolibacteriaceae | 0.001267 | |||||||||||||||||||||||||||||
135 | family | Methylophilaceae | 0.008590 | 0.003624 | 0.017858 | 0.011053 | 0.009427 | 0.005089 | ||||||||||||||||||||||||
136 | genus | Methylotenera | 0.011053 | 0.000945 | 0.002544 | |||||||||||||||||||||||||||
137 | genus | Methylovorus | 0.000857 | |||||||||||||||||||||||||||||
138 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 0.007732 | 0.003624 | 0.017858 | 0.008482 | 0.002544 | |||||||||||||||||||||||||
139 | family | Unclassified Nitrosomonadales | 0.000854 | 0.003760 | 0.003806 | |||||||||||||||||||||||||||
140 | order | Burkholderiales | 0.012392 | 0.014992 | 0.430661 | 0.012320 | 0.000925 | 0.382257 | 0.505800 | 0.220255 | 0.007473 | 0.001138 | 0.475487 | 0.202312 | 0.010394 | 0.000993 | 0.390292 | 7.453915e-03 | ||||||||||||||
141 | family | Burkholderiaceae | 0.003448 | 0.009780 | 0.003897 | 0.002528 | ||||||||||||||||||||||||||
142 | genus | Burkholderia | 0.000582 | 0.003276 | ||||||||||||||||||||||||||||
143 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 0.002866 | 0.006504 | 0.003897 | 0.002528 | ||||||||||||||||||||||||||
144 | genus | Rhizobacter | 0.002530 | |||||||||||||||||||||||||||||
145 | genus | Rubrivivax | 0.002508 | |||||||||||||||||||||||||||||
146 | genus | Methylibium | 0.003624 | |||||||||||||||||||||||||||||
147 | genus | Paucibacter | 0.000827 | |||||||||||||||||||||||||||||
148 | family | Alcaligenaceae | 0.001703 | 0.003182 | 0.002710 | 0.001269 | ||||||||||||||||||||||||||
149 | genus | Achromobacter | 0.000902 | |||||||||||||||||||||||||||||
150 | genus | Bordetella | 0.003182 | |||||||||||||||||||||||||||||
151 | genus | Unclassified Alcaligenaceae | 0.001703 | 0.001808 | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||||
152 | family | Oxalobacteraceae | 0.014992 | 0.081269 | 0.010947 | 0.058341 | 0.074787 | 0.011053 | 0.007473 | 0.062829 | 0.067107 | 0.006501 | 0.091516 | 7.453915e-03 | ||||||||||||||||||
153 | genus | Massilia | 0.002605 | 0.003482 | 0.003276 | 0.003642 | 0.001274 | |||||||||||||||||||||||||
154 | species | Massilia sp. WG5 | 0.001274 | |||||||||||||||||||||||||||||
155 | species | Unclassified Massilia | 0.002605 | 0.003482 | 0.003276 | 0.003642 | ||||||||||||||||||||||||||
156 | genus | Collimonas | 0.001695 | 0.002544 | ||||||||||||||||||||||||||||
157 | genus | Janthinobacterium | 0.004997 | 0.009510 | 0.002737 | 0.016464 | 0.019278 | 0.011053 | 0.001412 | 0.012671 | 0.011520 | 0.002602 | 0.003822 | |||||||||||||||||||
158 | species | Janthinobacterium sp. HH01 | 0.003455 | 0.007369 | ||||||||||||||||||||||||||||
159 | species | Unclassified Janthinobacterium | 0.004997 | 0.009510 | 0.002737 | 0.013010 | 0.019278 | 0.003684 | 0.001412 | 0.012671 | 0.011520 | 0.002602 | 0.003822 | |||||||||||||||||||
160 | genus | Herminiimonas | 0.004245 | 0.006061 | 0.001826 | |||||||||||||||||||||||||||
161 | species | Herminiimonas arsenicoxydans | 0.001710 | |||||||||||||||||||||||||||||
162 | species | Unclassified Herminiimonas | 0.002535 | 0.006061 | 0.001826 | |||||||||||||||||||||||||||
163 | genus | Duganella | 0.003397 | 0.003455 | 0.000906 | 0.003272 | 0.001270 | |||||||||||||||||||||||||
164 | species | Duganella zoogloeoides | 0.001698 | 0.003455 | 0.001636 | 0.001270 | ||||||||||||||||||||||||||
165 | species | Unclassified Duganella | 0.001698 | 0.000906 | 0.001636 | |||||||||||||||||||||||||||
166 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 0.009995 | 0.059816 | 0.008210 | 0.034940 | 0.052233 | 0.043784 | 0.052315 | 0.003898 | 0.082605 | 7.453915e-03 | ||||||||||||||||||||
167 | family | Comamonadaceae | 0.012392 | 0.148809 | 0.139788 | 0.169506 | 0.104864 | 0.126975 | 0.146100 | |||||||||||||||||||||||
168 | genus | Acidovorax | 0.003235 | 0.007308 | 0.006409 | 0.007369 | 0.000907 | 0.001263 | ||||||||||||||||||||||||
169 | species | Acidovorax sp. CF316 | 0.003654 | 0.001263 | ||||||||||||||||||||||||||||
170 | species | Unclassified Acidovorax | 0.003235 | 0.003654 | 0.006409 | 0.007369 | 0.000907 | |||||||||||||||||||||||||
171 | genus | Ramlibacter | 0.003482 | 0.000926 | ||||||||||||||||||||||||||||
172 | genus | Hylemonella | 0.007308 | |||||||||||||||||||||||||||||
173 | species | Hylemonella gracilis | 0.007308 | |||||||||||||||||||||||||||||
174 | genus | Rhodoferax | 0.001651 | 0.003654 | 0.003252 | 0.003652 | 0.001263 | |||||||||||||||||||||||||
175 | species | Rhodoferax ferrireducens | 0.000815 | |||||||||||||||||||||||||||||
176 | species | Unclassified Rhodoferax | 0.000836 | 0.003654 | 0.003252 | 0.003652 | 0.001263 | |||||||||||||||||||||||||
177 | genus | Variovorax | 0.008348 | 0.018270 | 0.041217 | 0.017371 | 0.034890 | 0.002526 | ||||||||||||||||||||||||
178 | species | Variovorax sp. PAMC 28711 | 0.003654 | 0.001826 | 0.001263 | |||||||||||||||||||||||||||
179 | species | Unclassified Variovorax | 0.008348 | 0.014616 | 0.041217 | 0.017371 | 0.033064 | 0.001263 | ||||||||||||||||||||||||
180 | genus | Hydrogenophaga | 0.000925 | |||||||||||||||||||||||||||||
181 | genus | Polaromonas | 0.009723 | 0.007308 | 0.011060 | 0.002829 | 0.008842 | |||||||||||||||||||||||||
182 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 0.012392 | 0.125851 | 0.095941 | 0.107568 | 0.076642 | 0.082845 | 0.132206 | |||||||||||||||||||||||
183 | family | Unclassified Burkholderiales | 0.194605 | 0.001373 | 0.000925 | 0.180504 | 0.248546 | 0.104338 | 0.001138 | 0.279077 | 0.135205 | 0.003894 | 0.000993 | 0.143841 | ||||||||||||||||||
184 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.114919 | 0.125182 | 0.069855 | 0.125139 | 0.004069 | 0.171804 | 0.015600 | 0.004545 | 0.001999 | 0.163368 | 4.962332e-03 | |||||||||||||||||||
185 | class | Deltaproteobacteria | 0.020807 | 0.020807 | 0.001849 | 0.001265 | ||||||||||||||||||||||||||
186 | order | Myxococcales | 0.013937 | 0.013937 | 0.001849 | 0.001265 | ||||||||||||||||||||||||||
187 | family | Sandaracinaceae | 0.000940 | |||||||||||||||||||||||||||||
188 | genus | Sandaracinus | 0.000940 | |||||||||||||||||||||||||||||
189 | family | Myxococcaceae | 0.004620 | 0.004620 | ||||||||||||||||||||||||||||
190 | family | Polyangiaceae | 0.000908 | |||||||||||||||||||||||||||||
191 | family | Unclassified Myxococcales | 0.009317 | 0.009317 | 0.001265 | |||||||||||||||||||||||||||
192 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 0.006870 | 0.006870 | ||||||||||||||||||||||||||||
193 | class | Epsilonproteobacteria | 0.002499 | 0.002499 | ||||||||||||||||||||||||||||
194 | order | Campylobacterales | 0.002499 | 0.002499 | ||||||||||||||||||||||||||||
195 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.352206 | 0.004174 | 0.002745 | 0.017708 | 0.004099 | 0.001408 | 0.236855 | 0.133755 | 0.208197 | 0.010764 | 0.000777 | 0.356201 | 0.084566 | 0.004522 | 0.014987 | 0.350839 | 0.033012 | 0.005432 | 0.010640 | |||||||||||
196 | phylum | Firmicutes | 0.001042 | 0.003537 | 0.010374 | 0.003032 | 0.003784 | 0.014577 | ||||||||||||||||||||||||
197 | class | Bacilli | 0.001889 | 0.001011 | 0.001265 | |||||||||||||||||||||||||||
198 | order | Bacillales | 0.000942 | 0.001265 | ||||||||||||||||||||||||||||
199 | order | Unclassified Bacilli | 0.000947 | 0.001011 | ||||||||||||||||||||||||||||
200 | class | Unclassified Firmicutes | 0.001042 | 0.003537 | 0.008484 | 0.002021 | 0.002519 | 0.014577 | ||||||||||||||||||||||||
201 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.003750 | |||||||||||||||||||||||||||||
202 | phylum | Chloroflexi | 0.001081 | |||||||||||||||||||||||||||||
203 | class | Chloroflexia | 0.001081 | |||||||||||||||||||||||||||||
204 | order | Chloroflexales | 0.001081 | |||||||||||||||||||||||||||||
205 | family | Roseiflexaceae | 0.001081 | |||||||||||||||||||||||||||||
206 | phylum | Actinobacteria | 0.004987 | 0.453490 | 0.00245 | 0.006412 | 0.436485 | 0.706478 | 0.546462 | 0.005016 | 0.746704 | 0.125976 | 0.012289 | 0.743460 | 1.413012e-02 | |||||||||||||||||
207 | class | Thermoleophilia | 0.005249 | 0.005249 | ||||||||||||||||||||||||||||
208 | order | Solirubrobacterales | 0.005249 | 0.005249 | ||||||||||||||||||||||||||||
209 | family | Conexibacteraceae | 0.005249 | 0.005249 | ||||||||||||||||||||||||||||
210 | genus | Conexibacter | 0.002624 | 0.002624 | ||||||||||||||||||||||||||||
211 | genus | Unclassified Conexibacteraceae | 0.002624 | 0.002624 | ||||||||||||||||||||||||||||
212 | class | Actinobacteria | 0.004987 | 0.418908 | 0.006412 | 0.367396 | 0.644066 | 0.413462 | 0.005016 | 0.631847 | 0.123047 | 0.010348 | 0.607757 | 1.413012e-02 | ||||||||||||||||||
213 | order | Nakamurellales | 0.003684 | 0.001272 | ||||||||||||||||||||||||||||
214 | family | Nakamurellaceae | 0.001272 | |||||||||||||||||||||||||||||
215 | genus | Nakamurella | 0.001272 | |||||||||||||||||||||||||||||
216 | family | Unclassified Nakamurellales | 0.003684 | |||||||||||||||||||||||||||||
217 | order | Actinopolysporales | 0.003252 | |||||||||||||||||||||||||||||
218 | family | Actinopolysporaceae | 0.003252 | |||||||||||||||||||||||||||||
219 | order | Kineosporiales | 0.000887 | |||||||||||||||||||||||||||||
220 | family | Kineosporiaceae | 0.000887 | |||||||||||||||||||||||||||||
221 | order | Micrococcales | 0.002564 | 0.012637 | 0.016212 | 0.014680 | 0.007369 | 0.002636 | 0.009719 | 0.011582 | 0.022707 | |||||||||||||||||||||
222 | family | Micrococcaceae | 0.003684 | |||||||||||||||||||||||||||||
223 | family | Sanguibacteraceae | 0.000878 | |||||||||||||||||||||||||||||
224 | genus | Sanguibacter | 0.000878 | |||||||||||||||||||||||||||||
225 | family | Promicromonosporaceae | 0.002456 | 0.003789 | ||||||||||||||||||||||||||||
226 | family | Dermabacteraceae | 0.001272 | |||||||||||||||||||||||||||||
227 | genus | Brachybacterium | 0.001272 | |||||||||||||||||||||||||||||
228 | family | Intrasporangiaceae | 0.005820 | |||||||||||||||||||||||||||||
229 | genus | Janibacter | 0.005820 | |||||||||||||||||||||||||||||
230 | family | Jonesiaceae | 0.001029 | |||||||||||||||||||||||||||||
231 | genus | Jonesia | 0.001029 | |||||||||||||||||||||||||||||
232 | family | Microbacteriaceae | 0.002564 | 0.003137 | 0.012960 | 0.003115 | 0.002636 | 0.001787 | 0.001230 | 0.011477 | ||||||||||||||||||||||
233 | genus | Cryobacterium | 0.002091 | |||||||||||||||||||||||||||||
234 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 0.002564 | 0.001046 | 0.012960 | 0.003115 | 0.002636 | 0.001787 | 0.001230 | 0.011477 | ||||||||||||||||||||||
235 | family | Unclassified Micrococcales | 0.008472 | 0.003252 | 0.005745 | 0.003684 | 0.007055 | 0.007897 | 0.006168 | |||||||||||||||||||||||
236 | order | Corynebacteriales | 0.240861 | 0.003827 | 0.152614 | 0.433236 | 0.184443 | 0.450557 | 0.024512 | 0.002597 | 0.228360 | 4.686826e-03 | ||||||||||||||||||||
237 | family | Mycobacteriaceae | 0.009744 | 0.005083 | 0.019438 | 0.005083 | 0.014608 | 0.007597 | ||||||||||||||||||||||||
238 | genus | Mycobacterium | 0.007294 | 0.005083 | 0.006298 | 0.005083 | 0.008232 | 0.005056 | ||||||||||||||||||||||||
239 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 0.002450 | 0.013140 | 0.006375 | 0.002541 | ||||||||||||||||||||||||||
240 | family | Nocardiaceae | 0.187369 | 0.060825 | 0.321188 | 0.072134 | 0.324104 | 0.023070 | 0.090837 | |||||||||||||||||||||||
241 | genus | Nocardia | 0.011529 | 0.003428 | 0.003137 | 0.003684 | 0.011065 | 0.011535 | 0.003784 | |||||||||||||||||||||||
242 | species | Nocardia sp. 348MFTsu5.1 | 0.002096 | 0.000921 | 0.001442 | 0.002523 | ||||||||||||||||||||||||||
243 | species | Unclassified Nocardia | 0.009432 | 0.003428 | 0.003137 | 0.003684 | 0.010145 | 0.010093 | 0.001261 | |||||||||||||||||||||||
244 | genus | Rhodococcus | 0.119552 | 0.023481 | 0.263984 | 0.023481 | 0.226186 | 0.026509 | ||||||||||||||||||||||||
245 | species | Rhodococcus sp. B7740 | 0.003779 | |||||||||||||||||||||||||||||
246 | species | Unclassified Rhodococcus | 0.119552 | 0.023481 | 0.260206 | 0.023481 | 0.226186 | 0.026509 | ||||||||||||||||||||||||
247 | genus | Smaragdicoccus | 0.002836 | 0.000918 | ||||||||||||||||||||||||||||
248 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 0.056289 | 0.033917 | 0.051232 | 0.044969 | 0.085934 | 0.011535 | 0.060543 | |||||||||||||||||||||||
249 | family | Gordoniaceae | 0.001280 | 0.000647 | 2.340315e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
250 | genus | Gordonia | 2.340315e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
251 | genus | Unclassified Gordoniaceae | 0.001280 | 0.000647 | ||||||||||||||||||||||||||||
252 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.043748 | 0.002547 | 0.086706 | 0.092610 | 0.107225 | 0.111846 | 0.001442 | 0.001951 | 0.129927 | 2.346511e-03 | ||||||||||||||||||||
253 | order | Micromonosporales | 0.001106 | 0.002782 | ||||||||||||||||||||||||||||
254 | family | Micromonosporaceae | 0.002782 | |||||||||||||||||||||||||||||
255 | genus | Actinoplanes | 0.002782 | |||||||||||||||||||||||||||||
256 | family | Unclassified Micromonosporales | 0.001106 | |||||||||||||||||||||||||||||
257 | order | Propionibacteriales | 0.044021 | 0.003428 | 0.110391 | 0.003684 | 0.016960 | 0.035593 | 0.010158 | |||||||||||||||||||||||
258 | family | Propionibacteriaceae | 0.005052 | |||||||||||||||||||||||||||||
259 | family | Nocardioidaceae | 0.037698 | 0.089342 | 0.011496 | 0.019593 | 0.001278 | |||||||||||||||||||||||||
260 | genus | Kribbella | 0.003325 | |||||||||||||||||||||||||||||
261 | genus | Nocardioides | 0.002189 | 0.015086 | 0.004580 | 0.006012 | ||||||||||||||||||||||||||
262 | genus | Aeromicrobium | 0.009410 | 0.003115 | 0.001797 | |||||||||||||||||||||||||||
263 | species | Aeromicrobium erythreum | 0.001046 | |||||||||||||||||||||||||||||
264 | species | Unclassified Aeromicrobium | 0.008365 | 0.003115 | 0.001797 | |||||||||||||||||||||||||||
265 | genus | Pimelobacter | 0.001100 | |||||||||||||||||||||||||||||
266 | genus | Unclassified Nocardioidaceae | 0.024999 | 0.067817 | 0.005120 | 0.013581 | 0.001278 | |||||||||||||||||||||||||
267 | family | Unclassified Propionibacteriales | 0.006323 | 0.003428 | 0.021048 | 0.003684 | 0.005464 | 0.016000 | 0.003828 | |||||||||||||||||||||||
268 | order | Pseudonocardiales | 0.002929 | 0.001449 | 0.003855 | |||||||||||||||||||||||||||
269 | family | Pseudonocardiaceae | 0.003855 | |||||||||||||||||||||||||||||
270 | genus | Lentzea | 0.002570 | |||||||||||||||||||||||||||||
271 | genus | Unclassified Pseudonocardiaceae | 0.001285 | |||||||||||||||||||||||||||||
272 | family | Unclassified Pseudonocardiales | 0.002929 | 0.001449 | ||||||||||||||||||||||||||||
273 | order | Streptomycetales | 0.004380 | 0.007049 | 0.006776 | 0.000891 | 0.015660 | 0.001272 | ||||||||||||||||||||||||
274 | family | Streptomycetaceae | 0.002591 | 0.003595 | 0.003595 | 0.000891 | 0.009587 | 0.001272 | ||||||||||||||||||||||||
275 | genus | Streptomyces | 0.004793 | |||||||||||||||||||||||||||||
276 | genus | Unclassified Streptomycetaceae | 0.002591 | 0.003595 | 0.003595 | 0.000891 | 0.004793 | 0.001272 | ||||||||||||||||||||||||
277 | family | Unclassified Streptomycetales | 0.001790 | 0.003455 | 0.003182 | 0.006073 | ||||||||||||||||||||||||||
278 | order | Streptosporangiales | 0.002574 | |||||||||||||||||||||||||||||
279 | family | Streptosporangiaceae | 0.001306 | |||||||||||||||||||||||||||||
280 | genus | Streptosporangium | 0.001306 | |||||||||||||||||||||||||||||
281 | family | Unclassified Streptosporangiales | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||||||
282 | order | Frankiales | 0.001621 | 0.021527 | 0.004486 | |||||||||||||||||||||||||||
283 | family | Frankiaceae | 0.001621 | 0.012050 | 0.002735 | |||||||||||||||||||||||||||
284 | genus | Frankia | 0.006143 | 0.001826 | ||||||||||||||||||||||||||||
285 | genus | Unclassified Frankiaceae | 0.001621 | 0.005907 | 0.000908 | |||||||||||||||||||||||||||
286 | family | Sporichthyaceae | 0.000885 | |||||||||||||||||||||||||||||
287 | family | Unclassified Frankiales | 0.009477 | 0.000867 | ||||||||||||||||||||||||||||
288 | order | Unclassified Actinobacteria | 0.002423 | 0.114283 | 0.002585 | 0.182059 | 0.061303 | 0.207506 | 0.002380 | 0.148347 | 0.034251 | 0.007751 | 0.337558 | 9.443299e-03 | ||||||||||||||||||
289 | class | Acidimicrobiia | 0.003595 | |||||||||||||||||||||||||||||
290 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.034582 | 0.00245 | 0.063840 | 0.062412 | 0.124157 | 0.114857 | 0.002929 | 0.001941 | 0.135704 | |||||||||||||||||||||
291 | phylum | Planctomycetes | 0.004028 | 0.005501 | 0.008842 | 0.009671 | 0.007852 | |||||||||||||||||||||||||
292 | class | Planctomycetia | 0.002015 | 0.003614 | 0.006620 | |||||||||||||||||||||||||||
293 | order | Planctomycetales | 0.002015 | 0.006620 | ||||||||||||||||||||||||||||
294 | family | Planctomycetaceae | 0.002015 | 0.001335 | ||||||||||||||||||||||||||||
295 | genus | Rhodopirellula | 0.001335 | |||||||||||||||||||||||||||||
296 | genus | Schlesneria | 0.002015 | |||||||||||||||||||||||||||||
297 | family | Gemmataceae | 0.001329 | |||||||||||||||||||||||||||||
298 | family | Unclassified Planctomycetales | 0.003955 | |||||||||||||||||||||||||||||
299 | order | Unclassified Planctomycetia | 0.003614 | |||||||||||||||||||||||||||||
300 | class | Phycisphaerae | 0.001232 | |||||||||||||||||||||||||||||
301 | order | Phycisphaerales | 0.001232 | |||||||||||||||||||||||||||||
302 | class | Unclassified Planctomycetes | 0.002013 | 0.005501 | 0.008842 | 0.006057 | ||||||||||||||||||||||||||
303 | phylum | Spirochaetes | 0.004955 | 0.001828 | ||||||||||||||||||||||||||||
304 | class | Spirochaetia | 0.000914 | |||||||||||||||||||||||||||||
305 | class | Unclassified Spirochaetes | 0.004955 | 0.000914 | ||||||||||||||||||||||||||||
306 | phylum | Lentisphaerae | 0.004589 | |||||||||||||||||||||||||||||
307 | phylum | Acidobacteria | 0.002034 | 0.003809 | 0.002439 | 0.002465 | ||||||||||||||||||||||||||
308 | genus | Luteitalea | 0.001003 | |||||||||||||||||||||||||||||
309 | class | Acidobacteriia | 0.002439 | 0.002465 | ||||||||||||||||||||||||||||
310 | order | Acidobacteriales | 0.002439 | 0.002465 | ||||||||||||||||||||||||||||
311 | family | Acidobacteriaceae | 0.002439 | 0.002465 | ||||||||||||||||||||||||||||
312 | genus | Granulicella | 0.001220 | 0.001225 | ||||||||||||||||||||||||||||
313 | genus | Unclassified Acidobacteriaceae | 0.001220 | 0.001240 | ||||||||||||||||||||||||||||
314 | class | Solibacteres | 0.001031 | |||||||||||||||||||||||||||||
315 | order | Solibacterales | 0.001031 | |||||||||||||||||||||||||||||
316 | class | Unclassified Acidobacteria | 0.003809 | |||||||||||||||||||||||||||||
317 | phylum | Armatimonadetes | 0.001310 | |||||||||||||||||||||||||||||
318 | phylum | Verrucomicrobia | 0.041654 | 0.061555 | 0.058949 | 0.007511 | 0.092459 | 0.134231 | 0.077768 | |||||||||||||||||||||||
319 | class | Spartobacteria | 0.012145 | 0.002745 | 0.007546 | 0.008804 | 0.013528 | |||||||||||||||||||||||||
320 | order | Chthoniobacterales | 0.009588 | 0.001373 | 0.007546 | 0.007546 | 0.013528 | |||||||||||||||||||||||||
321 | family | Chthoniobacteraceae | 0.009588 | 0.001373 | 0.006289 | 0.007546 | 0.007379 | |||||||||||||||||||||||||
322 | genus | Chthoniobacter | 0.005113 | 0.001373 | 0.001258 | 0.005031 | 0.002460 | |||||||||||||||||||||||||
323 | genus | Unclassified Chthoniobacteraceae | 0.004474 | 0.005031 | 0.002515 | 0.004919 | ||||||||||||||||||||||||||
324 | family | Unclassified Chthoniobacterales | 0.001258 | 0.006149 | ||||||||||||||||||||||||||||
325 | order | Unclassified Spartobacteria | 0.002557 | 0.001373 | 0.001258 | |||||||||||||||||||||||||||
326 | class | Methylacidiphilae | 0.002020 | |||||||||||||||||||||||||||||
327 | order | Methylacidiphilales | 0.002020 | |||||||||||||||||||||||||||||
328 | family | Methylacidiphilaceae | 0.002020 | |||||||||||||||||||||||||||||
329 | genus | Methylacidiphilum | 0.002020 | |||||||||||||||||||||||||||||
330 | class | Verrucomicrobiae | 0.013445 | 0.037706 | 0.033159 | 0.018920 | 0.036987 | 0.028484 | ||||||||||||||||||||||||
331 | order | Verrucomicrobiales | 0.011385 | 0.030850 | 0.029474 | 0.013874 | 0.035744 | 0.028484 | ||||||||||||||||||||||||
332 | family | Verrucomicrobia subdivision 3 | 0.001014 | 0.003700 | 0.001232 | |||||||||||||||||||||||||||
333 | family | Rubritaleaceae | 0.001244 | 0.002612 | ||||||||||||||||||||||||||||
334 | family | Verrucomicrobiaceae | 0.007259 | 0.027423 | 0.025790 | 0.011352 | 0.025862 | 0.016853 | ||||||||||||||||||||||||
335 | genus | Verrucomicrobium | 0.004148 | 0.006856 | 0.007369 | 0.007568 | 0.018473 | 0.003889 | ||||||||||||||||||||||||
336 | genus | Unclassified Verrucomicrobiaceae | 0.003111 | 0.020567 | 0.018421 | 0.003784 | 0.007389 | 0.012964 | ||||||||||||||||||||||||
337 | family | Unclassified Verrucomicrobiales | 0.003111 | 0.003428 | 0.003684 | 0.002523 | 0.004938 | 0.007788 | ||||||||||||||||||||||||
338 | order | Unclassified Verrucomicrobiae | 0.002061 | 0.006856 | 0.003684 | 0.005045 | 0.001244 | |||||||||||||||||||||||||
339 | class | Opitutae | 0.007057 | 0.009869 | 0.019182 | 0.023206 | ||||||||||||||||||||||||||
340 | order | Opitutales | 0.001999 | 0.009869 | 0.009550 | 0.018208 | ||||||||||||||||||||||||||
341 | family | Opitutaceae | 0.001999 | 0.007401 | 0.009550 | 0.013395 | ||||||||||||||||||||||||||
342 | genus | Lacunisphaera | 0.001233 | 0.001230 | ||||||||||||||||||||||||||||
343 | genus | Unclassified Opitutaceae | 0.001999 | 0.006168 | 0.009550 | 0.012165 | ||||||||||||||||||||||||||
344 | family | Unclassified Opitutales | 0.002468 | 0.004813 | ||||||||||||||||||||||||||||
345 | order | Puniceicoccales | 0.003043 | 0.001251 | 0.003768 | |||||||||||||||||||||||||||
346 | family | Puniceicoccaceae | 0.003043 | 0.001251 | ||||||||||||||||||||||||||||
347 | family | Unclassified Puniceicoccales | 0.003768 | |||||||||||||||||||||||||||||
348 | order | Unclassified Opitutae | 0.002014 | 0.008381 | 0.001230 | |||||||||||||||||||||||||||
349 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 0.009007 | 0.023848 | 0.025790 | 0.002745 | 0.056123 | 0.069257 | 0.012551 | |||||||||||||||||||||||
350 | phylum | Bacteroidetes | 0.237828 | 0.061466 | 0.212663 | 0.091279 | 0.007210 | 0.001125 | 0.247620 | 0.005027 | 0.131220 | 0.002419 | 0.002793 | 0.005809 | ||||||||||||||||||
351 | order | Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.001210 | 0.005809 | ||||||||||||||||||||||||||||
352 | family | Rhodothermaceae | 0.001210 | |||||||||||||||||||||||||||||
353 | family | Unclassified Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.005809 | |||||||||||||||||||||||||||||
354 | class | Flavobacteriia | 0.029284 | 0.009344 | 0.009151 | 0.003684 | 0.001498 | 0.025684 | 0.003001 | 0.001261 | ||||||||||||||||||||||
355 | order | Flavobacteriales | 0.028603 | 0.009344 | 0.009151 | 0.003684 | 0.001498 | 0.025684 | 0.003001 | |||||||||||||||||||||||
356 | family | Flavobacteriaceae | 0.027240 | 0.009344 | 0.009151 | 0.003684 | 0.001498 | 0.025684 | 0.003001 | |||||||||||||||||||||||
357 | genus | Flavobacterium | 0.024516 | 0.009151 | 0.001498 | 0.024765 | ||||||||||||||||||||||||||
358 | species | Flavobacterium sp. CF136 | 0.000681 | |||||||||||||||||||||||||||||
359 | species | Flavobacterium sp. WG21 | 0.001021 | |||||||||||||||||||||||||||||
360 | species | Flavobacterium johnsoniae | 0.000681 | |||||||||||||||||||||||||||||
361 | species | Unclassified Flavobacterium | 0.022132 | 0.009151 | 0.001498 | 0.024765 | ||||||||||||||||||||||||||
362 | genus | Unclassified Flavobacteriaceae | 0.002724 | 0.009344 | 0.003684 | 0.000919 | 0.003001 | |||||||||||||||||||||||||
363 | family | Unclassified Flavobacteriales | 0.001362 | |||||||||||||||||||||||||||||
364 | order | Unclassified Flavobacteriia | 0.000681 | 0.001261 | ||||||||||||||||||||||||||||
365 | class | Sphingobacteriia | 0.005447 | 0.003071 | 0.055692 | 0.017465 | 0.010091 | 0.002793 | ||||||||||||||||||||||||
366 | order | Sphingobacteriales | 0.004083 | 0.003071 | 0.055692 | 0.011947 | 0.010091 | 0.002793 | ||||||||||||||||||||||||
367 | family | Sphingobacteriaceae | 0.004083 | 0.055692 | 0.007352 | 0.010091 | 0.002793 | |||||||||||||||||||||||||
368 | genus | Mucilaginibacter | 0.002041 | 0.003228 | 0.001261 | |||||||||||||||||||||||||||
369 | genus | Pedobacter | 0.023028 | 0.004587 | ||||||||||||||||||||||||||||
370 | genus | Solitalea | 0.002793 | |||||||||||||||||||||||||||||
371 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 0.002043 | 0.029436 | 0.002765 | 0.008829 | ||||||||||||||||||||||||||
372 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.003071 | 0.004595 | ||||||||||||||||||||||||||||
373 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.001363 | 0.005517 | ||||||||||||||||||||||||||||
374 | class | Chitinophagia | 0.022990 | 0.009512 | 0.007369 | 0.018327 | 0.003784 | |||||||||||||||||||||||||
375 | order | Chitinophagales | 0.020962 | 0.009512 | 0.007369 | 0.018327 | 0.002523 | |||||||||||||||||||||||||
376 | family | Chitinophagaceae | 0.018935 | 0.006504 | 0.007369 | 0.006419 | 0.002523 | |||||||||||||||||||||||||
377 | genus | Niastella | 0.003252 | 0.000921 | ||||||||||||||||||||||||||||
378 | genus | Niabella | 0.000677 | |||||||||||||||||||||||||||||
379 | genus | Segetibacter | 0.004057 | |||||||||||||||||||||||||||||
380 | genus | Chitinophaga | 0.007369 | 0.000915 | ||||||||||||||||||||||||||||
381 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 0.014201 | 0.003252 | 0.004583 | 0.002523 | ||||||||||||||||||||||||||
382 | family | Unclassified Chitinophagales | 0.002027 | 0.003009 | 0.011908 | |||||||||||||||||||||||||||
383 | order | Unclassified Chitinophagia | 0.002028 | 0.001261 | ||||||||||||||||||||||||||||
384 | class | Cytophagia | 0.105680 | 0.011828 | 0.122000 | 0.015512 | 0.001125 | 0.088720 | 0.031573 | |||||||||||||||||||||||
385 | order | Cytophagales | 0.100353 | 0.009512 | 0.115590 | 0.013196 | 0.001125 | 0.078668 | 0.027789 | |||||||||||||||||||||||
386 | family | Hymenobacteraceae | 0.009512 | 0.009512 | 0.000920 | 0.007590 | ||||||||||||||||||||||||||
387 | genus | Hymenobacter | 0.009512 | 0.009512 | 0.003795 | |||||||||||||||||||||||||||
388 | species | Hymenobacter sp. PAMC 26628 | 0.002378 | 0.002378 | ||||||||||||||||||||||||||||
389 | species | Unclassified Hymenobacter | 0.007134 | 0.007134 | 0.003795 | |||||||||||||||||||||||||||
390 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.000920 | 0.003795 | ||||||||||||||||||||||||||||
391 | family | Flammeovirgaceae | 0.000913 | |||||||||||||||||||||||||||||
392 | family | Cytophagaceae | 0.090291 | 0.105906 | 0.001125 | 0.075923 | 0.010091 | |||||||||||||||||||||||||
393 | genus | Spirosoma | 0.007369 | 0.005496 | 0.006307 | |||||||||||||||||||||||||||
394 | genus | Dyadobacter | 0.010811 | 0.035509 | 0.015541 | |||||||||||||||||||||||||||
395 | species | Dyadobacter fermentans | 0.000685 | |||||||||||||||||||||||||||||
396 | species | Unclassified Dyadobacter | 0.010126 | 0.035509 | 0.015541 | |||||||||||||||||||||||||||
397 | genus | Fibrella | 0.012636 | 0.000915 | ||||||||||||||||||||||||||||
398 | genus | Unclassified Cytophagaceae | 0.072111 | 0.057760 | 0.001125 | 0.053972 | 0.003784 | |||||||||||||||||||||||||
399 | family | Unclassified Cytophagales | 0.010063 | 0.009684 | 0.003684 | 0.000912 | 0.010109 | |||||||||||||||||||||||||
400 | order | Unclassified Cytophagia | 0.005327 | 0.002316 | 0.006410 | 0.002316 | 0.010052 | 0.003784 | ||||||||||||||||||||||||
401 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.074427 | 0.037223 | 0.016308 | 0.064714 | 0.005712 | 0.097424 | 0.002025 | 0.084512 | 0.001210 | |||||||||||||||||||||
402 | phylum | Unclassified Bacteria | 0.271736 | 0.004174 | 0.004099 | 0.004282 | 0.664551 | 0.074647 | 0.725202 | 0.018632 | 0.004969 | 0.255355 | 0.026873 | 0.001976 | 0.912065 | 0.101154 | 0.003042 | 3.469447e-18 | 0.002559 | 0.024113 | ||||||||||||
403 | superkingdom | Archaea | 0.002561 | 0.001211 | ||||||||||||||||||||||||||||
404 | phylum | Crenarchaeota | 0.001294 | |||||||||||||||||||||||||||||
405 | class | Thermoprotei | 0.001294 | |||||||||||||||||||||||||||||
406 | phylum | Thaumarchaeota | 0.001267 | |||||||||||||||||||||||||||||
407 | phylum | Unclassified Archaea | 0.001211 | |||||||||||||||||||||||||||||
408 | superkingdom | Unclassified | 0.015750 | 0.002478 | 0.003806 | 0.001228 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NapA | 0.03246 | 33 | 92.95 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapB | 0.00807 | 3 | 89.93 | Periplasmic nitrate reductase cytochrome c550-type subunit |
NapC | 0.03048 | 11 | 91.19 | Cytochrome c-type protein NapC |
NapD | 0.02249 | 6 | 74.05 | Periplasmic nitrate reductase component NapD |
NapE | 0.01758 | 3 | 79.80 | Periplasmic nitrate reductase component NapE |
NapG | 0.00246 | 1 | 55.30 | Ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.04020 | 58 | 96.05 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.03854 | 27 | 93.77 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.05594 | 22 | 85.34 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.02924 | 11 | 74.51 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 2.59283 | 3081 | 82.74 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.61366 | 367 | 78.54 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.00587 | 4 | 83.47 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NifD_AnfD_VnfD | 0.00759 | 5 | 98.80 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NifH_AnfH_VnfH | 0.01548 | 7 | 97.10 | Nitrogenase reductase and maturation protein NifH/AnfH/VnfH |
NifK_AnfK_VnfK | 0.01315 | 9 | 92.70 | Nitrogenase beta chain (EC 1.18.6.1) NifK/AnfK/VnfK |
NirA | 0.44929 | 342 | 77.21 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 2.72878 | 2776 | 89.19 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 1.94592 | 584 | 81.86 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.11370 | 68 | 75.01 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirN | 0.00154 | 1 | 98.00 | Nitrite reductase associated c-type cytochorome NirN |
NirS | 0.00252 | 2 | 79.70 | nirS; Cytochrome cd1 nitrite reductase (NO-forming) / hydroxylamine reductase [EC:1.7.2.1 1.7.99.1] |
NirU | 0.39750 | 281 | 81.20 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.01349 | 12 | 85.96 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfA | 0.00469 | 3 | 91.63 | nrfA; nitrite reductase (cytochrome c-552) [EC:1.7.2.2] |
NrfH | 0.00239 | 1 | 75.50 | nrfH; cytochrome c nitrite reductase small subunit |
UreA | 2.47011 | 687 | 89.46 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 2.52497 | 723 | 85.46 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 3.16036 | 2342 | 91.55 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.00785 | 3 | 56.83 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.01179 | 11 | 82.25 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.00708 | 4 | 87.60 |
Denitrification | 0.15089 | 97 | 76.96 |
Nitrate assimilatory reduction | 3.20650 | 3448 | 82.29 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.27746 | 175 | 90.74 |
Nitrite assimilation | 5.52149 | 3983 | 86.53 |
Nitrogen fixation | 0.04210 | 25 | 93.68 |
Urease | 8.15544 | 3752 | 89.99 |
NapD | NapC | NarJ | NasA | NapG | NifH_AnfH_VnfH | NapA | NarH_NxrB | NifK_AnfK_VnfK | NirN | NirS | NrfH | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NirD | UreA | cNor-C | NirK | NosZ | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapE | NapB | NrfA | NarI | NifB | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.022489 | 0.030479 | 0.029242 | 2.592832 | 0.002458 | 0.015481 | 0.032464 | 0.038543 | 0.013154 | 0.001541 | 0.002524 | 0.002392 | 0.007592 | 2.524966 | 1.945923 | 2.470112 | 0.007848 | 0.113698 | 0.013491 | 2.728778 | 0.613664 | 0.040200 | 0.011789 | 3.160359 | 0.449292 | 0.017585 | 0.008068 | 0.004686 | 5.593573e-02 | 0.005873 | 0.397500 |
2 | norank | Unknown | 0.000897 | 0.005694 | 0.005064 | 0.017554 | |||||||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.022489 | 0.030479 | 0.029242 | 2.591935 | 0.002458 | 0.015481 | 0.032464 | 0.038543 | 0.013154 | 0.001541 | 0.002524 | 0.002392 | 0.007592 | 2.501494 | 1.945923 | 2.465047 | 0.007848 | 0.113698 | 0.013491 | 2.728778 | 0.613664 | 0.040200 | 0.011789 | 3.141453 | 0.447998 | 0.017585 | 0.008068 | 0.004686 | 5.593573e-02 | 0.005873 | 0.397500 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.020879 | 0.001355 | |||||||||||||||||||||||||||||
5 | order | Synechococcales | 0.002195 | ||||||||||||||||||||||||||||||
6 | family | Synechococcaceae | 0.001104 | ||||||||||||||||||||||||||||||
7 | family | Unclassified Synechococcales | 0.001091 | ||||||||||||||||||||||||||||||
8 | class | Unclassified Cyanobacteria | 0.018684 | 0.001355 | |||||||||||||||||||||||||||||
9 | phylum | Proteobacteria | 0.022489 | 0.030479 | 0.007843 | 1.640258 | 0.006624 | 0.032464 | 0.024861 | 0.011696 | 0.001541 | 0.001368 | 0.006090 | 1.496979 | 1.114373 | 1.294883 | 0.002635 | 0.062947 | 0.011399 | 1.563825 | 0.506546 | 0.027090 | 0.010708 | 1.597261 | 0.222884 | 0.017585 | 0.008068 | 2.886457e-02 | 0.005873 | 0.264438 | |||
10 | class | Gammaproteobacteria | 0.005720 | 0.002544 | 0.122482 | 0.005847 | 0.001541 | 0.001368 | 0.161832 | 0.095421 | 0.155504 | 0.005024 | 0.147976 | 0.017876 | 0.002056 | 0.002119 | 0.159973 | 5.284495e-03 | |||||||||||||||
11 | order | Xanthomonadales | 0.002856 | ||||||||||||||||||||||||||||||
12 | order | Oceanospirillales | 0.006893 | ||||||||||||||||||||||||||||||
13 | family | Endozoicomonaceae | 0.006893 | ||||||||||||||||||||||||||||||
14 | genus | Endozoicomonas | 0.006893 | ||||||||||||||||||||||||||||||
15 | order | Cellvibrionales | 0.001260 | ||||||||||||||||||||||||||||||
16 | order | Pseudomonadales | 0.002864 | 0.086977 | 0.001541 | 0.001368 | 0.147470 | 0.081087 | 0.149094 | 0.003412 | 0.116188 | 0.010368 | 0.151892 | ||||||||||||||||||||
17 | family | Pseudomonadaceae | 0.002864 | 0.079036 | 0.001541 | 0.001368 | 0.139643 | 0.074497 | 0.149094 | 0.001915 | 0.106261 | 0.010368 | 0.150613 | ||||||||||||||||||||
18 | genus | Pseudomonas | 0.002864 | 0.035899 | 0.001541 | 0.001368 | 0.123926 | 0.057883 | 0.129284 | 0.001915 | 0.079275 | 0.008615 | 0.085562 | ||||||||||||||||||||
19 | species | Pseudomonas sp. Ag1 | 0.000920 | ||||||||||||||||||||||||||||||
20 | species | Pseudomonas fluorescens | 0.001304 | 0.003397 | |||||||||||||||||||||||||||||
21 | species | Unclassified Pseudomonas | 0.002864 | 0.033675 | 0.001541 | 0.001368 | 0.123926 | 0.054485 | 0.129284 | 0.001915 | 0.079275 | 0.008615 | 0.085562 | ||||||||||||||||||||
22 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 0.043137 | 0.015717 | 0.016614 | 0.019810 | 0.026985 | 0.001753 | 0.065051 | ||||||||||||||||||||||||
23 | family | Moraxellaceae | 0.001497 | ||||||||||||||||||||||||||||||
24 | family | Unclassified Pseudomonadales | 0.007941 | 0.007827 | 0.006590 | 0.009927 | 0.001278 | ||||||||||||||||||||||||||
25 | order | Salinisphaerales | 0.001611 | ||||||||||||||||||||||||||||||
26 | family | Salinisphaeraceae | 0.001611 | ||||||||||||||||||||||||||||||
27 | order | Enterobacterales | 0.002544 | 0.005722 | 0.005847 | 0.002585 | 0.003559 | 0.001282 | 0.002056 | 5.284495e-03 | |||||||||||||||||||||||
28 | family | Erwiniaceae | 0.002544 | 0.001470 | 0.000974 | ||||||||||||||||||||||||||||
29 | genus | Erwinia | 0.000974 | ||||||||||||||||||||||||||||||
30 | genus | Unclassified Erwiniaceae | 0.002544 | 0.001470 | |||||||||||||||||||||||||||||
31 | family | Pectobacteriaceae | 0.001915 | ||||||||||||||||||||||||||||||
32 | genus | Pectobacterium | 0.000629 | ||||||||||||||||||||||||||||||
33 | genus | Brenneria | 0.000618 | ||||||||||||||||||||||||||||||
34 | genus | Unclassified Pectobacteriaceae | 0.000668 | ||||||||||||||||||||||||||||||
35 | family | Yersiniaceae | 0.000687 | 5.284495e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
36 | genus | Rahnella | 0.000687 | 5.284495e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
37 | family | Enterobacteriaceae | 0.001242 | ||||||||||||||||||||||||||||||
38 | genus | Gibbsiella | 0.000621 | ||||||||||||||||||||||||||||||
39 | genus | Unclassified Enterobacteriaceae | 0.000621 | ||||||||||||||||||||||||||||||
40 | family | Unclassified Enterobacterales | 0.002565 | 0.004377 | 0.002585 | 0.002585 | 0.001282 | 0.001369 | |||||||||||||||||||||||||
41 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 0.028523 | 0.014362 | 0.004856 | 0.006410 | 0.028229 | 0.006226 | 0.002119 | 0.008081 | |||||||||||||||||||||||
42 | class | Oligoflexia | 0.001061 | ||||||||||||||||||||||||||||||
43 | order | Bdellovibrionales | 0.001061 | ||||||||||||||||||||||||||||||
44 | class | Alphaproteobacteria | 0.018355 | 0.021961 | 0.600727 | 0.004406 | 0.010817 | 0.007321 | 0.003004 | 0.643988 | 0.393135 | 0.558925 | 0.034131 | 0.009735 | 0.466320 | 0.293320 | 0.613938 | 0.181546 | 0.017585 | 0.005438 | 2.536812e-03 | 0.004417 | 0.257312 | ||||||||||
45 | order | Rhodospirillales | 0.020688 | 0.003962 | 0.000998 | 0.005254 | 0.008473 | ||||||||||||||||||||||||||
46 | family | Rhodospirillaceae | 0.007731 | 0.000998 | |||||||||||||||||||||||||||||
47 | genus | Magnetospira | 0.007731 | ||||||||||||||||||||||||||||||
48 | genus | Unclassified Rhodospirillaceae | 0.000998 | ||||||||||||||||||||||||||||||
49 | family | Acetobacteraceae | 0.007859 | 0.004086 | 0.004233 | ||||||||||||||||||||||||||||
50 | genus | Reyranella | 0.001169 | 0.001169 | |||||||||||||||||||||||||||||
51 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.003929 | 0.003962 | 0.004241 | ||||||||||||||||||||||||||||
52 | order | Rhodobacterales | 0.000935 | 0.018374 | 0.014543 | 0.002010 | 0.003481 | 0.001366 | |||||||||||||||||||||||||
53 | family | Rhodobacteraceae | 0.000935 | 0.015717 | 0.011886 | 0.002010 | 0.003481 | ||||||||||||||||||||||||||
54 | genus | Sagittula | 0.000935 | ||||||||||||||||||||||||||||||
55 | species | Sagittula sp. P11 | 0.000935 | ||||||||||||||||||||||||||||||
56 | genus | Sulfitobacter | 0.003929 | ||||||||||||||||||||||||||||||
57 | genus | Roseovarius | 0.003929 | ||||||||||||||||||||||||||||||
58 | genus | Unclassified Rhodobacteraceae | 0.007859 | 0.011886 | 0.002010 | 0.003481 | |||||||||||||||||||||||||||
59 | family | Unclassified Rhodobacterales | 0.002657 | 0.002657 | 0.001366 | ||||||||||||||||||||||||||||
60 | order | Sphingomonadales | 0.237222 | 0.015471 | 0.226724 | 0.023737 | 0.205026 | 0.009481 | 0.001449 | ||||||||||||||||||||||||
61 | family | Erythrobacteraceae | 0.004809 | 0.003236 | |||||||||||||||||||||||||||||
62 | genus | Erythrobacter | 0.000959 | ||||||||||||||||||||||||||||||
63 | genus | Croceicoccus | 0.001927 | ||||||||||||||||||||||||||||||
64 | genus | Unclassified Erythrobacteraceae | 0.001923 | 0.003236 | |||||||||||||||||||||||||||||
65 | family | Sphingomonadaceae | 0.194140 | 0.015471 | 0.195376 | 0.021579 | 0.157896 | 0.009481 | 0.001449 | ||||||||||||||||||||||||
66 | genus | Sphingomonas | 0.039261 | 0.071813 | 0.002158 | 0.026437 | 0.001449 | ||||||||||||||||||||||||||
67 | species | Sphingomonas taxi | 0.000958 | 0.007260 | 0.002962 | ||||||||||||||||||||||||||||
68 | species | Sphingomonas panacis | 0.000961 | 0.007151 | 0.000978 | ||||||||||||||||||||||||||||
69 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.037342 | 0.057402 | 0.002158 | 0.022497 | 0.001449 | ||||||||||||||||||||||||||
70 | genus | Sphingorhabdus | 0.000983 | ||||||||||||||||||||||||||||||
71 | genus | Rhizorhabdus | 0.000946 | ||||||||||||||||||||||||||||||
72 | genus | Sphingobium | 0.015618 | 0.025152 | 0.009803 | ||||||||||||||||||||||||||||
73 | species | Sphingobium sp. MI1205 | 0.003804 | ||||||||||||||||||||||||||||||
74 | species | Unclassified Sphingobium | 0.015618 | 0.021348 | 0.009803 | ||||||||||||||||||||||||||||
75 | genus | Novosphingobium | 0.002849 | 0.003897 | 0.013745 | 0.004916 | 0.002709 | ||||||||||||||||||||||||||
76 | species | Novosphingobium sp. AP12 | 0.000958 | ||||||||||||||||||||||||||||||
77 | species | Novosphingobium resinovorum | 0.000945 | ||||||||||||||||||||||||||||||
78 | species | Novosphingobium sp. Rr 2-17 | 0.001355 | ||||||||||||||||||||||||||||||
79 | species | Unclassified Novosphingobium | 0.000945 | 0.003897 | 0.013745 | 0.004916 | 0.001355 | ||||||||||||||||||||||||||
80 | genus | Sphingopyxis | 0.000936 | 0.003576 | |||||||||||||||||||||||||||||
81 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.134531 | 0.011574 | 0.081090 | 0.019421 | 0.115757 | 0.006772 | |||||||||||||||||||||||||
82 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.038273 | 0.028112 | 0.002158 | 0.047130 | |||||||||||||||||||||||||||
83 | order | Caulobacterales | 0.038369 | 0.052561 | 0.047948 | ||||||||||||||||||||||||||||
84 | family | Caulobacteraceae | 0.034637 | 0.049530 | 0.040960 | ||||||||||||||||||||||||||||
85 | genus | Phenylobacterium | 0.000962 | 0.000999 | |||||||||||||||||||||||||||||
86 | genus | Caulobacter | 0.008301 | 0.007046 | 0.017993 | ||||||||||||||||||||||||||||
87 | species | Caulobacter sp. K31 | 0.003523 | ||||||||||||||||||||||||||||||
88 | species | Unclassified Caulobacter | 0.008301 | 0.003523 | 0.017993 | ||||||||||||||||||||||||||||
89 | genus | Unclassified Caulobacteraceae | 0.025374 | 0.042485 | 0.021968 | ||||||||||||||||||||||||||||
90 | family | Unclassified Caulobacterales | 0.003732 | 0.003030 | 0.006988 | ||||||||||||||||||||||||||||
91 | order | Parvularculales | 0.001004 | ||||||||||||||||||||||||||||||
92 | order | Rhizobiales | 0.018355 | 0.016399 | 0.187154 | 0.007868 | 0.005863 | 0.001502 | 0.433951 | 0.065064 | 0.282532 | 0.006077 | 0.006084 | 0.041120 | 0.257974 | 0.367983 | 0.171563 | 0.011723 | 0.005438 | 0.002967 | 0.246013 | ||||||||||||
93 | family | Methylobacteriaceae | 0.003658 | 0.002797 | 0.002797 | 0.005232 | 0.008098 | 0.003919 | 0.001507 | 0.005656 | |||||||||||||||||||||||
94 | genus | Methylobacterium | 0.002748 | 0.002797 | 0.002797 | 0.005232 | 0.008098 | 0.003919 | 0.004229 | ||||||||||||||||||||||||
95 | species | Methylobacterium sp. 77 | 0.000928 | ||||||||||||||||||||||||||||||
96 | species | Methylobacterium sp. 88A | 0.000910 | 0.004058 | |||||||||||||||||||||||||||||
97 | species | Unclassified Methylobacterium | 0.000910 | 0.002797 | 0.002797 | 0.005232 | 0.004039 | 0.003919 | 0.004229 | ||||||||||||||||||||||||
98 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 0.000910 | 0.001507 | 0.001428 | ||||||||||||||||||||||||||||
99 | family | Aurantimonadaceae | 0.000916 | 0.003835 | 0.003472 | 0.002706 | |||||||||||||||||||||||||||
100 | genus | Aurantimonas | 0.001353 | ||||||||||||||||||||||||||||||
101 | genus | Unclassified Aurantimonadaceae | 0.000916 | 0.003835 | 0.003472 | 0.001353 | |||||||||||||||||||||||||||
102 | family | Methylocystaceae | 0.002445 | ||||||||||||||||||||||||||||||
103 | genus | Methylocystis | 0.000899 | ||||||||||||||||||||||||||||||
104 | genus | Unclassified Methylocystaceae | 0.001546 | ||||||||||||||||||||||||||||||
105 | family | Xanthobacteraceae | 0.000924 | ||||||||||||||||||||||||||||||
106 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.018355 | 0.010941 | 0.094911 | 0.003931 | 0.133112 | 0.108408 | 0.006077 | 0.001218 | 0.189048 | 0.093222 | 0.099665 | 0.011723 | 0.005438 | 0.176398 | |||||||||||||||||
107 | genus | Rhodopseudomonas | 0.003630 | 0.027505 | 0.001323 | ||||||||||||||||||||||||||||
108 | species | Rhodopseudomonas palustris | 0.003929 | ||||||||||||||||||||||||||||||
109 | species | Unclassified Rhodopseudomonas | 0.003630 | 0.023576 | 0.001323 | ||||||||||||||||||||||||||||
110 | genus | Bradyrhizobium | 0.004612 | 0.003373 | 0.044142 | 0.004070 | 0.037805 | 0.011723 | 0.037043 | ||||||||||||||||||||||||
111 | genus | Bosea | 0.002759 | 0.002797 | 0.002797 | 0.003513 | 0.005351 | 0.002602 | 0.005763 | ||||||||||||||||||||||||
112 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.014725 | 0.010941 | 0.087541 | 0.003931 | 0.099436 | 0.105611 | 0.006077 | 0.001218 | 0.141392 | 0.083801 | 0.057935 | 0.005438 | 0.133593 | ||||||||||||||||||
113 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.002416 | 0.003658 | 0.005019 | 0.001770 | 0.004062 | ||||||||||||||||||||||||||
114 | genus | Pelagibacterium | 0.001004 | ||||||||||||||||||||||||||||||
115 | genus | Filomicrobium | 0.001770 | ||||||||||||||||||||||||||||||
116 | genus | Devosia | 0.002709 | ||||||||||||||||||||||||||||||
117 | species | Devosia sp. H5989 | 0.002709 | ||||||||||||||||||||||||||||||
118 | genus | Hyphomicrobium | 0.002416 | ||||||||||||||||||||||||||||||
119 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 0.003658 | 0.004016 | 0.001353 | ||||||||||||||||||||||||||||
120 | family | Phyllobacteriaceae | 0.001753 | 0.011788 | 0.014632 | 0.015848 | 0.001353 | ||||||||||||||||||||||||||
121 | genus | Hoeflea | 0.001353 | ||||||||||||||||||||||||||||||
122 | genus | Phyllobacterium | 0.010974 | ||||||||||||||||||||||||||||||
123 | genus | Mesorhizobium | 0.001753 | 0.015848 | |||||||||||||||||||||||||||||
124 | genus | Unclassified Phyllobacteriaceae | 0.011788 | 0.003658 | |||||||||||||||||||||||||||||
125 | family | Rhizobiaceae | 0.014835 | 0.149315 | 0.014282 | 0.006795 | 0.010019 | 0.035202 | |||||||||||||||||||||||||
126 | genus | Neorhizobium | 0.007859 | ||||||||||||||||||||||||||||||
127 | species | Neorhizobium galegae | 0.007859 | ||||||||||||||||||||||||||||||
128 | genus | Rhizobium | 0.062869 | ||||||||||||||||||||||||||||||
129 | species | Rhizobium sp. 2MFCol3.1 | 0.023576 | ||||||||||||||||||||||||||||||
130 | species | Unclassified Rhizobium | 0.039293 | ||||||||||||||||||||||||||||||
131 | genus | Unclassified Rhizobiaceae | 0.014835 | 0.078587 | 0.014282 | 0.006795 | 0.010019 | 0.035202 | |||||||||||||||||||||||||
132 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.005459 | 0.067712 | 0.003937 | 0.005863 | 0.001502 | 0.130688 | 0.029021 | 0.148684 | 0.004866 | 0.026081 | 0.061924 | 0.223340 | 0.067979 | 0.001461 | 0.063958 | ||||||||||||||||
133 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 0.005562 | 0.137047 | 0.004406 | 0.002950 | 0.001458 | 0.001502 | 0.155504 | 0.048786 | 0.257888 | 0.004316 | 0.003651 | 0.168215 | 0.031865 | 0.229853 | 0.009983 | 0.005862 | 2.536812e-03 | 0.002826 | |||||||||||||
134 | class | Betaproteobacteria | 0.004134 | 0.005299 | 0.556415 | 0.004947 | 0.019014 | 0.415937 | 0.478652 | 0.292619 | 0.008962 | 0.626305 | 0.139848 | 0.017403 | 0.001070 | 0.485574 | 0.002629 | 2.104327e-02 | |||||||||||||||
135 | order | Neisseriales | 0.001334 | ||||||||||||||||||||||||||||||
136 | order | Rhodocyclales | 0.000904 | 0.003929 | 0.003866 | 0.000988 | |||||||||||||||||||||||||||
137 | family | Zoogloeaceae | 0.000904 | ||||||||||||||||||||||||||||||
138 | family | Azonexaceae | 0.003929 | ||||||||||||||||||||||||||||||
139 | genus | Dechloromonas | 0.003929 | ||||||||||||||||||||||||||||||
140 | species | Dechloromonas aromatica | 0.003929 | ||||||||||||||||||||||||||||||
141 | family | Rhodocyclaceae | 0.000988 | ||||||||||||||||||||||||||||||
142 | genus | Rugosibacter | 0.000988 | ||||||||||||||||||||||||||||||
143 | family | Unclassified Rhodocyclales | 0.003866 | ||||||||||||||||||||||||||||||
144 | order | Nitrosomonadales | 0.005851 | 0.015563 | 0.003686 | 0.015693 | 0.005054 | 0.006776 | |||||||||||||||||||||||||
145 | family | Methylophilaceae | 0.005851 | 0.010393 | 0.003686 | 0.010523 | 0.004042 | 0.004068 | |||||||||||||||||||||||||
146 | genus | Methylotenera | 0.000918 | 0.007924 | 0.002709 | ||||||||||||||||||||||||||||
147 | genus | Methylovorus | 0.001836 | 0.001359 | |||||||||||||||||||||||||||||
148 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 0.003097 | 0.010393 | 0.003686 | 0.002599 | 0.004042 | ||||||||||||||||||||||||||
149 | family | Unclassified Nitrosomonadales | 0.005170 | 0.005170 | 0.001011 | 0.002708 | |||||||||||||||||||||||||||
150 | genus | Candidatus Accumulibacter | 0.003897 | ||||||||||||||||||||||||||||||
151 | order | Burkholderiales | 0.004134 | 0.005299 | 0.442076 | 0.004947 | 0.017549 | 0.320607 | 0.413595 | 0.183390 | 0.004296 | 0.456962 | 0.127759 | 0.009746 | 0.359946 | 0.002629 | 1.051800e-02 | ||||||||||||||||
152 | family | Burkholderiaceae | 0.004840 | 0.003929 | 0.004788 | ||||||||||||||||||||||||||||
153 | genus | Cupriavidus | 0.002706 | ||||||||||||||||||||||||||||||
154 | species | Cupriavidus basilensis | 0.001791 | ||||||||||||||||||||||||||||||
155 | species | Unclassified Cupriavidus | 0.000915 | ||||||||||||||||||||||||||||||
156 | genus | Paraburkholderia | 0.000626 | ||||||||||||||||||||||||||||||
157 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 0.001508 | 0.003929 | 0.004788 | ||||||||||||||||||||||||||||
158 | genus | Rhizobacter | 0.000903 | 0.003603 | 0.001351 | ||||||||||||||||||||||||||||
159 | family | Alcaligenaceae | 0.001850 | 0.000969 | |||||||||||||||||||||||||||||
160 | genus | Achromobacter | 0.001850 | ||||||||||||||||||||||||||||||
161 | genus | Unclassified Alcaligenaceae | 0.000969 | ||||||||||||||||||||||||||||||
162 | family | Oxalobacteraceae | 0.005299 | 0.071551 | 0.016089 | 0.037152 | 0.048888 | 0.020528 | 0.004296 | 0.062436 | 0.049648 | 0.007658 | 0.065196 | 5.262632e-03 | |||||||||||||||||||
163 | genus | Massilia | 0.003709 | 0.001665 | 0.001361 | ||||||||||||||||||||||||||||
164 | genus | Janthinobacterium | 0.002650 | 0.014767 | 0.001461 | 0.011059 | 0.003397 | 0.014608 | 0.003513 | 0.003484 | 0.009524 | ||||||||||||||||||||||
165 | species | Janthinobacterium sp. HH01 | 0.000971 | 0.002721 | |||||||||||||||||||||||||||||
166 | species | Unclassified Janthinobacterium | 0.002650 | 0.014767 | 0.001461 | 0.011059 | 0.003397 | 0.013637 | 0.003513 | 0.003484 | 0.006803 | ||||||||||||||||||||||
167 | genus | Herminiimonas | 0.004576 | 0.003472 | 0.005863 | ||||||||||||||||||||||||||||
168 | species | Herminiimonas arsenicoxydans | 0.000915 | 0.003909 | |||||||||||||||||||||||||||||
169 | species | Unclassified Herminiimonas | 0.003661 | 0.003472 | 0.001954 | ||||||||||||||||||||||||||||
170 | genus | Duganella | 0.001818 | 0.003877 | |||||||||||||||||||||||||||||
171 | species | Duganella zoogloeoides | 0.000909 | 0.000969 | |||||||||||||||||||||||||||||
172 | species | Unclassified Duganella | 0.000909 | 0.002908 | |||||||||||||||||||||||||||||
173 | genus | Herbaspirillum | 0.000913 | 0.003686 | 0.005199 | ||||||||||||||||||||||||||||
174 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 0.002650 | 0.045766 | 0.014628 | 0.022407 | 0.042019 | 0.020528 | 0.004296 | 0.038089 | 0.039271 | 0.004174 | 0.054312 | 5.262632e-03 | |||||||||||||||||||
175 | family | Comamonadaceae | 0.004134 | 0.180451 | 0.001979 | 0.174539 | 0.195289 | 0.104356 | 0.161852 | 0.157433 | |||||||||||||||||||||||
176 | genus | Acidovorax | 0.004134 | 0.004408 | 0.001979 | 0.003929 | 0.010315 | 0.002932 | |||||||||||||||||||||||||
177 | species | Acidovorax avenae | 0.000985 | ||||||||||||||||||||||||||||||
178 | species | Unclassified Acidovorax | 0.004134 | 0.004408 | 0.001979 | 0.003929 | 0.010315 | 0.001946 | |||||||||||||||||||||||||
179 | genus | Rhodoferax | 0.001791 | 0.007826 | 0.006745 | ||||||||||||||||||||||||||||
180 | species | Rhodoferax koreense | 0.002931 | 0.005396 | |||||||||||||||||||||||||||||
181 | species | Unclassified Rhodoferax | 0.001791 | 0.004895 | 0.001349 | ||||||||||||||||||||||||||||
182 | genus | Curvibacter | 0.000884 | ||||||||||||||||||||||||||||||
183 | genus | Variovorax | 0.003572 | 0.039293 | 0.059578 | 0.029437 | 0.042407 | 0.004047 | |||||||||||||||||||||||||
184 | species | Variovorax sp. PAMC 28711 | 0.003929 | 0.000977 | |||||||||||||||||||||||||||||
185 | species | Variovorax paradoxus | 0.007859 | 0.003397 | |||||||||||||||||||||||||||||
186 | species | Unclassified Variovorax | 0.003572 | 0.027505 | 0.059578 | 0.026040 | 0.041429 | 0.004047 | |||||||||||||||||||||||||
187 | genus | Hydrogenophaga | 0.001779 | ||||||||||||||||||||||||||||||
188 | genus | Polaromonas | 0.013847 | 0.007859 | 0.009098 | 0.004035 | 0.005396 | ||||||||||||||||||||||||||
189 | species | Polaromonas sp. CF318 | 0.000878 | 0.002974 | 0.001349 | ||||||||||||||||||||||||||||
190 | species | Unclassified Polaromonas | 0.012969 | 0.007859 | 0.006124 | 0.004035 | 0.004047 | ||||||||||||||||||||||||||
191 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 0.154170 | 0.123458 | 0.116299 | 0.074919 | 0.104653 | 0.141245 | |||||||||||||||||||||||||
192 | family | Unclassified Burkholderiales | 0.182481 | 0.002968 | 0.001461 | 0.104986 | 0.165815 | 0.058506 | 0.226916 | 0.078111 | 0.002088 | 0.135966 | 0.002629 | 5.255371e-03 | |||||||||||||||||||
193 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.107585 | 0.001465 | 0.075838 | 0.053608 | 0.093536 | 0.004665 | 0.163301 | 0.012089 | 0.007657 | 0.001070 | 0.117518 | 1.052526e-02 | |||||||||||||||||||
194 | class | Deltaproteobacteria | 0.014707 | 0.014707 | 0.005404 | ||||||||||||||||||||||||||||
195 | order | Myxococcales | 0.009828 | 0.009828 | 0.001351 | ||||||||||||||||||||||||||||
196 | family | Archangiaceae | 0.001351 | ||||||||||||||||||||||||||||||
197 | family | Unclassified Myxococcales | 0.009828 | 0.009828 | |||||||||||||||||||||||||||||
198 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 0.004879 | 0.004879 | 0.004053 | ||||||||||||||||||||||||||||
199 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.002797 | 0.360633 | 0.002218 | 0.016700 | 0.004375 | 0.003087 | 0.260516 | 0.147165 | 0.273127 | 0.002635 | 0.014831 | 0.001664 | 0.323224 | 0.055502 | 0.007631 | 0.006457 | 0.332374 | 0.041338 | 3.469447e-18 | 0.001456 | 0.007126 | ||||||||||
200 | phylum | Firmicutes | 0.001137 | 0.006723 | 0.007151 | 0.004057 | 0.002119 | 0.002907 | 0.021234 | ||||||||||||||||||||||||
201 | class | Bacilli | 0.001137 | 0.003373 | 0.007151 | 0.002119 | 0.002907 | 0.005643 | |||||||||||||||||||||||||
202 | order | Bacillales | 0.001137 | 0.003373 | 0.001411 | ||||||||||||||||||||||||||||
203 | family | Bacillaceae | 0.001411 | ||||||||||||||||||||||||||||||
204 | family | Paenibacillaceae | 0.001137 | 0.003373 | |||||||||||||||||||||||||||||
205 | genus | Paenibacillus | 0.001137 | ||||||||||||||||||||||||||||||
206 | genus | Unclassified Paenibacillaceae | 0.003373 | ||||||||||||||||||||||||||||||
207 | order | Unclassified Bacilli | 0.007151 | 0.002119 | 0.002907 | 0.004233 | |||||||||||||||||||||||||||
208 | class | Unclassified Firmicutes | 0.003350 | 0.004057 | 0.015590 | ||||||||||||||||||||||||||||
209 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.008003 | ||||||||||||||||||||||||||||||
210 | class | Deinococci | 0.002664 | ||||||||||||||||||||||||||||||
211 | order | Thermales | 0.002664 | ||||||||||||||||||||||||||||||
212 | family | Thermaceae | 0.002664 | ||||||||||||||||||||||||||||||
213 | class | Unclassified Deinococcus-Thermus | 0.005339 | ||||||||||||||||||||||||||||||
214 | phylum | Chloroflexi | 0.001156 | 0.001386 | |||||||||||||||||||||||||||||
215 | phylum | Deferribacteres | 0.002458 | ||||||||||||||||||||||||||||||
216 | phylum | Actinobacteria | 0.021399 | 0.328140 | 0.013682 | 0.442049 | 0.516204 | 0.421228 | 0.007517 | 0.655916 | 0.094330 | 0.013110 | 0.583138 | 2.707116e-02 | |||||||||||||||||||
217 | class | Actinobacteria | 0.021399 | 0.298465 | 0.013682 | 0.392381 | 0.477436 | 0.330903 | 0.004695 | 0.573454 | 0.092784 | 0.011720 | 0.492578 | 2.707116e-02 | |||||||||||||||||||
218 | order | Nakamurellales | 0.003962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
219 | family | Nakamurellaceae | 0.003962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
220 | genus | Nakamurella | 0.003962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
221 | species | Nakamurella multipartita | 0.003962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
222 | order | Catenulisporales | 0.000623 | ||||||||||||||||||||||||||||||
223 | family | Catenulisporaceae | 0.000623 | ||||||||||||||||||||||||||||||
224 | genus | Catenulispora | 0.000623 | ||||||||||||||||||||||||||||||
225 | order | Kineosporiales | 0.000949 | ||||||||||||||||||||||||||||||
226 | family | Kineosporiaceae | 0.000949 | ||||||||||||||||||||||||||||||
227 | order | Micrococcales | 0.002628 | 0.008934 | 0.001384 | 0.009772 | 0.012966 | 0.017197 | 0.004695 | 0.021636 | 0.012119 | 0.002725 | 0.005450 | 4.721905e-03 | |||||||||||||||||||
228 | family | Dermacoccaceae | 0.002830 | ||||||||||||||||||||||||||||||
229 | family | Promicromonosporaceae | 0.003962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
230 | genus | Isoptericola | 0.003962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
231 | species | Isoptericola dokdonensis | 0.003962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
232 | family | Dermatophilaceae | 0.002672 | 0.002672 | |||||||||||||||||||||||||||||
233 | genus | Kineosphaera | 0.002672 | 0.002672 | |||||||||||||||||||||||||||||
234 | family | Microbacteriaceae | 0.002628 | 0.005572 | 0.001384 | 0.006219 | 0.003929 | 0.004695 | 0.006374 | 0.004237 | 0.002044 | 0.004087 | 4.721905e-03 | ||||||||||||||||||||
235 | genus | Microbacterium | 0.001470 | 0.002725 | |||||||||||||||||||||||||||||
236 | genus | Cryobacterium | 0.002628 | 0.001118 | 0.001384 | 0.006219 | 0.003755 | 0.006374 | 0.002044 | 4.721905e-03 | |||||||||||||||||||||||
237 | species | Cryobacterium arcticum | 0.003109 | 0.000937 | 0.000681 | ||||||||||||||||||||||||||||
238 | species | Unclassified Cryobacterium | 0.002628 | 0.001118 | 0.001384 | 0.003109 | 0.002818 | 0.006374 | 0.001362 | 4.721905e-03 | |||||||||||||||||||||||
239 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 0.004454 | 0.003929 | 0.000941 | 0.002768 | 0.001362 | ||||||||||||||||||||||||||
240 | family | Unclassified Micrococcales | 0.003362 | 0.007100 | 0.006747 | 0.006634 | 0.012432 | 0.007882 | 0.000681 | 0.001362 | |||||||||||||||||||||||
241 | order | Corynebacteriales | 0.008038 | 0.164378 | 0.005443 | 0.136290 | 0.309862 | 0.146000 | 0.385465 | 0.013845 | 0.000697 | 0.174152 | 1.738774e-02 | ||||||||||||||||||||
242 | family | Mycobacteriaceae | 0.008673 | 0.005279 | 0.010545 | 0.005279 | 0.011802 | 0.005409 | |||||||||||||||||||||||||
243 | genus | Mycobacterium | 0.006652 | 0.002687 | 0.003446 | 0.002687 | 0.007884 | 0.001357 | |||||||||||||||||||||||||
244 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 0.002022 | 0.002592 | 0.007098 | 0.002592 | 0.003918 | 0.004053 | |||||||||||||||||||||||||
245 | family | Nocardiaceae | 0.125278 | 0.063887 | 0.240153 | 0.060456 | 0.256061 | 0.013845 | 0.064685 | ||||||||||||||||||||||||
246 | genus | Nocardia | 0.008465 | 0.003373 | 0.003962 | 0.006819 | 0.006153 | 0.001347 | |||||||||||||||||||||||||
247 | species | Nocardia sp. 348MFTsu5.1 | 0.003362 | 0.001538 | |||||||||||||||||||||||||||||
248 | species | Unclassified Nocardia | 0.005103 | 0.003373 | 0.003962 | 0.006819 | 0.004615 | 0.001347 | |||||||||||||||||||||||||
249 | genus | Rhodococcus | 0.077648 | 0.033178 | 0.174956 | 0.037140 | 0.186771 | 0.013484 | |||||||||||||||||||||||||
250 | species | Rhodococcus pyridinivorans | 0.003962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
251 | species | Rhodococcus sp. B7740 | 0.004063 | ||||||||||||||||||||||||||||||
252 | species | Unclassified Rhodococcus | 0.077648 | 0.033178 | 0.170892 | 0.033178 | 0.186771 | 0.013484 | |||||||||||||||||||||||||
253 | genus | Smaragdicoccus | 0.003050 | ||||||||||||||||||||||||||||||
254 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 0.039164 | 0.030710 | 0.058775 | 0.019354 | 0.062472 | 0.007692 | 0.049853 | ||||||||||||||||||||||||
255 | family | Gordoniaceae | 0.001359 | 1.241985e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
256 | genus | Gordonia | 0.001359 | 4.967898e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
257 | genus | Unclassified Gordoniaceae | 7.451947e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
258 | family | Tsukamurellaceae | 0.001362 | ||||||||||||||||||||||||||||||
259 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.008038 | 0.030426 | 0.005443 | 0.067124 | 0.059164 | 0.080266 | 0.117602 | 0.000697 | 0.101337 | 4.967898e-03 | |||||||||||||||||||||
260 | order | Micromonosporales | 0.001134 | ||||||||||||||||||||||||||||||
261 | family | Micromonosporaceae | 0.001134 | ||||||||||||||||||||||||||||||
262 | genus | Verrucosispora | 0.001134 | ||||||||||||||||||||||||||||||
263 | order | Propionibacteriales | 0.025155 | 0.004244 | 0.073924 | 0.024270 | 0.025960 | 0.002698 | |||||||||||||||||||||||||
264 | family | Propionibacteriaceae | 0.001968 | 0.001349 | |||||||||||||||||||||||||||||
265 | genus | Microlunatus | 0.000984 | 0.001349 | |||||||||||||||||||||||||||||
266 | genus | Unclassified Propionibacteriaceae | 0.000984 | ||||||||||||||||||||||||||||||
267 | family | Nocardioidaceae | 0.017539 | 0.004244 | 0.060891 | 0.017515 | 0.015575 | ||||||||||||||||||||||||||
268 | genus | Nocardioides | 0.001170 | 0.022741 | 0.003921 | 0.003206 | |||||||||||||||||||||||||||
269 | species | Nocardioides sp. JS614 | 0.006561 | ||||||||||||||||||||||||||||||
270 | species | Unclassified Nocardioides | 0.001170 | 0.016180 | 0.003921 | 0.003206 | |||||||||||||||||||||||||||
271 | genus | Aeromicrobium | 0.001118 | 0.004807 | |||||||||||||||||||||||||||||
272 | genus | Pimelobacter | 0.002352 | ||||||||||||||||||||||||||||||
273 | genus | Unclassified Nocardioidaceae | 0.012899 | 0.004244 | 0.038150 | 0.008787 | 0.012369 | ||||||||||||||||||||||||||
274 | family | Unclassified Propionibacteriales | 0.005648 | 0.013033 | 0.006755 | 0.010385 | 0.001349 | ||||||||||||||||||||||||||
275 | order | Pseudonocardiales | 0.003866 | 0.003009 | |||||||||||||||||||||||||||||
276 | family | Pseudonocardiaceae | 0.003866 | ||||||||||||||||||||||||||||||
277 | family | Unclassified Pseudonocardiales | 0.003009 | ||||||||||||||||||||||||||||||
278 | order | Streptomycetales | 0.003717 | 0.003866 | 0.000899 | 0.000899 | 0.010281 | ||||||||||||||||||||||||||
279 | family | Streptomycetaceae | 0.001825 | 0.003406 | |||||||||||||||||||||||||||||
280 | genus | Streptomyces | 0.001825 | 0.003406 | |||||||||||||||||||||||||||||
281 | family | Unclassified Streptomycetales | 0.001891 | 0.003866 | 0.000899 | 0.000899 | 0.006875 | ||||||||||||||||||||||||||
282 | order | Streptosporangiales | 0.000994 | 0.000983 | |||||||||||||||||||||||||||||
283 | family | Streptosporangiaceae | 0.000994 | ||||||||||||||||||||||||||||||
284 | family | Unclassified Streptosporangiales | 0.000983 | ||||||||||||||||||||||||||||||
285 | order | Frankiales | 0.010098 | ||||||||||||||||||||||||||||||
286 | family | Frankiaceae | 0.003303 | ||||||||||||||||||||||||||||||
287 | family | Unclassified Frankiales | 0.006795 | ||||||||||||||||||||||||||||||
288 | order | Unclassified Actinobacteria | 0.010733 | 0.093530 | 0.006855 | 0.234344 | 0.069688 | 0.163744 | 0.139251 | 0.027571 | 0.008299 | 0.310278 | 4.961511e-03 | ||||||||||||||||||||
289 | class | Acidimicrobiia | 0.003866 | ||||||||||||||||||||||||||||||
290 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.029675 | 0.049668 | 0.038768 | 0.086459 | 0.002822 | 0.082462 | 0.001546 | 0.001390 | 0.090561 | ||||||||||||||||||||||
291 | phylum | Planctomycetes | 0.007555 | 0.002542 | 0.004406 | 0.003122 | 0.005159 | 0.012759 | |||||||||||||||||||||||||
292 | class | Planctomycetia | 0.006427 | 0.001701 | 0.001701 | 0.003122 | 0.012759 | ||||||||||||||||||||||||||
293 | order | Planctomycetales | 0.005350 | 0.001701 | 0.001701 | 0.012759 | |||||||||||||||||||||||||||
294 | family | Planctomycetaceae | 0.002144 | 0.001701 | 0.001701 | ||||||||||||||||||||||||||||
295 | genus | Fuerstia | 0.001067 | ||||||||||||||||||||||||||||||
296 | genus | Unclassified Planctomycetaceae | 0.001078 | 0.001701 | 0.001701 | ||||||||||||||||||||||||||||
297 | family | Gemmataceae | 0.004258 | ||||||||||||||||||||||||||||||
298 | family | Unclassified Planctomycetales | 0.003205 | 0.008501 | |||||||||||||||||||||||||||||
299 | order | Unclassified Planctomycetia | 0.001078 | 0.003122 | |||||||||||||||||||||||||||||
300 | class | Phycisphaerae | 0.001127 | ||||||||||||||||||||||||||||||
301 | class | Unclassified Planctomycetes | 0.000840 | 0.002704 | 0.005159 | ||||||||||||||||||||||||||||
302 | phylum | Spirochaetes | 0.005213 | ||||||||||||||||||||||||||||||
303 | phylum | Nitrospirae | 0.001521 | ||||||||||||||||||||||||||||||
304 | phylum | Acidobacteria | 0.003279 | 0.002038 | 0.002648 | ||||||||||||||||||||||||||||
305 | class | Acidobacteriia | 0.001074 | 0.002648 | |||||||||||||||||||||||||||||
306 | order | Acidobacteriales | 0.001074 | 0.002648 | |||||||||||||||||||||||||||||
307 | family | Acidobacteriaceae | 0.001074 | 0.001308 | |||||||||||||||||||||||||||||
308 | genus | Granulicella | 0.001074 | 0.001308 | |||||||||||||||||||||||||||||
309 | species | Granulicella mallensis | 0.001074 | ||||||||||||||||||||||||||||||
310 | species | Unclassified Granulicella | 0.001308 | ||||||||||||||||||||||||||||||
311 | family | Unclassified Acidobacteriales | 0.001340 | ||||||||||||||||||||||||||||||
312 | class | Solibacteres | 0.002205 | 0.001019 | |||||||||||||||||||||||||||||
313 | order | Solibacterales | 0.001019 | ||||||||||||||||||||||||||||||
314 | family | Solibacteraceae | 0.001019 | ||||||||||||||||||||||||||||||
315 | genus | Candidatus Solibacter | 0.001019 | ||||||||||||||||||||||||||||||
316 | order | Unclassified Solibacteres | 0.002205 | ||||||||||||||||||||||||||||||
317 | class | Unclassified Acidobacteria | 0.001019 | ||||||||||||||||||||||||||||||
318 | phylum | Verrucomicrobia | 0.036153 | 0.051975 | 0.023772 | 0.005860 | 0.065365 | 0.110666 | 0.084172 | ||||||||||||||||||||||||
319 | class | Spartobacteria | 0.005481 | 0.001465 | 0.004030 | 0.010746 | 0.015764 | ||||||||||||||||||||||||||
320 | order | Chthoniobacterales | 0.004111 | 0.001343 | 0.010746 | 0.015764 | |||||||||||||||||||||||||||
321 | family | Chthoniobacteraceae | 0.002740 | 0.001343 | 0.008060 | 0.007882 | |||||||||||||||||||||||||||
322 | genus | Chthoniobacter | 0.002740 | 0.001343 | 0.004030 | 0.001314 | |||||||||||||||||||||||||||
323 | genus | Unclassified Chthoniobacteraceae | 0.004030 | 0.006568 | |||||||||||||||||||||||||||||
324 | family | Unclassified Chthoniobacterales | 0.001370 | 0.002687 | 0.007882 | ||||||||||||||||||||||||||||
325 | order | Unclassified Spartobacteria | 0.001370 | 0.001465 | 0.002687 | ||||||||||||||||||||||||||||
326 | class | Verrucomicrobiae | 0.018780 | 0.011059 | 0.015848 | 0.016165 | 0.034243 | 0.040069 | |||||||||||||||||||||||||
327 | order | Verrucomicrobiales | 0.017671 | 0.011059 | 0.015848 | 0.014818 | 0.026335 | 0.036010 | |||||||||||||||||||||||||
328 | family | Verrucomicrobia subdivision 3 | 0.002170 | ||||||||||||||||||||||||||||||
329 | genus | Pedosphaera | 0.002170 | ||||||||||||||||||||||||||||||
330 | family | Rubritaleaceae | 0.002657 | ||||||||||||||||||||||||||||||
331 | genus | Rubritalea | 0.002657 | ||||||||||||||||||||||||||||||
332 | family | Verrucomicrobiaceae | 0.012199 | 0.007373 | 0.011886 | 0.012124 | 0.023679 | 0.022148 | |||||||||||||||||||||||||
333 | genus | Verrucomicrobium | 0.008872 | 0.003686 | 0.003962 | 0.005388 | 0.015786 | 0.006921 | |||||||||||||||||||||||||
334 | species | Verrucomicrobium spinosum | 0.001347 | 0.002631 | |||||||||||||||||||||||||||||
335 | species | Unclassified Verrucomicrobium | 0.008872 | 0.003686 | 0.003962 | 0.004041 | 0.013155 | 0.006921 | |||||||||||||||||||||||||
336 | genus | Unclassified Verrucomicrobiaceae | 0.003327 | 0.003686 | 0.007924 | 0.006735 | 0.007893 | 0.015226 | |||||||||||||||||||||||||
337 | family | Unclassified Verrucomicrobiales | 0.003303 | 0.003686 | 0.003962 | 0.002694 | 0.013863 | ||||||||||||||||||||||||||
338 | order | Unclassified Verrucomicrobiae | 0.001109 | 0.001347 | 0.007907 | 0.004058 | |||||||||||||||||||||||||||
339 | class | Opitutae | 0.004340 | 0.023054 | 0.007907 | 0.012920 | 0.017870 | ||||||||||||||||||||||||||
340 | order | Opitutales | 0.016355 | 0.007907 | 0.007681 | 0.012785 | |||||||||||||||||||||||||||
341 | family | Opitutaceae | 0.016355 | 0.007907 | 0.007681 | 0.010382 | |||||||||||||||||||||||||||
342 | genus | Opitutus | 0.001284 | ||||||||||||||||||||||||||||||
343 | genus | Lacunisphaera | 0.003397 | 0.001317 | 0.001314 | ||||||||||||||||||||||||||||
344 | genus | Unclassified Opitutaceae | 0.012958 | 0.006590 | 0.006397 | 0.009069 | |||||||||||||||||||||||||||
345 | family | Unclassified Opitutales | 0.002402 | ||||||||||||||||||||||||||||||
346 | order | Puniceicoccales | 0.002170 | 0.001336 | 0.002683 | ||||||||||||||||||||||||||||
347 | family | Puniceicoccaceae | 0.001336 | 0.002683 | |||||||||||||||||||||||||||||
348 | family | Unclassified Puniceicoccales | 0.002170 | ||||||||||||||||||||||||||||||
349 | order | Unclassified Opitutae | 0.002170 | 0.006699 | 0.003903 | 0.002402 | |||||||||||||||||||||||||||
350 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 0.007552 | 0.017862 | 0.007924 | 0.004395 | 0.037263 | 0.052757 | 0.010469 | ||||||||||||||||||||||||
351 | phylum | Bacteroidetes | 0.287748 | 0.071919 | 0.255031 | 0.158149 | 0.007712 | 0.327869 | 0.001081 | 0.107785 | 0.001292 | 0.001490 | 0.010102 | ||||||||||||||||||||
352 | order | Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.010102 | ||||||||||||||||||||||||||||||
353 | class | Flavobacteriia | 0.039392 | 0.003303 | 0.029525 | 0.004672 | 0.031410 | 0.001081 | 0.002694 | ||||||||||||||||||||||||
354 | order | Flavobacteriales | 0.037932 | 0.003303 | 0.029525 | 0.003146 | 0.031410 | 0.001081 | 0.002694 | ||||||||||||||||||||||||
355 | family | Flavobacteriaceae | 0.037932 | 0.029525 | 0.003146 | 0.031410 | 0.002694 | ||||||||||||||||||||||||||
356 | genus | Flavobacterium | 0.034283 | 0.026244 | 0.001598 | 0.029448 | |||||||||||||||||||||||||||
357 | species | Flavobacterium sp. CF136 | 0.002919 | 0.000982 | |||||||||||||||||||||||||||||
358 | species | Unclassified Flavobacterium | 0.031364 | 0.026244 | 0.001598 | 0.028466 | |||||||||||||||||||||||||||
359 | genus | Elizabethkingia | 0.001347 | ||||||||||||||||||||||||||||||
360 | genus | Unclassified Flavobacteriaceae | 0.003649 | 0.003281 | 0.001548 | 0.001962 | 0.001347 | ||||||||||||||||||||||||||
361 | family | Unclassified Flavobacteriales | 0.003303 | 0.001081 | |||||||||||||||||||||||||||||
362 | order | Unclassified Flavobacteriia | 0.001459 | 0.001526 | |||||||||||||||||||||||||||||
363 | class | Sphingobacteriia | 0.004373 | 0.042327 | 0.003962 | 0.039490 | 0.028289 | 0.001490 | |||||||||||||||||||||||||
364 | order | Sphingobacteriales | 0.003644 | 0.038804 | 0.003962 | 0.033556 | 0.025594 | 0.001490 | |||||||||||||||||||||||||
365 | family | Sphingobacteriaceae | 0.003644 | 0.035281 | 0.003962 | 0.024699 | 0.025594 | ||||||||||||||||||||||||||
366 | genus | Sphingobacterium | 0.003523 | ||||||||||||||||||||||||||||||
367 | genus | Mucilaginibacter | 0.003962 | 0.004941 | 0.001347 | ||||||||||||||||||||||||||||
368 | species | Mucilaginibacter paludis | 0.001347 | ||||||||||||||||||||||||||||||
369 | species | Unclassified Mucilaginibacter | 0.003962 | 0.004941 | |||||||||||||||||||||||||||||
370 | genus | Pedobacter | 0.028236 | 0.008884 | |||||||||||||||||||||||||||||
371 | species | Pedobacter sp. BAL39 | 0.003523 | ||||||||||||||||||||||||||||||
372 | species | Unclassified Pedobacter | 0.024713 | 0.008884 | |||||||||||||||||||||||||||||
373 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 0.003644 | 0.003523 | 0.010874 | 0.024247 | |||||||||||||||||||||||||||
374 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.003523 | 0.008857 | 0.001490 | ||||||||||||||||||||||||||||
375 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.000729 | 0.003523 | 0.005934 | 0.002694 | |||||||||||||||||||||||||||
376 | class | Chitinophagia | 0.031120 | 0.006584 | 0.003236 | 0.003962 | 0.006860 | 0.006735 | |||||||||||||||||||||||||
377 | order | Chitinophagales | 0.028232 | 0.003236 | 0.003962 | 0.006860 | 0.005388 | ||||||||||||||||||||||||||
378 | family | Chitinophagaceae | 0.026782 | 0.003236 | 0.003962 | 0.002947 | 0.005388 | ||||||||||||||||||||||||||
379 | genus | Niastella | 0.000713 | 0.000985 | 0.002694 | ||||||||||||||||||||||||||||
380 | genus | Niabella | 0.007236 | ||||||||||||||||||||||||||||||
381 | genus | Segetibacter | 0.002899 | ||||||||||||||||||||||||||||||
382 | genus | Filimonas | 0.003236 | ||||||||||||||||||||||||||||||
383 | genus | Chitinophaga | 0.003962 | ||||||||||||||||||||||||||||||
384 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 0.015934 | 0.001961 | 0.002694 | ||||||||||||||||||||||||||||
385 | family | Unclassified Chitinophagales | 0.001450 | 0.003914 | |||||||||||||||||||||||||||||
386 | order | Unclassified Chitinophagia | 0.002888 | 0.006584 | 0.001347 | ||||||||||||||||||||||||||||
387 | class | Cytophagia | 0.137222 | 0.038677 | 0.124556 | 0.039289 | 0.131193 | 0.017531 | |||||||||||||||||||||||||
388 | order | Cytophagales | 0.125093 | 0.038677 | 0.121085 | 0.039289 | 0.123343 | 0.016184 | |||||||||||||||||||||||||
389 | family | Hymenobacteraceae | 0.035327 | 0.035327 | 0.002702 | ||||||||||||||||||||||||||||
390 | genus | Hymenobacter | 0.020187 | 0.020187 | 0.002702 | ||||||||||||||||||||||||||||
391 | species | Hymenobacter sp. PAMC 26628 | 0.002523 | 0.002523 | |||||||||||||||||||||||||||||
392 | species | Unclassified Hymenobacter | 0.017664 | 0.017664 | 0.002702 | ||||||||||||||||||||||||||||
393 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.015140 | 0.015140 | |||||||||||||||||||||||||||||
394 | family | Cyclobacteriaceae | 0.000988 | ||||||||||||||||||||||||||||||
395 | genus | Indibacter | 0.000988 | ||||||||||||||||||||||||||||||
396 | family | Cytophagaceae | 0.113692 | 0.103727 | 0.097874 | 0.008082 | |||||||||||||||||||||||||||
397 | genus | Spirosoma | 0.003519 | 0.003472 | 0.005875 | 0.002694 | |||||||||||||||||||||||||||
398 | genus | Dyadobacter | 0.012969 | 0.031244 | 0.020551 | ||||||||||||||||||||||||||||
399 | species | Dyadobacter fermentans | 0.001450 | ||||||||||||||||||||||||||||||
400 | species | Unclassified Dyadobacter | 0.011518 | 0.031244 | 0.020551 | ||||||||||||||||||||||||||||
401 | genus | Fibrella | 0.003397 | ||||||||||||||||||||||||||||||
402 | genus | Unclassified Cytophagaceae | 0.097204 | 0.065613 | 0.071447 | 0.005388 | |||||||||||||||||||||||||||
403 | family | Unclassified Cytophagales | 0.011401 | 0.003350 | 0.017358 | 0.003962 | 0.024481 | 0.005400 | |||||||||||||||||||||||||
404 | order | Unclassified Cytophagia | 0.012128 | 0.003472 | 0.007850 | 0.001347 | |||||||||||||||||||||||||||
405 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.075642 | 0.023354 | 0.055388 | 0.110936 | 0.003040 | 0.118915 | 0.052536 | 0.001292 | |||||||||||||||||||||||
406 | phylum | Unclassified Bacteria | 0.266786 | 0.008857 | 0.001458 | 0.002392 | 0.001502 | 0.431849 | 0.057773 | 0.559865 | 0.028141 | 0.002092 | 0.170667 | 0.007547 | 0.783641 | 0.077374 | 0.003196 | 0.023382 | |||||||||||||||
407 | superkingdom | Archaea | 0.001294 | ||||||||||||||||||||||||||||||
408 | superkingdom | Unclassified | 0.017778 | 0.001351 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NapA | 0.02910 | 40 | 93.54 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapB | 0.00772 | 3 | 81.77 | Periplasmic nitrate reductase cytochrome c550-type subunit |
NapC | 0.01724 | 8 | 95.44 | Cytochrome c-type protein NapC |
NapE | 0.00886 | 2 | 83.45 | Periplasmic nitrate reductase component NapE |
NapF | 0.00756 | 3 | 84.23 | Ferredoxin-type protein NapF (periplasmic nitrate reductase) |
NapG | 0.01204 | 6 | 74.18 | Ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase) |
NapH | 0.00175 | 1 | 79.20 | Polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.19922 | 396 | 95.14 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.20667 | 189 | 95.08 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.18273 | 90 | 85.68 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.17036 | 86 | 86.70 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 3.20391 | 5203 | 84.52 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.62835 | 566 | 82.16 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.00674 | 6 | 89.22 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NifD_AnfD_VnfD | 0.00793 | 7 | 91.99 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NifH_AnfH_VnfH | 0.00338 | 2 | 99.00 | Nitrogenase reductase and maturation protein NifH/AnfH/VnfH |
NifK_AnfK_VnfK | 0.00436 | 4 | 70.20 | Nitrogenase beta chain (EC 1.18.6.1) NifK/AnfK/VnfK |
NirA | 0.23873 | 247 | 76.71 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 3.42933 | 4788 | 90.14 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 2.41111 | 947 | 82.95 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.30768 | 224 | 83.46 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirN | 0.00672 | 6 | 82.48 | Nitrite reductase associated c-type cytochorome NirN |
NirS | 0.00102 | 1 | 93.90 | nirS; Cytochrome cd1 nitrite reductase (NO-forming) / hydroxylamine reductase [EC:1.7.2.1 1.7.99.1] |
NirU | 0.19653 | 189 | 80.67 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.05659 | 64 | 87.85 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfA | 0.01567 | 14 | 85.74 | nrfA; nitrite reductase (cytochrome c-552) [EC:1.7.2.2] |
NrfH | 0.01573 | 7 | 86.41 | nrfH; cytochrome c nitrite reductase small subunit |
UreA | 1.90706 | 693 | 93.44 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 1.94459 | 718 | 88.83 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 2.91391 | 2900 | 93.35 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.02011 | 7 | 77.17 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.12768 | 153 | 85.98 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.03139 | 21 | 85.97 |
Denitrification | 0.51978 | 455 | 84.84 |
Nitrate assimilatory reduction | 3.83227 | 5769 | 84.29 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.84326 | 824 | 92.85 |
Nitrite assimilation | 6.27569 | 6171 | 88.21 |
Nitrogen fixation | 0.02241 | 19 | 87.26 |
Urease | 6.76556 | 4311 | 92.61 |
NapC | NarJ | NasA | NapG | NapH | NifH_AnfH_VnfH | NapA | NarH_NxrB | NifK_AnfK_VnfK | NirN | NirS | NrfH | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NapF | NirD | UreA | NirK | cNor-C | NosZ | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapE | NapB | NrfA | NarI | NifB | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.017243 | 1.703602e-01 | 3.203912 | 0.012042 | 0.001747 | 0.003378 | 0.029100 | 0.206674 | 0.004360 | 0.006718 | 0.001016 | 0.015727 | 0.007926 | 1.944594 | 0.007562 | 2.411110 | 1.907063 | 0.307675 | 0.020111 | 0.056589 | 3.429328 | 0.628354 | 0.199220 | 0.127675 | 2.913905e+00 | 0.238729 | 0.008863 | 0.007715 | 0.015666 | 0.182729 | 0.006744 | 0.196528 |
2 | norank | Unknown | 0.010846 | 9.005083e-03 | 0.000992 | |||||||||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.017243 | 1.703602e-01 | 3.203912 | 0.012042 | 0.001747 | 0.003378 | 0.029100 | 0.206674 | 0.004360 | 0.006718 | 0.001016 | 0.015727 | 0.007926 | 1.933748 | 0.007562 | 2.411110 | 1.907063 | 0.307675 | 0.020111 | 0.056589 | 3.429328 | 0.628354 | 0.198577 | 0.127675 | 2.904900e+00 | 0.234276 | 0.008863 | 0.007715 | 0.015666 | 0.182729 | 0.006744 | 0.196528 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.000820 | 1.006701e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
5 | order | Synechococcales | 0.000820 | 1.006701e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
6 | family | Synechococcaceae | 0.000820 | 1.006701e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
7 | phylum | Proteobacteria | 0.017243 | 1.683259e-01 | 2.447725 | 0.005984 | 0.001747 | 0.003378 | 0.027601 | 0.204546 | 0.001087 | 0.006718 | 0.001016 | 0.004516 | 1.529615 | 0.007562 | 1.997559 | 1.375016 | 0.235108 | 0.010104 | 0.045598 | 2.889190 | 0.586136 | 0.198068 | 0.088242 | 2.061018e+00 | 0.113630 | 0.008863 | 0.007715 | 0.002404 | 0.178879 | 0.005458 | 0.122868 | |
8 | class | Gammaproteobacteria | 0.008908 | 1.212206e-01 | 0.535743 | 0.001904 | 0.010862 | 0.124847 | 0.005634 | 0.001016 | 0.530959 | 0.005163 | 0.529697 | 0.458139 | 0.035775 | 0.005366 | 0.001838 | 0.711577 | 0.089831 | 0.117338 | 0.014562 | 5.958319e-01 | 0.002552 | 0.118264 | ||||||||||
9 | order | Methylococcales | 0.000454 | |||||||||||||||||||||||||||||||
10 | family | Methylococcaceae | 0.000454 | |||||||||||||||||||||||||||||||
11 | order | Oceanospirillales | 0.002465 | |||||||||||||||||||||||||||||||
12 | order | Alteromonadales | 0.001301 | |||||||||||||||||||||||||||||||
13 | family | Alteromonadaceae | 0.001301 | |||||||||||||||||||||||||||||||
14 | order | Cellvibrionales | 0.004088 | 0.003572 | ||||||||||||||||||||||||||||||
15 | family | Cellvibrionaceae | 0.003637 | 0.003572 | ||||||||||||||||||||||||||||||
16 | genus | Cellvibrio | 0.001816 | 0.002858 | ||||||||||||||||||||||||||||||
17 | genus | Unclassified Cellvibrionaceae | 0.001821 | 0.000714 | ||||||||||||||||||||||||||||||
18 | family | Unclassified Cellvibrionales | 0.000451 | |||||||||||||||||||||||||||||||
19 | order | Nevskiales | 0.002242 | 1.986989e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
20 | family | Sinobacteraceae | 0.002242 | 1.986989e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
21 | order | Pseudomonadales | 0.008908 | 7.593365e-03 | 0.405772 | 0.006512 | 0.001099 | 0.004508 | 0.001016 | 0.525380 | 0.381465 | 0.458139 | 0.030621 | 0.005366 | 0.001838 | 0.485004 | 0.029735 | 0.003994 | 0.008262 | 5.687128e-01 | ||||||||||||||
22 | family | Pseudomonadaceae | 0.008908 | 5.695024e-03 | 0.375385 | 0.005788 | 0.001099 | 0.004508 | 0.001016 | 0.510178 | 0.343192 | 0.454119 | 0.030621 | 0.005366 | 0.000926 | 0.445427 | 0.024886 | 0.003495 | 0.006677 | 5.366347e-01 | ||||||||||||||
23 | genus | Pseudomonas | 0.008908 | 3.796683e-03 | 0.199342 | 0.005065 | 0.001099 | 0.004508 | 0.001016 | 0.407246 | 0.223670 | 0.344406 | 0.017425 | 0.005366 | 0.000926 | 0.298508 | 0.013012 | 0.003495 | 0.005092 | 2.957888e-01 | ||||||||||||||
24 | species | Pseudomonas sp. GM16 | 0.002694 | |||||||||||||||||||||||||||||||
25 | species | Pseudomonas sp. Ag1 | 0.002024 | |||||||||||||||||||||||||||||||
26 | species | Pseudomonas fluorescens | 0.001822 | |||||||||||||||||||||||||||||||
27 | species | Pseudomonas mendocina | 0.000673 | 0.013078 | ||||||||||||||||||||||||||||||
28 | species | Pseudomonas stutzeri | 0.001106 | 1.011182e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
29 | species | Unclassified Pseudomonas | 0.008908 | 3.796683e-03 | 0.192130 | 0.005065 | 0.001099 | 0.004508 | 0.001016 | 0.407246 | 0.223670 | 0.344406 | 0.004347 | 0.005366 | 0.000926 | 0.298508 | 0.011905 | 0.003495 | 0.005092 | 2.947776e-01 | ||||||||||||||
30 | genus | Azotobacter | 0.000674 | |||||||||||||||||||||||||||||||
31 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 1.898341e-03 | 0.175369 | 0.000724 | 0.102932 | 0.119522 | 0.109712 | 0.013196 | 0.146919 | 0.011874 | 0.001585 | 2.408459e-01 | |||||||||||||||||||||
32 | family | Unclassified Pseudomonadales | 1.898341e-03 | 0.030387 | 0.000724 | 0.015202 | 0.038272 | 0.004021 | 0.000912 | 0.039577 | 0.004849 | 0.000499 | 0.001585 | 3.207815e-02 | ||||||||||||||||||||
33 | order | Enterobacterales | 1.017213e-01 | 0.046592 | 0.001904 | 0.001456 | 0.098498 | 0.005163 | 0.093915 | 0.114932 | 0.038214 | 0.082149 | 0.075430 | |||||||||||||||||||||
34 | family | Erwiniaceae | 4.894731e-02 | 0.001394 | 0.001456 | 0.021914 | 0.005163 | 0.035865 | 0.049181 | 0.004082 | 0.014022 | 0.010233 | ||||||||||||||||||||||
35 | genus | Pantoea | 0.001394 | 0.001456 | 0.005163 | 0.000466 | 0.001179 | 0.000466 | ||||||||||||||||||||||||||
36 | genus | Erwinia | 4.308348e-02 | 0.019723 | 0.031394 | 0.042351 | 0.002260 | 0.011017 | 0.008186 | |||||||||||||||||||||||||
37 | species | Erwinia billingiae | 2.545842e-02 | 0.008766 | 0.026486 | 0.027921 | 0.007512 | 0.006140 | ||||||||||||||||||||||||||
38 | species | Unclassified Erwinia | 1.762506e-02 | 0.010957 | 0.004908 | 0.014430 | 0.002260 | 0.003505 | 0.002047 | |||||||||||||||||||||||||
39 | genus | Unclassified Erwiniaceae | 5.863831e-03 | 0.002191 | 0.004004 | 0.005651 | 0.001356 | 0.003005 | 0.002047 | |||||||||||||||||||||||||
40 | family | Pectobacteriaceae | 9.626227e-03 | 0.001337 | ||||||||||||||||||||||||||||||
41 | genus | Pectobacterium | 9.626227e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
42 | genus | Brenneria | 0.000449 | |||||||||||||||||||||||||||||||
43 | species | Brenneria goodwinii | 0.000449 | |||||||||||||||||||||||||||||||
44 | genus | Unclassified Pectobacteriaceae | 0.000888 | |||||||||||||||||||||||||||||||
45 | family | Yersiniaceae | 1.958340e-03 | 0.010257 | 0.001904 | 0.025774 | 0.021249 | 0.010889 | 0.003002 | |||||||||||||||||||||||||
46 | genus | Rahnella | 0.003415 | 0.005747 | 0.006074 | 0.002718 | 0.001501 | |||||||||||||||||||||||||||
47 | genus | Serratia | 0.001259 | 0.001259 | ||||||||||||||||||||||||||||||
48 | genus | Unclassified Yersiniaceae | 1.958340e-03 | 0.006843 | 0.001904 | 0.018769 | 0.013916 | 0.008171 | 0.001501 | |||||||||||||||||||||||||
49 | family | Enterobacteriaceae | 0.002898 | 0.004395 | ||||||||||||||||||||||||||||||
50 | genus | Kosakonia | 0.001195 | |||||||||||||||||||||||||||||||
51 | genus | Gibbsiella | 0.001096 | |||||||||||||||||||||||||||||||
52 | genus | Unclassified Enterobacteriaceae | 0.001703 | 0.003300 | ||||||||||||||||||||||||||||||
53 | family | Unclassified Enterobacterales | 4.118938e-02 | 0.030705 | 0.072189 | 0.032276 | 0.044503 | 0.023244 | 0.065125 | 0.065197 | ||||||||||||||||||||||||
54 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 1.190600e-02 | 0.078836 | 0.002894 | 0.025249 | 0.001126 | 0.005579 | 0.054317 | 0.002912 | 0.108069 | 0.018116 | 0.031195 | 0.006300 | 2.513209e-02 | 0.002552 | 0.042834 | |||||||||||||||||
55 | class | Oligoflexia | 0.002404 | |||||||||||||||||||||||||||||||
56 | order | Bdellovibrionales | 0.002404 | |||||||||||||||||||||||||||||||
57 | family | Bdellovibrionaceae | 0.001202 | |||||||||||||||||||||||||||||||
58 | family | Unclassified Bdellovibrionales | 0.001202 | |||||||||||||||||||||||||||||||
59 | class | Alphaproteobacteria | 0.589245 | 0.001687 | 0.001442 | 0.001121 | 0.247123 | 0.002400 | 0.361409 | 0.211857 | 0.000964 | 0.000900 | 0.497234 | 0.126327 | 0.001005 | 0.003243 | 3.318223e-01 | 0.094257 | 0.004173 | 0.005163 | 0.001130 | 0.118625 | ||||||||||||
60 | order | Rhodospirillales | 0.000698 | 0.002400 | 0.011297 | 0.001559 | 0.002683 | 3.021593e-03 | 0.003154 | |||||||||||||||||||||||||
61 | family | Rhodospirillaceae | 0.005648 | 0.000734 | ||||||||||||||||||||||||||||||
62 | genus | Azospirillum | 0.005648 | 0.000734 | ||||||||||||||||||||||||||||||
63 | family | Acetobacteraceae | 0.002683 | 3.021593e-03 | 0.001050 | |||||||||||||||||||||||||||||
64 | genus | Acetobacter | 1.008190e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
65 | genus | Unclassified Acetobacteraceae | 0.002683 | 2.013403e-03 | 0.001050 | |||||||||||||||||||||||||||||
66 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.000698 | 0.002400 | 0.005648 | 0.000825 | 0.002104 | |||||||||||||||||||||||||||
67 | order | Rhodobacterales | 0.000699 | 0.008403 | 0.000732 | |||||||||||||||||||||||||||||
68 | order | Sphingomonadales | 0.292949 | 0.005579 | 0.228689 | 0.005648 | 0.241501 | 1.509458e-02 | ||||||||||||||||||||||||||
69 | family | Erythrobacteraceae | 0.004243 | 0.002900 | ||||||||||||||||||||||||||||||
70 | genus | Croceicoccus | 0.001415 | |||||||||||||||||||||||||||||||
71 | genus | Unclassified Erythrobacteraceae | 0.002828 | 0.002900 | ||||||||||||||||||||||||||||||
72 | family | Sphingomonadaceae | 0.255361 | 0.005579 | 0.202325 | 0.005648 | 0.196786 | 9.055858e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
73 | genus | Sphingomonas | 0.047815 | 0.062787 | 0.034590 | 1.005217e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
74 | species | Sphingomonas taxi | 0.000703 | 0.005177 | 0.004355 | |||||||||||||||||||||||||||||
75 | species | Sphingomonas panacis | 0.002119 | 0.012334 | 0.001438 | |||||||||||||||||||||||||||||
76 | species | Sphingomonas hengshuiensis | 0.000699 | |||||||||||||||||||||||||||||||
77 | species | Sphingomonas sp. JJ-A5 | 0.000720 | |||||||||||||||||||||||||||||||
78 | species | Sphingomonas sp. LM7 | 0.002588 | |||||||||||||||||||||||||||||||
79 | species | Sphingomonas sanxanigenens | 1.005217e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
80 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.044294 | 0.042688 | 0.028077 | |||||||||||||||||||||||||||||
81 | genus | Blastomonas | 0.000699 | |||||||||||||||||||||||||||||||
82 | genus | Rhizorhabdus | 0.000732 | |||||||||||||||||||||||||||||||
83 | genus | Sphingobium | 0.015998 | 0.026567 | 0.002883 | |||||||||||||||||||||||||||||
84 | species | Sphingobium sp. MI1205 | 0.002712 | |||||||||||||||||||||||||||||||
85 | species | Sphingobium sp. YBL2 | 0.001022 | |||||||||||||||||||||||||||||||
86 | species | Unclassified Sphingobium | 0.014976 | 0.023855 | 0.002883 | |||||||||||||||||||||||||||||
87 | genus | Novosphingobium | 0.012614 | 0.023044 | 0.013710 | |||||||||||||||||||||||||||||
88 | species | Novosphingobium sp. AP12 | 0.000704 | |||||||||||||||||||||||||||||||
89 | species | Novosphingobium resinovorum | 0.002776 | 0.005177 | ||||||||||||||||||||||||||||||
90 | species | Unclassified Novosphingobium | 0.009134 | 0.017868 | 0.013710 | |||||||||||||||||||||||||||||
91 | genus | Sphingopyxis | 0.002788 | 0.003084 | 0.001461 | |||||||||||||||||||||||||||||
92 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.175446 | 0.005579 | 0.086842 | 0.005648 | 0.143410 | 8.050641e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
93 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.033344 | 0.023464 | 0.044714 | 6.038723e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
94 | order | Caulobacterales | 0.055628 | 0.051454 | 0.041831 | |||||||||||||||||||||||||||||
95 | family | Caulobacteraceae | 0.052219 | 0.036751 | 0.032292 | |||||||||||||||||||||||||||||
96 | genus | Phenylobacterium | 0.002794 | 0.002938 | ||||||||||||||||||||||||||||||
97 | genus | Brevundimonas | 0.000713 | |||||||||||||||||||||||||||||||
98 | genus | Caulobacter | 0.012858 | 0.005664 | 0.010281 | |||||||||||||||||||||||||||||
99 | species | Caulobacter sp. K31 | 0.002702 | 0.002208 | ||||||||||||||||||||||||||||||
100 | species | Unclassified Caulobacter | 0.010156 | 0.005664 | 0.008073 | |||||||||||||||||||||||||||||
101 | genus | Asticcacaulis | 0.002049 | |||||||||||||||||||||||||||||||
102 | genus | Unclassified Caulobacteraceae | 0.034518 | 0.031087 | 0.018361 | |||||||||||||||||||||||||||||
103 | family | Unclassified Caulobacterales | 0.003409 | 0.014703 | 0.009539 | |||||||||||||||||||||||||||||
104 | order | Rhizobiales | 0.123064 | 0.000721 | 0.183813 | 0.037521 | 0.114665 | 0.000964 | 0.000900 | 0.028748 | 0.105008 | 0.002454 | 1.899558e-01 | 0.089377 | 0.004173 | 0.005163 | 0.115471 | |||||||||||||||||
105 | family | Methylobacteriaceae | 0.002027 | 2.003075e-03 | 0.002907 | 0.003167 | ||||||||||||||||||||||||||||
106 | genus | Methylobacterium | 0.002027 | 2.003075e-03 | 0.002907 | 0.003167 | ||||||||||||||||||||||||||||
107 | family | Methylocystaceae | 0.000448 | |||||||||||||||||||||||||||||||
108 | family | Xanthobacteraceae | 0.004334 | 0.004334 | 0.001075 | |||||||||||||||||||||||||||||
109 | genus | Starkeya | 0.002163 | 0.002163 | ||||||||||||||||||||||||||||||
110 | genus | Azorhizobium | 0.002170 | 0.002170 | ||||||||||||||||||||||||||||||
111 | genus | Unclassified Xanthobacteraceae | 0.001075 | |||||||||||||||||||||||||||||||
112 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.053407 | 0.044099 | 0.041543 | 0.089042 | 5.222844e-02 | 0.057348 | 0.004173 | 0.005163 | 0.080591 | |||||||||||||||||||||||
113 | genus | Afipia | 0.001331 | |||||||||||||||||||||||||||||||
114 | genus | Rhodopseudomonas | 0.016671 | 0.001318 | 1.008190e-03 | 0.001055 | ||||||||||||||||||||||||||||
115 | species | Rhodopseudomonas palustris | 0.002801 | |||||||||||||||||||||||||||||||
116 | species | Unclassified Rhodopseudomonas | 0.013870 | 0.001318 | 1.008190e-03 | 0.001055 | ||||||||||||||||||||||||||||
117 | genus | Bradyrhizobium | 0.004745 | 0.011967 | 4.029784e-03 | 0.019044 | 0.004173 | 0.018022 | ||||||||||||||||||||||||||
118 | genus | Bosea | 0.002700 | 0.001321 | 0.001933 | 0.004293 | ||||||||||||||||||||||||||||
119 | species | Bosea sp. PAMC 26642 | 0.001321 | |||||||||||||||||||||||||||||||
120 | species | Unclassified Bosea | 0.002700 | 0.001933 | 0.004293 | |||||||||||||||||||||||||||||
121 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.045962 | 0.027428 | 0.041543 | 0.073105 | 4.719046e-02 | 0.036370 | 0.005163 | 0.057220 | ||||||||||||||||||||||||
122 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.002801 | 0.001334 | 3.017134e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
123 | genus | Devosia | 1.006701e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
124 | species | Devosia sp. H5989 | 1.006701e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
125 | genus | Hyphomicrobium | 0.001334 | 2.010433e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
126 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 0.002801 | |||||||||||||||||||||||||||||||
127 | family | Beijerinckiaceae | 0.000740 | |||||||||||||||||||||||||||||||
128 | genus | Methylocella | 0.000740 | |||||||||||||||||||||||||||||||
129 | family | Phyllobacteriaceae | 0.002613 | 0.002628 | 1.005217e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
130 | genus | Hoeflea | 1.005217e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
131 | genus | Mesorhizobium | 0.001937 | |||||||||||||||||||||||||||||||
132 | genus | Unclassified Phyllobacteriaceae | 0.000677 | 0.002628 | ||||||||||||||||||||||||||||||
133 | family | Rhizobiaceae | 0.020493 | 0.081229 | 0.014804 | 0.015474 | 1.910505e-02 | |||||||||||||||||||||||||||
134 | genus | Neorhizobium | 0.002801 | |||||||||||||||||||||||||||||||
135 | genus | Rhizobium | 0.007549 | 0.039214 | 0.006112 | |||||||||||||||||||||||||||||
136 | species | Rhizobium sp. 2MFCol3.1 | 0.008403 | |||||||||||||||||||||||||||||||
137 | species | Unclassified Rhizobium | 0.007549 | 0.030811 | 0.006112 | |||||||||||||||||||||||||||||
138 | genus | Unclassified Rhizobiaceae | 0.012944 | 0.039214 | 0.008693 | 0.015474 | 1.910505e-02 | |||||||||||||||||||||||||||
139 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.044074 | 0.000721 | 0.051351 | 0.020089 | 0.068788 | 0.000964 | 0.000900 | 0.012535 | 0.014632 | 0.002454 | 1.125969e-01 | 0.029122 | 0.030638 | |||||||||||||||||||
140 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 0.116207 | 0.001687 | 0.000721 | 0.001121 | 0.049327 | 0.043745 | 0.080246 | 0.182863 | 0.018635 | 0.001005 | 0.000790 | 1.237504e-01 | 0.004880 | 0.001130 | ||||||||||||||||||
141 | class | Betaproteobacteria | 0.004233 | 4.514691e-02 | 0.885705 | 0.004081 | 0.001747 | 0.003631 | 0.027267 | 0.576624 | 0.833071 | 0.357883 | 0.124319 | 0.034399 | 1.024918 | 0.317213 | 0.047132 | 0.032967 | 6.881695e-01 | 0.004690 | 0.058574 | 0.001068 | ||||||||||||
142 | order | Rhodocyclales | 0.000660 | 0.002824 | 0.000727 | |||||||||||||||||||||||||||||
143 | family | Zoogloeaceae | 0.000660 | 0.002824 | ||||||||||||||||||||||||||||||
144 | genus | Azoarcus | 0.002824 | |||||||||||||||||||||||||||||||
145 | genus | Unclassified Zoogloeaceae | 0.000660 | |||||||||||||||||||||||||||||||
146 | family | Rhodocyclaceae | 0.000727 | |||||||||||||||||||||||||||||||
147 | genus | Rugosibacter | 0.000727 | |||||||||||||||||||||||||||||||
148 | order | Nitrosomonadales | 0.062171 | 0.004081 | 0.001747 | 0.044233 | 0.063797 | 0.014121 | 0.082465 | 5.452293e-02 | ||||||||||||||||||||||||
149 | family | Methylophilaceae | 0.054980 | 0.004081 | 0.001747 | 0.044233 | 0.063797 | 0.014121 | 0.077298 | 3.836799e-02 | ||||||||||||||||||||||||
150 | genus | Methylophilus | 0.003226 | 0.004081 | 0.005339 | 0.003539 | 1.009684e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
151 | genus | Methylotenera | 0.028861 | 0.005556 | 0.018256 | 0.008473 | 0.025789 | 1.514526e-02 | ||||||||||||||||||||||||||
152 | species | Methylotenera mobilis | 0.000684 | |||||||||||||||||||||||||||||||
153 | species | Unclassified Methylotenera | 0.028177 | 0.005556 | 0.018256 | 0.008473 | 0.025789 | 1.514526e-02 | ||||||||||||||||||||||||||
154 | genus | Methylovorus | 0.000673 | 0.005467 | 3.029052e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
155 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 0.022220 | 0.001747 | 0.033338 | 0.040073 | 0.005648 | 0.047969 | 1.918400e-02 | |||||||||||||||||||||||||
156 | family | Unclassified Nitrosomonadales | 0.007190 | 0.005167 | 1.615494e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
157 | order | Burkholderiales | 0.002116 | 4.310036e-02 | 0.672979 | 0.003631 | 0.020728 | 0.450155 | 0.656523 | 0.228332 | 0.094223 | 0.029867 | 0.724669 | 0.297584 | 0.024317 | 0.012550 | 4.972480e-01 | 0.004690 | 0.046398 | |||||||||||||||
158 | family | Burkholderiaceae | 0.013134 | 0.015262 | 0.002135 | 2.011927e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
159 | genus | Cupriavidus | 0.000657 | |||||||||||||||||||||||||||||||
160 | genus | Burkholderia | 0.000445 | 1.008190e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
161 | genus | Ralstonia | 0.002673 | 0.006195 | 0.000711 | |||||||||||||||||||||||||||||
162 | species | Ralstonia insidiosa | 0.000668 | |||||||||||||||||||||||||||||||
163 | species | Unclassified Ralstonia | 0.002005 | 0.006195 | 0.000711 | |||||||||||||||||||||||||||||
164 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 0.009360 | 0.009067 | 0.001424 | 1.003736e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
165 | family | Alcaligenaceae | 0.003002 | 0.001421 | ||||||||||||||||||||||||||||||
166 | family | Oxalobacteraceae | 3.706243e-02 | 0.194236 | 0.007624 | 0.099510 | 0.191026 | 0.034656 | 0.086896 | 0.022650 | 0.179735 | 0.117819 | 0.017739 | 0.002364 | 1.101829e-01 | 0.030479 | ||||||||||||||||||
167 | genus | Massilia | 0.007457 | 0.012183 | 0.000911 | 0.006458 | 0.007699 | 1.011182e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
168 | genus | Collimonas | 0.004246 | |||||||||||||||||||||||||||||||
169 | genus | Janthinobacterium | 1.436301e-02 | 0.017619 | 0.001089 | 0.013458 | 0.006057 | 0.006892 | 0.011396 | 0.011887 | 0.002032 | 0.000788 | 7.078274e-03 | 0.006085 | ||||||||||||||||||||
170 | species | Janthinobacterium sp. HH01 | 2.046544e-03 | 0.000671 | 0.002649 | 0.001427 | ||||||||||||||||||||||||||||
171 | species | Unclassified Janthinobacterium | 1.231647e-02 | 0.016948 | 0.001089 | 0.010809 | 0.006057 | 0.006892 | 0.009969 | 0.011887 | 0.002032 | 0.000788 | 7.078274e-03 | 0.006085 | ||||||||||||||||||||
172 | genus | Herminiimonas | 0.025904 | 0.024230 | 0.049030 | 0.030881 | ||||||||||||||||||||||||||||
173 | species | Herminiimonas arsenicoxydans | 0.007363 | 0.003029 | 0.006537 | 0.005027 | ||||||||||||||||||||||||||||
174 | species | Unclassified Herminiimonas | 0.018542 | 0.021201 | 0.042492 | 0.025854 | ||||||||||||||||||||||||||||
175 | genus | Duganella | 0.006669 | 0.010594 | 0.015279 | 0.008473 | 0.004273 | 0.006553 | 4.032762e-03 | |||||||||||||||||||||||||
176 | species | Duganella zoogloeoides | 0.004001 | 0.009168 | 0.005648 | 0.000712 | 0.003932 | |||||||||||||||||||||||||||
177 | species | Unclassified Duganella | 0.002668 | 0.010594 | 0.006112 | 0.002824 | 0.003561 | 0.002621 | 4.032762e-03 | |||||||||||||||||||||||||
178 | genus | Herbaspirillum | 0.004009 | 0.007967 | 0.002976 | 0.002118 | 0.009103 | |||||||||||||||||||||||||||
179 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 2.269942e-02 | 0.132578 | 0.006536 | 0.067491 | 0.130301 | 0.026183 | 0.030974 | 0.021739 | 0.120362 | 0.082576 | 0.015708 | 0.001576 | 9.806071e-02 | 0.024394 | ||||||||||||||||||
180 | family | Comamonadaceae | 0.002116 | 1.856965e-03 | 0.246670 | 0.206315 | 0.216983 | 0.110941 | 0.002279 | 0.204808 | 0.002621 | 0.000769 | 2.069130e-01 | 0.004690 | 0.003714 | |||||||||||||||||||
181 | genus | Acidovorax | 0.001293 | 0.002801 | 0.011707 | 0.004296 | 0.001308 | |||||||||||||||||||||||||||
182 | species | Acidovorax sp. RAC01 | 0.002801 | |||||||||||||||||||||||||||||||
183 | species | Acidovorax sp. KKS102 | 0.000647 | |||||||||||||||||||||||||||||||
184 | species | Unclassified Acidovorax | 0.000645 | 0.011707 | 0.004296 | 0.001308 | ||||||||||||||||||||||||||||
185 | genus | Ramlibacter | 0.002900 | 0.002669 | ||||||||||||||||||||||||||||||
186 | genus | Diaphorobacter | 0.003714 | |||||||||||||||||||||||||||||||
187 | genus | Rhodoferax | 0.002626 | 0.008817 | 0.006470 | 4.998210e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
188 | species | Rhodoferax saidenbachensis | 0.002888 | |||||||||||||||||||||||||||||||
189 | species | Rhodoferax koreense | 0.000657 | 3.006781e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
190 | species | Unclassified Rhodoferax | 0.001970 | 0.005930 | 0.006470 | 1.991429e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
191 | genus | Comamonas | 0.002116 | 0.004690 | ||||||||||||||||||||||||||||||
192 | species | Comamonas testosteroni | 0.002116 | |||||||||||||||||||||||||||||||
193 | species | Unclassified Comamonas | 0.004690 | |||||||||||||||||||||||||||||||
194 | genus | Variovorax | 0.009172 | 0.030811 | 0.044587 | 0.026406 | 0.031873 | 5.011301e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
195 | species | Variovorax paradoxus | 0.008403 | 0.002989 | 0.000717 | |||||||||||||||||||||||||||||
196 | species | Variovorax boronicumulans | 1.002260e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
197 | species | Unclassified Variovorax | 0.009172 | 0.022408 | 0.044587 | 0.023417 | 0.031156 | 4.009041e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
198 | genus | Hydrogenophaga | 0.002863 | 0.000730 | ||||||||||||||||||||||||||||||
199 | genus | Polaromonas | 0.037659 | 0.045112 | 0.010992 | 0.001140 | 0.004436 | 0.000769 | 1.503390e-02 | |||||||||||||||||||||||||
200 | species | Polaromonas sp. CF318 | 0.005602 | 0.001140 | 2.004520e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
201 | species | Polaromonas naphthalenivorans | 0.005602 | 0.000727 | ||||||||||||||||||||||||||||||
202 | species | Polaromonas sp. JS666 | 2.004520e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
203 | species | Unclassified Polaromonas | 0.037659 | 0.033908 | 0.010992 | 0.003710 | 0.000769 | 1.102486e-02 | ||||||||||||||||||||||||||
204 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 1.856965e-03 | 0.195920 | 0.127590 | 0.135116 | 0.081865 | 0.001140 | 0.157003 | 0.001313 | 1.818696e-01 | |||||||||||||||||||||||
205 | genus | Leptothrix | 0.000734 | |||||||||||||||||||||||||||||||
206 | genus | Roseateles | 0.000722 | |||||||||||||||||||||||||||||||
207 | family | Unclassified Burkholderiales | 4.180967e-03 | 0.218939 | 0.003631 | 0.013103 | 0.144331 | 0.230250 | 0.082735 | 0.005048 | 0.007217 | 0.335113 | 0.177144 | 0.006577 | 0.009417 | 1.781401e-01 | 0.012206 | |||||||||||||||||
208 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.002116 | 2.046544e-03 | 0.149895 | 0.006539 | 0.082236 | 0.112751 | 0.112606 | 0.030096 | 0.004533 | 0.217057 | 0.019629 | 0.022816 | 0.020418 | 1.363986e-01 | 0.012176 | 0.001068 | ||||||||||||||||
209 | class | Deltaproteobacteria | 0.007490 | 0.007490 | 0.001153 | |||||||||||||||||||||||||||||
210 | order | Myxococcales | 0.005623 | 0.005623 | ||||||||||||||||||||||||||||||
211 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 0.001867 | 0.001867 | 0.001153 | |||||||||||||||||||||||||||||
212 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.004101 | 1.958340e-03 | 0.437032 | 0.001691 | 0.011666 | 0.052432 | 0.001087 | 0.001084 | 0.003395 | 0.167420 | 0.273383 | 0.339648 | 0.074049 | 0.004738 | 0.008460 | 0.655461 | 0.051612 | 0.032592 | 0.037470 | 4.451942e-01 | 0.019374 | 0.002040 | 0.003259 | 0.004243 | ||||||||
213 | phylum | Firmicutes | 0.001287 | 0.002824 | 2.004525e-03 | 0.003150 | ||||||||||||||||||||||||||||
214 | class | Clostridia | 0.002824 | 1.000789e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
215 | order | Clostridiales | 1.000789e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
216 | order | Unclassified Clostridia | 0.002824 | |||||||||||||||||||||||||||||||
217 | class | Bacilli | 0.000818 | 1.003736e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
218 | order | Bacillales | 0.000818 | 1.003736e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
219 | class | Unclassified Firmicutes | 0.000469 | 0.003150 | ||||||||||||||||||||||||||||||
220 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.001966 | |||||||||||||||||||||||||||||||
221 | phylum | Actinobacteria | 2.034327e-03 | 0.055410 | 0.001036 | 0.083550 | 0.066246 | 0.065327 | 0.055159 | 0.036980 | 0.000509 | 1.064126e-01 | 0.003850 | |||||||||||||||||||||
222 | class | Actinobacteria | 2.034327e-03 | 0.044400 | 0.001036 | 0.067644 | 0.057743 | 0.054790 | 0.041087 | 0.035780 | 0.000509 | 9.132811e-02 | 0.003850 | |||||||||||||||||||||
223 | order | Geodermatophilales | 0.000709 | |||||||||||||||||||||||||||||||
224 | family | Geodermatophilaceae | 0.000709 | |||||||||||||||||||||||||||||||
225 | order | Nakamurellales | 0.002824 | |||||||||||||||||||||||||||||||
226 | order | Micrococcales | 0.004195 | 0.002065 | 0.005800 | 0.010538 | 0.006163 | 0.012482 | 1.198016e-02 | |||||||||||||||||||||||||
227 | family | Micrococcaceae | 0.000698 | |||||||||||||||||||||||||||||||
228 | genus | Kocuria | 0.000698 | |||||||||||||||||||||||||||||||
229 | family | Dermatophilaceae | 0.002065 | 0.002065 | ||||||||||||||||||||||||||||||
230 | genus | Kineosphaera | 0.002065 | 0.002065 | ||||||||||||||||||||||||||||||
231 | family | Microbacteriaceae | 0.000825 | 0.002824 | 0.001322 | 0.002949 | 6.076106e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
232 | genus | Microbacterium | 1.012684e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
233 | genus | Cryobacterium | 0.000825 | 0.001322 | 0.000975 | |||||||||||||||||||||||||||||
234 | species | Cryobacterium sp. LW097 | 0.000975 | |||||||||||||||||||||||||||||||
235 | species | Unclassified Cryobacterium | 0.000825 | 0.001322 | ||||||||||||||||||||||||||||||
236 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 0.002824 | 0.001974 | 5.063422e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
237 | family | Unclassified Micrococcales | 0.003370 | 0.005800 | 0.005648 | 0.004143 | 0.009533 | 5.904058e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
238 | order | Corynebacteriales | 0.008897 | 0.005384 | 0.019623 | 0.011643 | 0.001149 | 7.022171e-03 | 0.001914 | |||||||||||||||||||||||||
239 | family | Mycobacteriaceae | 0.002427 | 0.002801 | 0.002895 | |||||||||||||||||||||||||||||
240 | genus | Mycobacterium | 0.001427 | 0.002801 | ||||||||||||||||||||||||||||||
241 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 0.001000 | 0.002895 | ||||||||||||||||||||||||||||||
242 | family | Nocardiaceae | 0.003642 | 0.011034 | 0.004368 | 0.001149 | 1.000789e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
243 | genus | Nocardia | 0.005339 | 0.002175 | 0.001149 | |||||||||||||||||||||||||||||
244 | genus | Rhodococcus | 0.000919 | 0.005696 | 0.002193 | 1.000789e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
245 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 0.002723 | |||||||||||||||||||||||||||||||
246 | family | Gordoniaceae | 1.006701e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
247 | genus | Gordonia | 1.006701e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
248 | family | Tsukamurellaceae | 2.025369e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
249 | genus | Tsukamurella | 1.012684e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
250 | genus | Unclassified Tsukamurellaceae | 1.012684e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||||
251 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.002829 | 0.005384 | 0.005788 | 0.004379 | 2.989313e-03 | 0.001914 | ||||||||||||||||||||||||||
252 | order | Micromonosporales | 0.000837 | |||||||||||||||||||||||||||||||
253 | family | Micromonosporaceae | 0.000837 | |||||||||||||||||||||||||||||||
254 | order | Propionibacteriales | 0.009288 | 0.004286 | 0.011649 | 0.004286 | 0.000706 | 0.008030 | 2.028383e-03 | |||||||||||||||||||||||||
255 | family | Propionibacteriaceae | 0.002143 | 0.002143 | ||||||||||||||||||||||||||||||
256 | genus | Microlunatus | 0.002143 | 0.002143 | ||||||||||||||||||||||||||||||
257 | family | Nocardioidaceae | 0.007594 | 0.011649 | 0.000706 | 0.005772 | 1.014191e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
258 | genus | Nocardioides | 0.005850 | 0.001200 | ||||||||||||||||||||||||||||||
259 | genus | Aeromicrobium | 0.000706 | 0.001157 | ||||||||||||||||||||||||||||||
260 | genus | Unclassified Nocardioidaceae | 0.007594 | 0.005800 | 0.003415 | 1.014191e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
261 | family | Unclassified Propionibacteriales | 0.001694 | 0.002143 | 0.002143 | 0.002258 | 1.014191e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
262 | order | Pseudonocardiales | 0.003056 | 0.001417 | ||||||||||||||||||||||||||||||
263 | family | Pseudonocardiaceae | 0.001417 | |||||||||||||||||||||||||||||||
264 | genus | Actinomycetospora | 0.001417 | |||||||||||||||||||||||||||||||
265 | family | Unclassified Pseudonocardiales | 0.003056 | |||||||||||||||||||||||||||||||
266 | order | Streptomycetales | 0.001362 | 0.003895 | ||||||||||||||||||||||||||||||
267 | family | Streptomycetaceae | 0.001362 | 0.001279 | ||||||||||||||||||||||||||||||
268 | family | Unclassified Streptomycetales | 0.002616 | |||||||||||||||||||||||||||||||
269 | order | Streptosporangiales | 0.001920 | 0.001920 | 0.001103 | |||||||||||||||||||||||||||||
270 | family | Streptosporangiaceae | 0.001920 | 0.001920 | ||||||||||||||||||||||||||||||
271 | family | Unclassified Streptosporangiales | 0.001103 | |||||||||||||||||||||||||||||||
272 | order | Frankiales | 0.000447 | 0.005875 | 0.001369 | |||||||||||||||||||||||||||||
273 | family | Frankiaceae | 0.005875 | 0.001369 | ||||||||||||||||||||||||||||||
274 | genus | Frankia | 0.005875 | 0.001369 | ||||||||||||||||||||||||||||||
275 | family | Sporichthyaceae | 0.000447 | |||||||||||||||||||||||||||||||
276 | genus | Sporichthya | 0.000447 | |||||||||||||||||||||||||||||||
277 | order | Unclassified Actinobacteria | 2.034327e-03 | 0.018664 | 0.001036 | 0.053989 | 0.011740 | 0.035222 | 0.019789 | 0.009120 | 0.000509 | 7.029739e-02 | 0.001936 | |||||||||||||||||||||
278 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.011009 | 0.015905 | 0.008503 | 0.010538 | 0.014072 | 0.001200 | 1.508448e-02 | |||||||||||||||||||||||||
279 | phylum | Planctomycetes | 0.017488 | 0.001500 | 0.000623 | 0.001250 | 3.005309e-03 | 0.001913 | 0.004151 | |||||||||||||||||||||||||
280 | class | Planctomycetia | 0.015903 | 0.000623 | 0.000623 | 2.003049e-03 | 0.000959 | 0.003175 | ||||||||||||||||||||||||||
281 | order | Planctomycetales | 0.011922 | 1.002260e-03 | 0.000959 | 0.003175 | ||||||||||||||||||||||||||||
282 | family | Planctomycetaceae | 0.008753 | 1.002260e-03 | 0.001062 | |||||||||||||||||||||||||||||
283 | genus | Rhodopirellula | 0.000790 | 0.001062 | ||||||||||||||||||||||||||||||
284 | genus | Schlesneria | 0.002383 | |||||||||||||||||||||||||||||||
285 | genus | Unclassified Planctomycetaceae | 0.005580 | 1.002260e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
286 | family | Gemmataceae | 0.002113 | |||||||||||||||||||||||||||||||
287 | family | Unclassified Planctomycetales | 0.003169 | 0.000959 | ||||||||||||||||||||||||||||||
288 | order | Unclassified Planctomycetia | 0.003982 | 0.000623 | 0.000623 | 1.000789e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
289 | class | Phycisphaerae | 0.000976 | |||||||||||||||||||||||||||||||
290 | order | Phycisphaerales | 0.000976 | |||||||||||||||||||||||||||||||
291 | family | Phycisphaeraceae | 0.000976 | |||||||||||||||||||||||||||||||
292 | class | Unclassified Planctomycetes | 0.001584 | 0.001500 | 0.000627 | 1.002260e-03 | 0.000955 | |||||||||||||||||||||||||||
293 | phylum | Lentisphaerae | 0.000806 | 0.001444 | ||||||||||||||||||||||||||||||
294 | class | Lentisphaeria | 0.000806 | |||||||||||||||||||||||||||||||
295 | class | Unclassified Lentisphaerae | 0.001444 | |||||||||||||||||||||||||||||||
296 | phylum | Acidobacteria | 0.000750 | 0.002900 | 0.001942 | |||||||||||||||||||||||||||||
297 | class | Acidobacteriia | 0.000967 | 0.000971 | ||||||||||||||||||||||||||||||
298 | order | Acidobacteriales | 0.000967 | 0.000971 | ||||||||||||||||||||||||||||||
299 | family | Acidobacteriaceae | 0.000967 | |||||||||||||||||||||||||||||||
300 | genus | Granulicella | 0.000967 | |||||||||||||||||||||||||||||||
301 | family | Unclassified Acidobacteriales | 0.000971 | |||||||||||||||||||||||||||||||
302 | class | Unclassified Acidobacteria | 0.000750 | 0.001933 | 0.000971 | |||||||||||||||||||||||||||||
303 | phylum | Armatimonadetes | 0.001041 | |||||||||||||||||||||||||||||||
304 | phylum | Verrucomicrobia | 0.022801 | 0.068203 | 0.056484 | 9.803939e-02 | 0.064067 | 0.054338 | ||||||||||||||||||||||||||
305 | class | Spartobacteria | 0.003994 | 0.005648 | 0.000998 | 0.007800 | ||||||||||||||||||||||||||||
306 | order | Chthoniobacterales | 0.002497 | 0.005648 | 0.000998 | 0.007800 | ||||||||||||||||||||||||||||
307 | family | Chthoniobacteraceae | 0.001498 | 0.002824 | 0.004875 | |||||||||||||||||||||||||||||
308 | genus | Chthoniobacter | 0.000999 | |||||||||||||||||||||||||||||||
309 | genus | Unclassified Chthoniobacteraceae | 0.000499 | 0.002824 | 0.004875 | |||||||||||||||||||||||||||||
310 | family | Unclassified Chthoniobacterales | 0.000999 | 0.002824 | 0.000998 | 0.002925 | ||||||||||||||||||||||||||||
311 | order | Unclassified Spartobacteria | 0.001498 | |||||||||||||||||||||||||||||||
312 | class | Verrucomicrobiae | 0.003273 | 0.007885 | 0.022594 | 1.701341e-02 | 0.006866 | 0.015397 | ||||||||||||||||||||||||||
313 | order | Verrucomicrobiales | 0.003273 | 0.007885 | 0.019769 | 1.401104e-02 | 0.006866 | 0.014391 | ||||||||||||||||||||||||||
314 | family | Rubritaleaceae | 0.002959 | 0.002075 | ||||||||||||||||||||||||||||||
315 | genus | Rubritalea | 0.001973 | |||||||||||||||||||||||||||||||
316 | genus | Unclassified Rubritaleaceae | 0.000986 | 0.002075 | ||||||||||||||||||||||||||||||
317 | family | Verrucomicrobiaceae | 0.002455 | 0.005256 | 0.008473 | 9.007097e-03 | 0.002929 | |||||||||||||||||||||||||||
318 | genus | Verrucomicrobium | 0.001636 | 0.008473 | 1.000789e-03 | 0.000976 | ||||||||||||||||||||||||||||
319 | genus | Unclassified Verrucomicrobiaceae | 0.000818 | 0.005256 | 8.006308e-03 | 0.001953 | ||||||||||||||||||||||||||||
320 | family | Unclassified Verrucomicrobiales | 0.000818 | 0.002628 | 0.011297 | 5.003943e-03 | 0.000978 | 0.012317 | ||||||||||||||||||||||||||
321 | order | Unclassified Verrucomicrobiae | 0.002824 | 3.002366e-03 | 0.001005 | |||||||||||||||||||||||||||||
322 | class | Opitutae | 0.003952 | 0.005715 | 0.002824 | 2.933448e-03 | 0.011423 | 0.021265 | ||||||||||||||||||||||||||
323 | order | Opitutales | 0.002364 | 0.005715 | 0.002824 | 9.778161e-04 | 0.008535 | 0.018297 | ||||||||||||||||||||||||||
324 | family | Opitutaceae | 0.001576 | 0.002726 | 0.002824 | 9.778161e-04 | 0.007583 | 0.009642 | ||||||||||||||||||||||||||
325 | family | Unclassified Opitutales | 0.000788 | 0.002989 | 0.000952 | 0.008655 | ||||||||||||||||||||||||||||
326 | order | Puniceicoccales | 0.000800 | 0.001993 | ||||||||||||||||||||||||||||||
327 | family | Puniceicoccaceae | 0.000800 | |||||||||||||||||||||||||||||||
328 | family | Unclassified Puniceicoccales | 0.001993 | |||||||||||||||||||||||||||||||
329 | order | Unclassified Opitutae | 0.000788 | 1.955632e-03 | 0.002888 | 0.000975 | ||||||||||||||||||||||||||||
330 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 0.011582 | 0.054604 | 0.025418 | 7.809254e-02 | 0.044780 | 0.009877 | ||||||||||||||||||||||||||
331 | phylum | Bacteroidetes | 0.357641 | 0.013276 | 0.036208 | 0.314765 | 0.080137 | 0.022560 | 0.010007 | 0.007061 | 0.400278 | 0.022296 | 6.098867e-02 | 0.000959 | 0.012230 | 0.001286 | 0.002177 | |||||||||||||||||
332 | order | Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.002177 | |||||||||||||||||||||||||||||||
333 | family | Rhodothermaceae | 0.002177 | |||||||||||||||||||||||||||||||
334 | genus | Rhodothermus | 0.002177 | |||||||||||||||||||||||||||||||
335 | class | Flavobacteriia | 0.143849 | 0.005926 | 0.090592 | 0.019769 | 0.016728 | 0.002673 | 0.110406 | 0.007953 | 9.007097e-03 | |||||||||||||||||||||||
336 | order | Flavobacteriales | 0.142252 | 0.005926 | 0.090592 | 0.016945 | 0.016728 | 0.002673 | 0.107520 | 0.006359 | 7.005520e-03 | |||||||||||||||||||||||
337 | family | Flavobacteriaceae | 0.139589 | 0.005926 | 0.090592 | 0.016945 | 0.014337 | 0.001782 | 0.105355 | 0.003169 | 5.003943e-03 | |||||||||||||||||||||||
338 | genus | Flavobacterium | 0.128133 | 0.090592 | 0.011297 | 0.011672 | 0.001782 | 0.097418 | ||||||||||||||||||||||||||
339 | species | Flavobacterium sp. CF136 | 0.003727 | 0.011649 | 0.002888 | |||||||||||||||||||||||||||||
340 | species | Flavobacterium gilvum | 0.001599 | 0.000723 | ||||||||||||||||||||||||||||||
341 | species | Flavobacterium johnsoniae | 0.011699 | |||||||||||||||||||||||||||||||
342 | species | Unclassified Flavobacterium | 0.122807 | 0.067244 | 0.011297 | 0.011672 | 0.001782 | 0.093807 | ||||||||||||||||||||||||||
343 | genus | Unclassified Flavobacteriaceae | 0.011456 | 0.005926 | 0.005648 | 0.002665 | 0.007937 | 0.003169 | 5.003943e-03 | |||||||||||||||||||||||||
344 | family | Unclassified Flavobacteriales | 0.002663 | 0.002391 | 0.000891 | 0.002164 | 0.003190 | 2.001577e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
345 | order | Unclassified Flavobacteriia | 0.001597 | 0.002824 | 0.002886 | 0.001594 | 2.001577e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
346 | class | Sphingobacteriia | 0.013832 | 0.013276 | 0.014687 | 0.149168 | 0.008473 | 0.080353 | 1.595318e-02 | 0.012230 | ||||||||||||||||||||||||
347 | order | Sphingobacteriales | 0.012236 | 0.013276 | 0.005875 | 0.146099 | 0.008473 | 0.055706 | 1.301025e-02 | 0.012230 | ||||||||||||||||||||||||
348 | family | Sphingobacteriaceae | 0.011173 | 0.013276 | 0.005875 | 0.137098 | 0.008473 | 0.031132 | 9.007097e-03 | 0.011118 | ||||||||||||||||||||||||
349 | genus | Sphingobacterium | 0.003056 | |||||||||||||||||||||||||||||||
350 | genus | Mucilaginibacter | 0.002659 | 0.008780 | 0.005648 | 0.005085 | 2.001577e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
351 | species | Mucilaginibacter paludis | 0.000532 | 0.002875 | ||||||||||||||||||||||||||||||
352 | species | Unclassified Mucilaginibacter | 0.002127 | 0.005904 | 0.005648 | 0.005085 | 2.001577e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
353 | genus | Pedobacter | 0.000533 | 0.091773 | 0.007228 | |||||||||||||||||||||||||||||
354 | species | Pedobacter sp. BAL39 | 0.006112 | |||||||||||||||||||||||||||||||
355 | species | Pedobacter steynii | 0.000533 | |||||||||||||||||||||||||||||||
356 | species | Unclassified Pedobacter | 0.085661 | 0.007228 | ||||||||||||||||||||||||||||||
357 | genus | Solitalea | 0.013276 | 0.005559 | ||||||||||||||||||||||||||||||
358 | species | Solitalea canadensis | 0.006638 | |||||||||||||||||||||||||||||||
359 | species | Unclassified Solitalea | 0.006638 | 0.005559 | ||||||||||||||||||||||||||||||
360 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 0.007981 | 0.005875 | 0.033489 | 0.002824 | 0.018820 | 7.005520e-03 | 0.005559 | |||||||||||||||||||||||||
361 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.001064 | 0.009001 | 0.024574 | 4.003154e-03 | 0.001112 | |||||||||||||||||||||||||||
362 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.001595 | 0.008812 | 0.003070 | 0.024646 | 2.942930e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
363 | class | Chitinophagia | 0.048508 | 0.005926 | 0.005755 | 1.000789e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
364 | order | Chitinophagales | 0.039533 | 0.005926 | 0.003603 | 1.000789e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
365 | family | Chitinophagaceae | 0.033195 | 0.005926 | 0.002883 | 1.000789e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
366 | genus | Niastella | 0.002601 | 1.000789e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||||
367 | genus | Niabella | 0.005281 | |||||||||||||||||||||||||||||||
368 | genus | Segetibacter | 0.001586 | |||||||||||||||||||||||||||||||
369 | genus | Chitinophaga | 0.000526 | 0.000720 | ||||||||||||||||||||||||||||||
370 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 0.023201 | 0.005926 | 0.002164 | |||||||||||||||||||||||||||||
371 | family | Unclassified Chitinophagales | 0.006338 | 0.000720 | ||||||||||||||||||||||||||||||
372 | order | Unclassified Chitinophagia | 0.008975 | 0.002152 | ||||||||||||||||||||||||||||||
373 | class | Cytophagia | 0.052123 | 0.003883 | 0.054398 | 0.003883 | 0.002652 | 0.033087 | 6.004731e-03 | |||||||||||||||||||||||||
374 | order | Cytophagales | 0.048436 | 0.003883 | 0.051369 | 0.003883 | 0.031648 | 6.004731e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
375 | family | Hymenobacteraceae | 0.003883 | 0.003883 | ||||||||||||||||||||||||||||||
376 | genus | Hymenobacter | 0.003883 | 0.003883 | ||||||||||||||||||||||||||||||
377 | species | Hymenobacter sp. PAMC 26628 | 0.001942 | 0.001942 | ||||||||||||||||||||||||||||||
378 | species | Unclassified Hymenobacter | 0.001942 | 0.001942 | ||||||||||||||||||||||||||||||
379 | family | Cytophagaceae | 0.045289 | 0.042322 | 0.031648 | 6.004731e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
380 | genus | Spirosoma | 0.003076 | 0.001442 | 5.003943e-03 | |||||||||||||||||||||||||||||
381 | genus | Dyadobacter | 0.003130 | 0.021201 | 0.008624 | |||||||||||||||||||||||||||||
382 | genus | Fibrella | 0.002989 | |||||||||||||||||||||||||||||||
383 | genus | Cytophaga | 0.002164 | |||||||||||||||||||||||||||||||
384 | genus | Unclassified Cytophagaceae | 0.039083 | 0.018133 | 0.019418 | 1.000789e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
385 | family | Unclassified Cytophagales | 0.003147 | 0.009046 | ||||||||||||||||||||||||||||||
386 | order | Unclassified Cytophagia | 0.003686 | 0.003029 | 0.002652 | 0.001439 | ||||||||||||||||||||||||||||
387 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.099330 | 0.011712 | 0.014681 | 0.048011 | 0.005832 | 0.007355 | 0.004388 | 0.170677 | 0.014343 | 2.902287e-02 | 0.000959 | 0.001286 | ||||||||||||||||||||
388 | phylum | Unclassified Bacteria | 2.775558e-17 | 0.299936 | 0.006057 | 0.001092 | 0.003273 | 0.002451 | 0.003410 | 0.216172 | 0.031916 | 0.327275 | 0.050007 | 0.003929 | 0.081258 | 0.005238 | 0.017137 | 5.724250e-01 | 0.044651 | 0.001033 | 0.011052 | |||||||||||||
389 | superkingdom | Archaea | 0.000643 | 0.002481 | ||||||||||||||||||||||||||||||
390 | phylum | Euryarchaeota | 0.000643 | 0.001496 | ||||||||||||||||||||||||||||||
391 | phylum | Unclassified Archaea | 0.000985 | |||||||||||||||||||||||||||||||
392 | superkingdom | Unclassified | 4.440892e-16 | 0.000979 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NapA | 0.01638 | 13 | 86.73 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapB | 0.01320 | 3 | 93.90 | Periplasmic nitrate reductase cytochrome c550-type subunit |
NapC | 0.00385 | 1 | 90.00 | Cytochrome c-type protein NapC |
NapD | 0.00509 | 1 | 73.50 | Periplasmic nitrate reductase component NapD |
NapF | 0.00430 | 1 | 63.30 | Ferredoxin-type protein NapF (periplasmic nitrate reductase) |
NapG | 0.01253 | 4 | 53.50 | Ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.05182 | 60 | 94.03 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.04789 | 26 | 93.71 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.04878 | 14 | 82.72 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.02746 | 8 | 86.55 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 2.87118 | 2597 | 81.63 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.55471 | 271 | 77.29 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.00565 | 3 | 92.00 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NifD_AnfD_VnfD | 0.00784 | 4 | 100.00 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NifH_AnfH_VnfH | 0.00293 | 1 | 98.00 | Nitrogenase reductase and maturation protein NifH/AnfH/VnfH |
NifK_AnfK_VnfK | 0.00376 | 2 | 95.00 | Nitrogenase beta chain (EC 1.18.6.1) NifK/AnfK/VnfK |
NirA | 0.51970 | 307 | 74.51 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 2.80760 | 2247 | 87.32 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 2.21788 | 452 | 80.16 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.08877 | 41 | 75.37 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirN | 0.00390 | 2 | 89.00 | Nitrite reductase associated c-type cytochorome NirN |
NirU | 0.38247 | 212 | 78.91 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.01983 | 13 | 88.15 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfA | 0.00809 | 4 | 87.00 | nrfA; nitrite reductase (cytochrome c-552) [EC:1.7.2.2] |
UreA | 2.52173 | 553 | 88.69 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 2.48893 | 536 | 84.28 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 3.34081 | 1924 | 90.32 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.01407 | 4 | 54.10 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.05024 | 37 | 86.11 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.00809 | 4 | 87.00 |
Denitrification | 0.17682 | 97 | 80.58 |
Nitrate assimilatory reduction | 3.42589 | 2868 | 81.22 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.23131 | 131 | 89.91 |
Nitrite assimilation | 5.92766 | 3218 | 84.54 |
Nitrogen fixation | 0.02019 | 10 | 96.40 |
Urease | 8.35147 | 3013 | 88.95 |
NapD | NapC | NarJ | NasA | NapG | NifH_AnfH_VnfH | NarH_NxrB | NapA | NifK_AnfK_VnfK | NirN | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NapF | NirD | UreA | NirK | cNor-C | NosZ | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapB | NrfA | NarI | NifB | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.005086 | 0.003851 | 0.027463 | 2.871181e+00 | 0.012530 | 0.002931 | 0.047893 | 0.016383 | 0.003762 | 0.003899 | 0.007845 | 2.488933 | 0.004302 | 2.217883 | 2.521732 | 0.088773 | 0.01407 | 0.019834 | 2.807600 | 0.554707 | 0.051818 | 0.050242 | 3.340808 | 0.519703 | 0.013196 | 0.008087 | 4.878405e-02 | 0.005649 | 3.824697e-01 |
2 | norank | Unknown | 1.962503e-03 | 0.040040 | 0.018112 | 0.010435 | 0.001716 | ||||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.005086 | 0.003851 | 0.027463 | 2.869218e+00 | 0.012530 | 0.002931 | 0.047893 | 0.016383 | 0.003762 | 0.003899 | 0.007845 | 2.424424 | 0.004302 | 2.217883 | 2.496678 | 0.088773 | 0.01407 | 0.019834 | 2.807600 | 0.554707 | 0.051818 | 0.050242 | 3.328634 | 0.511121 | 0.013196 | 0.008087 | 4.878405e-02 | 0.005649 | 3.824697e-01 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 4.194467e-02 | 0.001719 | |||||||||||||||||||||||||||
5 | order | Oscillatoriales | 1.404882e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
6 | order | Synechococcales | 0.001719 | ||||||||||||||||||||||||||||
7 | family | Synechococcaceae | 0.001719 | ||||||||||||||||||||||||||||
8 | class | Unclassified Cyanobacteria | 4.053978e-02 | ||||||||||||||||||||||||||||
9 | phylum | Proteobacteria | 0.005086 | 0.003851 | 0.020691 | 1.818500e+00 | 0.006329 | 0.046003 | 0.016383 | 0.003762 | 0.003899 | 0.005905 | 1.213801 | 0.004302 | 1.486502 | 1.256695 | 0.050946 | 0.018295 | 1.910156 | 0.372348 | 0.042206 | 0.043415 | 1.408405 | 0.183142 | 0.013196 | 3.876968e-02 | 0.005649 | 2.071250e-01 | |||
10 | class | Gammaproteobacteria | 0.003851 | 0.013593 | 1.684013e-01 | 0.013904 | 0.001251 | 0.003899 | 0.167078 | 0.209682 | 0.129590 | 0.001537 | 0.212726 | 0.054847 | 0.016208 | 0.002716 | 0.185772 | 0.001711 | 1.419747e-02 | ||||||||||||
11 | order | Chromatiales | 1.164360e-03 | 0.001711 | |||||||||||||||||||||||||||
12 | family | Ectothiorhodospiraceae | 1.164360e-03 | 0.001711 | |||||||||||||||||||||||||||
13 | order | Xanthomonadales | 3.503481e-03 | 0.001537 | 0.001747 | ||||||||||||||||||||||||||
14 | family | Rhodanobacteraceae | 3.503481e-03 | 0.001537 | 0.001747 | ||||||||||||||||||||||||||
15 | genus | Frateuria | 0.001747 | ||||||||||||||||||||||||||||
16 | genus | Unclassified Rhodanobacteraceae | 3.503481e-03 | 0.001537 | |||||||||||||||||||||||||||
17 | order | Cellvibrionales | 3.921413e-03 | 0.016304 | 0.001235 | ||||||||||||||||||||||||||
18 | family | Cellvibrionaceae | 3.921413e-03 | 0.016304 | 0.001235 | ||||||||||||||||||||||||||
19 | genus | Cellvibrio | 3.129370e-03 | 0.016304 | |||||||||||||||||||||||||||
20 | genus | Unclassified Cellvibrionaceae | 7.920438e-04 | 0.001235 | |||||||||||||||||||||||||||
21 | order | Thiotrichales | 0.009670 | ||||||||||||||||||||||||||||
22 | family | Thiotrichaceae | 0.009670 | ||||||||||||||||||||||||||||
23 | genus | Thiothrix | 0.004835 | ||||||||||||||||||||||||||||
24 | genus | Unclassified Thiotrichaceae | 0.004835 | ||||||||||||||||||||||||||||
25 | order | Pseudomonadales | 1.107261e-01 | 0.003899 | 0.147777 | 0.161182 | 0.129590 | 0.152543 | 0.036170 | 0.001726 | 0.171793 | ||||||||||||||||||||
26 | family | Pseudomonadaceae | 9.903849e-02 | 0.003899 | 0.133389 | 0.142047 | 0.129590 | 0.135086 | 0.020210 | 0.001726 | 0.163160 | ||||||||||||||||||||
27 | genus | Pseudomonas | 4.187718e-02 | 0.003899 | 0.100143 | 0.100926 | 0.086394 | 0.083787 | 0.015627 | 0.001726 | 0.084512 | ||||||||||||||||||||
28 | species | Pseudomonas sp. Ag1 | 2.333338e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
29 | species | Unclassified Pseudomonas | 3.954384e-02 | 0.003899 | 0.100143 | 0.100926 | 0.086394 | 0.083787 | 0.015627 | 0.001726 | 0.084512 | ||||||||||||||||||||
30 | genus | Azotobacter | 1.165513e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
31 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 5.599580e-02 | 0.033247 | 0.041121 | 0.043197 | 0.051299 | 0.004583 | 0.078648 | ||||||||||||||||||||||
32 | family | Moraxellaceae | 5.697750e-03 | 0.009592 | 0.009100 | 0.009100 | 0.005244 | ||||||||||||||||||||||||
33 | genus | Acinetobacter | 5.697750e-03 | 0.009592 | 0.009100 | 0.009100 | 0.005244 | ||||||||||||||||||||||||
34 | family | Unclassified Pseudomonadales | 5.989855e-03 | 0.004796 | 0.010035 | 0.017457 | 0.006861 | 0.003389 | |||||||||||||||||||||||
35 | order | Salinisphaerales | 1.178353e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
36 | family | Salinisphaeraceae | 1.178353e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
37 | order | Enterobacterales | 0.013593 | 1.236778e-02 | 0.013904 | 0.010527 | 0.012455 | 0.004708 | 0.011887 | 1.064810e-02 | |||||||||||||||||||||
38 | family | Erwiniaceae | 0.007048 | 0.005276 | 0.001562 | 0.000865 | 3.549367e-03 | ||||||||||||||||||||||||
39 | genus | Erwinia | 0.005485 | 0.003714 | 0.000865 | 3.549367e-03 | |||||||||||||||||||||||||
40 | species | Erwinia billingiae | 0.005485 | 0.001238 | 3.549367e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
41 | species | Unclassified Erwinia | 0.002476 | 0.000865 | |||||||||||||||||||||||||||
42 | genus | Unclassified Erwiniaceae | 0.001562 | 0.001562 | 0.001562 | ||||||||||||||||||||||||||
43 | family | Pectobacteriaceae | 0.003406 | 3.120073e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
44 | genus | Pectobacterium | 0.003406 | ||||||||||||||||||||||||||||
45 | genus | Brenneria | 2.329095e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
46 | genus | Unclassified Pectobacteriaceae | 7.909789e-04 | ||||||||||||||||||||||||||||
47 | family | Yersiniaceae | 1.180718e-03 | 0.000782 | 0.000782 | 0.000782 | 0.000865 | ||||||||||||||||||||||||
48 | family | Enterobacteriaceae | 1.649132e-03 | 0.001902 | 0.001739 | ||||||||||||||||||||||||||
49 | family | Unclassified Enterobacterales | 0.010187 | 6.417860e-03 | 0.012002 | 0.002698 | 0.006398 | 0.002364 | 0.008418 | 7.098734e-03 | |||||||||||||||||||||
50 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 0.003851 | 3.553983e-02 | 0.001251 | 0.009631 | 0.021669 | 0.046493 | 0.013969 | 0.002595 | 0.002716 | 0.012232 | 3.549367e-03 | ||||||||||||||||||
51 | class | Acidithiobacillia | 2.274694e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
52 | order | Acidithiobacillales | 2.274694e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
53 | family | Acidithiobacillaceae | 2.274694e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
54 | class | Alphaproteobacteria | 7.431837e-01 | 0.003753 | 0.001940 | 0.498845 | 0.004302 | 0.544245 | 0.529473 | 0.004317 | 0.008923 | 0.625648 | 0.177138 | 0.002728 | 0.466103 | 0.136785 | 0.001893 | 1.998198e-01 | |||||||||||||
55 | order | Magnetococcales | 0.005414 | ||||||||||||||||||||||||||||
56 | order | Rhodospirillales | 0.004302 | 0.001269 | 0.002323 | 0.005249 | 0.001726 | 5.468291e-03 | |||||||||||||||||||||||
57 | family | Rhodospirillaceae | 0.004302 | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||||
58 | family | Acetobacteraceae | 0.002323 | 0.001771 | 0.001726 | ||||||||||||||||||||||||||
59 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.003478 | 5.468291e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
60 | order | Rhodobacterales | 1.195110e-03 | 0.010870 | 0.009751 | 0.001053 | 0.002540 | 0.002265 | 0.003484 | ||||||||||||||||||||||
61 | family | Rhodobacteraceae | 1.195110e-03 | 0.010870 | 0.009751 | 0.002265 | 0.003484 | ||||||||||||||||||||||||
62 | genus | Pannonibacter | 0.009751 | ||||||||||||||||||||||||||||
63 | species | Pannonibacter phragmitetus | 0.009751 | ||||||||||||||||||||||||||||
64 | genus | Unclassified Rhodobacteraceae | 1.195110e-03 | 0.010870 | 0.002265 | 0.003484 | |||||||||||||||||||||||||
65 | family | Unclassified Rhodobacterales | 0.001053 | 0.002540 | |||||||||||||||||||||||||||
66 | order | Sphingomonadales | 2.929017e-01 | 0.039096 | 0.273497 | 0.009751 | 0.223351 | 0.002728 | 0.015666 | ||||||||||||||||||||||
67 | family | Erythrobacteraceae | 7.342193e-03 | 0.010078 | |||||||||||||||||||||||||||
68 | genus | Croceicoccus | 2.447398e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
69 | genus | Unclassified Erythrobacteraceae | 4.894795e-03 | 0.010078 | |||||||||||||||||||||||||||
70 | family | Sphingomonadaceae | 2.272733e-01 | 0.039096 | 0.211056 | 0.009751 | 0.172148 | 0.002728 | 0.015666 | ||||||||||||||||||||||
71 | genus | Sphingomonas | 3.650039e-02 | 0.026877 | 0.028679 | ||||||||||||||||||||||||||
72 | species | Sphingomonas taxi | 1.216110e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
73 | species | Sphingomonas panacis | 2.442317e-03 | 0.005361 | 0.003729 | ||||||||||||||||||||||||||
74 | species | Sphingomonas hengshuiensis | 1.208615e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
75 | species | Unclassified Sphingomonas | 3.163335e-02 | 0.021516 | 0.024950 | ||||||||||||||||||||||||||
76 | genus | Sphingorhabdus | 0.001250 | ||||||||||||||||||||||||||||
77 | genus | Blastomonas | 1.208615e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
78 | genus | Sphingobium | 1.205642e-02 | 0.010321 | 0.025864 | 0.001240 | 0.003481 | ||||||||||||||||||||||||
79 | genus | Novosphingobium | 1.199986e-03 | 0.019183 | 0.015969 | 0.009751 | 0.006247 | ||||||||||||||||||||||||
80 | species | Novosphingobium resinovorum | 1.199986e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
81 | species | Unclassified Novosphingobium | 0.019183 | 0.015969 | 0.009751 | 0.006247 | |||||||||||||||||||||||||
82 | genus | Sphingopyxis | 1.206809e-02 | 0.026778 | 0.010052 | ||||||||||||||||||||||||||
83 | species | Sphingopyxis macrogoltabida | 0.001255 | ||||||||||||||||||||||||||||
84 | species | Unclassified Sphingopyxis | 1.206809e-02 | 0.026778 | 0.008797 | ||||||||||||||||||||||||||
85 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 1.642398e-01 | 0.009592 | 0.115568 | 0.124679 | 0.002728 | 0.012185 | |||||||||||||||||||||||
86 | family | Unclassified Sphingomonadales | 5.828618e-02 | 0.052363 | 0.051203 | ||||||||||||||||||||||||||
87 | order | Caulobacterales | 1.059663e-01 | 0.114985 | 0.077448 | ||||||||||||||||||||||||||
88 | family | Caulobacteraceae | 9.531132e-02 | 0.088496 | 0.054582 | ||||||||||||||||||||||||||
89 | genus | Phenylobacterium | 1.222427e-03 | 0.019329 | 0.002540 | ||||||||||||||||||||||||||
90 | genus | Caulobacter | 7.028015e-03 | 0.021470 | 0.005076 | ||||||||||||||||||||||||||
91 | genus | Unclassified Caulobacteraceae | 8.706088e-02 | 0.047697 | 0.046967 | ||||||||||||||||||||||||||
92 | family | Unclassified Caulobacterales | 1.065503e-02 | 0.026489 | 0.022866 | ||||||||||||||||||||||||||
93 | order | Rhizobiales | 1.651342e-01 | 0.003753 | 0.317771 | 0.081374 | 0.252382 | 0.001893 | 0.006292 | 0.053562 | 0.151819 | 0.255763 | 0.121849 | 0.001893 | 1.943515e-01 | ||||||||||||||||
94 | family | Methylobacteriaceae | 2.325396e-03 | 0.014782 | 0.014782 | 0.003453 | 0.006690 | ||||||||||||||||||||||||
95 | genus | Methylobacterium | 1.154081e-03 | 0.007530 | 0.007530 | 0.003453 | 0.006690 | ||||||||||||||||||||||||
96 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 1.171315e-03 | 0.007251 | 0.007251 | ||||||||||||||||||||||||||
97 | family | Aurantimonadaceae | 1.162060e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
98 | family | Bradyrhizobiaceae | 7.833101e-02 | 0.117483 | 0.099456 | 0.124233 | 0.069527 | 0.066663 | 1.266664e-01 | ||||||||||||||||||||||
99 | genus | Rhodopseudomonas | 1.172482e-03 | 0.014506 | 0.002282 | 0.005213 | 0.001699 | 3.645527e-03 | |||||||||||||||||||||||
100 | species | Rhodopseudomonas palustris | 1.172482e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
101 | species | Unclassified Rhodopseudomonas | 0.014506 | 0.002282 | 0.005213 | 0.001699 | 3.645527e-03 | ||||||||||||||||||||||||
102 | genus | Bradyrhizobium | 8.179433e-03 | 0.017380 | 0.017380 | 0.018390 | 0.006978 | 0.029974 | 2.936903e-02 | ||||||||||||||||||||||
103 | genus | Bosea | 3.501165e-03 | 0.004530 | 0.005157 | 0.001672 | 3.714583e-03 | ||||||||||||||||||||||||
104 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 6.547793e-02 | 0.085598 | 0.082076 | 0.099030 | 0.052180 | 0.033317 | 8.993724e-02 | ||||||||||||||||||||||
105 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.004835 | 0.010215 | 0.008704 | 3.651184e-03 | |||||||||||||||||||||||||
106 | genus | Pelagibacterium | 0.002554 | ||||||||||||||||||||||||||||
107 | genus | Devosia | 0.001742 | ||||||||||||||||||||||||||||
108 | species | Devosia sp. H5989 | 0.001742 | ||||||||||||||||||||||||||||
109 | genus | Hyphomicrobium | 0.001739 | ||||||||||||||||||||||||||||
110 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 0.004835 | 0.007661 | 0.005223 | 3.651184e-03 | |||||||||||||||||||||||||
111 | family | Beijerinckiaceae | 0.002559 | ||||||||||||||||||||||||||||
112 | genus | Methylocella | 0.002559 | ||||||||||||||||||||||||||||
113 | family | Phyllobacteriaceae | 1.082913e-03 | 0.038682 | 0.010920 | 0.009751 | 0.001702 | ||||||||||||||||||||||||
114 | genus | Chelativorans | 0.004835 | ||||||||||||||||||||||||||||
115 | genus | Mesorhizobium | 0.009670 | 0.009751 | |||||||||||||||||||||||||||
116 | genus | Unclassified Phyllobacteriaceae | 1.082913e-03 | 0.024176 | 0.010920 | 0.001702 | |||||||||||||||||||||||||
117 | family | Rhizobiaceae | 1.649935e-02 | 0.067693 | 0.027150 | 0.006377 | 0.015661 | ||||||||||||||||||||||||
118 | genus | Neorhizobium | 0.004835 | ||||||||||||||||||||||||||||
119 | genus | Rhizobium | 2.373345e-03 | 0.029011 | 0.003481 | ||||||||||||||||||||||||||
120 | species | Rhizobium sp. 2MFCol3.1 | 0.009670 | ||||||||||||||||||||||||||||
121 | species | Unclassified Rhizobium | 2.373345e-03 | 0.019341 | 0.003481 | ||||||||||||||||||||||||||
122 | genus | Unclassified Rhizobiaceae | 1.412600e-02 | 0.033847 | 0.027150 | 0.006377 | 0.012180 | ||||||||||||||||||||||||
123 | family | Unclassified Rhizobiales | 6.573349e-02 | 0.003753 | 0.074296 | 0.043304 | 0.128394 | 0.001893 | 0.006292 | 0.034411 | 0.027586 | 0.156717 | 0.048496 | 0.001893 | 6.403390e-02 | ||||||||||||||||
124 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 1.779864e-01 | 0.001940 | 0.141978 | 0.063520 | 0.252177 | 0.002423 | 0.001578 | 0.267480 | 0.020731 | 0.185942 | 0.013209 | 2.775558e-17 | |||||||||||||||||
125 | class | Betaproteobacteria | 0.005086 | 0.007099 | 5.443020e-01 | 0.016975 | 0.002513 | 0.337693 | 0.508631 | 0.299545 | 0.024973 | 0.009371 | 0.688050 | 0.109544 | 0.021009 | 0.020229 | 0.417414 | 0.013196 | 2.113684e-02 | ||||||||||||
126 | order | Neisseriales | 0.001905 | 0.001244 | |||||||||||||||||||||||||||
127 | family | Neisseriaceae | 0.001905 | ||||||||||||||||||||||||||||
128 | family | Unclassified Neisseriales | 0.001244 | ||||||||||||||||||||||||||||
129 | order | Rhodocyclales | 0.004796 | 0.001256 | 0.002703 | ||||||||||||||||||||||||||
130 | family | Zoogloeaceae | 0.004796 | ||||||||||||||||||||||||||||
131 | family | Rhodocyclaceae | 0.002703 | ||||||||||||||||||||||||||||
132 | genus | Rugosibacter | 0.001352 | ||||||||||||||||||||||||||||
133 | species | Rugosibacter aromaticivorans | 0.001352 | ||||||||||||||||||||||||||||
134 | genus | Unclassified Rhodocyclaceae | 0.001352 | ||||||||||||||||||||||||||||
135 | family | Unclassified Rhodocyclales | 0.001256 | ||||||||||||||||||||||||||||
136 | order | Nitrosomonadales | 2.438574e-02 | 0.021299 | 0.004975 | 0.016662 | 0.041119 | 0.013976 | |||||||||||||||||||||||
137 | family | Sterolibacteriaceae | 0.003435 | 0.003435 | |||||||||||||||||||||||||||
138 | family | Methylophilaceae | 2.242505e-02 | 0.013068 | 0.008351 | 0.039545 | 0.013976 | ||||||||||||||||||||||||
139 | genus | Methylophilus | 1.592665e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
140 | genus | Methylotenera | 5.798845e-03 | 0.003476 | 0.008351 | 0.011454 | 0.006988 | ||||||||||||||||||||||||
141 | genus | Methylovorus | 1.164360e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
142 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 1.386918e-02 | 0.009592 | 0.028091 | 0.006988 | |||||||||||||||||||||||||
143 | family | Unclassified Nitrosomonadales | 1.960692e-03 | 0.004796 | 0.004975 | 0.004875 | 0.001574 | ||||||||||||||||||||||||
144 | genus | Candidatus Accumulibacter | 0.004835 | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||||||
145 | order | Burkholderiales | 0.005086 | 0.007099 | 4.104616e-01 | 0.011310 | 0.002513 | 0.253634 | 0.462337 | 0.214750 | 0.010533 | 0.007795 | 0.446342 | 0.098227 | 0.013114 | 0.009409 | 0.304565 | 0.013196 | 7.045614e-03 | ||||||||||||
146 | family | Burkholderiaceae | 1.280713e-02 | 0.003518 | 0.003518 | 0.002218 | 0.001737 | ||||||||||||||||||||||||
147 | genus | Paraburkholderia | 7.841260e-04 | 0.003518 | 0.003518 | ||||||||||||||||||||||||||
148 | genus | Burkholderia | 3.128173e-03 | 0.002218 | |||||||||||||||||||||||||||
149 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 8.894835e-03 | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||||||
150 | genus | Rhizobacter | 0.001240 | 0.003473 | |||||||||||||||||||||||||||
151 | genus | Rubrivivax | 0.004875 | ||||||||||||||||||||||||||||
152 | genus | Thiomonas | 0.001271 | ||||||||||||||||||||||||||||
153 | family | Alcaligenaceae | 1.155214e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
154 | family | Oxalobacteraceae | 0.007099 | 1.150538e-01 | 0.009426 | 0.021565 | 0.078698 | 0.014626 | 0.010533 | 0.004672 | 0.095906 | 0.029486 | 0.007004 | 0.001363 | 0.043609 | 3.517533e-03 | |||||||||||||||
155 | genus | Massilia | 0.005312 | 0.001242 | 0.001164 | 0.001750 | |||||||||||||||||||||||||
156 | genus | Collimonas | 1.151821e-03 | 0.004875 | |||||||||||||||||||||||||||
157 | genus | Janthinobacterium | 8.168124e-03 | 0.005265 | 0.001557 | 0.008633 | 0.004574 | 0.000879 | 0.001750 | ||||||||||||||||||||||
158 | species | Janthinobacterium sp. HH01 | 2.321827e-03 | 0.001234 | |||||||||||||||||||||||||||
159 | species | Unclassified Janthinobacterium | 5.846297e-03 | 0.005265 | 0.001557 | 0.007399 | 0.004574 | 0.000879 | 0.001750 | ||||||||||||||||||||||
160 | genus | Herminiimonas | 1.372651e-02 | 0.026323 | 0.005664 | 0.023594 | |||||||||||||||||||||||||
161 | species | Herminiimonas arsenicoxydans | 3.441851e-03 | 0.009934 | |||||||||||||||||||||||||||
162 | species | Unclassified Herminiimonas | 1.028466e-02 | 0.026323 | 0.005664 | 0.013660 | |||||||||||||||||||||||||
163 | genus | Duganella | 1.152950e-03 | 0.002269 | |||||||||||||||||||||||||||
164 | species | Duganella zoogloeoides | 1.152950e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
165 | species | Unclassified Duganella | 0.002269 | ||||||||||||||||||||||||||||
166 | genus | Herbaspirillum | 0.005511 | 0.001221 | 0.004470 | 0.001750 | |||||||||||||||||||||||||
167 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 0.007099 | 9.085439e-02 | 0.009426 | 0.016054 | 0.036923 | 0.014626 | 0.004869 | 0.003115 | 0.061216 | 0.017009 | 0.006124 | 0.001363 | 0.038361 | 3.517533e-03 | |||||||||||||||
168 | family | Comamonadaceae | 0.005086 | 1.438324e-01 | 0.110100 | 0.181782 | 0.108532 | 0.120091 | 0.002274 | 0.000854 | 0.100347 | 0.013196 | |||||||||||||||||||
169 | genus | Acidovorax | 0.005086 | 1.118959e-03 | 0.004981 | 0.013196 | |||||||||||||||||||||||||
170 | genus | Ramlibacter | 0.005511 | ||||||||||||||||||||||||||||
171 | genus | Hylemonella | 0.001260 | ||||||||||||||||||||||||||||
172 | genus | Rhodoferax | 3.405457e-03 | 0.015755 | 0.015865 | 0.003749 | 0.001734 | ||||||||||||||||||||||||
173 | species | Rhodoferax saidenbachensis | 0.010920 | ||||||||||||||||||||||||||||
174 | species | Rhodoferax koreense | 0.001734 | ||||||||||||||||||||||||||||
175 | species | Unclassified Rhodoferax | 3.405457e-03 | 0.004835 | 0.015865 | 0.003749 | |||||||||||||||||||||||||
176 | genus | Curvibacter | 0.002274 | ||||||||||||||||||||||||||||
177 | genus | Comamonas | 0.001234 | ||||||||||||||||||||||||||||
178 | genus | Variovorax | 9.065928e-03 | 0.019341 | 0.036411 | 0.010070 | 0.021290 | 0.003468 | |||||||||||||||||||||||
179 | species | Variovorax paradoxus | 0.004835 | ||||||||||||||||||||||||||||
180 | species | Unclassified Variovorax | 9.065928e-03 | 0.014506 | 0.036411 | 0.010070 | 0.021290 | 0.003468 | |||||||||||||||||||||||
181 | genus | Hydrogenophaga | 0.000854 | ||||||||||||||||||||||||||||
182 | genus | Polaromonas | 1.312596e-02 | 0.004835 | 0.004773 | 0.003850 | 0.005202 | ||||||||||||||||||||||||
183 | species | Polaromonas sp. JS666 | 0.001284 | 0.001734 | |||||||||||||||||||||||||||
184 | species | Unclassified Polaromonas | 1.312596e-02 | 0.004835 | 0.004773 | 0.002566 | 0.003468 | ||||||||||||||||||||||||
185 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 1.171161e-01 | 0.070169 | 0.124733 | 0.092950 | 0.083726 | 0.089942 | |||||||||||||||||||||||
186 | genus | Roseateles | 0.002497 | 0.001734 | |||||||||||||||||||||||||||
187 | family | Unclassified Burkholderiales | 1.376131e-01 | 0.001884 | 0.002513 | 0.118452 | 0.201857 | 0.083200 | 0.003123 | 0.225337 | 0.064249 | 0.005257 | 0.008046 | 0.153665 | 3.528081e-03 | ||||||||||||||||
188 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 1.094547e-01 | 0.005664 | 0.053129 | 0.041319 | 0.068133 | 0.012535 | 0.001576 | 0.198088 | 0.011317 | 0.007895 | 0.008117 | 0.097137 | 1.409123e-02 | ||||||||||||||||
189 | class | Deltaproteobacteria | 1.437494e-03 | 0.016437 | 0.005336 | 0.016437 | 0.005978 | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||
190 | order | Myxococcales | 0.013173 | 0.005336 | 0.013173 | 0.005978 | |||||||||||||||||||||||||
191 | family | Anaeromyxobacteraceae | 0.003237 | 0.003237 | |||||||||||||||||||||||||||
192 | family | Unclassified Myxococcales | 0.009936 | 0.005336 | 0.009936 | 0.005978 | |||||||||||||||||||||||||
193 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 1.437494e-03 | 0.003264 | 0.003264 | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||||
194 | class | Unclassified Proteobacteria | 3.589007e-01 | 0.006329 | 0.015124 | 0.008866 | 0.003762 | 0.003965 | 0.193748 | 0.218607 | 0.281650 | 0.020119 | 0.383732 | 0.024841 | 0.004990 | 0.017742 | 0.337379 | 0.044646 | 3.435369e-03 | 0.003756 | 7.305274e-03 | ||||||||||
195 | phylum | Firmicutes | 8.100388e-04 | 0.015448 | 0.003861 | 0.002833 | 0.007211 | 0.029376 | |||||||||||||||||||||||
196 | class | Bacilli | 8.100388e-04 | 0.010299 | 0.002833 | 0.003751 | 0.001817 | ||||||||||||||||||||||||
197 | order | Bacillales | 8.100388e-04 | 0.010299 | |||||||||||||||||||||||||||
198 | family | Paenibacillaceae | 8.100388e-04 | 0.010299 | |||||||||||||||||||||||||||
199 | genus | Paenibacillus | 8.100388e-04 | ||||||||||||||||||||||||||||
200 | genus | Unclassified Paenibacillaceae | 0.010299 | ||||||||||||||||||||||||||||
201 | order | Unclassified Bacilli | 0.002833 | 0.003751 | 0.001817 | ||||||||||||||||||||||||||
202 | class | Unclassified Firmicutes | 0.005149 | 0.003861 | 0.003461 | 0.027559 | |||||||||||||||||||||||||
203 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.010306 | ||||||||||||||||||||||||||||
204 | phylum | Actinobacteria | 0.006772 | 2.677511e-01 | 0.493515 | 0.388458 | 0.387773 | 0.331339 | 0.142252 | 0.009611 | 0.739937 | 0.001559 | 1.001437e-02 | ||||||||||||||||||
205 | class | Thermoleophilia | 0.003741 | 0.003741 | 0.001734 | ||||||||||||||||||||||||||
206 | order | Solirubrobacterales | 0.003741 | 0.003741 | |||||||||||||||||||||||||||
207 | family | Conexibacteraceae | 0.003741 | 0.003741 | |||||||||||||||||||||||||||
208 | order | Unclassified Thermoleophilia | 0.001734 | ||||||||||||||||||||||||||||
209 | class | Actinobacteria | 0.006772 | 2.417081e-01 | 0.414162 | 0.298776 | 0.333593 | 0.258990 | 0.135813 | 0.009611 | 0.564026 | 1.001437e-02 | |||||||||||||||||||
210 | order | Geodermatophilales | 1.189071e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
211 | family | Geodermatophilaceae | 1.189071e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
212 | order | Nakamurellales | 2.499388e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
213 | family | Nakamurellaceae | 1.249694e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
214 | family | Unclassified Nakamurellales | 1.249694e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
215 | order | Catenulisporales | 7.830822e-04 | ||||||||||||||||||||||||||||
216 | order | Micrococcales | 2.104436e-02 | 0.039558 | 0.004773 | 0.024376 | 0.007087 | 0.014004 | 0.001744 | 0.015189 | |||||||||||||||||||||
217 | family | Micrococcaceae | 2.798071e-03 | 0.001956 | |||||||||||||||||||||||||||
218 | family | Cellulomonadaceae | 0.004875 | ||||||||||||||||||||||||||||
219 | family | Promicromonosporaceae | 2.717032e-03 | 0.005039 | 0.009751 | 0.006710 | |||||||||||||||||||||||||
220 | genus | Isoptericola | 0.005039 | 0.009751 | 0.001784 | ||||||||||||||||||||||||||
221 | genus | Unclassified Promicromonosporaceae | 2.717032e-03 | 0.004926 | |||||||||||||||||||||||||||
222 | family | Dermatophilaceae | 0.001177 | ||||||||||||||||||||||||||||
223 | family | Intrasporangiaceae | 0.001744 | ||||||||||||||||||||||||||||
224 | genus | Janibacter | 0.001744 | ||||||||||||||||||||||||||||
225 | family | Microbacteriaceae | 7.189052e-03 | 0.015865 | 0.004875 | 0.001181 | 0.003381 | 0.008761 | |||||||||||||||||||||||
226 | genus | Microbacterium | 1.480918e-03 | 0.010577 | 0.004875 | 0.001752 | |||||||||||||||||||||||||
227 | genus | Cryobacterium | 2.854067e-03 | 0.001181 | 0.003381 | ||||||||||||||||||||||||||
228 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 2.854067e-03 | 0.005288 | 0.007009 | ||||||||||||||||||||||||||
229 | family | Unclassified Micrococcales | 8.340210e-03 | 0.018655 | 0.004773 | 0.004875 | 0.004729 | 0.001956 | 0.006428 | ||||||||||||||||||||||
230 | order | Corynebacteriales | 4.205753e-02 | 0.074182 | 0.055617 | 0.069974 | 0.101351 | 0.007924 | 0.098915 | ||||||||||||||||||||||
231 | family | Mycobacteriaceae | 2.230576e-02 | 0.033397 | 0.036036 | 0.028716 | 0.038651 | 0.027872 | |||||||||||||||||||||||
232 | genus | Mycobacterium | 1.076008e-02 | 0.011911 | 0.020762 | 0.007230 | 0.028755 | 0.013932 | |||||||||||||||||||||||
233 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 1.154567e-02 | 0.021486 | 0.015274 | 0.021486 | 0.009895 | 0.013940 | |||||||||||||||||||||||
234 | family | Nocardiaceae | 1.237797e-02 | 0.003718 | 0.014664 | 0.003718 | 0.022684 | 0.005968 | 0.008668 | ||||||||||||||||||||||
235 | genus | Nocardia | 1.430503e-03 | 0.005013 | 0.003978 | ||||||||||||||||||||||||||
236 | species | Nocardia sp. 348MFTsu5.1 | 0.001989 | ||||||||||||||||||||||||||||
237 | species | Unclassified Nocardia | 1.430503e-03 | 0.005013 | 0.001989 | ||||||||||||||||||||||||||
238 | genus | Rhodococcus | 5.542781e-03 | 0.003718 | 0.009832 | 0.003718 | 0.015143 | 0.001732 | |||||||||||||||||||||||
239 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 5.404688e-03 | 0.004832 | 0.002528 | 0.001989 | 0.006936 | ||||||||||||||||||||||||
240 | family | Gordoniaceae | 0.001266 | 0.001734 | |||||||||||||||||||||||||||
241 | genus | Gordonia | 0.001266 | ||||||||||||||||||||||||||||
242 | genus | Unclassified Gordoniaceae | 0.001734 | ||||||||||||||||||||||||||||
243 | family | Unclassified Corynebacteriales | 7.373795e-03 | 0.037067 | 0.004916 | 0.037540 | 0.038750 | 0.001956 | 0.060641 | ||||||||||||||||||||||
244 | order | Micromonosporales | 0.005511 | 0.004875 | 0.002013 | 0.001747 | |||||||||||||||||||||||||
245 | family | Micromonosporaceae | 0.005511 | 0.004875 | 0.001747 | ||||||||||||||||||||||||||
246 | genus | Actinoplanes | 0.005511 | ||||||||||||||||||||||||||||
247 | genus | Unclassified Micromonosporaceae | 0.004875 | 0.001747 | |||||||||||||||||||||||||||
248 | family | Unclassified Micromonosporales | 0.002013 | ||||||||||||||||||||||||||||
249 | order | Propionibacteriales | 6.529168e-02 | 0.019621 | 0.098659 | 0.013468 | 0.035533 | 0.046396 | |||||||||||||||||||||||
250 | family | Propionibacteriaceae | 0.003718 | 0.003718 | |||||||||||||||||||||||||||
251 | family | Nocardioidaceae | 6.081451e-02 | 0.015903 | 0.093620 | 0.004875 | 0.022078 | 0.028360 | |||||||||||||||||||||||
252 | genus | Kribbella | 0.010443 | ||||||||||||||||||||||||||||
253 | genus | Nocardioides | 2.991964e-03 | 0.030365 | 0.003737 | 0.006231 | |||||||||||||||||||||||||
254 | genus | Aeromicrobium | 4.281100e-03 | 0.006106 | |||||||||||||||||||||||||||
255 | genus | Pimelobacter | 6.014517e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
256 | genus | Unclassified Nocardioidaceae | 4.752693e-02 | 0.005460 | 0.063254 | 0.004875 | 0.012235 | 0.022129 | |||||||||||||||||||||||
257 | family | Unclassified Propionibacteriales | 4.477170e-03 | 0.005039 | 0.004875 | 0.013456 | 0.018036 | ||||||||||||||||||||||||
258 | order | Pseudonocardiales | 0.001251 | 0.006988 | |||||||||||||||||||||||||||
259 | family | Pseudonocardiaceae | 0.003515 | ||||||||||||||||||||||||||||
260 | family | Unclassified Pseudonocardiales | 0.001251 | 0.003473 | |||||||||||||||||||||||||||
261 | order | Streptomycetales | 8.045000e-04 | 0.003264 | 0.008021 | 0.001199 | 0.009126 | 0.008766 | |||||||||||||||||||||||
262 | family | Streptomycetaceae | 8.045000e-04 | 0.003515 | |||||||||||||||||||||||||||
263 | family | Unclassified Streptomycetales | 0.003264 | 0.008021 | 0.001199 | 0.009126 | 0.005251 | ||||||||||||||||||||||||
264 | order | Streptosporangiales | 1.475347e-03 | 0.010971 | 0.001242 | 0.004069 | |||||||||||||||||||||||||
265 | family | Streptosporangiaceae | 1.475347e-03 | 0.010971 | 0.002062 | ||||||||||||||||||||||||||
266 | genus | Streptosporangium | 1.475347e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
267 | genus | Nonomuraea | 0.010971 | ||||||||||||||||||||||||||||
268 | genus | Unclassified Streptosporangiaceae | 0.002062 | ||||||||||||||||||||||||||||
269 | family | Unclassified Streptosporangiales | 0.001242 | 0.002006 | |||||||||||||||||||||||||||
270 | order | Frankiales | 2.667752e-03 | 0.020779 | 0.002401 | 0.001473 | 0.001726 | ||||||||||||||||||||||||
271 | family | Frankiaceae | 1.099098e-03 | 0.001199 | 0.001473 | ||||||||||||||||||||||||||
272 | genus | Frankia | 1.099098e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
273 | genus | Unclassified Frankiaceae | 0.001199 | 0.001473 | |||||||||||||||||||||||||||
274 | family | Sporichthyaceae | 7.717815e-04 | 0.001202 | |||||||||||||||||||||||||||
275 | family | Unclassified Frankiales | 7.968718e-04 | 0.020779 | 0.001726 | ||||||||||||||||||||||||||
276 | order | Glycomycetales | 0.002114 | ||||||||||||||||||||||||||||
277 | order | Unclassified Actinobacteria | 0.006772 | 1.038954e-01 | 0.277538 | 0.102465 | 0.212878 | 0.108926 | 0.048695 | 0.007868 | 0.430694 | 1.001437e-02 | |||||||||||||||||||
278 | class | Acidimicrobiia | 0.004757 | ||||||||||||||||||||||||||||
279 | class | Unclassified Actinobacteria | 2.604300e-02 | 0.075611 | 0.089682 | 0.045683 | 0.072349 | 0.006440 | 0.174177 | 0.001559 | |||||||||||||||||||||
280 | phylum | Planctomycetes | 1.797613e-02 | 0.003246 | 0.003231 | 0.003246 | 0.009246 | 0.019820 | 2.022748e-02 | ||||||||||||||||||||||
281 | class | Planctomycetia | 1.659110e-02 | 0.003231 | 0.004513 | 0.006585 | 1.835838e-02 | ||||||||||||||||||||||||
282 | order | Planctomycetales | 1.387223e-02 | 0.003231 | 0.003231 | 0.006585 | 1.835838e-02 | ||||||||||||||||||||||||
283 | family | Planctomycetaceae | 9.777573e-03 | 0.003231 | 0.003231 | 0.003264 | 1.760049e-03 | ||||||||||||||||||||||||
284 | genus | Pirellula | 1.351623e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
285 | genus | Gimesia | 0.002154 | 0.002154 | |||||||||||||||||||||||||||
286 | genus | Planctopirus | 0.001631 | ||||||||||||||||||||||||||||
287 | genus | Rhodopirellula | 1.557367e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
288 | genus | Schlesneria | 1.373717e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
289 | genus | Unclassified Planctomycetaceae | 5.494867e-03 | 0.001077 | 0.001077 | 0.001633 | 1.760049e-03 | ||||||||||||||||||||||||
290 | family | Isosphaeraceae | 1.353178e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
291 | family | Gemmataceae | 9.142144e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
292 | genus | Zavarzinella | 1.828429e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
293 | genus | Unclassified Gemmataceae | 7.313715e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
294 | family | Unclassified Planctomycetales | 2.741483e-03 | 0.003321 | 7.456189e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
295 | order | Unclassified Planctomycetia | 2.718863e-03 | 0.001282 | |||||||||||||||||||||||||||
296 | class | Phycisphaerae | 0.003246 | 0.003246 | |||||||||||||||||||||||||||
297 | order | Phycisphaerales | 0.003246 | 0.003246 | |||||||||||||||||||||||||||
298 | family | Phycisphaeraceae | 0.003246 | 0.003246 | |||||||||||||||||||||||||||
299 | class | Unclassified Planctomycetes | 1.385036e-03 | 0.004733 | 0.013235 | 1.869094e-03 | |||||||||||||||||||||||||
300 | phylum | Spirochaetes | 9.356524e-04 | 0.01407 | 0.001247 | ||||||||||||||||||||||||||
301 | class | Spirochaetia | 9.356524e-04 | ||||||||||||||||||||||||||||
302 | class | Unclassified Spirochaetes | 0.01407 | 0.001247 | |||||||||||||||||||||||||||
303 | phylum | Lentisphaerae | 0.001248 | ||||||||||||||||||||||||||||
304 | class | Lentisphaeria | 0.001248 | ||||||||||||||||||||||||||||
305 | phylum | Acidobacteria | 5.506985e-03 | 0.005186 | 0.005001 | 6.802138e-03 | |||||||||||||||||||||||||
306 | genus | Luteitalea | 1.362580e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
307 | class | Acidobacteriia | 2.737843e-03 | 0.003340 | 6.802138e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
308 | order | Acidobacteriales | 2.737843e-03 | 0.001668 | 6.802138e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
309 | family | Acidobacteriaceae | 2.737843e-03 | 0.001668 | 3.359292e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
310 | genus | Granulicella | 2.737843e-03 | 1.679646e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
311 | species | Granulicella mallensis | 1.368922e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
312 | species | Unclassified Granulicella | 1.368922e-03 | 1.679646e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
313 | genus | Unclassified Acidobacteriaceae | 0.001668 | 1.679646e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
314 | family | Unclassified Acidobacteriales | 3.442846e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
315 | order | Unclassified Acidobacteriia | 0.001672 | ||||||||||||||||||||||||||||
316 | class | Solibacteres | 1.406562e-03 | 0.002593 | |||||||||||||||||||||||||||
317 | order | Solibacterales | 1.406562e-03 | 0.002593 | |||||||||||||||||||||||||||
318 | family | Solibacteraceae | 1.406562e-03 | 0.002593 | |||||||||||||||||||||||||||
319 | genus | Candidatus Solibacter | 0.002593 | ||||||||||||||||||||||||||||
320 | genus | Unclassified Solibacteraceae | 1.406562e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
321 | class | Unclassified Acidobacteria | 8.673617e-19 | 0.002593 | 0.001661 | ||||||||||||||||||||||||||
322 | phylum | Armatimonadetes | 0.001800 | ||||||||||||||||||||||||||||
323 | class | Chthonomonadetes | 0.001800 | ||||||||||||||||||||||||||||
324 | order | Chthonomonadales | 0.001800 | ||||||||||||||||||||||||||||
325 | phylum | Verrucomicrobia | 4.913573e-02 | 0.086876 | 0.029252 | 0.001890 | 0.105866 | 0.140446 | 1.172548e-01 | ||||||||||||||||||||||
326 | class | Spartobacteria | 1.347237e-02 | 0.006906 | 0.012085 | 1.349496e-02 | |||||||||||||||||||||||||
327 | order | Chthoniobacterales | 1.088363e-02 | 0.005179 | 0.010359 | 1.349496e-02 | |||||||||||||||||||||||||
328 | family | Chthoniobacteraceae | 9.157807e-03 | 0.005179 | 0.010359 | 8.434353e-03 | |||||||||||||||||||||||||
329 | genus | Chthoniobacter | 3.451652e-03 | 0.006906 | 1.686871e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
330 | species | Chthoniobacter flavus | 2.588739e-03 | 0.001726 | |||||||||||||||||||||||||||
331 | species | Unclassified Chthoniobacter | 8.629131e-04 | 0.005179 | 1.686871e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
332 | genus | Unclassified Chthoniobacteraceae | 5.706154e-03 | 0.005179 | 0.003453 | 6.747482e-03 | |||||||||||||||||||||||||
333 | family | Unclassified Chthoniobacterales | 1.725826e-03 | 5.060612e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
334 | order | Unclassified Spartobacteria | 2.588739e-03 | 0.001726 | 0.001726 | ||||||||||||||||||||||||||
335 | class | Verrucomicrobiae | 1.266661e-02 | 0.016380 | 0.013852 | 0.015228 | 3.197117e-02 | ||||||||||||||||||||||||
336 | order | Verrucomicrobiales | 7.043486e-03 | 0.016380 | 0.013852 | 0.013536 | 3.023194e-02 | ||||||||||||||||||||||||
337 | family | Verrucomicrobia subdivision 3 | 1.383408e-03 | 0.003383 | |||||||||||||||||||||||||||
338 | genus | Pedosphaera | 1.383408e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
339 | genus | Unclassified Verrucomicrobia subdivision 3 | 0.003383 | ||||||||||||||||||||||||||||
340 | family | Rubritaleaceae | 0.001706 | ||||||||||||||||||||||||||||
341 | family | Verrucomicrobiaceae | 5.660078e-03 | 0.010920 | 0.010389 | 0.005068 | 1.425094e-02 | ||||||||||||||||||||||||
342 | genus | Verrucomicrobium | 4.245059e-03 | 0.005460 | 0.001732 | 0.003379 | 3.562735e-03 | ||||||||||||||||||||||||
343 | genus | Unclassified Verrucomicrobiaceae | 1.415020e-03 | 0.005460 | 0.008658 | 0.001689 | 1.068821e-02 | ||||||||||||||||||||||||
344 | family | Unclassified Verrucomicrobiales | 8.673617e-19 | 0.005460 | 0.003463 | 0.003379 | 1.598100e-02 | ||||||||||||||||||||||||
345 | order | Unclassified Verrucomicrobiae | 5.623128e-03 | 0.001692 | 1.739236e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
346 | class | Opitutae | 8.190012e-03 | 0.009470 | 0.011837 | 0.024675 | 5.467826e-02 | ||||||||||||||||||||||||
347 | order | Opitutales | 5.447173e-03 | 0.004735 | 0.008454 | 0.016412 | 5.123037e-02 | ||||||||||||||||||||||||
348 | family | Opitutaceae | 5.447173e-03 | 0.004735 | 0.008454 | 0.013133 | 2.659404e-02 | ||||||||||||||||||||||||
349 | genus | Opitutus | 0.001647 | ||||||||||||||||||||||||||||
350 | genus | Lacunisphaera | 1.686871e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
351 | genus | Unclassified Opitutaceae | 5.447173e-03 | 0.004735 | 0.008454 | 0.011486 | 2.490717e-02 | ||||||||||||||||||||||||
352 | family | Unclassified Opitutales | 0.003280 | 2.463633e-02 | |||||||||||||||||||||||||||
353 | order | Puniceicoccales | 1.383408e-03 | 3.447891e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
354 | family | Puniceicoccaceae | 1.383408e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
355 | genus | Coraliomargarita | 1.383408e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
356 | family | Unclassified Puniceicoccales | 3.447891e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
357 | order | Unclassified Opitutae | 1.359432e-03 | 0.004735 | 0.003383 | 0.008262 | |||||||||||||||||||||||||
358 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 1.480673e-02 | 0.061026 | 0.029252 | 0.001890 | 0.073270 | 0.088458 | 1.711043e-02 | ||||||||||||||||||||||
359 | phylum | Bacteroidetes | 3.295928e-01 | 0.074576 | 0.215748 | 0.081720 | 0.014033 | 0.001539 | 0.286794 | 0.002775 | 0.093535 | 0.001658 | 7.554530e-03 | ||||||||||||||||||
360 | order | Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 9.195644e-04 | 0.001658 | 7.554530e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
361 | family | Rhodothermaceae | 9.195644e-04 | ||||||||||||||||||||||||||||
362 | family | Unclassified Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.001658 | 7.554530e-03 | |||||||||||||||||||||||||||
363 | class | Flavobacteriia | 4.286517e-02 | 0.005149 | 0.005083 | 0.004875 | 0.012067 | 0.018719 | 0.001374 | 0.003463 | |||||||||||||||||||||
364 | order | Flavobacteriales | 4.194417e-02 | 0.005149 | 0.005083 | 0.004875 | 0.010094 | 0.017469 | 0.001374 | 0.001732 | |||||||||||||||||||||
365 | family | Flavobacteriaceae | 4.194417e-02 | 0.005149 | 0.005083 | 0.004875 | 0.010094 | 0.014974 | 0.001374 | 0.001732 | |||||||||||||||||||||
366 | genus | Flavobacterium | 3.734131e-02 | 0.005083 | 0.008085 | 0.014974 | 0.001374 | ||||||||||||||||||||||||
367 | species | Flavobacterium sp. CF136 | 9.202837e-04 | 0.002497 | |||||||||||||||||||||||||||
368 | species | Unclassified Flavobacterium | 3.642103e-02 | 0.005083 | 0.008085 | 0.012477 | 0.001374 | ||||||||||||||||||||||||
369 | genus | Unclassified Flavobacteriaceae | 4.602859e-03 | 0.005149 | 0.004875 | 0.002010 | 0.001732 | ||||||||||||||||||||||||
370 | family | Unclassified Flavobacteriales | 0.002495 | ||||||||||||||||||||||||||||
371 | order | Unclassified Flavobacteriia | 9.210041e-04 | 0.001972 | 0.001250 | 0.001732 | |||||||||||||||||||||||||
372 | class | Sphingobacteriia | 8.276808e-03 | 0.079827 | 0.004875 | 0.025033 | 0.012121 | ||||||||||||||||||||||||
373 | order | Sphingobacteriales | 8.276808e-03 | 0.079827 | 0.004875 | 0.022536 | 0.012121 | ||||||||||||||||||||||||
374 | family | Sphingobacteriaceae | 8.276808e-03 | 0.079827 | 0.004875 | 0.017528 | 0.006926 | ||||||||||||||||||||||||
375 | genus | Mucilaginibacter | 3.676103e-03 | 0.004875 | 0.005025 | 0.001732 | |||||||||||||||||||||||||
376 | species | Mucilaginibacter gotjawali | 0.001256 | ||||||||||||||||||||||||||||
377 | species | Unclassified Mucilaginibacter | 3.676103e-03 | 0.004875 | 0.003769 | 0.001732 | |||||||||||||||||||||||||
378 | genus | Pedobacter | 0.069178 | 0.004991 | |||||||||||||||||||||||||||
379 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 4.600705e-03 | 0.010648 | 0.007512 | 0.005195 | |||||||||||||||||||||||||
380 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.005008 | 0.005195 | |||||||||||||||||||||||||||
381 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.002497 | ||||||||||||||||||||||||||||
382 | class | Chitinophagia | 2.738956e-02 | 0.010299 | 0.016217 | 0.003463 | |||||||||||||||||||||||||
383 | order | Chitinophagales | 2.647571e-02 | 0.010299 | 0.013724 | 0.003463 | |||||||||||||||||||||||||
384 | family | Chitinophagaceae | 2.373487e-02 | 0.010299 | 0.013724 | 0.003463 | |||||||||||||||||||||||||
385 | genus | Niastella | 0.003463 | ||||||||||||||||||||||||||||
386 | genus | Niabella | 1.829122e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
387 | species | Niabella ginsenosidivorans | 9.145609e-04 | ||||||||||||||||||||||||||||
388 | species | Unclassified Niabella | 9.145609e-04 | ||||||||||||||||||||||||||||
389 | genus | Segetibacter | 2.741552e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
390 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 1.916419e-02 | 0.010299 | 0.013724 | ||||||||||||||||||||||||||
391 | family | Unclassified Chitinophagales | 2.740845e-03 | ||||||||||||||||||||||||||||
392 | order | Unclassified Chitinophagia | 9.138506e-04 | 0.002493 | |||||||||||||||||||||||||||
393 | class | Cytophagia | 1.608755e-01 | 0.033669 | 0.094623 | 0.018342 | 0.128106 | 0.015615 | |||||||||||||||||||||||
394 | order | Cytophagales | 1.427069e-01 | 0.028519 | 0.084094 | 0.018342 | 0.121876 | 0.013878 | |||||||||||||||||||||||
395 | family | Hymenobacteraceae | 0.025153 | 0.010100 | 0.006947 | ||||||||||||||||||||||||||
396 | genus | Hymenobacter | 0.020135 | 0.010100 | 0.005210 | ||||||||||||||||||||||||||
397 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.005018 | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||||||
398 | family | Cytophagaceae | 1.372678e-01 | 0.078829 | 0.004875 | 0.103225 | 0.005195 | ||||||||||||||||||||||||
399 | genus | Spirosoma | 8.037615e-03 | 0.004875 | 0.003736 | 0.001732 | |||||||||||||||||||||||||
400 | species | Spirosoma linguale | 8.816652e-04 | ||||||||||||||||||||||||||||
401 | species | Unclassified Spirosoma | 7.155950e-03 | 0.004875 | 0.003736 | 0.001732 | |||||||||||||||||||||||||
402 | genus | Dyadobacter | 9.954801e-03 | 0.031588 | 0.024862 | ||||||||||||||||||||||||||
403 | genus | Unclassified Cytophagaceae | 1.192753e-01 | 0.047242 | 0.074627 | 0.003463 | |||||||||||||||||||||||||
404 | family | Unclassified Cytophagales | 5.439182e-03 | 0.003367 | 0.005265 | 0.003367 | 0.018652 | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||
405 | order | Unclassified Cytophagia | 1.816859e-02 | 0.005149 | 0.010529 | 0.006230 | 0.001737 | ||||||||||||||||||||||||
406 | class | Unclassified Bacteroidetes | 8.926611e-02 | 0.035758 | 0.025917 | 0.053628 | 0.001966 | 0.001539 | 0.098719 | 0.001402 | 0.058873 | ||||||||||||||||||||
407 | phylum | Unclassified Bacteria | 3.370652e-01 | 0.006201 | 0.002931 | 0.001890 | 0.001940 | 0.536961 | 0.123944 | 0.737991 | 0.021904 | 0.258522 | 0.037273 | 0.004052 | 0.971961 | 0.118011 | 0.008087 | 6.938894e-18 | 2.350573e-02 | ||||||||||||
408 | superkingdom | Archaea | 0.004716 | 0.001739 | |||||||||||||||||||||||||||
409 | phylum | Euryarchaeota | 0.004716 | ||||||||||||||||||||||||||||
410 | class | Halobacteria | 0.004716 | ||||||||||||||||||||||||||||
411 | order | Halobacteriales | 0.004716 | ||||||||||||||||||||||||||||
412 | family | Haloarculaceae | 0.004716 | ||||||||||||||||||||||||||||
413 | genus | Halorientalis | 0.004716 | ||||||||||||||||||||||||||||
414 | phylum | Thaumarchaeota | 0.001739 | ||||||||||||||||||||||||||||
415 | superkingdom | Unclassified | 4.440892e-16 | 0.019753 | 0.006942 | 0.006866 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NarG_NxrA | 0.00677 | 1 | 88.00 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NasA | 3.92239 | 513 | 79.63 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.76948 | 46 | 78.23 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.01433 | 1 | 83.70 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NirA | 2.10652 | 161 | 73.27 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 2.42968 | 252 | 79.39 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 1.93570 | 54 | 76.70 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirU | 1.47956 | 105 | 81.30 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.00811 | 1 | 62.50 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
UreA | 1.73486 | 58 | 85.34 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 2.04484 | 66 | 83.44 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 3.35050 | 251 | 88.88 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Denitrification | 0.00811 | 1 | 62.50 |
Nitrate assimilatory reduction | 4.69187 | 559 | 79.51 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.00677 | 1 | 88.00 |
Nitrite assimilation | 7.95146 | 572 | 77.77 |
Nitrogen fixation | 0.01433 | 1 | 83.70 |
Urease | 7.13020 | 375 | 87.37 |
NasA | NirB | NasB | NarG_NxrA | UreC | NirA | UreB | NirD | UreA | NifB | NirU | NosZ | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 3.922386 | 2.429676 | 0.769480 | 0.006769 | 3.350501 | 2.106520 | 2.044840 | 1.935699 | 1.734863 | 0.014332 | 1.479564 | 0.008106 |
2 | norank | Unknown | 0.067001 | |||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 3.922386 | 2.429676 | 0.769480 | 0.006769 | 3.283501 | 2.106520 | 1.817953 | 1.935699 | 1.734863 | 0.014332 | 1.479564 | 0.008106 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.013302 | 0.285146 | ||||||||||
5 | order | Synechococcales | 0.028565 | |||||||||||
6 | class | Unclassified Cyanobacteria | 0.013302 | 0.256581 | ||||||||||
7 | phylum | Proteobacteria | 1.918405 | 1.241634 | 0.739297 | 1.599814 | 1.511227 | 1.013138 | 1.126633 | 0.865018 | 0.014332 | 1.370277 | 0.008106 | |
8 | class | Gammaproteobacteria | 0.148712 | 0.027386 | 0.012941 | 0.035802 | 0.008478 | 0.037582 | ||||||
9 | order | Chromatiales | 0.035802 | |||||||||||
10 | family | Ectothiorhodospiraceae | 0.035802 | |||||||||||
11 | order | Methylococcales | 0.018117 | |||||||||||
12 | family | Methylococcaceae | 0.006039 | |||||||||||
13 | genus | Methylomicrobium | 0.006039 | |||||||||||
14 | family | Unclassified Methylococcales | 0.012078 | |||||||||||
15 | order | Nevskiales | 0.037582 | |||||||||||
16 | family | Sinobacteraceae | 0.037582 | |||||||||||
17 | genus | Hydrocarboniphaga | 0.037582 | |||||||||||
18 | order | Pseudomonadales | 0.056777 | 0.009439 | 0.012941 | |||||||||
19 | family | Pseudomonadaceae | 0.050473 | 0.009439 | 0.012941 | |||||||||
20 | genus | Pseudomonas | 0.006334 | 0.009439 | ||||||||||
21 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 0.044139 | 0.012941 | ||||||||||
22 | family | Unclassified Pseudomonadales | 0.006303 | |||||||||||
23 | order | Enterobacterales | 0.018883 | |||||||||||
24 | family | Pectobacteriaceae | 0.012184 | |||||||||||
25 | family | Enterobacteriaceae | 0.006699 | |||||||||||
26 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 0.054936 | 0.017946 | 0.008478 | |||||||||
27 | class | Alphaproteobacteria | 1.043189 | 0.715913 | 0.687384 | 0.879940 | 0.709514 | 0.437587 | 0.810230 | 0.550641 | 1.187004 | |||
28 | order | Rhodospirillales | 0.027132 | 0.026564 | ||||||||||
29 | family | Rhodospirillaceae | 0.018088 | |||||||||||
30 | genus | Nitrospirillum | 0.009044 | |||||||||||
31 | genus | Unclassified Rhodospirillaceae | 0.009044 | |||||||||||
32 | family | Acetobacteraceae | 0.026564 | |||||||||||
33 | genus | Roseomonas | 0.026564 | |||||||||||
34 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.009044 | |||||||||||
35 | order | Sphingomonadales | 0.382567 | 0.279143 | 0.026780 | 0.037273 | 0.656490 | |||||||
36 | family | Sphingomonadaceae | 0.373234 | 0.211677 | 0.026780 | 0.037273 | 0.656490 | |||||||
37 | genus | Sphingomonas | 0.121833 | 0.028839 | 0.165584 | |||||||||
38 | species | Sphingomonas taxi | 0.009660 | 0.082886 | ||||||||||
39 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.121833 | 0.019179 | 0.082698 | |||||||||
40 | genus | Sphingobium | 0.009609 | 0.123764 | ||||||||||
41 | species | Sphingobium sp. SYK-6 | 0.082509 | |||||||||||
42 | species | Unclassified Sphingobium | 0.009609 | 0.041255 | ||||||||||
43 | genus | Novosphingobium | 0.012349 | |||||||||||
44 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.239051 | 0.173228 | 0.026780 | 0.037273 | 0.367143 | |||||||
45 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.009332 | 0.067466 | ||||||||||
46 | order | Rhizobiales | 0.464246 | 0.118192 | 0.563430 | 0.572467 | 0.591688 | 0.315751 | 0.071042 | 0.315751 | 1.172874 | |||
47 | family | Methylobacteriaceae | 0.378513 | 0.362690 | 0.438704 | 0.332099 | 0.286853 | 0.286853 | 0.465077 | |||||
48 | genus | Methylobacterium | 0.261467 | 0.362690 | 0.265840 | 0.306653 | 0.260086 | 0.260086 | 0.422923 | |||||
49 | species | Methylobacterium sp. GXF4 | 0.018034 | 0.013282 | 0.063795 | |||||||||
50 | species | Methylobacterium sp. 77 | 0.009062 | |||||||||||
51 | species | Unclassified Methylobacterium | 0.234371 | 0.362690 | 0.252558 | 0.242858 | 0.260086 | 0.260086 | 0.422923 | |||||
52 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 0.117046 | 0.172864 | 0.025446 | 0.026766 | 0.026766 | 0.042154 | ||||||
53 | family | Methylocystaceae | 0.014286 | |||||||||||
54 | family | Xanthobacteraceae | 0.014309 | |||||||||||
55 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.009117 | 0.017548 | 0.012997 | 0.056304 | ||||||||
56 | family | Beijerinckiaceae | 0.022234 | 0.098493 | 0.042837 | |||||||||
57 | genus | Methyloferula | 0.014264 | |||||||||||
58 | genus | Methylocella | 0.078794 | |||||||||||
59 | genus | Unclassified Beijerinckiaceae | 0.022234 | 0.019699 | 0.028573 | |||||||||
60 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.054382 | 0.019699 | 0.183191 | 0.133763 | 0.246592 | 0.028898 | 0.071042 | 0.028898 | 0.580060 | |||
61 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 0.169244 | 0.318578 | 0.123955 | 0.280693 | 0.091261 | 0.084563 | 0.082698 | 0.234890 | 0.014131 | |||
62 | class | Betaproteobacteria | 0.112900 | 0.116648 | 0.034827 | 0.079929 | 0.041255 | 0.122466 | 0.014332 | |||||
63 | order | Burkholderiales | 0.074890 | 0.097551 | 0.034827 | 0.053363 | 0.041255 | 0.122466 | 0.014332 | |||||
64 | family | Burkholderiaceae | 0.042094 | |||||||||||
65 | family | Oxalobacteraceae | 0.041255 | |||||||||||
66 | family | Comamonadaceae | 0.087669 | 0.026682 | ||||||||||
67 | genus | Acidovorax | 0.013341 | |||||||||||
68 | genus | Rhodoferax | 0.009559 | |||||||||||
69 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 0.078111 | 0.013341 | ||||||||||
70 | family | Unclassified Burkholderiales | 0.032796 | 0.009882 | 0.034827 | 0.026682 | 0.122466 | 0.014332 | ||||||
71 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.038010 | 0.019097 | 0.026566 | |||||||||
72 | class | Deltaproteobacteria | 0.011103 | 0.051033 | 0.051033 | |||||||||
73 | order | Myxococcales | 0.011103 | 0.051033 | 0.051033 | |||||||||
74 | family | Polyangiaceae | 0.011103 | |||||||||||
75 | family | Unclassified Myxococcales | 0.051033 | 0.051033 | ||||||||||
76 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.602501 | 0.381687 | 0.017085 | 0.627004 | 0.801712 | 0.447461 | 0.185460 | 0.225762 | 0.183273 | 0.008106 | ||
77 | phylum | Firmicutes | 0.013360 | 0.035802 | ||||||||||
78 | class | Bacilli | 0.013360 | |||||||||||
79 | order | Bacillales | 0.013360 | |||||||||||
80 | class | Unclassified Firmicutes | 0.035802 | |||||||||||
81 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.039119 | |||||||||||
82 | class | Deinococci | 0.039119 | |||||||||||
83 | order | Deinococcales | 0.039119 | |||||||||||
84 | family | Deinococcaceae | 0.039119 | |||||||||||
85 | phylum | Actinobacteria | 0.477918 | 0.170703 | 0.006769 | 0.081122 | 0.151259 | 0.112745 | ||||||
86 | class | Actinobacteria | 0.414594 | 0.095065 | 0.006769 | 0.081122 | 0.114665 | 0.112745 | ||||||
87 | order | Kineosporiales | 0.040803 | |||||||||||
88 | family | Kineosporiaceae | 0.027202 | |||||||||||
89 | genus | Kineococcus | 0.027202 | |||||||||||
90 | species | Kineococcus radiotolerans | 0.027202 | |||||||||||
91 | family | Unclassified Kineosporiales | 0.013601 | |||||||||||
92 | order | Micrococcales | 0.042346 | 0.019424 | 0.078579 | |||||||||
93 | family | Micrococcaceae | 0.019424 | |||||||||||
94 | genus | Arthrobacter | 0.009712 | |||||||||||
95 | genus | Unclassified Micrococcaceae | 0.009712 | |||||||||||
96 | family | Intrasporangiaceae | 0.021598 | |||||||||||
97 | family | Microbacteriaceae | 0.039460 | |||||||||||
98 | genus | Agromyces | 0.039460 | |||||||||||
99 | family | Unclassified Micrococcales | 0.020748 | 0.039119 | ||||||||||
100 | order | Corynebacteriales | 0.024392 | |||||||||||
101 | family | Gordoniaceae | 0.012159 | |||||||||||
102 | genus | Gordonia | 0.012159 | |||||||||||
103 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.012233 | |||||||||||
104 | order | Propionibacteriales | 0.009630 | |||||||||||
105 | family | Propionibacteriaceae | 0.009630 | |||||||||||
106 | order | Pseudonocardiales | 0.036086 | 0.075163 | ||||||||||
107 | family | Pseudonocardiaceae | 0.075163 | |||||||||||
108 | family | Unclassified Pseudonocardiales | 0.036086 | |||||||||||
109 | order | Streptomycetales | 0.024448 | |||||||||||
110 | family | Streptomycetaceae | 0.024448 | |||||||||||
111 | genus | Streptomyces | 0.018319 | |||||||||||
112 | genus | Unclassified Streptomycetaceae | 0.006129 | |||||||||||
113 | order | Streptosporangiales | 0.005995 | |||||||||||
114 | family | Streptosporangiaceae | 0.005995 | |||||||||||
115 | genus | Streptosporangium | 0.005995 | |||||||||||
116 | order | Unclassified Actinobacteria | 0.307782 | 0.075640 | 0.006769 | 0.040319 | 0.037582 | |||||||
117 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.063323 | 0.075638 | 0.036594 | |||||||||
118 | phylum | Planctomycetes | 0.008292 | 0.008292 | ||||||||||
119 | phylum | Acidobacteria | 0.031981 | 0.051325 | 0.039271 | |||||||||
120 | class | Acidobacteriia | 0.031981 | 0.038494 | 0.013090 | |||||||||
121 | order | Acidobacteriales | 0.031981 | 0.038494 | 0.013090 | |||||||||
122 | family | Acidobacteriaceae | 0.031981 | 0.038494 | ||||||||||
123 | genus | Terriglobus | 0.021445 | 0.012831 | ||||||||||
124 | genus | Unclassified Acidobacteriaceae | 0.010536 | 0.025662 | ||||||||||
125 | family | Unclassified Acidobacteriales | 0.013090 | |||||||||||
126 | class | Unclassified Acidobacteria | 0.012831 | 0.026181 | ||||||||||
127 | phylum | Bacteroidetes | 0.402475 | 0.298178 | 0.173667 | 0.284360 | 0.241682 | 0.284360 | ||||||
128 | class | Sphingobacteriia | 0.014168 | 0.019321 | 0.040883 | |||||||||
129 | order | Sphingobacteriales | 0.007092 | 0.019321 | 0.040883 | |||||||||
130 | family | Sphingobacteriaceae | 0.007092 | 0.019321 | 0.040883 | |||||||||
131 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.007076 | |||||||||||
132 | class | Chitinophagia | 0.006924 | 0.019219 | ||||||||||
133 | order | Chitinophagales | 0.006924 | 0.009579 | ||||||||||
134 | family | Chitinophagaceae | 0.006924 | 0.009579 | ||||||||||
135 | order | Unclassified Chitinophagia | 0.009640 | |||||||||||
136 | class | Cytophagia | 0.048979 | 0.009630 | 0.160247 | 0.284360 | 0.079963 | 0.284360 | ||||||
137 | order | Cytophagales | 0.034805 | 0.160247 | 0.284360 | 0.079963 | 0.284360 | |||||||
138 | family | Hymenobacteraceae | 0.007076 | 0.106884 | 0.232658 | 0.079963 | 0.232658 | |||||||
139 | genus | Rufibacter | 0.079963 | |||||||||||
140 | genus | Hymenobacter | 0.013360 | 0.103403 | 0.103403 | |||||||||
141 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.007076 | 0.093523 | 0.129254 | 0.129254 | ||||||||
142 | family | Cytophagaceae | 0.013579 | |||||||||||
143 | family | Unclassified Cytophagales | 0.014151 | 0.053363 | 0.051702 | 0.051702 | ||||||||
144 | order | Unclassified Cytophagia | 0.014173 | 0.009630 | ||||||||||
145 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.332404 | 0.250008 | 0.013420 | 0.120836 | ||||||||
146 | phylum | Unclassified Bacteria | 1.091607 | 0.710869 | 0.030184 | 1.402236 | 0.258822 | 0.520455 | 0.332912 | 0.472740 | 0.070016 | |||
147 | superkingdom | Unclassified | 0.226887 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
AmoA_PmoA | 0.01134 | 1 | 100.00 | amoA-pmoA; methane/ammonia monooxygenase subunit A [EC:1.14.18.3 1.14.99.39] |
AmoC_PmoC | 0.01213 | 1 | 100.00 | amoC-pmoC; methane/ammonia monooxygenase subunit C |
NapA | 0.07675 | 17 | 96.68 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapB | 0.06287 | 4 | 87.95 | Periplasmic nitrate reductase cytochrome c550-type subunit |
NapD | 0.04466 | 2 | 92.90 | Periplasmic nitrate reductase component NapD |
NapF | 0.01665 | 1 | 96.90 | Ferredoxin-type protein NapF (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.20971 | 67 | 91.35 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.29308 | 46 | 90.98 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.10887 | 9 | 86.94 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.38402 | 30 | 78.77 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 2.34858 | 656 | 79.74 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.48116 | 75 | 80.43 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.00681 | 1 | 95.90 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NifD_AnfD_VnfD | 0.01417 | 2 | 96.00 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NifH_AnfH_VnfH | 0.01084 | 1 | 100.00 | Nitrogenase reductase and maturation protein NifH/AnfH/VnfH |
NifK_AnfK_VnfK | 0.01372 | 2 | 96.50 | Nitrogenase beta chain (EC 1.18.6.1) NifK/AnfK/VnfK |
NirA | 0.40686 | 67 | 77.04 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 3.71978 | 846 | 79.17 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 1.95815 | 146 | 76.97 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.21383 | 30 | 74.31 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirN | 0.00683 | 1 | 87.80 | Nitrite reductase associated c-type cytochorome NirN |
NirS | 0.00542 | 1 | 62.50 | nirS; Cytochrome cd1 nitrite reductase (NO-forming) / hydroxylamine reductase [EC:1.7.2.1 1.7.99.1] |
NirU | 0.34582 | 52 | 81.90 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.05011 | 9 | 86.52 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfA | 0.01430 | 2 | 79.60 | nrfA; nitrite reductase (cytochrome c-552) [EC:1.7.2.2] |
UreA | 2.39241 | 161 | 80.87 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 3.35045 | 212 | 79.74 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 4.54774 | 723 | 87.63 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.01271 | 1 | 50.00 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.19378 | 40 | 83.28 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.01430 | 2 | 79.60 |
Ammonium oxidation | 0.02347 | 2 | 100.00 |
Denitrification | 0.48269 | 82 | 79.75 |
Nitrate assimilatory reduction | 2.82974 | 731 | 79.81 |
Nitrate dissimilatory reduction | 1.19661 | 176 | 89.37 |
Nitrite assimilation | 6.43060 | 1111 | 78.88 |
Nitrogen fixation | 0.04554 | 6 | 96.82 |
Urease | 10.29060 | 1096 | 85.11 |
NapD | NarJ | NasA | AmoC_PmoC | NifH_AnfH_VnfH | NarH_NxrB | NapA | NifK_AnfK_VnfK | NirN | AmoA_PmoA | NirS | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NapF | NirD | UreA | NirK | cNor-C | NosZ | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapB | NrfA | NarI | NifB | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.044657 | 3.840235e-01 | 2.348580 | 0.012127 | 0.010841 | 0.293079 | 0.076750 | 0.013720 | 0.006832 | 0.01134 | 0.005419 | 0.014172 | 3.350451 | 0.016653 | 1.958146e+00 | 2.392406 | 0.213832 | 0.012715 | 0.050113 | 3.719777 | 0.481162 | 0.209711 | 0.193777 | 4.547742 | 0.406856 | 0.062871 | 0.014299 | 0.108868 | 0.00681 | 0.345823 |
2 | norank | Unknown | 0.157525 | |||||||||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.044657 | 3.840235e-01 | 2.348580 | 0.012127 | 0.010841 | 0.293079 | 0.076750 | 0.013720 | 0.006832 | 0.01134 | 0.005419 | 0.014172 | 3.331109 | 0.016653 | 1.958146e+00 | 2.373917 | 0.213832 | 0.012715 | 0.050113 | 3.719777 | 0.481162 | 0.209711 | 0.193777 | 4.358659 | 0.406856 | 0.062871 | 0.014299 | 0.108868 | 0.00681 | 0.345823 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.005041 | 0.004520 | 0.004855 | 0.006298 | 0.033417 | |||||||||||||||||||||||||
5 | order | Oscillatoriales | 0.005041 | |||||||||||||||||||||||||||||
6 | family | Microcoleaceae | 0.005041 | |||||||||||||||||||||||||||||
7 | genus | Arthrospira | 0.005041 | |||||||||||||||||||||||||||||
8 | order | Synechococcales | 0.004520 | |||||||||||||||||||||||||||||
9 | family | Merismopediaceae | 0.004520 | |||||||||||||||||||||||||||||
10 | genus | Synechocystis | 0.004520 | |||||||||||||||||||||||||||||
11 | class | Unclassified Cyanobacteria | 0.004855 | 0.006298 | 0.033417 | |||||||||||||||||||||||||||
12 | phylum | Proteobacteria | 0.044657 | 1.871394e-01 | 1.226711 | 0.012127 | 0.010841 | 0.087803 | 0.076750 | 0.006899 | 0.006832 | 0.01134 | 0.005419 | 0.014172 | 1.403341 | 0.016653 | 9.552716e-01 | 1.054255 | 0.146314 | 0.011514 | 1.500644 | 0.426081 | 0.062074 | 0.120459 | 1.743623 | 0.259750 | 0.049960 | 0.059575 | 0.00681 | 0.298391 | ||
13 | class | Gammaproteobacteria | 0.044657 | 1.623395e-01 | 0.119561 | 0.012127 | 0.067002 | 0.018157 | 0.007122 | 0.478980 | 0.016653 | 1.277340e-01 | 0.226992 | 0.005556 | 0.157555 | 0.028366 | 0.037338 | 0.029201 | 0.460562 | 0.033674 | ||||||||||||
14 | order | Xanthomonadales | 0.024358 | |||||||||||||||||||||||||||||
15 | family | Rhodanobacteraceae | 0.024358 | |||||||||||||||||||||||||||||
16 | genus | Rhodanobacter | 0.019486 | |||||||||||||||||||||||||||||
17 | genus | Unclassified Rhodanobacteraceae | 0.004872 | |||||||||||||||||||||||||||||
18 | order | Methylococcales | 0.012127 | 0.007122 | ||||||||||||||||||||||||||||
19 | family | Methylococcaceae | 0.012127 | 0.007122 | ||||||||||||||||||||||||||||
20 | genus | Methylomonas | 0.012127 | 0.007122 | ||||||||||||||||||||||||||||
21 | order | Immundisolibacterales | 0.041766 | |||||||||||||||||||||||||||||
22 | family | Immundisolibacteraceae | 0.041766 | |||||||||||||||||||||||||||||
23 | genus | Immundisolibacter | 0.041766 | |||||||||||||||||||||||||||||
24 | order | Pseudomonadales | 0.036287 | 0.394815 | 0.205576 | 0.035616 | 0.316212 | |||||||||||||||||||||||||
25 | family | Pseudomonadaceae | 0.033367 | 0.394815 | 0.205576 | 0.031183 | 0.316212 | |||||||||||||||||||||||||
26 | genus | Pseudomonas | 0.010046 | 0.381983 | 0.149912 | 0.022329 | 0.233877 | |||||||||||||||||||||||||
27 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 0.023320 | 0.012832 | 0.055664 | 0.008853 | 0.082335 | |||||||||||||||||||||||||
28 | family | Unclassified Pseudomonadales | 0.002921 | 0.004434 | ||||||||||||||||||||||||||||
29 | order | Enterobacterales | 0.044657 | 1.498519e-01 | 0.041781 | 0.032516 | 0.018157 | 0.016653 | 8.448533e-02 | 0.080634 | 0.022759 | 0.021777 | 0.013072 | |||||||||||||||||||
30 | family | Erwiniaceae | 0.044657 | 7.492594e-02 | 0.017422 | 0.009079 | 0.016653 | 7.881005e-02 | 0.052771 | 0.017084 | 0.009327 | 0.013072 | ||||||||||||||||||||
31 | genus | Pantoea | 0.044657 | 0.013066 | 0.004539 | 0.016653 | 4.982417e-02 | 0.013126 | 0.008673 | 0.013072 | ||||||||||||||||||||||
32 | species | Pantoea sp. GM01 | 4.115085e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
33 | species | Unclassified Pantoea | 0.044657 | 0.013066 | 0.004539 | 0.016653 | 8.673322e-03 | 0.013126 | 0.008673 | 0.013072 | ||||||||||||||||||||||
34 | genus | Erwinia | 6.243828e-02 | 2.057542e-02 | 0.031234 | 0.009327 | ||||||||||||||||||||||||||
35 | species | Erwinia billingiae | 2.497531e-02 | 2.057542e-02 | 0.022310 | 0.003109 | ||||||||||||||||||||||||||
36 | species | Unclassified Erwinia | 3.746297e-02 | 0.008924 | 0.006218 | |||||||||||||||||||||||||||
37 | genus | Unclassified Erwiniaceae | 1.248766e-02 | 0.004355 | 0.004539 | 8.410460e-03 | 0.008410 | 0.008410 | ||||||||||||||||||||||||
38 | family | Pectobacteriaceae | 0.002787 | |||||||||||||||||||||||||||||
39 | family | Yersiniaceae | 3.746297e-02 | 0.004262 | 0.004438 | |||||||||||||||||||||||||||
40 | genus | Rahnella | 1.248766e-02 | 0.004438 | ||||||||||||||||||||||||||||
41 | genus | Serratia | 0.004262 | |||||||||||||||||||||||||||||
42 | genus | Unclassified Yersiniaceae | 2.497531e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
43 | family | Enterobacteriaceae | 0.004311 | 0.004976 | ||||||||||||||||||||||||||||
44 | genus | Kosakonia | 0.004311 | |||||||||||||||||||||||||||||
45 | genus | Unclassified Enterobacteriaceae | 0.004976 | |||||||||||||||||||||||||||||
46 | family | Unclassified Enterobacterales | 3.746297e-02 | 0.013000 | 0.027541 | 0.009079 | 5.675277e-03 | 0.023424 | 0.005675 | 0.012450 | ||||||||||||||||||||||
47 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 1.248766e-02 | 0.041493 | 0.034486 | 0.042399 | 4.324871e-02 | 0.021416 | 0.005556 | 0.041305 | 0.005607 | 0.015561 | 0.004843 | 0.144350 | 0.020603 | |||||||||||||||||
48 | class | Alphaproteobacteria | 2.479991e-02 | 0.373144 | 0.020801 | 0.040503 | 0.006899 | 0.007050 | 0.301804 | 1.798083e-01 | 0.390451 | 0.044625 | 0.011514 | 0.334692 | 0.174630 | 0.003104 | 0.004805 | 0.287743 | 0.180803 | 0.049960 | 0.00681 | 0.258786 | ||||||||||
49 | order | Rhodospirillales | 0.005398 | 2.037548e-02 | 0.005398 | 0.013191 | ||||||||||||||||||||||||||
50 | family | Rhodospirillaceae | 2.037548e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
51 | genus | Nitrospirillum | 2.037548e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
52 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.005398 | 0.005398 | 0.013191 | |||||||||||||||||||||||||||
53 | order | Sphingomonadales | 0.129437 | 0.020575 | 9.947171e-02 | 0.183797 | 0.004805 | |||||||||||||||||||||||||
54 | family | Erythrobacteraceae | 1.952180e-02 | 0.004539 | ||||||||||||||||||||||||||||
55 | family | Sphingomonadaceae | 0.116370 | 0.020575 | 7.994991e-02 | 0.116790 | 0.004805 | |||||||||||||||||||||||||
56 | genus | Sphingomonas | 0.017522 | 2.008274e-02 | 0.008962 | |||||||||||||||||||||||||||
57 | species | Sphingomonas panacis | 2.008274e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
58 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.017522 | 0.008962 | ||||||||||||||||||||||||||||
59 | genus | Sphingobium | 0.020575 | |||||||||||||||||||||||||||||
60 | genus | Novosphingobium | 0.004500 | |||||||||||||||||||||||||||||
61 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.098848 | 5.986717e-02 | 0.103327 | 0.004805 | ||||||||||||||||||||||||||
62 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.013067 | 1.387779e-17 | 0.062468 | |||||||||||||||||||||||||||
63 | order | Rhizobiales | 1.263820e-02 | 0.172158 | 0.013856 | 0.035979 | 0.199809 | 0.213812 | 0.044625 | 0.011514 | 0.032269 | 0.158032 | 0.213298 | 0.168507 | 0.049960 | 0.00681 | 0.245595 | |||||||||||||||
64 | family | Methylobacteriaceae | 0.096919 | 0.165670 | 0.187086 | 0.074429 | 0.106367 | 0.108208 | 0.119206 | |||||||||||||||||||||||
65 | genus | Microvirga | 0.021416 | |||||||||||||||||||||||||||||
66 | genus | Methylobacterium | 0.075779 | 0.151776 | 0.151776 | 0.057749 | 0.093864 | 0.102224 | 0.112662 | |||||||||||||||||||||||
67 | species | Methylobacterium sp. GXF4 | 0.008439 | 0.012503 | 0.012002 | |||||||||||||||||||||||||||
68 | species | Unclassified Methylobacterium | 0.067339 | 0.151776 | 0.151776 | 0.057749 | 0.081362 | 0.090223 | 0.112662 | |||||||||||||||||||||||
69 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 0.021141 | 0.013894 | 0.013894 | 0.016680 | 0.012503 | 0.005984 | 0.006544 | |||||||||||||||||||||||
70 | family | Methylocystaceae | 0.005562 | |||||||||||||||||||||||||||||
71 | genus | Methylocystis | 0.005562 | |||||||||||||||||||||||||||||
72 | family | Bradyrhizobiaceae | 1.263820e-02 | 0.025284 | 0.035979 | 0.037355 | 0.033494 | 0.012559 | 0.036095 | 0.049960 | 0.033345 | |||||||||||||||||||||
73 | genus | Bradyrhizobium | 1.263820e-02 | 0.017982 | 0.027321 | 0.033494 | 0.006270 | 0.024065 | 0.033307 | 0.019954 | ||||||||||||||||||||||
74 | species | Bradyrhizobium icense | 0.016747 | |||||||||||||||||||||||||||||
75 | species | Unclassified Bradyrhizobium | 1.263820e-02 | 0.017982 | 0.027321 | 0.016747 | 0.006270 | 0.024065 | 0.033307 | 0.019954 | ||||||||||||||||||||||
76 | genus | Bosea | 0.004207 | |||||||||||||||||||||||||||||
77 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.021077 | 0.017997 | 0.010035 | 0.006289 | 0.012030 | 0.016653 | 0.013391 | |||||||||||||||||||||||
78 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.006308 | |||||||||||||||||||||||||||||
79 | genus | Rhodoplanes | 0.006308 | |||||||||||||||||||||||||||||
80 | species | Rhodoplanes sp. Z2-YC6860 | 0.006308 | |||||||||||||||||||||||||||||
81 | family | Beijerinckiaceae | 0.018950 | 0.007270 | 0.023071 | |||||||||||||||||||||||||||
82 | genus | Methyloferula | 0.008516 | |||||||||||||||||||||||||||||
83 | genus | Methylocella | 0.005217 | 0.004614 | ||||||||||||||||||||||||||||
84 | genus | Unclassified Beijerinckiaceae | 0.005217 | 0.007270 | 0.018457 | |||||||||||||||||||||||||||
85 | family | Rhizobiaceae | 0.021307 | |||||||||||||||||||||||||||||
86 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.025442 | 0.013856 | 0.012832 | 0.026726 | 0.011514 | 0.009198 | 0.050109 | 0.088064 | 0.024204 | 0.00681 | 0.093043 | |||||||||||||||||||
87 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 1.216171e-02 | 0.071550 | 0.006945 | 0.004525 | 0.006899 | 0.007050 | 0.076021 | 5.996107e-02 | 0.176638 | 0.118625 | 0.016598 | 0.003104 | 0.069047 | 0.012296 | ||||||||||||||||
88 | class | Betaproteobacteria | 0.308317 | 0.006832 | 0.01134 | 0.127213 | 4.467641e-01 | 0.149912 | 0.016088 | 0.479567 | 0.182561 | 0.009189 | 0.019502 | 0.352757 | 0.025901 | |||||||||||||||||
89 | order | Nitrosomonadales | 0.004178 | 0.01134 | 4.075096e-02 | 0.009003 | 0.004645 | |||||||||||||||||||||||||
90 | family | Nitrosomonadaceae | 0.01134 | 0.009003 | ||||||||||||||||||||||||||||
91 | genus | Nitrosospira | 0.01134 | |||||||||||||||||||||||||||||
92 | genus | Unclassified Nitrosomonadaceae | 0.009003 | |||||||||||||||||||||||||||||
93 | family | Methylophilaceae | 0.004178 | 4.075096e-02 | 0.004645 | |||||||||||||||||||||||||||
94 | genus | Methylotenera | 0.004178 | 4.075096e-02 | ||||||||||||||||||||||||||||
95 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 0.004645 | |||||||||||||||||||||||||||||
96 | order | Burkholderiales | 0.244963 | 0.006832 | 0.106536 | 3.663173e-01 | 0.042832 | 0.007086 | 0.274076 | 0.174335 | 0.006123 | 0.014703 | 0.270933 | 0.025901 | ||||||||||||||||||
97 | family | Burkholderiaceae | 0.039087 | 0.021307 | 7.679990e-02 | 0.042832 | 0.022159 | 0.063259 | 0.025901 | |||||||||||||||||||||||
98 | genus | Cupriavidus | 5.671716e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
99 | genus | Paraburkholderia | 0.025901 | |||||||||||||||||||||||||||||
100 | genus | Burkholderia | 0.013964 | |||||||||||||||||||||||||||||
101 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 0.025123 | 0.021307 | 2.008274e-02 | 0.042832 | 0.022159 | 0.063259 | ||||||||||||||||||||||||
102 | family | Oxalobacteraceae | 0.071553 | 0.008854 | 0.050185 | 0.069700 | ||||||||||||||||||||||||||
103 | genus | Massilia | 0.004250 | 0.008389 | 0.019009 | |||||||||||||||||||||||||||
104 | genus | Herbaspirillum | 0.004157 | |||||||||||||||||||||||||||||
105 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 0.063147 | 0.008854 | 0.041796 | 0.050691 | ||||||||||||||||||||||||||
106 | family | Comamonadaceae | 0.012260 | 0.006832 | 2.008274e-02 | 0.022677 | 0.031068 | |||||||||||||||||||||||||
107 | genus | Acidovorax | 0.006279 | |||||||||||||||||||||||||||||
108 | genus | Variovorax | 2.008274e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
109 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 0.012260 | 0.006832 | 0.022677 | 0.024788 | ||||||||||||||||||||||||||
110 | family | Unclassified Burkholderiales | 0.122063 | 0.085229 | 2.694346e-01 | 0.007086 | 0.220386 | 0.124151 | 0.006123 | 0.014703 | 0.106907 | |||||||||||||||||||||
111 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.059176 | 0.020677 | 3.969584e-02 | 0.107080 | 0.200846 | 0.008226 | 0.003066 | 0.004799 | 0.081824 | |||||||||||||||||||||
112 | class | Deltaproteobacteria | 0.059538 | 3.930862e-03 | 0.059538 | 0.008540 | 0.007245 | 0.062889 | ||||||||||||||||||||||||
113 | order | Myxococcales | 0.011786 | 0.011786 | 0.044022 | |||||||||||||||||||||||||||
114 | family | Anaeromyxobacteraceae | 0.006289 | |||||||||||||||||||||||||||||
115 | genus | Anaeromyxobacter | 0.006289 | |||||||||||||||||||||||||||||
116 | family | Unclassified Myxococcales | 0.011786 | 0.011786 | 0.037733 | |||||||||||||||||||||||||||
117 | order | Desulfuromonadales | 3.930862e-03 | 0.003931 | ||||||||||||||||||||||||||||
118 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 0.047753 | 0.047753 | 0.004609 | 0.007245 | 0.018867 | |||||||||||||||||||||||||
119 | class | Epsilonproteobacteria | 0.004877 | |||||||||||||||||||||||||||||
120 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.420810 | 0.010841 | 0.018089 | 0.005419 | 0.435805 | 1.970344e-01 | 0.227361 | 0.080044 | 0.520290 | 0.033279 | 0.012443 | 0.066951 | 0.579672 | 0.078947 | 0.039605 | |||||||||||||||
121 | phylum | Firmicutes | 0.058025 | 0.043901 | ||||||||||||||||||||||||||||
122 | class | Bacilli | 0.038683 | 0.031398 | ||||||||||||||||||||||||||||
123 | order | Bacillales | 0.012578 | |||||||||||||||||||||||||||||
124 | order | Unclassified Bacilli | 0.038683 | 0.018820 | ||||||||||||||||||||||||||||
125 | class | Unclassified Firmicutes | 0.019342 | 0.012503 | ||||||||||||||||||||||||||||
126 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.005178 | 0.097853 | 0.018588 | |||||||||||||||||||||||||||
127 | class | Deinococci | 0.005178 | 0.057822 | ||||||||||||||||||||||||||||
128 | order | Deinococcales | 0.005178 | |||||||||||||||||||||||||||||
129 | family | Deinococcaceae | 0.005178 | |||||||||||||||||||||||||||||
130 | order | Unclassified Deinococci | 0.057822 | |||||||||||||||||||||||||||||
131 | class | Unclassified Deinococcus-Thermus | 0.040031 | 0.018588 | ||||||||||||||||||||||||||||
132 | phylum | Chloroflexi | 0.006261 | |||||||||||||||||||||||||||||
133 | phylum | Actinobacteria | 1.968841e-01 | 0.305179 | 0.189021 | 0.102352 | 3.381041e-01 | 0.182480 | 0.552483 | 0.020095 | 0.141437 | 0.024002 | 0.313801 | 0.049293 | ||||||||||||||||||
134 | class | Actinobacteria | 1.968841e-01 | 0.261872 | 0.146584 | 0.082554 | 2.618748e-01 | 0.147869 | 0.412433 | 0.020095 | 0.116219 | 0.019137 | 0.220342 | 0.049293 | ||||||||||||||||||
135 | order | Geodermatophilales | 0.012853 | |||||||||||||||||||||||||||||
136 | family | Geodermatophilaceae | 0.012853 | |||||||||||||||||||||||||||||
137 | order | Nakamurellales | 2.520044e-02 | 0.013516 | 0.008924 | 0.012654 | ||||||||||||||||||||||||||
138 | family | Nakamurellaceae | 0.013516 | 0.004462 | 0.006327 | |||||||||||||||||||||||||||
139 | genus | Nakamurella | 0.009010 | 0.004462 | ||||||||||||||||||||||||||||
140 | genus | Unclassified Nakamurellaceae | 0.004505 | 0.006327 | ||||||||||||||||||||||||||||
141 | family | Unclassified Nakamurellales | 2.520044e-02 | 0.004462 | 0.006327 | |||||||||||||||||||||||||||
142 | order | Kineosporiales | 0.005870 | 2.077933e-02 | 0.008684 | |||||||||||||||||||||||||||
143 | family | Kineosporiaceae | 0.005870 | 0.004342 | ||||||||||||||||||||||||||||
144 | genus | Kineococcus | 0.002935 | 0.004342 | ||||||||||||||||||||||||||||
145 | genus | Unclassified Kineosporiaceae | 0.002935 | |||||||||||||||||||||||||||||
146 | family | Unclassified Kineosporiales | 2.077933e-02 | 0.004342 | ||||||||||||||||||||||||||||
147 | order | Micrococcales | 2.490116e-02 | 0.005035 | 4.049591e-02 | 0.079230 | 0.006276 | 0.044115 | ||||||||||||||||||||||||
148 | family | Micrococcaceae | 0.022223 | 0.003144 | 0.006106 | |||||||||||||||||||||||||||
149 | genus | Arthrobacter | 0.006106 | |||||||||||||||||||||||||||||
150 | genus | Unclassified Micrococcaceae | 0.022223 | 0.003144 | ||||||||||||||||||||||||||||
151 | family | Dermacoccaceae | 0.005035 | 0.006327 | ||||||||||||||||||||||||||||
152 | family | Cellulomonadaceae | 1.961310e-02 | 0.008934 | ||||||||||||||||||||||||||||
153 | genus | Cellulomonas | 0.008934 | |||||||||||||||||||||||||||||
154 | genus | Unclassified Cellulomonadaceae | 1.961310e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
155 | family | Intrasporangiaceae | 2.490116e-02 | 0.003132 | ||||||||||||||||||||||||||||
156 | genus | Janibacter | 1.245058e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
157 | genus | Unclassified Intrasporangiaceae | 1.245058e-02 | 0.003132 | ||||||||||||||||||||||||||||
158 | family | Microbacteriaceae | 0.012738 | 0.012692 | ||||||||||||||||||||||||||||
159 | genus | Microbacterium | 0.004276 | 0.012692 | ||||||||||||||||||||||||||||
160 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 0.008462 | |||||||||||||||||||||||||||||
161 | family | Unclassified Micrococcales | 2.088281e-02 | 0.035335 | 0.018990 | |||||||||||||||||||||||||||
162 | order | Corynebacteriales | 1.299055e-02 | 0.036645 | 0.046188 | 1.925292e-02 | 0.017921 | 0.022087 | 0.006308 | 0.012162 | ||||||||||||||||||||||
163 | family | Mycobacteriaceae | 0.014856 | 1.925292e-02 | 0.013520 | 0.003100 | ||||||||||||||||||||||||||
164 | genus | Mycobacterium | 0.014856 | 0.009128 | ||||||||||||||||||||||||||||
165 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 1.925292e-02 | 0.004392 | 0.003100 | |||||||||||||||||||||||||||
166 | family | Nocardiaceae | 1.299055e-02 | 0.016093 | 0.006414 | 0.006308 | ||||||||||||||||||||||||||
167 | genus | Nocardia | 0.010402 | |||||||||||||||||||||||||||||
168 | species | Nocardia sp. 348MFTsu5.1 | 0.005166 | |||||||||||||||||||||||||||||
169 | species | Unclassified Nocardia | 0.005237 | |||||||||||||||||||||||||||||
170 | genus | Rhodococcus | 0.002845 | 0.006308 | ||||||||||||||||||||||||||||
171 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 1.299055e-02 | 0.002845 | 0.006414 | |||||||||||||||||||||||||||
172 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.005696 | 0.039774 | 0.004401 | 0.018987 | 0.012162 | |||||||||||||||||||||||||
173 | order | Micromonosporales | 0.004554 | |||||||||||||||||||||||||||||
174 | order | Propionibacteriales | 0.040590 | 5.894897e-02 | 0.027425 | 0.017692 | 0.013275 | |||||||||||||||||||||||||
175 | family | Propionibacteriaceae | 0.036080 | 2.130724e-02 | 0.004544 | |||||||||||||||||||||||||||
176 | genus | Microlunatus | 0.013530 | 0.004544 | ||||||||||||||||||||||||||||
177 | genus | Unclassified Propionibacteriaceae | 0.022550 | 2.130724e-02 | ||||||||||||||||||||||||||||
178 | family | Nocardioidaceae | 3.764174e-02 | 0.013148 | 0.013275 | |||||||||||||||||||||||||||
179 | genus | Nocardioides | 3.764174e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
180 | genus | Unclassified Nocardioidaceae | 0.013148 | 0.013275 | ||||||||||||||||||||||||||||
181 | family | Unclassified Propionibacteriales | 0.004510 | 0.027425 | ||||||||||||||||||||||||||||
182 | order | Pseudonocardiales | 0.005269 | 1.970527e-02 | 0.008826 | |||||||||||||||||||||||||||
183 | family | Pseudonocardiaceae | 0.005269 | 0.008826 | ||||||||||||||||||||||||||||
184 | genus | Pseudonocardia | 0.004448 | |||||||||||||||||||||||||||||
185 | genus | Actinomycetospora | 0.005269 | |||||||||||||||||||||||||||||
186 | genus | Unclassified Pseudonocardiaceae | 0.004378 | |||||||||||||||||||||||||||||
187 | family | Unclassified Pseudonocardiales | 1.970527e-02 | |||||||||||||||||||||||||||||
188 | order | Streptomycetales | 0.019289 | 0.006375 | ||||||||||||||||||||||||||||
189 | family | Streptomycetaceae | 0.016409 | 0.006375 | ||||||||||||||||||||||||||||
190 | genus | Streptomyces | 0.002819 | |||||||||||||||||||||||||||||
191 | genus | Unclassified Streptomycetaceae | 0.013590 | 0.006375 | ||||||||||||||||||||||||||||
192 | family | Unclassified Streptomycetales | 0.002881 | |||||||||||||||||||||||||||||
193 | order | Unclassified Actinobacteria | 1.337919e-01 | 0.127840 | 0.100396 | 0.077519 | 1.026924e-01 | 0.120443 | 0.266601 | 0.006821 | 0.087856 | 0.019137 | 0.150891 | 0.037131 | ||||||||||||||||||
194 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.043307 | 0.042437 | 0.019798 | 7.622923e-02 | 0.034611 | 0.140051 | 0.025218 | 0.004866 | 0.093459 | |||||||||||||||||||||
195 | phylum | Planctomycetes | 0.010056 | 0.202635 | 5.004599e-02 | 0.202635 | 0.100692 | 0.021925 | ||||||||||||||||||||||||
196 | class | Planctomycetia | 0.010056 | 3.468913e-02 | 0.050296 | 0.021925 | ||||||||||||||||||||||||||
197 | order | Planctomycetales | 0.010056 | 1.938179e-02 | 0.019382 | 0.014591 | ||||||||||||||||||||||||||
198 | family | Planctomycetaceae | 1.550543e-02 | 0.015505 | ||||||||||||||||||||||||||||
199 | genus | Gimesia | 1.550543e-02 | 0.015505 | ||||||||||||||||||||||||||||
200 | family | Gemmataceae | 0.014591 | |||||||||||||||||||||||||||||
201 | genus | Zavarzinella | 0.014591 | |||||||||||||||||||||||||||||
202 | family | Unclassified Planctomycetales | 0.010056 | 3.876358e-03 | 0.003876 | |||||||||||||||||||||||||||
203 | order | Unclassified Planctomycetia | 1.530734e-02 | 0.030914 | 0.007334 | |||||||||||||||||||||||||||
204 | class | Phycisphaerae | 0.011920 | 0.011920 | ||||||||||||||||||||||||||||
205 | class | Unclassified Planctomycetes | 0.190716 | 1.535686e-02 | 0.190716 | 0.050397 | ||||||||||||||||||||||||||
206 | phylum | Spirochaetes | 0.012715 | 0.004481 | ||||||||||||||||||||||||||||
207 | phylum | Lentisphaerae | 0.013501 | |||||||||||||||||||||||||||||
208 | phylum | Acidobacteria | 0.025106 | 0.009789 | 0.012045 | |||||||||||||||||||||||||||
209 | class | Acidobacteriia | 0.020028 | 0.009789 | 0.012045 | |||||||||||||||||||||||||||
210 | order | Acidobacteriales | 0.020028 | 0.009789 | 0.012045 | |||||||||||||||||||||||||||
211 | family | Acidobacteriaceae | 0.020028 | 0.012045 | ||||||||||||||||||||||||||||
212 | genus | Terriglobus | 0.005029 | |||||||||||||||||||||||||||||
213 | genus | Granulicella | 0.004940 | 0.006009 | ||||||||||||||||||||||||||||
214 | genus | Unclassified Acidobacteriaceae | 0.010059 | 0.006035 | ||||||||||||||||||||||||||||
215 | family | Unclassified Acidobacteriales | 0.009789 | |||||||||||||||||||||||||||||
216 | class | Solibacteres | 0.005078 | |||||||||||||||||||||||||||||
217 | order | Solibacterales | 0.005078 | |||||||||||||||||||||||||||||
218 | family | Solibacteraceae | 0.005078 | |||||||||||||||||||||||||||||
219 | genus | Candidatus Solibacter | 0.005078 | |||||||||||||||||||||||||||||
220 | phylum | Verrucomicrobia | 0.021093 | 0.008561 | 0.006124 | |||||||||||||||||||||||||||
221 | class | Spartobacteria | 0.021093 | |||||||||||||||||||||||||||||
222 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 0.008561 | 0.006124 | ||||||||||||||||||||||||||||
223 | phylum | Bacteroidetes | 0.362866 | 0.310673 | 3.159592e-01 | 0.310673 | 0.007208 | 0.038599 | 0.360645 | 0.004993 | 0.150933 | 0.005676 | 0.012911 | |||||||||||||||||||
224 | class | Flavobacteriia | 0.011645 | 0.007208 | 0.013482 | 0.004993 | 0.006270 | 0.012911 | ||||||||||||||||||||||||
225 | order | Flavobacteriales | 0.011645 | 0.007208 | 0.013482 | 0.004993 | 0.006270 | 0.012911 | ||||||||||||||||||||||||
226 | family | Flavobacteriaceae | 0.011645 | 0.007208 | 0.008991 | 0.006270 | 0.012911 | |||||||||||||||||||||||||
227 | genus | Wenyingzhuangia | 0.012911 | |||||||||||||||||||||||||||||
228 | genus | Flavobacterium | 0.008337 | 0.008991 | ||||||||||||||||||||||||||||
229 | genus | Unclassified Flavobacteriaceae | 0.003308 | 0.007208 | 0.006270 | |||||||||||||||||||||||||||
230 | family | Unclassified Flavobacteriales | 0.004491 | 0.004993 | ||||||||||||||||||||||||||||
231 | class | Sphingobacteriia | 0.019828 | 9.993512e-02 | 0.013555 | 0.006270 | ||||||||||||||||||||||||||
232 | order | Sphingobacteriales | 0.019828 | 9.993512e-02 | 0.009054 | 0.006270 | ||||||||||||||||||||||||||
233 | family | Sphingobacteriaceae | 0.016525 | 7.994809e-02 | 0.009054 | |||||||||||||||||||||||||||
234 | genus | Mucilaginibacter | 0.004530 | |||||||||||||||||||||||||||||
235 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 0.016525 | 7.994809e-02 | 0.004525 | |||||||||||||||||||||||||||
236 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.003302 | 1.998702e-02 | 0.006270 | |||||||||||||||||||||||||||
237 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.004500 | |||||||||||||||||||||||||||||
238 | class | Chitinophagia | 0.019549 | |||||||||||||||||||||||||||||
239 | order | Chitinophagales | 0.016265 | |||||||||||||||||||||||||||||
240 | family | Chitinophagaceae | 0.013034 | |||||||||||||||||||||||||||||
241 | genus | Niastella | 0.003231 | |||||||||||||||||||||||||||||
242 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 0.009802 | |||||||||||||||||||||||||||||
243 | family | Unclassified Chitinophagales | 0.003231 | |||||||||||||||||||||||||||||
244 | order | Unclassified Chitinophagia | 0.003284 | |||||||||||||||||||||||||||||
245 | class | Bacteroidia | 0.012635 | |||||||||||||||||||||||||||||
246 | class | Cytophagia | 0.045206 | 0.297881 | 3.941053e-02 | 0.297881 | 0.040475 | 0.106892 | ||||||||||||||||||||||||
247 | order | Cytophagales | 0.038739 | 0.210410 | 3.941053e-02 | 0.210410 | 0.040475 | 0.088025 | ||||||||||||||||||||||||
248 | family | Hymenobacteraceae | 0.003302 | 0.173279 | 0.173279 | 0.004510 | 0.044022 | |||||||||||||||||||||||||
249 | genus | Rufibacter | 0.003302 | |||||||||||||||||||||||||||||
250 | genus | Hymenobacter | 0.012377 | 0.012377 | 0.025155 | |||||||||||||||||||||||||||
251 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.160902 | 0.160902 | 0.004510 | 0.018867 | ||||||||||||||||||||||||||
252 | family | Cytophagaceae | 0.025537 | 3.941053e-02 | 0.026978 | |||||||||||||||||||||||||||
253 | genus | Spirosoma | 0.012671 | 0.004496 | ||||||||||||||||||||||||||||
254 | genus | Unclassified Cytophagaceae | 0.012866 | 3.941053e-02 | 0.022483 | |||||||||||||||||||||||||||
255 | family | Unclassified Cytophagales | 0.009900 | 0.037131 | 0.037131 | 0.008986 | 0.044003 | |||||||||||||||||||||||||
256 | order | Unclassified Cytophagia | 0.006468 | 0.087470 | 0.087470 | 0.018867 | ||||||||||||||||||||||||||
257 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.266638 | 0.012792 | 1.766135e-01 | 0.012792 | 0.038599 | 0.293134 | 0.018867 | 0.005676 | ||||||||||||||||||||||
258 | phylum | Unclassified Bacteria | 5.551115e-17 | 0.408443 | 0.016255 | 0.006821 | 1.232990 | 2.987648e-01 | 0.623874 | 0.051749 | 1.084958 | 0.013062 | 0.006200 | 0.029679 | 2.093841 | 0.071257 | 0.014299 | 0.047432 | ||||||||||||||
259 | superkingdom | Archaea | 0.012635 | |||||||||||||||||||||||||||||
260 | phylum | Euryarchaeota | 0.012635 | |||||||||||||||||||||||||||||
261 | superkingdom | Unclassified | 0.019342 | 0.018489 | 0.018923 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NapA | 0.02650 | 21 | 91.95 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapB | 0.04354 | 10 | 77.40 | Periplasmic nitrate reductase cytochrome c550-type subunit |
NapC | 0.03745 | 10 | 87.28 | Cytochrome c-type protein NapC |
NapD | 0.00977 | 2 | 73.00 | Periplasmic nitrate reductase component NapD |
NapE | 0.02904 | 4 | 79.90 | Periplasmic nitrate reductase component NapE |
NapH | 0.00296 | 1 | 96.00 | Polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.07409 | 85 | 93.13 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.07343 | 39 | 91.73 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.03459 | 10 | 78.16 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.04839 | 14 | 83.86 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 1.27439 | 1349 | 80.61 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.04969 | 29 | 74.53 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifD_AnfD_VnfD | 0.00596 | 3 | 91.33 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NirA | 0.27616 | 165 | 72.44 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 1.36711 | 1105 | 84.14 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 1.02551 | 250 | 78.26 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.01378 | 8 | 63.12 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirS | 0.00594 | 4 | 53.02 | nirS; Cytochrome cd1 nitrite reductase (NO-forming) / hydroxylamine reductase [EC:1.7.2.1 1.7.99.1] |
NirU | 0.16492 | 94 | 78.64 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.00256 | 2 | 94.00 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfH | 0.00428 | 1 | 79.60 | nrfH; cytochrome c nitrite reductase small subunit |
UreA | 1.38375 | 307 | 86.22 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 1.63747 | 375 | 81.25 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 2.37482 | 1368 | 88.73 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.01029 | 3 | 52.40 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.00535 | 4 | 75.97 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.00428 | 1 | 79.60 |
Denitrification | 0.03792 | 21 | 65.06 |
Nitrate assimilatory reduction | 1.32407 | 1378 | 80.48 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.37976 | 196 | 89.74 |
Nitrite assimilation | 2.83370 | 1614 | 81.71 |
Nitrogen fixation | 0.00596 | 3 | 91.33 |
Urease | 5.39603 | 2050 | 86.99 |
NapD | NapC | NarJ | NasA | NapH | NapA | NarH_NxrB | NirS | NrfH | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NirD | UreA | NirK | cNor-C | NosZ | NirB | NarG_NxrA | NasB | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapE | NapB | NarI | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.009767 | 0.037449 | 0.048391 | 1.274385 | 0.002958 | 0.026499 | 0.073434 | 0.005943 | 0.004283 | 0.005961 | 1.637465 | 1.025511 | 1.383751e+00 | 0.013776 | 0.010287 | 0.002564 | 1.367106 | 0.074091 | 0.049689 | 0.005346 | 2.374817 | 0.276161 | 0.029044 | 0.043541 | 0.034587 | 0.164922 |
2 | norank | Unknown | 0.003670 | 0.015557 | 4.914243e-03 | 0.029936 | ||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.009767 | 0.037449 | 0.048391 | 1.270715 | 0.002958 | 0.026499 | 0.073434 | 0.005943 | 0.004283 | 0.005961 | 1.612534 | 1.025511 | 1.378837e+00 | 0.013776 | 0.010287 | 0.002564 | 1.367106 | 0.074091 | 0.049689 | 0.005346 | 2.330706 | 0.276161 | 0.029044 | 0.043541 | 0.034587 | 0.164922 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.022794 | 4.914243e-03 | 0.002063 | |||||||||||||||||||||||
5 | order | Oscillatoriales | 0.013309 | 4.914243e-03 | ||||||||||||||||||||||||
6 | family | Cyanothecaceae | 0.013309 | 4.914243e-03 | ||||||||||||||||||||||||
7 | genus | Cyanothece | 0.013309 | 4.914243e-03 | ||||||||||||||||||||||||
8 | class | Unclassified Cyanobacteria | 0.009485 | 0.002063 | ||||||||||||||||||||||||
9 | phylum | Proteobacteria | 0.009767 | 0.037449 | 0.048391 | 0.825678 | 0.002958 | 0.025143 | 0.073434 | 0.001500 | 0.005961 | 1.076640 | 0.891031 | 8.966190e-01 | 0.006772 | 0.010287 | 0.001055 | 1.027366 | 0.074091 | 0.044947 | 0.001331 | 1.200953 | 0.026845 | 0.029044 | 0.043541 | 0.034587 | 0.038444 | |
10 | class | Gammaproteobacteria | 0.005263 | 0.010073 | 0.059140 | 0.002521 | 0.013209 | 0.083744 | 0.016540 | 4.422819e-02 | 0.003075 | 0.054723 | 0.019118 | 0.004724 | 0.047240 | 0.007020 | ||||||||||||
11 | order | Xanthomonadales | 0.009124 | 0.004681 | 0.001536 | 0.002540 | ||||||||||||||||||||||
12 | family | Rhodanobacteraceae | 0.004681 | 0.001536 | ||||||||||||||||||||||||
13 | genus | Rhodanobacter | 0.001536 | |||||||||||||||||||||||||
14 | genus | Rudaea | 0.004681 | |||||||||||||||||||||||||
15 | family | Xanthomonadaceae | 0.006836 | 0.002540 | ||||||||||||||||||||||||
16 | genus | Xanthomonas | 0.002270 | |||||||||||||||||||||||||
17 | genus | Pseudoxanthomonas | 0.002288 | |||||||||||||||||||||||||
18 | genus | Unclassified Xanthomonadaceae | 0.002279 | 0.002540 | ||||||||||||||||||||||||
19 | family | Unclassified Xanthomonadales | 0.002288 | |||||||||||||||||||||||||
20 | order | Cellvibrionales | 0.000788 | |||||||||||||||||||||||||
21 | family | Cellvibrionaceae | 0.000788 | |||||||||||||||||||||||||
22 | genus | Cellvibrio | 0.000788 | |||||||||||||||||||||||||
23 | order | Thiotrichales | 0.009748 | |||||||||||||||||||||||||
24 | family | Thiotrichaceae | 0.009748 | |||||||||||||||||||||||||
25 | genus | Thiothrix | 0.009748 | |||||||||||||||||||||||||
26 | order | Pseudomonadales | 0.029371 | 0.061642 | 4.422819e-02 | 0.027506 | 0.035562 | |||||||||||||||||||||
27 | family | Pseudomonadaceae | 0.026926 | 0.061642 | 4.422819e-02 | 0.023773 | 0.035562 | |||||||||||||||||||||
28 | genus | Pseudomonas | 0.016488 | 0.056768 | 2.948546e-02 | 0.021321 | 0.032088 | |||||||||||||||||||||
29 | species | Pseudomonas sp. M47T1 | 0.003494 | |||||||||||||||||||||||||
30 | species | Unclassified Pseudomonas | 0.016488 | 0.056768 | 2.948546e-02 | 0.021321 | 0.028594 | |||||||||||||||||||||
31 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 0.010439 | 0.004874 | 1.474273e-02 | 0.002452 | 0.003473 | |||||||||||||||||||||
32 | family | Unclassified Pseudomonadales | 0.002445 | 0.003734 | ||||||||||||||||||||||||
33 | order | Enterobacterales | 0.005263 | 0.003361 | 0.001190 | 0.002521 | 0.005688 | 0.003936 | 0.011345 | 0.014774 | 0.003936 | 0.003510 | ||||||||||||||||
34 | family | Erwiniaceae | 0.001260 | 0.002479 | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||
35 | genus | Pantoea | 0.001260 | |||||||||||||||||||||||||
36 | genus | Erwinia | 0.002479 | 0.001737 | ||||||||||||||||||||||||
37 | species | Erwinia billingiae | 0.002479 | 0.000868 | ||||||||||||||||||||||||
38 | species | Unclassified Erwinia | 0.000868 | |||||||||||||||||||||||||
39 | family | Yersiniaceae | 0.003361 | 0.000784 | 0.000784 | 0.000784 | ||||||||||||||||||||||
40 | genus | Rahnella | 0.003361 | |||||||||||||||||||||||||
41 | genus | Unclassified Yersiniaceae | 0.000784 | 0.000784 | 0.000784 | |||||||||||||||||||||||
42 | family | Unclassified Enterobacterales | 0.005263 | 0.001190 | 0.001260 | 0.005688 | 0.003151 | 0.008082 | 0.013038 | 0.003151 | 0.003510 | |||||||||||||||||
43 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 0.006712 | 0.018667 | 0.007521 | 0.007673 | 0.012605 | 0.001538 | 0.013332 | 0.004344 | 0.000789 | 0.011679 | 0.003510 | |||||||||||||||
44 | class | Alphaproteobacteria | 0.003439 | 0.241106 | 0.002958 | 0.001249 | 0.238816 | 0.277996 | 2.488759e-01 | 0.001055 | 0.249402 | 0.020565 | 0.216927 | 0.015116 | 0.003172 | 0.038444 | ||||||||||||
45 | order | Rhodospirillales | 0.002988 | 4.276337e-03 | 0.004730 | 0.001724 | ||||||||||||||||||||||
46 | family | Acetobacteraceae | 4.276337e-03 | 0.001724 | ||||||||||||||||||||||||
47 | genus | Roseomonas | 0.001724 | |||||||||||||||||||||||||
48 | genus | Unclassified Acetobacteraceae | 4.276337e-03 | |||||||||||||||||||||||||
49 | genus | Reyranella | 0.001494 | 0.001494 | ||||||||||||||||||||||||
50 | species | Reyranella massiliensis | 0.001494 | 0.001494 | ||||||||||||||||||||||||
51 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.001494 | 0.003236 | ||||||||||||||||||||||||
52 | order | Rhodobacterales | 0.001210 | 0.002958 | 0.001055 | 0.001273 | 0.008709 | |||||||||||||||||||||
53 | family | Rhodobacteraceae | 0.001210 | 0.002958 | 0.001055 | 0.001273 | 0.001744 | |||||||||||||||||||||
54 | genus | Paracoccus | 0.001210 | 0.002958 | 0.001055 | |||||||||||||||||||||||
55 | species | Paracoccus yeei | 0.001210 | 0.002958 | ||||||||||||||||||||||||
56 | species | Paracoccus denitrificans | 0.001055 | |||||||||||||||||||||||||
57 | genus | Unclassified Rhodobacteraceae | 0.001273 | 0.001744 | ||||||||||||||||||||||||
58 | family | Unclassified Rhodobacterales | 0.006965 | |||||||||||||||||||||||||
59 | order | Sphingomonadales | 0.172784 | 0.237920 | 0.175548 | 0.015653 | ||||||||||||||||||||||
60 | family | Sphingomonadaceae | 0.147110 | 0.225203 | 0.124438 | 0.012175 | ||||||||||||||||||||||
61 | genus | Sphingomonas | 0.069649 | 0.106471 | 0.057210 | |||||||||||||||||||||||
62 | species | Sphingomonas taxi | 0.001218 | |||||||||||||||||||||||||
63 | species | Sphingomonas panacis | 0.013451 | 0.057672 | 0.007468 | |||||||||||||||||||||||
64 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.054980 | 0.048799 | 0.049742 | |||||||||||||||||||||||
65 | genus | Sphingorhabdus | 0.001251 | |||||||||||||||||||||||||
66 | genus | Novosphingobium | 0.003243 | 0.008742 | 0.001246 | 0.001739 | ||||||||||||||||||||||
67 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.074218 | 0.109990 | 0.064731 | 0.010436 | ||||||||||||||||||||||
68 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.025675 | 0.012716 | 0.051110 | 0.003479 | ||||||||||||||||||||||
69 | order | Caulobacterales | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||
70 | family | Caulobacteraceae | 0.001269 | |||||||||||||||||||||||||
71 | order | Rhizobiales | 0.003439 | 0.025048 | 0.001249 | 0.075152 | 3.354286e-02 | 0.002554 | 0.011334 | 0.059074 | 0.011740 | 0.038444 | ||||||||||||||||
72 | family | Methylobacteriaceae | 0.002346 | 0.007168 | 7.167934e-03 | 0.004498 | 0.003327 | 0.001831 | ||||||||||||||||||||
73 | genus | Methylobacterium | 0.003449 | 3.448777e-03 | 0.004498 | 0.003327 | 0.001831 | |||||||||||||||||||||
74 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 0.002346 | 0.003719 | 3.719157e-03 | |||||||||||||||||||||||
75 | family | Methylocystaceae | 0.001555 | |||||||||||||||||||||||||
76 | genus | Methylocystis | 0.000778 | |||||||||||||||||||||||||
77 | genus | Unclassified Methylocystaceae | 0.000778 | |||||||||||||||||||||||||
78 | family | Xanthobacteraceae | 0.001167 | |||||||||||||||||||||||||
79 | genus | Starkeya | 0.001167 | |||||||||||||||||||||||||
80 | species | Starkeya novella | 0.001167 | |||||||||||||||||||||||||
81 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.008157 | 0.001249 | 0.011751 | 6.877553e-03 | 0.001273 | 0.004563 | 0.005218 | 0.001680 | 0.005497 | |||||||||||||||||
82 | genus | Rhodopseudomonas | 0.004874 | |||||||||||||||||||||||||
83 | species | Rhodopseudomonas palustris | 0.004874 | |||||||||||||||||||||||||
84 | genus | Bradyrhizobium | 0.001273 | 0.002290 | 0.001742 | 0.001680 | 0.005497 | |||||||||||||||||||||
85 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.008157 | 0.001249 | 0.006878 | 6.877553e-03 | 0.002272 | 0.003476 | ||||||||||||||||||||
86 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.002366 | 0.008182 | 0.003473 | 0.003644 | ||||||||||||||||||||||
87 | genus | Rhodoplanes | 0.001185 | |||||||||||||||||||||||||
88 | genus | Hyphomicrobium | 0.001181 | 0.004091 | ||||||||||||||||||||||||
89 | species | Hyphomicrobium sp. 99 | 0.001181 | |||||||||||||||||||||||||
90 | species | Unclassified Hyphomicrobium | 0.004091 | |||||||||||||||||||||||||
91 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 0.004091 | 0.003473 | 0.003644 | |||||||||||||||||||||||
92 | family | Beijerinckiaceae | 0.002367 | 0.001281 | 0.001856 | |||||||||||||||||||||||
93 | family | Bartonellaceae | 0.003439 | |||||||||||||||||||||||||
94 | genus | Bartonella | 0.003439 | |||||||||||||||||||||||||
95 | family | Rhizobiaceae | 0.043865 | 0.027793 | ||||||||||||||||||||||||
96 | genus | Ensifer | 0.001737 | |||||||||||||||||||||||||
97 | genus | Rhizobium | 0.009748 | |||||||||||||||||||||||||
98 | genus | Unclassified Rhizobiaceae | 0.034117 | 0.026056 | ||||||||||||||||||||||||
99 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.007087 | 0.004186 | 1.949737e-02 | 0.002272 | 0.022590 | 0.006733 | 0.025616 | |||||||||||||||||||
100 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 0.042063 | 0.160676 | 0.040076 | 2.110567e-01 | 0.068759 | 0.009232 | 0.128761 | 0.001652 | 0.003172 | |||||||||||||||||
101 | class | Betaproteobacteria | 0.004504 | 0.022638 | 0.034880 | 0.253227 | 0.005038 | 0.024447 | 0.003974 | 0.338198 | 0.465684 | 3.349385e-01 | 0.002031 | 0.344939 | 0.035773 | 0.011244 | 0.399513 | 0.029044 | 0.039195 | 0.020906 | ||||||||
102 | order | Neisseriales | 0.001166 | 0.032012 | ||||||||||||||||||||||||
103 | family | Chromobacteriaceae | 0.001166 | 0.018293 | ||||||||||||||||||||||||
104 | genus | Jeongeupia | 0.004573 | |||||||||||||||||||||||||
105 | genus | Unclassified Chromobacteriaceae | 0.001166 | 0.013719 | ||||||||||||||||||||||||
106 | family | Unclassified Neisseriales | 0.013719 | |||||||||||||||||||||||||
107 | order | Rhodocyclales | 0.014622 | |||||||||||||||||||||||||
108 | family | Zoogloeaceae | 0.009748 | |||||||||||||||||||||||||
109 | genus | Thauera | 0.009748 | |||||||||||||||||||||||||
110 | family | Unclassified Rhodocyclales | 0.004874 | |||||||||||||||||||||||||
111 | order | Nitrosomonadales | 0.005082 | 0.004944 | 0.002501 | |||||||||||||||||||||||
112 | family | Sterolibacteriaceae | 0.001161 | |||||||||||||||||||||||||
113 | family | Methylophilaceae | 0.003922 | 0.004944 | 0.002501 | |||||||||||||||||||||||
114 | genus | Methylotenera | 0.002323 | 0.001274 | ||||||||||||||||||||||||
115 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 0.001598 | 0.004944 | 0.001227 | |||||||||||||||||||||||
116 | order | Burkholderiales | 0.004504 | 0.018907 | 0.010377 | 0.174827 | 0.005038 | 0.007537 | 0.211887 | 0.333194 | 1.958710e-01 | 0.240704 | 0.006889 | 0.011244 | 0.279584 | 0.029044 | 0.039195 | 0.010448 | ||||||||||
117 | family | Burkholderiaceae | 0.004504 | 0.007583 | 0.006918 | 0.085351 | 0.001258 | 0.003772 | 0.087729 | 0.135099 | 9.337062e-02 | 0.043687 | 0.001754 | 0.002264 | 0.081894 | 0.029044 | 0.026141 | 0.003489 | ||||||||||
118 | genus | Cupriavidus | 0.004874 | 0.024823 | 0.001228 | |||||||||||||||||||||||
119 | genus | Paraburkholderia | 0.003731 | 0.003152 | 0.001285 | |||||||||||||||||||||||
120 | species | Paraburkholderia caribensis | 0.002369 | |||||||||||||||||||||||||
121 | species | Unclassified Paraburkholderia | 0.003731 | 0.000783 | 0.001285 | |||||||||||||||||||||||
122 | genus | Burkholderia | 0.008573 | 0.004339 | 0.021783 | |||||||||||||||||||||||
123 | genus | Polynucleobacter | 0.001744 | |||||||||||||||||||||||||
124 | genus | Ralstonia | 0.001156 | 0.004874 | 0.008873 | |||||||||||||||||||||||
125 | species | Ralstonia insidiosa | 0.004874 | |||||||||||||||||||||||||
126 | species | Unclassified Ralstonia | 0.001156 | 0.008873 | ||||||||||||||||||||||||
127 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 0.004504 | 0.003852 | 0.006918 | 0.072470 | 0.001258 | 0.003772 | 0.077982 | 0.097064 | 9.337062e-02 | 0.041174 | 0.001754 | 0.002264 | 0.080149 | 0.007261 | 0.026141 | 0.003489 | ||||||||||
128 | genus | Methylibium | 0.004834 | |||||||||||||||||||||||||
129 | family | Alcaligenaceae | 0.004012 | 0.002286 | ||||||||||||||||||||||||
130 | genus | Orrella | 0.001605 | |||||||||||||||||||||||||
131 | genus | Unclassified Alcaligenaceae | 0.002407 | 0.002286 | ||||||||||||||||||||||||
132 | family | Oxalobacteraceae | 0.009327 | 0.039256 | 0.008617 | 3.439970e-02 | 0.013657 | 0.002260 | 0.067994 | |||||||||||||||||||
133 | genus | Janthinobacterium | 0.001173 | 0.012213 | 0.005241 | |||||||||||||||||||||||
134 | genus | Herminiimonas | 0.001243 | |||||||||||||||||||||||||
135 | genus | Duganella | 0.004609 | |||||||||||||||||||||||||
136 | genus | Herbaspirillum | 0.001161 | |||||||||||||||||||||||||
137 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 0.006993 | 0.022435 | 0.008617 | 3.439970e-02 | 0.012414 | 0.002260 | 0.062754 | |||||||||||||||||||
138 | family | Comamonadaceae | 0.003334 | 0.009748 | 0.004863 | 4.914243e-03 | 0.013639 | 0.001732 | 0.003469 | |||||||||||||||||||
139 | genus | Rhodoferax | 0.002487 | 0.001732 | ||||||||||||||||||||||||
140 | species | Rhodoferax koreense | 0.001732 | |||||||||||||||||||||||||
141 | species | Unclassified Rhodoferax | 0.002487 | |||||||||||||||||||||||||
142 | genus | Variovorax | 0.002483 | |||||||||||||||||||||||||
143 | genus | Polaromonas | 0.004874 | |||||||||||||||||||||||||
144 | species | Polaromonas sp. CF318 | 0.004874 | |||||||||||||||||||||||||
145 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 0.003334 | 0.004874 | 0.004863 | 4.914243e-03 | 0.008669 | 0.003469 | ||||||||||||||||||||
146 | family | Unclassified Burkholderiales | 0.011324 | 0.003459 | 0.072802 | 0.003780 | 0.003766 | 0.070320 | 0.184615 | 6.318645e-02 | 0.169720 | 0.005135 | 0.004435 | 0.127964 | 0.013054 | 0.003489 | ||||||||||||
147 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.003731 | 0.024503 | 0.072151 | 0.016910 | 0.003974 | 0.111690 | 0.095534 | 1.390675e-01 | 0.002031 | 0.101735 | 0.028884 | 0.119929 | 0.010458 | |||||||||||||
148 | class | Deltaproteobacteria | 0.019449 | 1.944911e-02 | 0.003468 | |||||||||||||||||||||||
149 | order | Myxococcales | 0.009786 | 9.786259e-03 | 0.001734 | |||||||||||||||||||||||
150 | order | Unclassified Deltaproteobacteria | 0.009663 | 9.662849e-03 | 0.001734 | |||||||||||||||||||||||
151 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.014811 | 0.272205 | 0.016336 | 0.035778 | 0.001500 | 0.001987 | 0.396433 | 0.130810 | 2.491273e-01 | 0.001666 | 0.010287 | 0.378301 | 0.019200 | 0.008414 | 0.001331 | 0.533805 | 0.011729 | 0.004346 | 0.003489 | |||||||
152 | phylum | Firmicutes | 1.965697e-02 | 0.013861 | ||||||||||||||||||||||||
153 | class | Clostridia | 1.965697e-02 | |||||||||||||||||||||||||
154 | order | Clostridiales | 1.474273e-02 | |||||||||||||||||||||||||
155 | family | Ruminococcaceae | 4.914243e-03 | |||||||||||||||||||||||||
156 | family | Unclassified Clostridiales | 9.828487e-03 | |||||||||||||||||||||||||
157 | order | Unclassified Clostridia | 4.914243e-03 | |||||||||||||||||||||||||
158 | class | Bacilli | 0.010405 | |||||||||||||||||||||||||
159 | order | Bacillales | 0.006937 | |||||||||||||||||||||||||
160 | order | Unclassified Bacilli | 0.003468 | |||||||||||||||||||||||||
161 | class | Unclassified Firmicutes | 0.003456 | |||||||||||||||||||||||||
162 | phylum | Deinococcus-Thermus | 0.002450 | |||||||||||||||||||||||||
163 | class | Deinococci | 0.001214 | |||||||||||||||||||||||||
164 | class | Unclassified Deinococcus-Thermus | 0.001236 | |||||||||||||||||||||||||
165 | phylum | Chloroflexi | 0.017311 | |||||||||||||||||||||||||
166 | class | Ktedonobacteria | 0.003453 | |||||||||||||||||||||||||
167 | order | Ktedonobacterales | 0.003453 | |||||||||||||||||||||||||
168 | family | Ktedonobacteraceae | 0.001727 | |||||||||||||||||||||||||
169 | family | Unclassified Ktedonobacterales | 0.001727 | |||||||||||||||||||||||||
170 | class | Caldilineae | 0.005203 | |||||||||||||||||||||||||
171 | order | Caldilineales | 0.001734 | |||||||||||||||||||||||||
172 | family | Caldilineaceae | 0.001734 | |||||||||||||||||||||||||
173 | order | Unclassified Caldilineae | 0.003468 | |||||||||||||||||||||||||
174 | class | Unclassified Chloroflexi | 0.008656 | |||||||||||||||||||||||||
175 | phylum | Actinobacteria | 0.046034 | 0.043890 | 0.050293 | 2.457122e-02 | 0.067299 | 0.001845 | 0.002662 | 0.046483 | ||||||||||||||||||
176 | class | Actinobacteria | 0.034348 | 0.035010 | 0.040934 | 2.457122e-02 | 0.049158 | 0.001845 | 0.001328 | 0.036293 | ||||||||||||||||||
177 | order | Micrococcales | 0.001445 | 0.012922 | 2.457122e-02 | 0.012188 | 0.003491 | |||||||||||||||||||||
178 | family | Micrococcaceae | 0.001445 | |||||||||||||||||||||||||
179 | genus | Glutamicibacter | 0.001445 | |||||||||||||||||||||||||
180 | family | Microbacteriaceae | 0.008615 | 2.457122e-02 | 0.002326 | 0.001747 | ||||||||||||||||||||||
181 | genus | Agromyces | 0.001208 | |||||||||||||||||||||||||
182 | genus | Frondihabitans | 0.008615 | 1.965697e-02 | ||||||||||||||||||||||||
183 | genus | Unclassified Microbacteriaceae | 4.914243e-03 | 0.001118 | 0.001747 | |||||||||||||||||||||||
184 | family | Unclassified Micrococcales | 0.004307 | 0.009862 | 0.001744 | |||||||||||||||||||||||
185 | order | Corynebacteriales | 0.013903 | 0.012945 | 0.003728 | 0.003458 | ||||||||||||||||||||||
186 | family | Mycobacteriaceae | 0.003466 | 0.008255 | 0.002460 | |||||||||||||||||||||||
187 | genus | Mycobacterium | 0.001266 | |||||||||||||||||||||||||
188 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 0.003466 | 0.008255 | 0.001194 | |||||||||||||||||||||||
189 | family | Nocardiaceae | 0.004818 | |||||||||||||||||||||||||
190 | family | Gordoniaceae | 0.000799 | |||||||||||||||||||||||||
191 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.004820 | 0.004690 | 0.001267 | 0.003458 | ||||||||||||||||||||||
192 | order | Propionibacteriales | 0.004538 | |||||||||||||||||||||||||
193 | family | Nocardioidaceae | 0.004538 | |||||||||||||||||||||||||
194 | order | Pseudonocardiales | 0.001500 | |||||||||||||||||||||||||
195 | order | Streptomycetales | 0.000807 | |||||||||||||||||||||||||
196 | family | Streptomycetaceae | 0.000807 | |||||||||||||||||||||||||
197 | genus | Streptomyces | 0.000807 | |||||||||||||||||||||||||
198 | order | Unclassified Actinobacteria | 0.016694 | 0.022088 | 0.023451 | 0.033243 | 0.001845 | 0.001328 | 0.029344 | |||||||||||||||||||
199 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.011686 | 0.008881 | 0.009360 | 0.018141 | 0.001334 | 0.010189 | ||||||||||||||||||||
200 | phylum | Planctomycetes | 0.001434 | 0.007314 | 0.009659 | 3.215045e-03 | 0.014004 | 0.007952 | 0.010545 | |||||||||||||||||||
201 | class | Planctomycetia | 0.001434 | 0.004290 | 0.004290 | 0.004664 | 0.003658 | |||||||||||||||||||||
202 | order | Planctomycetales | 0.001434 | 0.002159 | 0.002159 | 0.003109 | 0.003658 | |||||||||||||||||||||
203 | family | Planctomycetaceae | 0.001079 | 0.001079 | ||||||||||||||||||||||||
204 | genus | Gimesia | 0.001079 | 0.001079 | ||||||||||||||||||||||||
205 | family | Isosphaeraceae | 0.001555 | |||||||||||||||||||||||||
206 | family | Unclassified Planctomycetales | 0.001434 | 0.001079 | 0.001079 | 0.001555 | 0.003658 | |||||||||||||||||||||
207 | order | Unclassified Planctomycetia | 0.002131 | 0.002131 | 0.001555 | |||||||||||||||||||||||
208 | class | Phycisphaerae | 0.005062 | |||||||||||||||||||||||||
209 | order | Phycisphaerales | 0.005062 | |||||||||||||||||||||||||
210 | family | Phycisphaeraceae | 0.005062 | |||||||||||||||||||||||||
211 | class | Unclassified Planctomycetes | 0.007314 | 0.005369 | 3.215045e-03 | 0.009714 | 0.003288 | 0.001825 | ||||||||||||||||||||
212 | phylum | Spirochaetes | 0.001249 | |||||||||||||||||||||||||
213 | phylum | Lentisphaerae | 0.012499 | |||||||||||||||||||||||||
214 | phylum | Acidobacteria | 0.073151 | 0.131851 | 0.079211 | |||||||||||||||||||||||
215 | class | Acidobacteriia | 0.067630 | 0.086804 | 0.075855 | |||||||||||||||||||||||
216 | order | Acidobacteriales | 0.063405 | 0.083463 | 0.075855 | |||||||||||||||||||||||
217 | family | Acidobacteriaceae | 0.063405 | 0.075138 | 0.063985 | |||||||||||||||||||||||
218 | genus | Terriglobus | 0.006969 | 0.001666 | ||||||||||||||||||||||||
219 | species | Terriglobus roseus | 0.001394 | |||||||||||||||||||||||||
220 | species | Unclassified Terriglobus | 0.005575 | 0.001666 | ||||||||||||||||||||||||
221 | genus | Granulicella | 0.037073 | 0.043425 | 0.025166 | |||||||||||||||||||||||
222 | species | Granulicella mallensis | 0.005479 | |||||||||||||||||||||||||
223 | species | Unclassified Granulicella | 0.031594 | 0.043425 | 0.025166 | |||||||||||||||||||||||
224 | genus | Unclassified Acidobacteriaceae | 0.019363 | 0.030046 | 0.038819 | |||||||||||||||||||||||
225 | family | Unclassified Acidobacteriales | 0.008325 | 0.011870 | ||||||||||||||||||||||||
226 | order | Unclassified Acidobacteriia | 0.004225 | 0.003341 | ||||||||||||||||||||||||
227 | class | Unclassified Acidobacteria | 0.005521 | 0.045047 | 0.003356 | |||||||||||||||||||||||
228 | phylum | Armatimonadetes | 0.004246 | 0.001280 | ||||||||||||||||||||||||
229 | class | Chthonomonadetes | 0.004246 | |||||||||||||||||||||||||
230 | class | Unclassified Armatimonadetes | 0.001280 | |||||||||||||||||||||||||
231 | phylum | Verrucomicrobia | 0.001384 | 0.004283 | 0.003414 | 0.008421 | 0.004899 | |||||||||||||||||||||
232 | class | Spartobacteria | 0.004283 | |||||||||||||||||||||||||
233 | order | Chthoniobacterales | 0.004283 | |||||||||||||||||||||||||
234 | family | Chthoniobacteraceae | 0.004283 | |||||||||||||||||||||||||
235 | genus | Chthoniobacter | 0.004283 | |||||||||||||||||||||||||
236 | class | Verrucomicrobiae | 0.001687 | |||||||||||||||||||||||||
237 | order | Verrucomicrobiales | 0.001687 | |||||||||||||||||||||||||
238 | family | Verrucomicrobia subdivision 3 | 0.001687 | |||||||||||||||||||||||||
239 | genus | Pedosphaera | 0.001687 | |||||||||||||||||||||||||
240 | class | Opitutae | 0.003212 | |||||||||||||||||||||||||
241 | order | Opitutales | 0.003212 | |||||||||||||||||||||||||
242 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 0.001384 | 0.003414 | 0.008421 | |||||||||||||||||||||||
243 | phylum | Bacteroidetes | 0.044687 | 0.001356 | 0.016272 | 0.012926 | 1.798414e-02 | 0.001509 | 0.038852 | 0.067150 | 0.005911 | |||||||||||||||||
244 | order | Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.005911 | |||||||||||||||||||||||||
245 | family | Rhodothermaceae | 0.005911 | |||||||||||||||||||||||||
246 | genus | Rhodothermus | 0.003731 | |||||||||||||||||||||||||
247 | genus | Unclassified Rhodothermaceae | 0.002181 | |||||||||||||||||||||||||
248 | class | Flavobacteriia | 0.007386 | 0.008748 | 0.017291 | |||||||||||||||||||||||
249 | order | Flavobacteriales | 0.007386 | 0.008748 | 0.013833 | |||||||||||||||||||||||
250 | family | Flavobacteriaceae | 0.007386 | 0.008748 | 0.003458 | |||||||||||||||||||||||
251 | genus | Flavobacterium | 0.007386 | 0.008748 | ||||||||||||||||||||||||
252 | species | Flavobacterium gilvum | 0.001251 | |||||||||||||||||||||||||
253 | species | Unclassified Flavobacterium | 0.007386 | 0.007497 | ||||||||||||||||||||||||
254 | genus | Unclassified Flavobacteriaceae | 0.003458 | |||||||||||||||||||||||||
255 | family | Unclassified Flavobacteriales | 0.010375 | |||||||||||||||||||||||||
256 | order | Unclassified Flavobacteriia | 0.003458 | |||||||||||||||||||||||||
257 | class | Sphingobacteriia | 0.013838 | 0.004099 | 0.004307 | 0.015075 | 0.008442 | |||||||||||||||||||||
258 | order | Sphingobacteriales | 0.012917 | 0.004099 | 0.010047 | 0.008442 | ||||||||||||||||||||||
259 | family | Sphingobacteriaceae | 0.011071 | 0.004099 | 0.010047 | 0.006814 | ||||||||||||||||||||||
260 | genus | Mucilaginibacter | 0.001844 | 0.004099 | 0.005027 | 0.003458 | ||||||||||||||||||||||
261 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 0.009227 | 0.005019 | 0.003356 | |||||||||||||||||||||||
262 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.001845 | 0.001627 | ||||||||||||||||||||||||
263 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.000922 | 0.004307 | 0.005029 | |||||||||||||||||||||||
264 | class | Chitinophagia | 0.000917 | 0.001509 | 0.002496 | |||||||||||||||||||||||
265 | order | Chitinophagales | 0.000917 | 0.001509 | 0.002496 | |||||||||||||||||||||||
266 | family | Chitinophagaceae | 0.000917 | 0.001509 | ||||||||||||||||||||||||
267 | genus | Flavisolibacter | 0.001509 | |||||||||||||||||||||||||
268 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 0.000917 | |||||||||||||||||||||||||
269 | family | Unclassified Chitinophagales | 0.002496 | |||||||||||||||||||||||||
270 | class | Cytophagia | 0.000920 | 0.004403 | 0.008666 | |||||||||||||||||||||||
271 | order | Cytophagales | 0.000920 | 0.004403 | 0.008666 | |||||||||||||||||||||||
272 | family | Cytophagaceae | 0.000920 | 0.004403 | ||||||||||||||||||||||||
273 | genus | Spirosoma | 0.004403 | |||||||||||||||||||||||||
274 | genus | Cytophaga | 0.000920 | |||||||||||||||||||||||||
275 | species | Cytophaga aurantiaca | 0.000920 | |||||||||||||||||||||||||
276 | family | Unclassified Cytophagales | 0.008666 | |||||||||||||||||||||||||
277 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.021626 | 0.001356 | 0.012173 | 0.004216 | 1.798414e-02 | 0.012533 | 0.032751 | |||||||||||||||||||
278 | phylum | Unclassified Bacteria | 0.278348 | 0.004444 | 0.445624 | 0.057356 | 4.118763e-01 | 0.007004 | 0.202109 | 0.002897 | 0.001352 | 0.981535 | 0.099029 | 0.025912 | ||||||||||||||
279 | superkingdom | Archaea | 0.001742 | |||||||||||||||||||||||||
280 | phylum | Euryarchaeota | 0.001742 | |||||||||||||||||||||||||
281 | class | Halobacteria | 0.001742 | |||||||||||||||||||||||||
282 | superkingdom | Unclassified | 0.009374 | 2.220446e-16 | 0.012433 |
Function | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average | Description |
---|---|---|---|---|
NapA | 0.02048 | 12 | 89.56 | Periplasmic nitrate reductase precursor (EC 1.7.99.4) |
NapD | 0.01449 | 2 | 81.60 | Periplasmic nitrate reductase component NapD |
NapE | 0.00978 | 1 | 77.50 | Periplasmic nitrate reductase component NapE |
NapF | 0.01179 | 2 | 71.80 | Ferredoxin-type protein NapF (periplasmic nitrate reductase) |
NarG_NxrA | 0.02594 | 22 | 93.53 | narG, narZ, nxrA; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, alpha subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarH_NxrB | 0.03933 | 15 | 85.10 | narH, narY, nxrB; nitrate reductase / nitrite oxidoreductase, beta subunit [EC:1.7.5.1 1.7.99.-] |
NarI | 0.05300 | 11 | 86.46 | Respiratory nitrate reductase gamma chain (EC 1.7.99.4) |
NarJ | 0.04299 | 9 | 81.49 | narJ, narW; nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone NarJ/NarW |
NasA | 2.09904 | 1520 | 80.03 | Assimilatory nitrate reductase large subunit (EC:1.7.99.4) |
NasB | 0.44008 | 152 | 75.50 | nasB; assimilatory nitrate reductase NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NifB | 0.00757 | 3 | 98.07 | nifB; nitrogen fixation protein NifB |
NifD_AnfD_VnfD | 0.00264 | 1 | 100.00 | Nitrogenase alpha chain (EC 1.18.6.1) NifD/AnfD/VnfD |
NifH_AnfH_VnfH | 0.01199 | 3 | 100.00 | Nitrogenase reductase and maturation protein NifH/AnfH/VnfH |
NifK_AnfK_VnfK | 0.00515 | 2 | 97.85 | Nitrogenase beta chain (EC 1.18.6.1) NifK/AnfK/VnfK |
NirA | 0.58682 | 257 | 75.71 | nirA; ferredoxin-nitrite reductase [EC:1.7.7.1] |
NirB | 1.91215 | 1130 | 85.45 | nirB; nitrite reductase (NADH) large subunit [EC:1.7.1.15] |
NirD | 1.46719 | 228 | 77.70 | nirD; nitrite reductase (NADH) small subunit [EC:1.7.1.15] |
NirK | 0.02523 | 9 | 71.26 | nirK; nitrite reductase (NO-forming) [EC:1.7.2.1] |
NirN | 0.00794 | 3 | 62.50 | Nitrite reductase associated c-type cytochorome NirN |
NirU | 0.43522 | 176 | 77.01 | assimilatory nitrite reductase, putative NADH oxidase subunit [EC:1.7.99.-] |
NosZ | 0.00773 | 4 | 86.22 | nosZ; nitrous-oxide reductase [EC:1.7.2.4] |
NrfA | 0.00273 | 1 | 94.00 | nrfA; nitrite reductase (cytochrome c-552) [EC:1.7.2.2] |
UreA | 1.82077 | 296 | 87.95 | ureA; urease subunit gamma [EC:3.5.1.5] |
UreB | 2.17945 | 338 | 82.76 | ureB; urease subunit beta [EC:3.5.1.5] |
UreC | 3.24362 | 1371 | 90.13 | ureC; urease subunit alpha [EC:3.5.1.5] |
cNor-C | 0.00473 | 1 | 51.40 | Nitric-oxide reductase subunit C (EC 1.7.99.7) |
cNorB_qNor | 0.00181 | 1 | 66.00 | Nitric-oxide reductase (EC 1.7.99.7) |
Function category | efpkg | Raw sequence count | Amino acid identity %, average |
---|---|---|---|
Ammonification | 0.00273 | 1 | 94.00 |
Denitrification | 0.04744 | 18 | 71.73 |
Nitrate assimilatory reduction | 2.53912 | 1672 | 79.62 |
Nitrate dissimilatory reduction | 0.21781 | 74 | 87.54 |
Nitrite assimilation | 4.40138 | 1791 | 82.24 |
Nitrogen fixation | 0.02736 | 9 | 98.88 |
Urease | 7.24385 | 2005 | 88.57 |
NapD | NarJ | NasA | NifH_AnfH_VnfH | NapA | NarH_NxrB | NifK_AnfK_VnfK | NirN | NifD_AnfD_VnfD | UreB | NapF | NirD | UreA | NirK | cNor-C | NosZ | NirB | NasB | NarG_NxrA | cNorB_qNor | UreC | NirA | NapE | NrfA | NarI | NifB | NirU | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rank | Taxon name | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | efpkg | |
1 | norank | root | 0.014489 | 0.042995 | 2.099036 | 0.011995 | 0.020476 | 0.039327 | 0.005150 | 0.007936 | 0.002641 | 2.179454 | 0.011793 | 1.467193e+00 | 1.820773 | 0.025233 | 0.004728 | 0.007731 | 1.912145 | 0.440082 | 0.025941 | 0.001812 | 3.243621 | 0.586820 | 0.009782 | 0.002727 | 0.053003 | 0.007570 | 0.435221 |
2 | norank | Unknown | 0.003329 | 0.032591 | 0.022683 | 0.030764 | |||||||||||||||||||||||
3 | superkingdom | Bacteria | 0.014489 | 0.042995 | 2.099036 | 0.011995 | 0.020476 | 0.035999 | 0.005150 | 0.007936 | 0.002641 | 2.114645 | 0.011793 | 1.459473e+00 | 1.798090 | 0.025233 | 0.004728 | 0.007731 | 1.912145 | 0.440082 | 0.025941 | 0.001812 | 3.205715 | 0.586820 | 0.009782 | 0.002727 | 0.053003 | 0.007570 | 0.435221 |
4 | phylum | Cyanobacteria | 0.006523 | 1.433218e-02 | 0.001705 | 0.004686 | |||||||||||||||||||||||
5 | order | Oscillatoriales | 0.002343 | ||||||||||||||||||||||||||
6 | family | Oscillatoriaceae | 0.002343 | ||||||||||||||||||||||||||
7 | order | Synechococcales | 0.006523 | 1.433218e-02 | |||||||||||||||||||||||||
8 | family | Chamaesiphonaceae | 0.006523 | 1.433218e-02 | |||||||||||||||||||||||||
9 | genus | Chamaesiphon | 7.166088e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
10 | genus | Unclassified Chamaesiphonaceae | 0.006523 | 7.166088e-03 | |||||||||||||||||||||||||
11 | class | Unclassified Cyanobacteria | 0.001705 | 0.002343 | |||||||||||||||||||||||||
12 | phylum | Proteobacteria | 0.014489 | 0.042995 | 1.281543 | 0.003985 | 0.020476 | 0.033413 | 0.005150 | 0.007936 | 1.309355 | 0.011793 | 8.979162e-01 | 1.026352 | 0.013161 | 0.004728 | 0.005690 | 1.128132 | 0.401103 | 0.025941 | 1.607337 | 0.204823 | 0.009782 | 0.053003 | 0.007570 | 0.194771 | |||
13 | class | Gammaproteobacteria | 0.013895 | 0.103581 | 0.001713 | 0.005098 | 0.100937 | 5.995643e-02 | 0.068326 | 0.069695 | 0.017243 | 0.005890 | 0.103298 | ||||||||||||||||
14 | order | Chromatiales | 0.001596 | 0.007297 | 0.005138 | ||||||||||||||||||||||||
15 | family | Ectothiorhodospiraceae | 0.001596 | 0.001716 | |||||||||||||||||||||||||
16 | family | Unclassified Chromatiales | 0.007297 | 0.003422 | |||||||||||||||||||||||||
17 | order | Xanthomonadales | 0.009616 | 0.011889 | |||||||||||||||||||||||||
18 | family | Rhodanobacteraceae | 0.004842 | 0.011889 | |||||||||||||||||||||||||
19 | genus | Frateuria | 0.011889 | ||||||||||||||||||||||||||
20 | species | Frateuria aurantia | 0.002378 | ||||||||||||||||||||||||||
21 | species | Unclassified Frateuria | 0.009511 | ||||||||||||||||||||||||||
22 | genus | Rhodanobacter | 0.001614 | ||||||||||||||||||||||||||
23 | genus | Unclassified Rhodanobacteraceae | 0.003228 | ||||||||||||||||||||||||||
24 | family | Xanthomonadaceae | 0.004774 | ||||||||||||||||||||||||||
25 | genus | Lysobacter | 0.001591 | ||||||||||||||||||||||||||
26 | genus | Unclassified Xanthomonadaceae | 0.003183 | ||||||||||||||||||||||||||
27 | order | Methylococcales | 0.002667 | 0.001680 | |||||||||||||||||||||||||
28 | family | Methylococcaceae | 0.002667 | ||||||||||||||||||||||||||
29 | genus | Methylomonas | 0.001601 | ||||||||||||||||||||||||||
30 | genus | Unclassified Methylococcaceae | 0.001066 | ||||||||||||||||||||||||||
31 | family | Unclassified Methylococcales | 0.001680 | ||||||||||||||||||||||||||
32 | order | Oceanospirillales | 0.006218 | ||||||||||||||||||||||||||
33 | order | Vibrionales | 0.001595 | ||||||||||||||||||||||||||
34 | family | Vibrionaceae | 0.001595 | ||||||||||||||||||||||||||
35 | genus | Enterovibrio | 0.001595 | ||||||||||||||||||||||||||
36 | order | Nevskiales | 0.007538 | 0.001664 | |||||||||||||||||||||||||
37 | family | Sinobacteraceae | 0.007538 | 0.001664 | |||||||||||||||||||||||||
38 | order | Pseudomonadales | 0.037424 | 0.064847 | 2.386363e-02 | 0.047371 | 0.026839 | 0.005602 | 0.061737 | ||||||||||||||||||||
39 | family | Pseudomonadaceae | 0.030670 | 0.064847 | 1.426847e-02 | 0.047371 | 0.023500 | 0.003109 | 0.061737 | ||||||||||||||||||||
40 | genus | Pseudomonas | 0.016048 | 0.057126 | 7.166088e-03 | 0.034129 | 0.016755 | 0.003109 | 0.033324 | ||||||||||||||||||||
41 | genus | Unclassified Pseudomonadaceae | 0.014621 | 0.007720 | 7.102379e-03 | 0.013241 | 0.006745 | 0.028412 | |||||||||||||||||||||
42 | family | Moraxellaceae | 2.492784e-03 | 0.002493 | |||||||||||||||||||||||||
43 | family | Unclassified Pseudomonadales | 0.006755 | 7.102379e-03 | 0.003339 | ||||||||||||||||||||||||
44 | order | Enterobacterales | 0.013895 | 0.010949 | 0.001713 | 0.002505 | 4.276690e-03 | 0.008391 | 0.004277 | 0.004713 | |||||||||||||||||||
45 | family | Erwiniaceae | 1.061678e-03 | 0.004386 | 0.001062 | ||||||||||||||||||||||||
46 | genus | Pantoea | 0.001640 | ||||||||||||||||||||||||||
47 | genus | Erwinia | 0.001684 | ||||||||||||||||||||||||||
48 | species | Erwinia billingiae | 0.001684 | ||||||||||||||||||||||||||
49 | genus | Unclassified Erwiniaceae | 1.061678e-03 | 0.001062 | 0.001062 | ||||||||||||||||||||||||
50 | family | Pectobacteriaceae | 0.007716 | ||||||||||||||||||||||||||
51 | genus | Brenneria | 0.005542 | ||||||||||||||||||||||||||
52 | genus | Unclassified Pectobacteriaceae | 0.002174 | ||||||||||||||||||||||||||
53 | family | Yersiniaceae | 0.001606 | ||||||||||||||||||||||||||
54 | genus | Rahnella | 0.001606 | ||||||||||||||||||||||||||
55 | family | Unclassified Enterobacterales | 0.013895 | 0.001627 | 0.001713 | 0.002505 | 3.215013e-03 | 0.004005 | 0.003215 | 0.004713 | |||||||||||||||||||
56 | order | Unclassified Gammaproteobacteria | 0.039733 | 0.002594 | 0.022335 | 3.181611e-02 | 0.013658 | 0.025982 | 0.007365 | 0.001177 | 0.029673 | ||||||||||||||||||
57 | class | Alphaproteobacteria | 0.004887 | 0.332251 | 0.003985 | 0.001707 | 0.002624 | 0.002561 | 0.434810 | 0.011793 | 3.925924e-01 | 0.443515 | 0.007757 | 0.004258 | 0.324285 | 0.179351 | 0.001182 | 0.472721 | 0.159636 | 0.182287 | |||||||||
58 | order | Rhodospirillales | 0.013787 | 0.006945 | 0.007123 | 0.007049 | 0.024766 | ||||||||||||||||||||||
59 | family | Acetobacteraceae | 0.013787 | 0.003477 | 0.004749 | 0.007049 | 0.007444 | ||||||||||||||||||||||
60 | genus | Roseomonas | 0.007049 | ||||||||||||||||||||||||||
61 | genus | Saccharibacter | 0.002374 | ||||||||||||||||||||||||||
62 | genus | Acidiphilium | 0.003477 | ||||||||||||||||||||||||||
63 | genus | Unclassified Acetobacteraceae | 0.013787 | 0.002374 | 0.007444 | ||||||||||||||||||||||||
64 | family | Unclassified Rhodospirillales | 0.003468 | 0.002374 | 0.017322 | ||||||||||||||||||||||||
65 | order | Rhodobacterales | 0.004887 | 0.006566 | 0.004707 | ||||||||||||||||||||||||
66 | family | Rhodobacteraceae | 0.004887 | 0.006566 | 0.002336 | ||||||||||||||||||||||||
67 | family | Unclassified Rhodobacterales | 0.002371 | ||||||||||||||||||||||||||
68 | order | Sphingomonadales | 0.086777 | 3.272017e-01 | 0.007757 | 0.184037 | 0.011854 | ||||||||||||||||||||||
69 | family | Sphingomonadaceae | 0.070817 | 2.909515e-01 | 0.007757 | 0.116631 | 0.007112 | ||||||||||||||||||||||
70 | genus | Sphingomonas | 0.013281 | 2.199142e-02 | 0.006765 | ||||||||||||||||||||||||
71 | species | Sphingomonas panacis | 0.001661 | 7.330474e-03 | 0.001691 | ||||||||||||||||||||||||
72 | species | Unclassified Sphingomonas | 0.011620 | 1.466095e-02 | 0.005074 | ||||||||||||||||||||||||
73 | genus | Sphingorhabdus | 1.459399e-02 | 0.001700 | |||||||||||||||||||||||||
74 | genus | Blastomonas | 7.364260e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
75 | genus | Sphingobium | 7.039794e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
76 | genus | Novosphingobium | 0.003270 | 5.821010e-02 | 0.018388 | ||||||||||||||||||||||||
77 | species | Novosphingobium nitrogenifigens | 0.002180 | ||||||||||||||||||||||||||
78 | species | Unclassified Novosphingobium | 0.001090 | 5.821010e-02 | 0.018388 | ||||||||||||||||||||||||
79 | genus | Sphingopyxis | 0.001647 | ||||||||||||||||||||||||||
80 | genus | Unclassified Sphingomonadaceae | 0.052619 | 1.817519e-01 | 0.007757 | 0.089778 | 0.007112 | ||||||||||||||||||||||
81 | family | Unclassified Sphingomonadales | 0.015960 | 3.625018e-02 | 0.067405 | 0.004741 | |||||||||||||||||||||||
82 | order | Caulobacterales | 0.012783 | 1.383433e-02 | 0.020707 | ||||||||||||||||||||||||
83 | family | Caulobacteraceae | 0.011161 | 1.383433e-02 | 0.013799 | ||||||||||||||||||||||||
84 | genus | Caulobacter | 0.003191 | ||||||||||||||||||||||||||
85 | genus | Unclassified Caulobacteraceae | 0.007970 | 1.383433e-02 | 0.013799 | ||||||||||||||||||||||||
86 | family | Unclassified Caulobacterales | 0.001622 | 0.006908 | |||||||||||||||||||||||||
87 | order | Rhizobiales | 0.128914 | 0.002561 | 0.173455 | 0.011793 | 1.493503e-02 | 0.106115 | 0.002119 | 0.008673 | 0.154181 | 0.205889 | 0.139412 | 0.157522 | |||||||||||||||
88 | family | Methylobacteriaceae | 0.001598 | 0.043185 | 0.043185 | 0.014203 | 0.002279 | ||||||||||||||||||||||
89 | genus | Methylobacterium | 0.001598 | 0.009512 | 0.009512 | 0.004734 | 0.002279 | ||||||||||||||||||||||
90 | genus | Unclassified Methylobacteriaceae | 0.033673 | 0.033673 | 0.009469 | ||||||||||||||||||||||||
91 | family | Chelatococcaceae | 0.011793 | ||||||||||||||||||||||||||
92 | genus | Chelatococcus | 0.011793 | ||||||||||||||||||||||||||
93 | family | Aurantimonadaceae | 0.001167 | ||||||||||||||||||||||||||
94 | genus | Martelella | 0.001167 | ||||||||||||||||||||||||||
95 | family | Bradyrhizobiaceae | 0.054057 | 0.002561 | 0.040167 | 0.037845 | 0.002119 | 0.056506 | 0.061502 | 0.059198 | 0.067387 | ||||||||||||||||||
96 | genus | Bradyrhizobium | 0.009554 | 0.002561 | 0.004742 | 0.004742 | 0.012530 | 0.002374 | 0.034209 | 0.014976 | |||||||||||||||||||
97 | species | Bradyrhizobium sp. S23321 | 0.002561 | ||||||||||||||||||||||||||
98 | species | Unclassified Bradyrhizobium | 0.009554 | 0.004742 | 0.004742 | 0.012530 | 0.002374 | 0.034209 | 0.014976 | ||||||||||||||||||||
99 | genus | Unclassified Bradyrhizobiaceae | 0.044503 | 0.035425 | 0.033103 | 0.002119 | 0.043976 | 0.059128 | 0.024989 | 0.052411 | |||||||||||||||||||
100 | family | Hyphomicrobiaceae | 0.003209 | 0.003127 | 0.007102 | 0.002485 | |||||||||||||||||||||||
101 | genus | Hyphomicrobium | 0.004734 | 0.002485 | |||||||||||||||||||||||||
102 | genus | Unclassified Hyphomicrobiaceae | 0.003209 | 0.003127 | 0.002367 | ||||||||||||||||||||||||
103 | family | Beijerinckiaceae | 0.006430 | 0.025313 | 0.002309 | 0.017710 | |||||||||||||||||||||||
104 | genus | Methyloferula | 0.006328 | ||||||||||||||||||||||||||
105 | genus | Unclassified Beijerinckiaceae | 0.006430 | 0.018985 | 0.002309 | 0.017710 | |||||||||||||||||||||||
106 | family | Phyllobacteriaceae | 0.003235 | 7.467514e-03 | 0.001735 | 0.002367 | |||||||||||||||||||||||
107 | genus | Aminobacter | 0.002367 | ||||||||||||||||||||||||||
108 | genus | Mesorhizobium | 0.003235 | 7.467514e-03 | 0.001735 | ||||||||||||||||||||||||
109 | family | Rhizobiaceae | 0.065663 | 7.467514e-03 | 0.001735 | 0.014207 | |||||||||||||||||||||||
110 | family | Unclassified Rhizobiales | 0.059219 | 0.024440 | 0.025085 | 0.005203 | 0.069234 | 0.106508 | 0.075626 | 0.069939 | |||||||||||||||||||
111 | order | Unclassified Alphaproteobacteria | 0.103777 | 0.003985 | 0.001707 | 0.002624 | 0.254789 | 3.662137e-02 | 0.323613 | 0.002139 | 0.103924 | 0.025171 | 0.001182 | 0.243149 | 0.013174 | ||||||||||||||
112 | class | Betaproteobacteria | 0.007398 | 0.024213 | 0.333704 | 0.003422 | 0.010243 | 0.179085 | 3.099930e-01 | 0.152275 | 0.002750 | 0.316889 | 0.097802 | 0.014149 | 0.253270 | 0.002309 | 0.009782 | 0.038505 | 0.005009 | ||||||||||
113 | order | Neisseriales | 0.001584 | 1.493503e-02 | |||||||||||||||||||||||||
114 | family | Chromobacteriaceae | 0.001584 | ||||||||||||||||||||||||||
115 | family | Unclassified Neisseriales | 1.493503e-02 | ||||||||||||||||||||||||||
116 | order | Rhodocyclales | 0.001570 | 0.019699 | 0.004749 | ||||||||||||||||||||||||
117 | family | Zoogloeaceae | 0.019699 | 0.004749 | |||||||||||||||||||||||||
118 | genus | Thauera | 0.006566 | ||||||||||||||||||||||||||
119 | genus | Uliginosibacterium | 0.002374 | ||||||||||||||||||||||||||
120 | genus | Unclassified Zoogloeaceae | 0.013133 | 0.002374 | |||||||||||||||||||||||||
121 | family | Unclassified Rhodocyclales | 0.001570 | ||||||||||||||||||||||||||
122 | order | Nitrosomonadales | 0.009038 | 0.015440 | 7.646193e-03 | 0.006621 | 0.012207 | 0.011885 | |||||||||||||||||||||
123 | family | Thiobacillaceae | 0.001625 | ||||||||||||||||||||||||||
124 | family | Nitrosomonadaceae | 0.002374 | ||||||||||||||||||||||||||
125 | family | Methylophilaceae | 0.007412 | 0.015440 | 7.646193e-03 | 0.006621 | 0.012207 | 0.007133 | |||||||||||||||||||||
126 | genus | Methylophilus | 0.001083 | ||||||||||||||||||||||||||
127 | genus | Unclassified Methylophilaceae | 0.006330 | 0.015440 | 7.646193e-03 | 0.006621 | 0.012207 | 0.007133 | |||||||||||||||||||||
128 | family | Unclassified Nitrosomonadales | 0.002378 | ||||||||||||||||||||||||||
129 | order | Burkholderiales | 0.007398 | 0.024213 | 0.208748 | 0.003422 | 0.005142 | 0.054585 | 1.887400e-01 | 0.059586 | 0.002750 | 0.191343 | 0.079545 | 0.005865 | 0.161050 | 0.009782 | 0.009626 | ||||||||||||
130 | family | Burkholderiaceae | 0.007398 | 0.009627 | 0.043148 | 0.001714 | 0.026265 | 7.753322e-02 | 0.026483 | 0.028929 | 0.003109 | 0.001159 | 0.073595 | 0.009782 | |||||||||||||||
131 | genus | Paraburkholderia | 0.004784 | 0.001536 | 0.001159 | ||||||||||||||||||||||||
132 | species | Paraburkholderia kururiensis | 0.001536 | ||||||||||||||||||||||||||
133 | species | Unclassified Paraburkholderia | 0.004784 | 0.001159 | |||||||||||||||||||||||||
134 | genus | Burkholderia | 0.004842 | 0.005284 | 0.006566 | 2.046321e-02 | 0.003477 | 0.009782 | |||||||||||||||||||||
135 | genus | Ralstonia | 7.330474e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
136 | genus | Pandoraea | 0.001536 | ||||||||||||||||||||||||||
137 | genus | Unclassified Burkholderiaceae | 0.007398 | 0.034791 | 0.001714 | 0.019699 | 4.973954e-02 | 0.026483 | 0.025452 | 0.003109 | 0.073595 | ||||||||||||||||||
138 | genus | Thiomonas | 0.007720 | ||||||||||||||||||||||||||
139 | species | Thiomonas sp. FB-6 | 0.007720 | ||||||||||||||||||||||||||
140 | family | Alcaligenaceae | 0.011593 | 0.001707 | 1.446190e-02 | 0.003127 | |||||||||||||||||||||||
141 | genus | Orrella | 0.001087 | ||||||||||||||||||||||||||
142 | genus | Unclassified Alcaligenaceae | 0.010506 | 0.001707 | 1.446190e-02 | 0.003127 | |||||||||||||||||||||||
143 | family | Oxalobacteraceae | 0.004842 | 0.020463 | 7.198372e-03 | 0.002750 | 0.010016 | 0.006175 | 0.011903 | ||||||||||||||||||||
144 | genus | Janthinobacterium | 0.001596 | ||||||||||||||||||||||||||
145 | genus | Duganella | 0.001568 | 0.003091 | |||||||||||||||||||||||||
146 | genus | Herbaspirillum | 0.004721 | ||||||||||||||||||||||||||
147 | genus | Unclassified Oxalobacteraceae | 0.004842 | 0.012577 | 7.198372e-03 | 0.002750 | 0.010016 | 0.003085 | 0.011903 | ||||||||||||||||||||
148 | family | Comamonadaceae | 0.020788 | 0.007468 | 6.686280e-03 | 0.005216 | 0.014072 | ||||||||||||||||||||||
149 | genus | Variovorax | 0.001542 | 6.686280e-03 | 0.001733 | 0.002360 | |||||||||||||||||||||||
150 | genus | Hydrogenophaga | 0.001550 | ||||||||||||||||||||||||||
151 | genus | Unclassified Comamonadaceae | 0.017696 | 0.007468 | 0.003483 | 0.011712 | |||||||||||||||||||||||
152 | genus | Roseateles | 0.001698 | ||||||||||||||||||||||||||
153 | family | Unclassified Burkholderiales | 0.009744 | 0.112756 | 0.005142 | 0.013133 | 8.286019e-02 | 0.033103 | 0.145484 | 0.067134 | 0.004706 | 0.061480 | 0.009626 | ||||||||||||||||
154 | order | Unclassified Betaproteobacteria | 0.112765 | 0.005101 | 0.089361 | 9.867179e-02 | 0.086069 | 0.113339 | 0.018256 | 0.008284 | 0.075587 | 0.002309 | 0.028879 | 0.005009 | |||||||||||||||
155 | class | Deltaproteobacteria | 0.001854 | 0.004378 | 0.004378 | ||||||||||||||||||||||||
156 | class | Unclassified Proteobacteria | 0.007091 | 0.510154 | 0.013635 | 0.015448 | 0.002590 | 0.007936 | 0.590146 | 1.353744e-01 | 0.357858 | 0.002654 | 0.004728 | 0.001432 | 0.417262 | 0.106707 | 0.004720 | 0.778048 | 0.042878 | 0.014498 | 0.002561 | 0.012484 | |||||||
157 | phylum | Firmicutes | 0.001698 | 0.007077 | 0.007463 | ||||||||||||||||||||||||
158 | class | Bacilli | 0.004710 | ||||||||||||||||||||||||||
159 | class | Unclassified Firmicutes | 0.001698 | 0.002367 | 0.007463 | ||||||||||||||||||||||||
160 | phylum | Chloroflexi | 0.018837 | ||||||||||||||||||||||||||
161 | class | Ktedonobacteria | 0.004707 | ||||||||||||||||||||||||||
162 | order | Ktedonobacterales | 0.004707 | ||||||||||||||||||||||||||
163 | family | Ktedonobacteraceae | 0.004707 | ||||||||||||||||||||||||||
164 | class | Unclassified Chloroflexi | 0.014130 | ||||||||||||||||||||||||||
165 | phylum | Actinobacteria | 0.216094 | 0.298715 | 3.167372e-01 | 0.244048 | 0.383450 | 0.025366 | 0.391597 | ||||||||||||||||||||
166 | class | Actinobacteria | 0.193005 | 0.253995 | 2.983788e-01 | 0.201050 | 0.346732 | 0.022573 | 0.338335 | ||||||||||||||||||||
167 | order | Nakamurellales | 0.002378 | ||||||||||||||||||||||||||
168 | family | Nakamurellaceae | 0.002378 | ||||||||||||||||||||||||||
169 | genus | Nakamurella | 0.002378 | ||||||||||||||||||||||||||
170 | order | Micrococcales | 0.001808 | 0.006907 | 6.858484e-03 | 0.004887 | 0.004836 | 0.002364 | |||||||||||||||||||||
171 | family | Micrococcaceae | 6.858484e-03 | 0.002364 | |||||||||||||||||||||||||
172 | genus | Arthrobacter | 6.858484e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
173 | genus | Kocuria | 0.002364 | ||||||||||||||||||||||||||
174 | species | Kocuria rhizophila | 0.002364 | ||||||||||||||||||||||||||
175 | family | Unclassified Micrococcales | 0.001808 | 0.006907 | 0.004887 | 0.004836 | |||||||||||||||||||||||
176 | order | Corynebacteriales | 0.138032 | 0.123317 | 2.134050e-01 | 0.029756 | 0.214625 | 0.141732 | |||||||||||||||||||||
177 | family | Mycobacteriaceae | 0.099635 | 0.065862 | 1.645279e-01 | 0.011568 | 0.106313 | 0.040265 | |||||||||||||||||||||
178 | genus | Mycobacterium | 0.062013 | 0.015220 | 9.237122e-02 | 0.056118 | 0.004731 | ||||||||||||||||||||||
179 | genus | Unclassified Mycobacteriaceae | 0.037622 | 0.050642 | 7.215667e-02 | 0.011568 | 0.050195 | 0.035534 | |||||||||||||||||||||
180 | family | Nocardiaceae | 0.005074 | 0.001700 | 0.009511 | ||||||||||||||||||||||||
181 | genus | Nocardia | 0.002990 | ||||||||||||||||||||||||||
182 | genus | Rhodococcus | 0.001079 | 0.001700 | 0.009511 | ||||||||||||||||||||||||
183 | species | Rhodococcus rhodnii | 0.002378 | ||||||||||||||||||||||||||
184 | species | Unclassified Rhodococcus | 0.001079 | 0.001700 | 0.007133 | ||||||||||||||||||||||||
185 | genus | Unclassified Nocardiaceae | 0.001004 | ||||||||||||||||||||||||||
186 | family | Unclassified Corynebacteriales | 0.033323 | 0.057455 | 4.887707e-02 | 0.018189 | 0.106611 | 0.091956 | |||||||||||||||||||||
187 | order | Micromonosporales | 0.005362 | ||||||||||||||||||||||||||
188 | order | Propionibacteriales | 1.377610e-02 | 0.005555 | 0.002378 | ||||||||||||||||||||||||
189 | family | Nocardioidaceae | 1.377610e-02 | 0.005555 | |||||||||||||||||||||||||
190 | genus | Nocardioides | 6.888051e-03 | 0.002828 | |||||||||||||||||||||||||
191 | genus | Aeromicrobium | 0.002727 | ||||||||||||||||||||||||||
192 | genus | Unclassified Nocardioidaceae | 6.888051e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
193 | family | Unclassified Propionibacteriales | 0.002378 | ||||||||||||||||||||||||||
194 | order | Streptomycetales | 0.003263 | 0.004819 | |||||||||||||||||||||||||
195 | family | Streptomycetaceae | 0.002181 | 0.002357 | |||||||||||||||||||||||||
196 | family | Unclassified Streptomycetales | 0.001082 | 0.002462 | |||||||||||||||||||||||||
197 | order | Frankiales | 7.102379e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
198 | order | Unclassified Actinobacteria | 0.049902 | 0.123772 | 5.723692e-02 | 0.166407 | 0.127271 | 0.011656 | 0.184665 | ||||||||||||||||||||
199 | class | Unclassified Actinobacteria | 0.023089 | 0.044720 | 1.835834e-02 | 0.042998 | 0.036718 | 0.002794 | 0.053262 | ||||||||||||||||||||
200 | phylum | Planctomycetes | 0.001839 | 1.019547e-02 | 0.011669 | 0.013407 | 0.021668 | ||||||||||||||||||||||
201 | class | Planctomycetia | 0.001839 | 5.820331e-03 | 0.005820 | 0.002260 | 0.012472 | ||||||||||||||||||||||
202 | order | Planctomycetales | 0.001839 | 2.929127e-03 | 0.002929 | 0.002260 | 0.012472 | ||||||||||||||||||||||
203 | family | Planctomycetaceae | 2.929127e-03 | 0.002929 | |||||||||||||||||||||||||
204 | genus | Gimesia | 2.929127e-03 | 0.002929 | |||||||||||||||||||||||||
205 | family | Gemmataceae | 0.002489 | ||||||||||||||||||||||||||
206 | family | Unclassified Planctomycetales | 0.001839 | 0.002260 | 0.009983 | ||||||||||||||||||||||||
207 | order | Unclassified Planctomycetia | 2.891204e-03 | 0.002891 | |||||||||||||||||||||||||
208 | class | Phycisphaerae | 0.009196 | ||||||||||||||||||||||||||
209 | order | Phycisphaerales | 0.009196 | ||||||||||||||||||||||||||
210 | class | Unclassified Planctomycetes | 4.375135e-03 | 0.005849 | 0.011147 | ||||||||||||||||||||||||
211 | phylum | Spirochaetes | 0.001238 | ||||||||||||||||||||||||||
212 | phylum | Lentisphaerae | 0.006792 | ||||||||||||||||||||||||||
213 | class | Lentisphaeria | 0.001698 | ||||||||||||||||||||||||||
214 | class | Unclassified Lentisphaerae | 0.005094 | ||||||||||||||||||||||||||
215 | phylum | Acidobacteria | 0.158947 | 0.102234 | 0.092441 | ||||||||||||||||||||||||
216 | class | Acidobacteriia | 0.128427 | 0.059103 | 0.087839 | ||||||||||||||||||||||||
217 | order | Acidobacteriales | 0.120915 | 0.054583 | 0.087839 | ||||||||||||||||||||||||
218 | family | Acidobacteriaceae | 0.101904 | 0.052307 | 0.055264 | ||||||||||||||||||||||||
219 | genus | Terriglobus | 0.009477 | 0.006809 | |||||||||||||||||||||||||
220 | species | Terriglobus roseus | 0.001895 | ||||||||||||||||||||||||||
221 | species | Unclassified Terriglobus | 0.007582 | 0.006809 | |||||||||||||||||||||||||
222 | genus | Granulicella | 0.046934 | 0.022762 | 0.020687 | ||||||||||||||||||||||||
223 | species | Granulicella mallensis | 0.003725 | 0.002276 | 0.002286 | ||||||||||||||||||||||||
224 | species | Unclassified Granulicella | 0.043210 | 0.020485 | 0.018401 | ||||||||||||||||||||||||
225 | genus | Unclassified Acidobacteriaceae | 0.045493 | 0.022736 | 0.034577 | ||||||||||||||||||||||||
226 | family | Unclassified Acidobacteriales | 0.019010 | 0.002276 | 0.032576 | ||||||||||||||||||||||||
227 | order | Unclassified Acidobacteriia | 0.007512 | 0.004520 | |||||||||||||||||||||||||
228 | class | Solibacteres | 0.007682 | ||||||||||||||||||||||||||
229 | order | Solibacterales | 0.007682 | ||||||||||||||||||||||||||
230 | family | Solibacteraceae | 0.007682 | ||||||||||||||||||||||||||
231 | class | Unclassified Acidobacteria | 0.022839 | 0.043131 | 0.004602 | ||||||||||||||||||||||||
232 | phylum | Armatimonadetes | 0.002451 | ||||||||||||||||||||||||||
233 | phylum | Verrucomicrobia | 0.015117 | 0.023049 | 0.048434 | 0.103059 | 0.055088 | ||||||||||||||||||||||
234 | class | Spartobacteria | 0.003519 | 0.011749 | 0.006887 | ||||||||||||||||||||||||
235 | order | Chthoniobacterales | 0.003519 | 0.011749 | 0.006887 | ||||||||||||||||||||||||
236 | family | Chthoniobacteraceae | 0.003519 | 0.009399 | 0.006887 | ||||||||||||||||||||||||
237 | genus | Chthoniobacter | 0.003519 | ||||||||||||||||||||||||||
238 | genus | Unclassified Chthoniobacteraceae | 0.009399 | 0.006887 | |||||||||||||||||||||||||
239 | family | Unclassified Chthoniobacterales | 0.002350 | ||||||||||||||||||||||||||
240 | class | Verrucomicrobiae | 0.011532 | 0.002367 | |||||||||||||||||||||||||
241 | order | Verrucomicrobiales | 0.011532 | ||||||||||||||||||||||||||
242 | family | Verrucomicrobia subdivision 3 | 0.009210 | ||||||||||||||||||||||||||
243 | family | Rubritaleaceae | 0.002322 | ||||||||||||||||||||||||||
244 | order | Unclassified Verrucomicrobiae | 0.002367 | ||||||||||||||||||||||||||
245 | class | Opitutae | 0.005552 | 0.009223 | 0.033466 | 0.043537 | |||||||||||||||||||||||
246 | order | Opitutales | 0.005552 | 0.009223 | 0.029003 | 0.038845 | |||||||||||||||||||||||
247 | family | Opitutaceae | 0.005552 | 0.009223 | 0.024558 | 0.036549 | |||||||||||||||||||||||
248 | genus | Opitutus | 0.001849 | 0.004611 | |||||||||||||||||||||||||
249 | genus | Lacunisphaera | 0.001854 | ||||||||||||||||||||||||||
250 | genus | Unclassified Opitutaceae | 0.001849 | 0.004611 | 0.024558 | 0.036549 | |||||||||||||||||||||||
251 | family | Unclassified Opitutales | 0.004445 | 0.002296 | |||||||||||||||||||||||||
252 | order | Puniceicoccales | 0.004693 | ||||||||||||||||||||||||||
253 | order | Unclassified Opitutae | 0.004463 | ||||||||||||||||||||||||||
254 | class | Unclassified Verrucomicrobia | 0.006045 | 0.023049 | 0.039212 | 0.046312 | 0.002296 | ||||||||||||||||||||||
255 | phylum | Bacteroidetes | 0.176382 | 0.069845 | 1.324533e-01 | 0.072827 | 0.002727 | 0.172112 | 0.080129 | 0.018445 | |||||||||||||||||||
256 | order | Bacteroidetes Order II. Incertae sedis | 0.015464 | ||||||||||||||||||||||||||
257 | family | Rhodothermaceae | 0.015464 | ||||||||||||||||||||||||||
258 | genus | Rhodothermus | 0.010309 | ||||||||||||||||||||||||||
259 | genus | Unclassified Rhodothermaceae | 0.005155 | ||||||||||||||||||||||||||
260 | class | Flavobacteriia | 0.003148 | 0.002727 | 0.006794 | ||||||||||||||||||||||||
261 | order | Flavobacteriales | 0.003148 | 0.002727 | |||||||||||||||||||||||||
262 | family | Flavobacteriaceae | 0.003148 | 0.002727 | |||||||||||||||||||||||||
263 | genus | Flavobacterium | 0.003148 | 0.002727 | |||||||||||||||||||||||||
264 | order | Unclassified Flavobacteriia | 0.006794 | ||||||||||||||||||||||||||
265 | class | Sphingobacteriia | 0.044994 | 0.055826 | 7.659768e-02 | 0.013241 | 0.058071 | 0.040065 | |||||||||||||||||||||
266 | order | Sphingobacteriales | 0.043743 | 0.048848 | 6.976851e-02 | 0.013241 | 0.042709 | 0.035351 | |||||||||||||||||||||
267 | family | Sphingobacteriaceae | 0.041244 | 0.041870 | 6.257014e-02 | 0.013241 | 0.042709 | 0.035351 | |||||||||||||||||||||
268 | genus | Mucilaginibacter | 0.017497 | 0.034892 | 5.574097e-02 | 0.013241 | 0.030742 | 0.030638 | |||||||||||||||||||||
269 | species | Mucilaginibacter paludis | 0.013957 | 6.829170e-03 | 0.006621 | 0.004713 | |||||||||||||||||||||||
270 | species | Unclassified Mucilaginibacter | 0.017497 | 0.020935 | 4.891180e-02 | 0.006621 | 0.030742 | 0.025924 | |||||||||||||||||||||
271 | genus | Unclassified Sphingobacteriaceae | 0.023747 | 0.006978 | 6.829170e-03 | 0.011966 | 0.004713 | ||||||||||||||||||||||
272 | family | Unclassified Sphingobacteriales | 0.002500 | 0.006978 | 7.198372e-03 | ||||||||||||||||||||||||
273 | order | Unclassified Sphingobacteriia | 0.001250 | 0.006978 | 6.829170e-03 | 0.015362 | 0.004713 | ||||||||||||||||||||||
274 | class | Chitinophagia | 0.016088 | 1.427074e-02 | 0.008469 | ||||||||||||||||||||||||
275 | order | Chitinophagales | 0.014845 | 7.039794e-03 | 0.001687 | ||||||||||||||||||||||||
276 | family | Chitinophagaceae | 0.014845 | 7.039794e-03 | 0.001687 | ||||||||||||||||||||||||
277 | genus | Niastella | 0.002445 | ||||||||||||||||||||||||||
278 | genus | Segetibacter | 0.003727 | ||||||||||||||||||||||||||
279 | genus | Unclassified Chitinophagaceae | 0.008673 | 7.039794e-03 | 0.001687 | ||||||||||||||||||||||||
280 | order | Unclassified Chitinophagia | 0.001242 | 7.230949e-03 | 0.006781 | ||||||||||||||||||||||||
281 | class | Cytophagia | 0.008655 | 0.007040 | 7.134091e-03 | 0.005069 | 0.002357 | ||||||||||||||||||||||
282 | order | Cytophagales | 0.008655 | 0.007040 | 7.134091e-03 | 0.005069 | |||||||||||||||||||||||
283 | family | Hymenobacteraceae | 0.003748 | ||||||||||||||||||||||||||
284 | genus | Rufibacter | 0.002499 | ||||||||||||||||||||||||||
285 | genus | Unclassified Hymenobacteraceae | 0.001249 | ||||||||||||||||||||||||||
286 | family | Flammeovirgaceae | 0.001689 | ||||||||||||||||||||||||||
287 | family | Cytophagaceae | 0.003659 | 0.007040 | 0.003380 | ||||||||||||||||||||||||
288 | family | Unclassified Cytophagales | 0.001248 | 7.134091e-03 | |||||||||||||||||||||||||
289 | order | Unclassified Cytophagia | 0.002357 | ||||||||||||||||||||||||||
290 | class | Unclassified Bacteroidetes | 0.103497 | 0.006978 | 3.445077e-02 | 0.059586 | 0.093710 | 0.037708 | 0.002981 | ||||||||||||||||||||
291 | phylum | Unclassified Bacteria | 0.247876 | 0.008010 | 0.002586 | 0.002641 | 0.407158 | 8.783859e-02 | 0.454863 | 0.009345 | 0.002041 | 0.206586 | 0.013613 | 0.001812 | 1.047618 | 0.153383 | 0.002727 | 0.052807 | |||||||||||
292 | superkingdom | Archaea | 7.720081e-03 | 0.002421 | |||||||||||||||||||||||||
293 | phylum | Crenarchaeota | 0.002421 | ||||||||||||||||||||||||||
294 | class | Thermoprotei | 0.002421 | ||||||||||||||||||||||||||
295 | phylum | Unclassified Archaea | 7.720081e-03 | ||||||||||||||||||||||||||
296 | superkingdom | Unclassified | 0.032218 | 2.220446e-16 | 0.004720 |